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PCR檢測白斑綜合征病毒(WSSV)方法在小龍蝦養(yǎng)殖中應(yīng)用探索

2018-11-14 06:38:06陳俊豪丁文嶺方麗君徐洲羅春景
水產(chǎn)養(yǎng)殖 2018年11期
關(guān)鍵詞:檢測

陳俊豪 ,丁文嶺 ,方麗君 ,徐洲 ,羅春景

(1.揚州市江都區(qū)水產(chǎn)管理站,江蘇 揚州 225200;2.揚州市江都區(qū)小紀(jì)鎮(zhèn)神潼塔岳水產(chǎn)養(yǎng)殖場,江蘇 揚州 225241;3.揚州市江都區(qū)丁溝鎮(zhèn)農(nóng)業(yè)推廣中心,江蘇 揚州 225235)

隨著小龍蝦池塘養(yǎng)殖和稻蝦綜合種養(yǎng)產(chǎn)業(yè)迅速發(fā)展,小龍蝦白斑綜合征病害問題也日漸突出。其病原為一種環(huán)狀雙鏈DNA病毒,能感染對蝦、螯蝦等各種蝦類,該病毒病流行快、發(fā)病廣、致死率高,對小龍蝦養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟損失。由于白斑綜合征病毒類病原侵染動物體后在宿主細(xì)胞內(nèi)進(jìn)行復(fù)制繁殖,一般常規(guī)藥物無法在不傷害宿主細(xì)胞的情況下將其消滅,故而該病毒性疾病目前尚無特效治療藥物。因此在小龍蝦親本繁殖、苗種放養(yǎng)及養(yǎng)殖環(huán)節(jié)中對病原的早期診斷和及早處理帶毒動物體,及時進(jìn)行預(yù)測預(yù)報,并在基層生產(chǎn)指導(dǎo)單位建立快速準(zhǔn)確靈敏的WSSV檢測方法,對科學(xué)養(yǎng)殖指導(dǎo)工作有著重要的意義,對實際養(yǎng)殖生產(chǎn)的幫助也是顯而易見的。PCR檢測方法是一項分子生物學(xué)技術(shù),用于放大特定的核酸片段,具有特異性強、靈敏度高、樣本純度要求低、簡便快速的特點,已廣泛應(yīng)用于醫(yī)學(xué)和生物學(xué)實驗室以及傳染病病原的檢測。自20世紀(jì)末,對于WSSV的PCR檢測方法就已有了系統(tǒng)研究,可對于將WSSV的PCR檢測方法引入生產(chǎn)實踐中,為養(yǎng)殖戶進(jìn)行病害的預(yù)測預(yù)報,這在揚州地區(qū)尚屬首次。近年來小龍蝦白斑綜合征在我國湖北、江蘇、安徽等小龍蝦主要養(yǎng)殖區(qū)域危害嚴(yán)重,每年的5月至6月和9月至10月,水溫在20~28℃為流行高峰,一旦發(fā)病,病死率高達(dá)90%以上。筆者在2018年上半年走訪了江蘇省揚州市江都區(qū)兩戶小龍蝦養(yǎng)殖戶,皆因苗種攜帶了WSSV,在2017年秋后和2018年春夏期間,存塘小龍蝦急劇減少,導(dǎo)致養(yǎng)殖池塘血本無歸。為探索小龍蝦苗種及親本攜帶WSSV情況,便于從源頭上開展苗種產(chǎn)地檢疫,筆者等人利用PCR法分子檢測技術(shù)對小龍蝦存塘親本、苗種、異地進(jìn)購的蝦苗及發(fā)病塘養(yǎng)殖的小龍蝦進(jìn)行采樣檢測,取得了較好的效果,現(xiàn)將有關(guān)方法介紹如下。

1 材料與方法

1.1 檢測樣品的選擇

檢測樣品來源于江蘇龍禾生態(tài)農(nóng)業(yè)有限責(zé)任公司(地點位于揚州市江都區(qū)吳橋鎮(zhèn))2017年存塘小龍蝦親本、2008年存塘小龍蝦繁育的苗種、泗洪某小龍蝦繁育公司的苗種及江都區(qū)真武鎮(zhèn)、邵伯鎮(zhèn)兩養(yǎng)殖戶(以下分別簡稱為樣品 A1、A2、B、C、D、E)。

