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利用流式細胞法鑒定馬鈴薯倍性方法的優(yōu)化

2019-03-05 09:12:22王婷婷張光海蔡汶玻郭華春
中國馬鈴薯 2019年1期

王婷婷,張光海,蔡汶玻,郭華春

(云南農(nóng)業(yè)大學(xué),云南 昆明 650201)

流式細胞法(Flow cytometry,F(xiàn)CM)是利用流式細胞分析儀檢測植物細胞DNA含量,分析得到DNA含量直方圖,根據(jù)DNA含量直方圖的峰值位置推斷出植株的倍性。由于細胞在有絲分裂的過程中,核內(nèi)的DNA會進行復(fù)制,造成DNA含量的變化。如果把處于G0/G1期的細胞的DNA含量看作2n的話,處于G2/M期的細胞的DNA含量則為4n,所以FCM可以準確快速地鑒定大批量植物材料的染色體倍性水平[1,2]。流式細胞術(shù)可以測定液體懸浮液中熒光和微小粒子的光散射(熒光標記的微粒)。由于其快速準確的特點,F(xiàn)CM在20世紀80年代,代替細胞熒光光度法和顯微分光光度測定法,成為測定植物細胞核DNA含量的主流方法,其原理是利用特異的熒光染色劑對細胞進行染色,通過流式細胞儀測定熒光含量[3,4]。由于所使用的熒光染色劑大多為核酸熒光染料,可以與細胞內(nèi)DNA堿基特異性結(jié)合,所以熒光的含量與細胞DNA含量成正比關(guān)系,隨著染色體數(shù)目的成倍增加,細胞核DNA含量也必然成倍增加,細胞核DNA相對含量的高低與細胞的倍性密切相關(guān),根據(jù)細胞核DNA含量的高低可進行倍性鑒定。常用的熒光染料有碘化丙啶(Propidium iodide,PI)、異硫氰基熒光素(Fluorescein isothiocyanate,F(xiàn)ITC)和4',6-二脒基-2-苯基吲哚(4',6-diamidino-2-phenylindole,DAPI)等[5-7]。FCM短時間內(nèi)可以測定大量的細胞核,樣品需求量小,不會影響植物的正常生長。且樣品制備僅需要幾分鐘,而且不需要昂貴的試劑。流式細胞術(shù)簡便、快速、分辨率和準確度高,鑒于這些優(yōu)點,已經(jīng)在多種植物的染色體倍性鑒定中得以應(yīng)用。例如,蘋果[5]、梨[8]、桑樹[9]、菘藍[10]、草莓[11]、 水稻[12]、櫻桃[13]等。

馬 鈴 薯(Solanum tuberosum L.)屬 于 茄 科(Solanaceae)茄屬(Solanum)一年生,草本植物,起源于南美洲的秘魯和智利地區(qū)[14]。馬鈴薯普通栽培種分為2個亞種,分別為長日照普通栽培種亞種(S.tuberosum subsp.tuberosum)和短日照安第斯亞種(S.tuberosum subsp.andigena),經(jīng)過幾個世紀的自然進化選擇,形成了目前世界各國廣泛栽培的普通栽培種(Solanum tuberosum L.)[15]。馬鈴薯倍性豐富,染色體基數(shù)為n=12,自然界中分布有二倍體(2n=24)、三倍體(2n=36)、四倍體(2n=48)、五倍體(2n=60)、六倍體(2n=72)[16]。這些是改善栽培馬鈴薯的重要基因資源,可以為育種工作提供具有理想遺傳背景的材料,而馬鈴薯的倍性鑒定則是開展野生種馬鈴薯育種應(yīng)用研究的基礎(chǔ)和前提[17,18]。

盡管關(guān)于馬鈴薯倍性鑒定方法已有很多研究報道,但利用流式細胞法鑒定馬鈴薯倍性方面的報道仍然較少。本試驗借鑒流式細胞法在其他植物染色體倍性鑒定方面的研究,通過篩選適合制備馬鈴薯幼葉單細胞核懸浮液的緩沖液,比較離心和不離心及不同染料對結(jié)果的影響,期望利用流式細胞術(shù)建立一套適合鑒定馬鈴薯染色體倍性的方法,快速準確地鑒定馬鈴薯倍性,從而為馬鈴薯的倍性研究提供依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料與儀器

