基于SNP遺傳圖譜定位甘藍型油菜分枝角度QTL

汪文祥 儲 文 梅德圣 成洪濤 朱琳琳 付 麗 胡 瓊 劉 佳,*

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基于SNP遺傳圖譜定位甘藍型油菜分枝角度QTL

汪文祥1儲 文1梅德圣1成洪濤1朱琳琳2付 麗1胡 瓊1劉 佳1,*

1中國農業科學院油料作物研究所/ 農業農村部油料作物生物學與遺傳育種重點實驗室, 湖北武漢 430062;2南漳縣植保站, 湖北襄陽 441500

分枝角度是油菜株型的重要性狀, 與油菜的耐密植性密切相關。本研究利用油菜分枝角差異顯著的育種親本材料1098B (分枝角小)和R2 (分枝角大)雜交獲得F1, 通過小孢子培養獲得含163份株系的DH群體。以油菜60K SNP芯片進行DH群體基因分型, 構建高密度遺傳圖譜, 并利用QTL Cartographer 2.5對2個環境下油菜頂端分枝角和基部分枝角進行QTL分析。結果表明, 構建的高密度遺傳圖譜覆蓋甘藍型油菜19條染色體, 包含9521個多態性SNP標記, 1442個簇(bin), 覆蓋基因組長度為2544.07 cM, 相鄰簇(bin)之間平均距離為1.76 cM。在此圖譜基礎上采用復合區間作圖法(CIM), 在2個環境下檢測到17個分枝角度QTL, 分別位于A01、A02、A03、A06、A09、C02、C03、C04、C06和C08染色體上, 單個QTL解釋的表型變異為6.39%~21.78%。用比較基因組方法與擬南芥分枝角度同源基因區間比對, 鑒定出其中6個QTL的12個候選基因。其中位于A03連鎖群QTL在2年的試驗中被重復檢測到, 根據物理位置和基因組信息推測為分枝角度的候選基因。這些QTL和候選基因將為油菜分枝角度的遺傳改良提供有用的信息。

甘藍型油菜; 分枝角度; 60K SNP芯片; QTL位點; 候選基因

油菜是我國重要的油料作物, 每年提供450萬噸左右食用油, 占全國植物油總產的40%以上[1]。現階段, 油菜單產水平低和機械化生產普及率不高是限制我國油菜產業發展的兩大瓶頸。……