王蘭蘭
摘 要:RNA干擾(RNA interference, RNAi)是正常生物體內抑制特定基因表達的一種現象,通過雙鏈RNA的介導特異性降解相應序列的mRNA,從而導致轉錄后水平的基因沉默。RNAi發生過程主要分為3個階段:起始階段、擴增階段、效應階段。其在抵抗病毒感染、抑制轉座子活動、調控內源性基因表達等方面發揮重要作用。本文就RNAi的分子機制、作用特點及其應用研究方面的進展做相關介紹。
關鍵詞:RNA干涉;基因沉默;雙鏈RNA
RNA 干擾(RNA interference,RNAi) 是指與靶基因序列同源的雙鏈RNA( dsRNA) 所誘導的轉錄后基因沉默現象,是真核生物抵御病毒入侵、抑制轉座子活動、調控基因表達的監控機制。基因的表達具有選擇性,我們發現生物體內存在一套RNA 監視系統,能通過多種途徑產生異常dsRNA,誘發RNAi,激活抑制基因,控制活躍基因,從而參與基因選擇性表達。目前RNAi 技術因其操作簡單、特異性強、高效性等特點,被廣泛應用于植物的抗病毒研究、藥物靶基因的篩選、腫瘤治療等領域[1]。現對RNAi的研究進展做綜述。
1 RNA干涉的的發現
RNAi最早是在線蟲C.elegans上發現的,人們發現水蛭、錐體蟲、渦蟲、果蠅等無脊椎動物RNAi都非常有效。開始,較長雙鏈RNA只能引起少數胚胎細胞(如斑馬魚和小鼠胚胎)的RNAi現象。后來人工合成的21nt長度的RNA二合體在培養的哺乳動物細胞成功進行了RNAi。最近,利用載體表達的shRNA在許多培養的人源,猴源和鼠源的哺乳動物細胞的RNAi實驗取得了成功。RNAi廣泛存在于是生物界的現象。
2? RNA干涉的分子機制及作用特點
2.1 RNA干涉的分子機制
雖然遺傳學和生物化學的方法都已用于探索RNA干涉的機制,但其真正的機理尚未明了。目前認為其可能機制可分為三步:
第一步:dsRNA的形成。dsRNA是誘導細胞RNAi的關鍵組分,外源DNA、RNA序列均可激發細胞產生相應的dsRNA,但產生的方式不同。RNA病毒在病毒或細胞中RNA依賴性RNA聚合酶的催化下,合成病毒的RNA序列互補鏈,并與之結合形成dsRNA;細胞通過“通讀轉錄’,轉座子的反向重復序列,直接產生雙鏈RNA[2]。
第二步:siRNA的形成。形成的dsRNA要在細胞中大量擴增,當其在細胞中達到一定量的時候,會被一種特異的核酸內切酶識別并與之結合形成酶-dsRNA復合體。此后,在ATP的參與下,細胞中存在的另一種復合體—RNA誘導的沉默復合體,利用結合在其上的核酸內切酶活性切割靶mRNA分子中與dsRNA反義鏈互補的區域,形成了21-23個核昔酸的dsRNA,小片段稱之為短干涉RNA[3]。
第三步:RNAi的形成。SiRNA還可作為一種特殊的引物,在RdRP酶的作用下以把mRNA為模板合成dsRNA分子,這些dsNRA分子又可被RISC切割形成新的siRNA,新的siRNA又可進人上述循環,這種過程稱之為隨機降解性聚合酶鏈式反應。新生的dsRNA反復合成和降解,不斷產生新的siNRA,從而使靶mRNA漸進性減少,導致目的基因沉默,呈現RNiA現象。
2.2 RNA干涉的作用特點
RNAi途徑主要存在于細胞漿中,與反義核酸,核酶相比,RNAi具有以下特點。①特異性。siRNA是嚴格按照堿基配對法則與靶mRNA結合的,故只引起同源mRNA的降解。②遺傳性。dsRNA分子可擴散至生物體各個細胞,干擾效應可遺傳給后代,研究表明,通過注射或者浸泡siRNA,在二代線蟲中仍可觀察到對靶基因的抑制作用。③位置效應。研究表明只有針對編碼區的dsRNA才產生干擾效應,對內含子區域的dsRNA不產生干擾效應[4]。
3 RNA干涉的應用
3.1用于基因治療
RNAi的作用具有高效率和高特異性的特點,它能使目標蛋白的mRNA發生特異性的降解。目前,人們已經證明在培養的哺乳動物細胞中,RNAi可用于抗病毒和抗腫瘤等的基因治療Wilda等[5],在K562細胞系用針對融合基因bcr-abl的dsRNA可以明顯引起細胞凋亡。隨著RNAi被成功應用于哺乳動物細胞,用于人類疾病的治療已為期不遠。
3.2新藥物的研究與開發
蛋白質是細胞功能的執行者,各種疾病的發生和蛋白質功能的異常是分不開的。RNAi不僅可以使細胞產生特定基因表型,而且它還具有高效和特異的特點。因此,它在新藥的開發與研究上具有廣闊的前景。比如RNAi可以作為尋找新的藥物靶標的工具[6],可以高通量地對發現的藥物靶基因做功能分析,可幫助了解藥物作用的生化模式等。
3.3探索基因功能的工具
由于RNAi可以使特異基因mRNA發生降解,從而獲得特定蛋白功能喪失或降低的突變株。因此,RNAi可以作為一種強有力的研究工具,用于后基因組的研究。線蟲全基因組已于1998年測序完畢,RNAi的發現又為系統和高通量研究線蟲全基因組功能提供了可能。目前已探索了幾乎整個線蟲的所有基因(約19 000個)。植物的全基因組探索也正在進行中。
展望
RNAi作為一種改變基因表達的方法已在許多生物中進行了嘗試,取得了不同程度的成功。研究已發現在培養的人類細胞中確實存在RNAi現象,使人們看到了將RNAi作為遺傳學工具用于哺乳類乃至人類進行研究的曙光[7]。雖然RNAi研究的歷史很短,許多問題仍有待認識、解決,但隨著對RNAi機制的深入理解,RNAi將在功能基因組學、發育生物學研究,以及疾病的基因治療等方面發揮巨大的作用。
參 考 文 獻
[1] Koch A, Kogel K H. New wind in the sails: improving the agronomic value of crop plants through RNAi-mediated gene silencing.[J]. Plant Biotechnology Journal, 2014, 12(7):821-831
[2] 付文金, 巢時斌, 彭劍雄. RNA干擾[J]. 中國細胞生物學學報, 2002, 24(5):279-282.
[3] Zamore P D, Tuschl T, Sharp P A, et al. RNAi: double-stranded RNA directs the ATP-dependent cleavage of mRNA at 21 to 23 nucleotide intervals.[J]. Cell, 2000, 101(1):25-33.
[4] 萬志紅, 王宇明. 基因功能研究新途徑-RNA干擾[J]. 世界華人消化雜志, 2004, 12(4):962-964.
[5] 萬志紅, 王宇明. 基因功能研究新途徑-RNA干擾[J]. 世界華人消化雜志, 2004, 12(4):962-964.
[6] 吳濤, 石寶晨, 陳潤生. RNA干涉現象的發現與研究進展——2006年諾貝爾生理學或醫學獎簡介[J]. 生物化學與生物物理進展, 2006, 33(10):915-917.
[7] 孫秀菊. RNA干涉:沉默基因的機制及應用研究新進展[J]. 國際遺傳學雜志, 2002, 25(6):313-316.