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抗艱難梭菌毒素納米抗體在乳酸乳球菌中重組表達及其功能分析

2018-11-07 08:58:36武國松李杉
生物技術通報 2018年10期

武國松 李杉

(華南理工大學生物科學與工程學院,廣州 510006)

艱難梭菌(Clostridium difficile)為革蘭氏陽性厭氧芽孢桿菌,是抗生素藥物相關性腹瀉的主要致病菌[1-2];由于近年來抗生素的廣泛使用,特別是強毒菌株(027/NAPI/BI)的出現,使得艱難梭菌感染(Clostridium difficileinfection,CDI)在國內外呈上升趨勢[3];CDI常見病癥為假膜性結腸炎,外周白細胞明顯增多,腹瀉,發熱等,嚴重的會出現急性腎衰竭和低血壓甚至死亡,復發率高達40%[4]。

目前用萬古霉素、非達霉素作為感染的一線治療方案,然而抗生素藥物易進一步破壞腸道微生態,加重菌群失衡,從而引起反復感染[5]。1989年在駱駝的血清中發現一種天然缺失輕鏈只含有重鏈的抗體[9]。具有相對分子質量小(分子量只有15 kD左右)、穩定性強、抗原結合性能好、易表達及免疫原性低等特點。這種只由重鏈可變區構成的單域抗體被稱為VHH抗體(Variable domain of heavy chain of heavy-chain antibody,VHH)[6],亦被稱為納米抗體(Nanobody,Nb)。納米抗體具有多種優勢[12-13],在食品及藥物開發等領域擁有廣闊的前景。

本實驗室已獲得了從駝羊血清中分離的抗艱難梭菌毒素的基因E3和AA6,通過短小的連接序列(Linker)將E3及AA6串聯在一起,從而轉化成二價雙特異的形式,相比單價納米抗體,二價納米抗體具有更高的抗原識別能力及抗原親和力[7]。從而增強其對毒素B的抑制效率,為治療艱難梭菌感染奠定基礎。

乳酸菌是治療性蛋白載體,自身具有免疫佐劑作用,能夠在強胃酸環境下生存,不需要對抗原進行復雜的處理。乳酸菌高效表達系統NICE(The nisin controlled expression,NICE)是在乳鏈菌肽(Nisin)誘導下由 nisA 啟動子控制目的基因表達的[8]。nisin可以在含有 nisRK的菌中高度誘導克隆在 nisA啟動子之后的基因而自身不會產生內毒素。當在菌的對數生長期時加入微量的 nisin,目的基因的濃度依賴誘導將會發生,且誘導作用與 nisin的濃度在一定范圍內成正比,誘導效率可高1 000倍以上[9]。

本研究應用NICE系統構建質粒pNZ8148-E3-AA6,獲得重組乳酸乳球菌NZ9000/ pNZ8148-E3-AA6,誘導表達納米抗體,通過SDS-PAGE 和Western blot鑒定表達產物,親和層析法純化目標蛋白,并對所獲得重組二價納米抗體進行初步活性鑒定,可以中和艱難梭菌毒素TcdB的細胞毒性。本研究成功在乳酸乳球菌中表達具有抑制TcdB細胞毒性的納米抗體,旨在為治療艱難梭菌感染提供一個潛在方法,具有一定的應用前景。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 菌株、質粒和培養基 乳酸乳球菌NZ9000,質粒pNZ8148(氯霉素抗性)由江南大學生物工程學院張娟博士惠贈。M17培養基:購自青島海博生物技術有限公司;GM17液體培養基(M17培養基中含 0.5%葡萄糖);G-SGM17液體培養基:M17干粉培養基37.25 g/L,蔗糖0.5 mol/L,甘氨酸2.5%,115℃高壓滅菌20 min,待冷卻至50℃以下時加入0.22 μm濾膜過濾的葡萄糖溶液,其終濃度為0.5%。細胞培養相關試劑:DMEM(Dulbecco’s Modified Eagle Medium)細胞培養基(Gibco),胰蛋白酶(0.25%Trypsin,Gibco),PBS緩沖液(雙螺旋生物科技,上海),胎牛血清(FBS,Gibco),青霉素和鏈霉素雙抗(Gibco),二甲基亞砜(DMSO,Sigma)

