基于不完全雙列雜交設計的水稻農藝性狀配合力基因組預測

王欣 馬瑩 胡中立 徐辰武,

基于不完全雙列雜交設計的水稻農藝性狀配合力基因組預測

王欣1,2,3馬瑩1胡中立3徐辰武1,*

(1江蘇省作物遺傳生理重點實驗室/植物功能基因組學教育部重點實驗室/江蘇省作物基因組學和分子育種重點實驗室/揚州大學 農學院，江蘇 揚州，225009；2揚州大學 信息工程學院，江蘇 揚州 225009；3雜交水稻國家重點實驗室/武漢大學 生命科學院，武漢 430072;*通訊聯系人, E-mail：cwxu@yzu.edu.cn)

【】在親本一般配合力的基礎上優選特殊配合力高的雜交種，是水稻雜種育種的關鍵。基因組選擇基于覆蓋全基因組的分子標記和樣本的表型數據建立預測模型，實現對品種更加可靠的選擇。本研究利用一組基于不完全雙列雜交(NCII設計)的水稻數據集，考查其多個農藝性狀配合力的基因組預測能力。并比較了不同訓練群體構建方法對雜交種表型預測能力的影響。8個農藝性狀一般配合力的預測能力由其遺傳率主導，從0.3888到0.7367。雜交種特殊配合力的預測能力較低，但是直接預測雜交種的表型可以獲得較高的預測能力。基因組預測水稻親本一般配合力是有效的，能夠幫助育種家實現對親本的科學選擇。如果要選配雜交種，直接預測雜交種表型是最有效的手段。此時讓更多的親本均衡地參與雜交種訓練集的組配，有利于獲得更高的預測能力。

水稻；不完全雙列雜交；表型；配合力；基因組預測

雜種優勢的利用，對水稻的育種工作至關重要。基因組選擇(genomic selection，GS)[1]基于覆蓋全基因組的分子標記和樣本的表型數據建立預測模型，實現對品種更加可靠的選擇。……