吳保軍,王卓,董宇,鄧宇亮,施奇惠
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肺癌惡性胸腔積液中稀有腫瘤細(xì)胞的鑒定與單細(xì)胞測序分析
吳保軍,王卓,董宇,鄧宇亮,施奇惠
上海交通大學(xué)系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)研究院,系統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 200240
腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性是指腫瘤細(xì)胞在基因組或表型水平上具有不同特征。在外界環(huán)境壓力或人為殺傷因素刺激下,腫瘤細(xì)胞具有不同的響應(yīng)方式,從而導(dǎo)致它們在細(xì)胞增殖、侵襲轉(zhuǎn)移及耐藥能力等方面產(chǎn)生差別,尤其是一部分具有轉(zhuǎn)移能力的腫瘤細(xì)胞能脫離原位組織并在遠(yuǎn)處器官形成轉(zhuǎn)移灶。因此,腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性為其發(fā)生轉(zhuǎn)移和耐藥提供了可能。傳統(tǒng)的腫瘤異質(zhì)性研究主要基于不同位置原位組織樣本中的群體細(xì)胞,缺乏單細(xì)胞層面的解析,尤其是對具有轉(zhuǎn)移能力的腫瘤細(xì)胞的異質(zhì)性研究。本研究建立了基于肺癌惡性胸腔積液中轉(zhuǎn)移性腫瘤細(xì)胞的單細(xì)胞研究路線,首先利用代謝標(biāo)志物鑒定惡性胸腔積液中高代謝活性的腫瘤細(xì)胞,其次通過單細(xì)胞Sanger測序揭示這些腫瘤細(xì)胞具有一致的驅(qū)動基因突變特征,然后利用高通量測序技術(shù)對腫瘤細(xì)胞染色體拷貝數(shù)變異進(jìn)行分析,從而揭示同一患者具有轉(zhuǎn)移能力的腫瘤細(xì)胞即使具有相同的驅(qū)動基因突變特征,但在基因組層面上仍具有異質(zhì)性,可進(jìn)一步細(xì)分為若干子群。本研究結(jié)果對于更深入地理解腫瘤轉(zhuǎn)移機(jī)制具有重要意義。
肺癌;胸腔積液;腫瘤細(xì)胞;……