二倍體馬鈴薯品系‘E’和四倍體馬鈴薯‘青薯9號’為研究對象,取在MS培養(yǎng)基中正常生長3周左右的幼嫩葉片為試驗材料。流式細胞儀(BD FACSAriaTMⅡ)。

1.2 細胞核分離緩沖液的配制

細胞核分離緩沖液Ⅰ(LB01):15 mmol/L Tris,2 mmol/L Na2EDTA,0.5 mmol/L腈胺,80 mmol/L KCl, 20 mmol/L NaCl, 0.1%(v/v)Trition X-100,用1 mol/L NaOH調(diào)節(jié)pH至7.5,0.22 μm濾膜過濾除菌,再加15 mmol/L β-巰基乙醇;分裝后-20℃保存。

細胞核分離緩沖液Ⅱ(Galbraith's buffer):45 mmol/L MgCl2,20 mmol/L MOPS,30 mmol/L檸檬 酸 鈉 , 0.1%(v/v)Trition X-100; 用 1 mol/L NaOH調(diào)節(jié)pH至7.0,0.22 μm濾膜過濾除菌;分裝后-20℃保存。

細胞核分離緩沖液Ⅲ(Tris·MgCl2buffer):200mmol/L Tris, 4 mmol/L MgCl2, 0.5%(v/v)Trition X-100;用1 mol/L HCl調(diào)節(jié)pH至7.5,0.22 μm濾膜過濾除菌,4℃保存。

1.3 馬鈴薯葉片細胞核懸浮液的制備

選用上述3種核分離緩沖液,取約20 mg正常生長3周左右的馬鈴薯‘E’組培苗葉片,置于預(yù)冷的培養(yǎng)皿中央,加入1 mL預(yù)冷的核分離緩沖液,使材料完全浸沒在解離液中,然后用鋒利的雙面刀片迅速切碎,切的過程中樣品應(yīng)始終接觸緩沖液。將勻漿混勻,避免產(chǎn)生氣泡。將預(yù)先浸泡在解離液中400目的濾膜取出,用此濾膜將勻漿過濾到1.5 mL離心管中[19]。

1.4 離心漂洗次數(shù)選擇

采用1.3的方法,加入1 mL預(yù)冷的LB01緩沖液,分別進行不離心和離心1次的比較試驗。離心1次的試驗條件為4℃,1 000 r/min,離心5 min,棄去上清,再加200 μL LB01緩沖液。

1.5 染色劑的選擇

在用LB01緩沖液制備的單細胞核懸浮液中,分別加入 PI(50 μg/mL)染料和 DAPI(5 μg/mL)染料,注意加PI染料的核懸浮液中要同時加入質(zhì)量濃度為50 μg/mL的核糖核酸酶(RNase)。4℃避光染色30 min,并輕搖混勻。

1.6 上機檢測與數(shù)據(jù)分析

用BD FACSAriaTMⅡ流式細胞儀進行檢測,調(diào)節(jié)參數(shù),每個經(jīng)過染色的樣品收集10 000個細胞核,利用FlowJo軟件進行數(shù)據(jù)分析,從而獲得流式峰值圖(橫坐標為細胞核DNA相對含量的熒光強度,縱坐標為細胞核數(shù)量)和散點圖(橫坐標為細胞的總熒光強度,縱坐標為細胞通過激光的時間)。

2 結(jié)果與分析

2.1 不同緩沖液的效果比較

圖1 不同解離液下二倍體馬鈴薯品系‘E’單細胞核懸浮液的相對DNA含量直方圖和散點圖Figure 1 Peak valuehistogram and scatter diagram ofsinglecellsuspension solution for relativeDNA contentsusing different dissociation buffersin diploid potato line'E'

