動物基因組選配方法與應用

何俊，Fernando B. Lopes，吳曉林,,3

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動物基因組選配方法與應用

何俊1，Fernando B. Lopes2，吳曉林1,2,3

1. 湖南農業大學動物科技學院，長沙 410128 2. 美國威斯康星大學動物科學系，威斯康星州麥迪遜市 53706 3. 美國紐勤公司生物信息與生物統計部，內布拉斯加州林肯市 68504

基因組選擇(genomic selection, GS)是利用覆蓋基因組的分子標記預測動物個體的估計育種值，可以提高選擇的準確度和選擇強度，縮短世代間隔，做到早選、準選，使動物育種發生了巨大變革。過去的10多年間，基因組選擇技術應用于奶牛等動物的育種中，使種用動物的選擇更為準確，遺傳進展得到大幅提高。但基因組選擇通常重視目標性狀的遺傳進展，而忽略了配種親本個體間的遺傳關系，因此也沒有考慮到后代群體中近交程度的增加、遺傳多樣性的降低以及有害基因的純合等問題，因此難以維持長期的遺傳進展。2016年，一種具有可持續性的遺傳選擇方法被正式提出，稱為基因組選配(genomic mating, GM)。該方法利用待選種用個體的基因組信息實施優化的選種和選配，可以控制群體近交的增長速率，實現長期且可持續的遺傳進展。因此基因組選配方法比基因組選擇的方法更適合于現代動物育種，尤其適用于地方品種的保護和遺傳改良。本文綜述了基因組選配的基本概念、方法和應用，并通過模擬的方法比較了6種選配方案的選擇效果，旨在為動物育種方法的應用提供參考。

基因組選擇；基因組選配；優化貢獻選擇

動物育種方法在過去的100年間經歷……