1.1.2 主要試劑及儀器 PrimerSTAR Max聚合酶、DNA Marker 購自寶生物工程(大連)有限公司。限制性內切酶NcoⅠ和SacⅠ、T4DNA 連接酶購自Thermo公司。CCK8檢測液購自背景索寶來生物科技有限公司,質粒小提試劑盒以及膠回收試劑盒購自TIANGEN公司。革蘭陽性菌質粒小提試劑盒購自北京索萊寶科技有限公司,BCA Protein Assay Kit購自Thermo公司,nisin購自 Sigma公司。非洲綠猴腎細胞株(Vero細胞,實驗室保存)。其他試劑均為分析純。PCR儀Bio-Rad公司,凝膠成像儀Bio-Rad,熒光倒置顯微鏡(Olypus IX71,日本)。Spectramax M5酶標儀購自美谷分子儀器(上海)有限公司。

1.2 方法

1.2.1 引物的設計與合成 根據E3和AA6的基因序列,在E3基因序列的 3′端添加Linker(G4S)密碼子,在AA6的3′端添加6個His標簽,利用Primer 5.0 設計擴增基因的引物:E3-F1:5′- CATG CCATGGCTATGGCGGCCGCTTCCCAG-3′(下劃線處為NcoⅠ酶切位點),E3-R1:5′-ATCGAGCTCTTAG TGGTGGTGGTGGTGGTGTGATCCGCCTCCGCCTTGT GGTTTTGGTGTCTTGGGTTCC-3′(下劃線處為SacⅠ酶切位點)。AA6-F2 :5′-ATCGAGCTCATGGCGGCC GCTCAGTTGCA -3′(下劃線處為SacⅠ酶切位點),AA6-R2 :5′-CCCAAGCTTTTAGTGGTGGTGGTGGTG GTGTTGTGGTTTTGGTGTCTTGGGTTCTGA-3′(下劃線處HindIII酶切位點),引物由生工生物工程(上海)服務有限公司合成。

1.2.2 重組表達載體的構建及蛋白小量表達 PCR分別擴增E3、AA6納米抗體編碼基因,酶切依次將AA6、E3連接至載體pNZ8148 上,雙酶切及測序鑒定獲得質粒pNZ8148-E3-AA6。按Holo等[10]方法制備乳酸乳球菌 NZ9000感受態細胞。將連接產物通過電穿孔轉化法轉化到NZ9000感受態細胞中,設置電壓2 000 V,電脈沖時間為1.5-5.0 ms。電轉細胞在GM17 恢復培養基(含20 mmol/LMgCl2,2 mmol/L CaCl2)30℃培養2 h后,取100 μL涂布到GM17氯霉素抗性平板上,30℃厭氧培養24-48 h。雙酶切進行鑒定,重組菌株為NZ9000/ pNZ8148-E3-AA6。

30℃靜置培養過夜的重組菌按照1∶100的比例轉接至5 mL GM17培養基中(氯霉素終濃度為10 ug/mL),測定不同時間點重組乳酸乳球菌 NZ9000/pNZ8148-E3-AA6的OD600值,在培養至菌液 OD600值為0.4-0.5時加入終濃度為 1 ng/mL 的誘導劑 nisin進行誘導表達,12 h時收集菌體。收集的菌體經超聲破碎后,SDS-PAGE和 Western-blot鑒定。

1.2.3 重組乳酸乳球菌的大量表達 將誘導后的菌液500 mL離心,每克濕菌體用3 mL 5 mmol/L咪唑緩沖液重懸,菌體用高壓破碎儀進行破碎,4℃12 000 r/min離心30 min 收集上清液。將上清液加入預先用5 mmol/L咪唑緩沖液平衡的Ni-NTA 層析柱內,分別用100(20% buffer B)mmol/L、150(30%buffer B)mmol/L咪唑緩沖液洗脫,并收集洗脫液,SDS-PAGE 電泳檢測目的蛋白分離純化效果,透析至1×PBS溶液,使用BCA 蛋白濃度測定試劑盒測定蛋白濃度。