取約20 mg正常生長3周左右的二倍體馬鈴薯品系‘E’組培苗幼嫩葉片,分別用核分離緩沖液Ⅰ(LB01)、核分離緩沖液Ⅱ(Galbraith's buffer)和核分離緩沖液Ⅲ(Tris·MgCl2buffer)制備馬鈴薯單細胞核懸浮液,檢測結(jié)果見圖1。使用3種緩沖液制備的馬鈴薯幼葉細胞核懸浮液,經(jīng)流式細胞儀檢測均可產(chǎn)生非常明顯的峰。核分離緩沖液Ⅰ(LB01)(圖1-a)的解離效果明顯優(yōu)于Galbraith's buffer(圖 1-b)和 Tris·MgCl2buffer(圖 1-c)。LB01解離液得到的散點圖中,粒子團清晰、集中,2個細胞群可以完全分開,收集到的完整細胞核較多,在熒光通道值為200處附近出現(xiàn)G1峰,G1峰和G2峰可以完全分開,峰值較為準確(圖1-a-2)。而Galbraith's buffer和Tris·MgCl2buffer制備的核懸浮液中(圖1-b-2和圖1-c-2),2個細胞群不能完全分開,反映在直方圖上則表現(xiàn)為G1峰和G2峰不能完全分開,主峰位置明顯發(fā)生偏移。因此,核分離緩沖液LB01可作為制備馬鈴薯幼葉單細胞核懸浮液的最優(yōu)解離液。

2.2 離心和不離心的效果比較

取二倍體馬鈴薯品系‘E’組培苗新鮮幼嫩葉片制備的馬鈴薯單細胞核懸浮液,進行不離心(圖2-a)和離心1次(圖2-b)的試驗,檢測結(jié)果如圖2所示。從圖2-a-2和圖2-b-2看出兩者均表現(xiàn)為粒子團集中、清晰,2個細胞群可以完全分開,反映在直方圖上則表現(xiàn)為G1峰和G2峰可以完全分開,但離心得到的懸浮液中完整細胞核少于不離心得到的。

從提高試驗效率和節(jié)約試驗成本來說,應(yīng)采用不離心的方法制備馬鈴薯單細胞懸浮液。

圖2 不同離心次數(shù)制備二倍體馬鈴薯品系‘E’的相對DNA含量直方圖和散點圖Figure 2 Peak value histogram and scatter diagram for relative DNA contents using different centrifugation times in diploid potato line'E'

2.3 不同染料的效果比較

取二倍體馬鈴薯品系‘E’組培苗新鮮幼嫩葉片制備的單細胞核懸浮液,分別用PI(50 μg/mL)染料和DAPI(5 μg/mL)染料進行染色試驗,檢測結(jié)果如圖3所示。PI染料和DAPI染料對馬鈴薯單細胞核懸浮液的制備無明顯差異,處理后得到的完整細胞核均較多,粒子團清晰集中,背景碎片少,2個峰可以完全分開。

2.4 馬鈴薯品種‘青薯9號’的倍性分析

圖3 不同染料制備二倍體馬鈴薯品系‘E’幼葉的相對DNA含量直方圖和散點圖Figure 3 Peak value histogram and scatter diagram for relative DNA contents using different fluorescent dyes in diploid potato line'E'

圖4 流式細胞術(shù)檢測二倍體馬鈴薯品系‘E’(a)和四倍體品種‘青薯9號’(b)的相對DNA含量Figure 4 Peak value histogram for relative DNA contents of diploid potato line'E'(a)and tetraploid variety'Qingshu 9'(b)by flow cytometry

利用以上所得的最優(yōu)試驗方案,取大約20 mg正常生長3周左右的‘青薯9號’組培苗幼嫩葉片,置于預(yù)冷的培養(yǎng)皿中央,加入1 mL預(yù)冷的核分離緩沖液LB01,然后用鋒利的雙面刀片迅速切碎,將勻漿混勻,隨后用預(yù)先浸泡在解離液LB01中的400目濾膜將勻漿過濾到1.5 mL離心管中。加入10 μL預(yù)冷的質(zhì)量濃度為50 μg/mL PI的染料,同時加入質(zhì)量濃度為50 μg/mL的RNase,避光染色30~60 min,最后流式細胞儀上樣檢測。以二倍體馬鈴薯品系‘E’作為對照,將‘青薯9號’的核DNA含量與二倍體馬鈴薯‘E’相比較,結(jié)果如圖4。二倍體馬鈴薯‘E’的細胞核熒光強度在200道附近有明顯的峰,而‘青薯9號’在400道附近出現(xiàn)明顯的峰,為二倍體馬鈴薯‘E’的2倍,符合四倍體核DNA的特征。以上建立的方法適合進行馬鈴薯的倍性分析。