1.2 樣品規(guī)格和采集時間

樣品A1為2017年存塘的小龍蝦親本,規(guī)格30g/只左右,采集時間為2018年4月9日;樣品B、C為2018年繁殖的小龍蝦苗,規(guī)格4~5 g/只,采集時間為4月13日;樣品D為2017年存塘發(fā)病的種蝦、A2為2017年存塘的小龍蝦親本,規(guī)格約30 g/只,采集時間為5月23日;樣品E為2018年從外地進(jìn)購的小龍苗,規(guī)格約5 g/只,采集時間為2018年6月7日。2018年5月23日前后江蘇龍禾生態(tài)農(nóng)業(yè)有限公司養(yǎng)殖的小龍蝦陸續(xù)出現(xiàn)死亡,經(jīng)檢查為2017年存塘的小龍蝦親本,此時正是小龍蝦白斑綜合征發(fā)病高峰期,在采集樣品D時,同時也在該池塘采集了樣品A2,經(jīng)PCR分子檢測,結(jié)果為WSSV陰性。

1.3 樣品處理

取活蝦苗或者活大蝦的鰓部,放在95%酒精中(可在常溫下保存30 d)或-20℃保存。如果用樣品95%酒精保存,處理前必須讓酒精完全揮發(fā)。充分研磨至粉末狀,無明顯顆粒。

1.4 DNA抽提

取 2~25 mg組織研磨物,加入 180μL GL Buffer,加入20μL蛋白酶K,10μL RNase A 混勻,56℃溫浴2~3 h,可適當(dāng)延長時間,12 000 r/min離心2 min離心除雜質(zhì);加入200μL GB buffer,200μL無水乙醇,充分混勻,將溶液加入收集柱小管Spin Column中,12 000 r/min離心2 min,去離心液;加入 500 μL WA Buffer,10 000 r/min離心 1 min,去離心液;加入700μL WB Buffer,10 000 rpm離心1 min,去離心液。重復(fù)1次以上步驟。再10 000 rpm離心2 min,把小柱加入新的1.5 mL離心管中,加入50~200μL Elution Buffer到小柱中央,靜置5 min,65 ℃ 溫浴 5 min,12 000 r/min,2 min 離心洗脫,可重復(fù)洗脫1次。

1.5 PCR

短時離心,按PCR儀WSV程序擴增DNA:94℃,4 min、94 ℃,1 min、55 ℃,1 min、72 ℃、2 min,30 個循環(huán),72℃,10 min。4℃保溫,擴增1 447 bp片段。

1.6 瓊脂糖核酸電泳

倒平板:用TBE緩沖液配制1.5%的瓊脂糖(含0.5μg/mL核酸染料)凝膠,厚0.5 cm;將平板放入水平電泳槽,電泳緩沖液剛好淹沒膠面;加樣:6μL(用MIX混合液)樣品加入樣品孔;電泳:根據(jù)電泳槽長度,5 V/cm電泳約30 min停止;紫外光下觀察核酸帶,并記錄結(jié)果。

1.7 nested-PCR

當(dāng)PCR結(jié)果為陰性(即電泳無帶)時,PCR產(chǎn)物可直接當(dāng)模板使用。當(dāng)PCR為陽性時,PCR產(chǎn)物要根據(jù)DNA帶的強弱用水稀釋10~1 000倍后才能作為nested-PCR的模板;短時離心,按PCR儀WSV 程序擴增 DNA:94 ℃,4 min、94 ℃,1 min、55℃,1 min、72 ℃、2 min,30 個循環(huán),72 ℃,10 min。4℃保溫,擴增941 bp片段。

1.8 瓊脂糖核酸電泳

倒平板:用TBE緩沖液配制1.5%的瓊脂糖(含0.5μg/mL核酸染料)凝膠,厚0.5 cm;將平板放入水平電泳槽,電泳緩沖液(TBE,含0.5μg/mL核酸染料)剛好淹沒膠面;加樣:6μL(用MIX混合液)樣品加入樣品孔;電泳:根據(jù)電泳槽長度,5 V/cm電泳約30 min停止;紫外光下觀察核酸帶,并記錄結(jié)果。

2 結(jié)果

圖1為樣品A1檢測結(jié)果,采樣地點:江都區(qū)吳橋鎮(zhèn)。圖1中,7號孔為陽性對照,8號孔為陰性對照,1—6號孔未出現(xiàn)1 447 bp大小陽性條帶;15號孔為陽性對照,16號孔為陰性對照,9—14號孔未出現(xiàn)941 bp大小陽性條帶,樣品A1判斷為陰性。