3 討 論

在利用流式細胞術(shù)鑒定染色體倍性的試驗中,由于只利用物理方法切碎葉片,很難獲得大量的完整的細胞核。因此,還需要加入核分離緩沖液[20]。但是,對于不同科、屬和種的植物來說,在提取單細胞核懸浮液時,需要的解離液也是不同的。如果解離液不適合,會加速細胞核破裂,導(dǎo)致碎片增多。因此,選擇適合本試驗材料的解離液尤為重要。例如,楊靜等[9]利用MgSO4緩沖液成功鑒定了桑樹的染色體倍性;馬艷芝和客紹英[10]利用LB01解離液成功鑒定了菘藍的染色體倍性;在本文中,利用3種核分離緩沖液制備馬鈴薯幼嫩葉片的單細胞核懸浮液,結(jié)果表明,解離液LB01的效果最好,所得到的單細胞核懸浮液中,有較多的完整細胞核,而且背景碎片較少,峰圖清晰。另外,LB01緩沖液也適應(yīng)于蘋果的染色體倍性鑒定[5]。所以,在利用流式細胞術(shù)鑒定馬鈴薯染色體倍性時,選擇LB01緩沖液來制備核懸浮液。

由于植物的組織結(jié)構(gòu)不同,會采用不同的離心次數(shù)。于紅梅等[11]采用離心2次和離心3次的方法處理草莓單細胞核懸浮液,發(fā)現(xiàn)兩者相比,離心3次的效果更好,碎片較少,流式直方圖更清晰,還可以減少對儀器的堵塞。楊靜等[9]比較了不離心、離心1次、離心2次對桑樹染色體倍性鑒定結(jié)果的影響,發(fā)現(xiàn)3種離心方式對結(jié)果并無顯著影響,認為采用不離心的方法制備桑樹的單細胞懸浮液,既可以提高試驗效率又可以簡化試驗操作步驟。吳雅琴等[13]利用流式細胞術(shù)鑒定甜櫻桃砧木細胞核DNA含量和染色體倍性的試驗中,采用不離心的方式處理甜櫻桃砧木單細胞核懸浮液,效果顯著,鑒定出了不同砧木品種的倍性。朱道圩等[21]則發(fā)現(xiàn)離心2次對中華獼猴桃染色體倍性鑒定效果好。本文比較了不離心和離心1次對馬鈴薯葉片單細胞核懸浮液制備效果的影響,發(fā)現(xiàn)離心之后,雖然粒子團也清晰集中,但目的細胞略少于不離心組,可能是離心過程中丟失了部分目的細胞。故選擇不離心的方式制備馬鈴薯葉片單細胞核懸浮液。PI染料不僅可以與DNA結(jié)合而且還能與RNA結(jié)合,所以用PI進行染色的時候要同時加入RNase。而DAPI僅與DNA結(jié)構(gòu)中的A-T區(qū)域結(jié)合,與RNA沒有結(jié)合位點。從試驗結(jié)果來看,2種染料的效果差異不大,所以今后的的試驗既可以選擇PI又可以選擇DAPI作為熒光染料。

在本試驗中,通過對馬鈴薯幼嫩葉片的不同處理與結(jié)果分析,總結(jié)出一套利用流式細胞術(shù)鑒定馬鈴薯染色體倍性的方案:取大約20 mg正常生長3周左右的馬鈴薯組培苗幼嫩葉片,置于預(yù)冷的培養(yǎng)皿中央,加入1 mL預(yù)冷的核分離緩沖液LB01,用鋒利的雙面刀片迅速切碎,然后將勻漿混勻,用預(yù)先浸泡在解離液LB01中的400目濾膜將勻漿過濾到1.5 mL離心管中。加入10 μL預(yù)冷的PI(50 μg/mL)染料,同時加入RNase(50 μg/mL),避光染色30~60 min,最后流式細胞儀上樣檢測。

采用流式細胞術(shù)鑒定馬鈴薯染色體倍性,所需材料用量少,速度快,短時間內(nèi)便可鑒定出植株倍性,可以為馬鈴薯的倍性研究提供實驗依據(jù)。

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