圖1樣品A1檢測結(jié)果

圖2 為樣品B、C檢測結(jié)果,采樣地點:泗洪某小龍蝦繁育公司、江都區(qū)吳橋鎮(zhèn)。圖2中,7號孔為陽性對照,8號孔為陰性對照,1—6號孔未出現(xiàn)1 447 bp大小陽性條帶;15號孔為陽性對照,16號孔為陰性對照,9—14號孔未出現(xiàn)941 bp大小陽性條帶,樣品B、C均判斷為陰性。

圖2 樣品B、C檢測結(jié)果

圖3 樣品D、A2檢測結(jié)果

圖3 為樣品D、A2檢測結(jié)果,采樣地點:江都區(qū)真武鎮(zhèn)、江都區(qū)吳橋鎮(zhèn)。圖3中,7號孔為陽性對照,8號孔為陰性對照,1—3號孔出現(xiàn)1 447 bp大小陽性條帶,4—6號孔未出現(xiàn)1 447 bp大小陽性條帶;15號孔為陽性對照,16號孔為陰性對照,9—11號孔出現(xiàn)941 bp大小陽性條帶,12—14號孔未出現(xiàn)941 bp陽性條帶,樣品D判斷為陽性,樣品A2判斷為陰性。

圖4為樣品E檢測結(jié)果,采樣地點:江都區(qū)邵伯鎮(zhèn)。圖4中,5號孔為陽性對照,6號孔為陰性對照,2、3號孔出現(xiàn)1 447 bp大小陽性條帶,1、4號孔為空白對照;11號孔為陽性對照,12號孔為陰性對照,8、9號孔出現(xiàn) 941 bp大小陽性條帶,7、10號孔為空白對照,樣品E判斷為陽性。

圖4 樣品E檢測結(jié)果

上列電泳照片中所使用的條帶標(biāo)記物均為DL2000 Marker。

第1次PCR擴增后,陽性對照會出現(xiàn)1條1 447 bp的DNA條帶,陰性對照和空白對照沒有該核酸帶;

第2次PCR擴增后,陽性對照會出現(xiàn)1條941 bp的DNA條帶,陰性對照和空白對照沒有該核酸帶。

因此,樣品A1、A2、B、C為白斑綜合征病毒(WSSV)陰性,樣品D、E白斑綜合征病毒(WSSV)陽性。

3 討論

小龍蝦苗種要從專業(yè)苗種繁育基地選購,要對當(dāng)?shù)匦↓埼r白斑綜合征進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查,避免多渠道或從小龍蝦白斑綜合征疫區(qū)進(jìn)購苗種。筆者調(diào)查到江都區(qū)真武鎮(zhèn)、邵伯鎮(zhèn)兩戶養(yǎng)殖戶放養(yǎng)的苗種,一戶是2017年8月從周邊不同渠道收購放養(yǎng),另一戶是2018年4月從湖北某地進(jìn)購,發(fā)病后在短時間內(nèi)存塘量急驟減少,經(jīng)采樣檢測小龍蝦均為白斑綜合征病毒(WSSV)陽性。

小龍蝦白斑綜合征發(fā)病水溫一般為20~28℃,在每年4月底到6月之間暴發(fā),而小龍蝦苗種放養(yǎng)時多在3—4月,即便苗種或親本自身攜帶WSSV,但在發(fā)病季節(jié)前,小龍蝦體表無明顯癥狀,也不發(fā)生死亡。因此,苗種放養(yǎng)前對存塘苗種、親本及異地進(jìn)購的苗種進(jìn)行WSSV檢測尤為重要。筆者等人2018年在小龍蝦放養(yǎng)前,對存塘小龍蝦親本、苗種、異地進(jìn)購的苗種進(jìn)行了采樣檢測,檢測結(jié)果均為WSSV陰性,在5月23日前后雖有小龍蝦陸續(xù)死亡,但通過潑灑消毒劑、內(nèi)服Vc、免疫多糖等,病情很快得到控制。而在樣品A2池塘小龍蝦發(fā)病死亡的小龍蝦中,多數(shù)為存塘小龍蝦親本,筆者認(rèn)為主要原因是存塘小龍蝦親本在蝦苗孵出后,體質(zhì)虛弱,蛻殼不遂或蛻殼后體質(zhì)難以恢復(fù)而造成死亡。

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