1.2.4 CCK8法檢測二價納米抗體E3-AA6蛋白對毒素TcdB的抑制實驗 在細胞變圓實驗中,用不同濃度梯度TcdB處理Vero細胞,并且在顯微鏡下觀察細胞的形態變化。分別統計細胞變圓率,通過觀察統計得出,當毒素TcdB濃度為0.0125 ng/mL時,24 h變圓率約為70% 左右,選定此濃度為對照實驗施加毒素濃度。將對數生長期Vero細胞,用含10%胎牛血清的DMEM培養基配制1×105/mL細胞懸液,按每孔個細胞約1×104個(100 μL)加入到96 孔細胞培養板中,過夜培養后,進行毒素中和實驗。分別設置3個實驗組:空白組、對照組、實驗組。空白組施加完全培養基,對照組施加完全培養基和0.0125ng/mL TcdB,實驗組為Vero細胞同時施加加0.0125 ng/mL TcdB和12.5、25、50 μg/mL的重組納米抗體蛋白,每個濃度設置3次平行實驗。培養2 h,6 h,12 h,18 h和24 h后每孔加入10 μL CCK8 檢測液,37℃孵育2 h后,酶標儀在450 nm檢測其吸光度值。

1.2.5 統計學處理 采用 Origin 9.1.軟件及SPSS 22.0軟件進行數據分析,數據以x-±s表示。

2 結果

2.1 重組乳酸乳球菌蛋白表達與鑒定

根據重組乳酸乳球菌的生長曲線確定菌液 OD600為 0.4-0.5時,加入nisin,終濃度為1 ng/ mL。將12h誘導培養的重組乳酸乳球菌,超聲破碎處理后進行SDS-PAGE(圖1-A)可見經誘導的重組菌在32 kD處有與預期大小一致的條帶,未誘導的重組乳酸乳球菌未見相應條帶,說明經誘導的目的蛋白在重組乳酸乳球菌中獲得表達。

Western-blot、Anti-His-tag抗體檢測結果(圖2)顯示,誘導的重組乳酸乳球菌在32 kD處有特異性條帶,表明目的蛋白在重組乳酸乳球菌中獲得表達,通過鎳柱親和層析純化目的蛋白,SDS-PAGE檢測(圖1-B),BCAProtein Quantification Kit測定其蛋白濃度為 720 μg /mL。

圖1 表達產物的 SDS-PAGE分析

2.2 二價納米抗體E3-AA6蛋白對毒素TcdB的抑制

CCK8法實驗結果(圖3)表明二價納米抗體E3-AA6對TcdB有抑制作用,并且TcdB的抑制作用與納米抗體的濃度呈現一定的正相關,根據公式:抑制率(%)={1-[OD(實驗組)-OD(空白)]/[OD(對照組)-OD(空白)]}×100,計算得出當二價納米抗體E3-AA6濃度為50 μg /mL時,對TcdB的抑制率在24 h時為39%。

圖2 表達產物的Western-blotting分析

圖3 納米抗體E3-AA6對毒素TcdB的抑制效應

3 討論

艱難梭菌廣泛存在于自然環境及動物糞便中,是人體腸道中的正常菌群。由于廣泛應用廣譜抗生素、免疫抑制劑或化療藥物等藥物,人體腸道微生物菌群平衡被擾亂,艱難梭菌大量繁殖,引發艱難梭菌感染,導致嚴重腹瀉和腸道炎癥甚至死亡。

目前針對艱難梭菌感染,常見的CDI治療是抗生素治療[11],甲硝唑用于CDI輕中度患者,萬古霉素用于CDI重度患者,菲達霉素是一種大環內酯類抗菌藥物,對艱難梭菌有殺菌活性,但是對其他革蘭氏陽性菌作用有限,一般用于治療復發患者[12]。但近年高毒素菌株出現,藥物的敏感性降低,甲硝唑和萬古霉素可進一步破壞腸道微生態平衡,艱難梭菌感染復發率很高,且治愈后復發率高達25%-60%[13]。因此抗生素藥物需要向窄譜,不可吸收,可重復給藥,安全性高等方向發展[14]。另一種新型CDI治療方式是糞菌移植法,其原理是將健康供體的糞便經過過濾后注入到患者的結腸中,達到重新恢復正常結腸菌群的目的[15-16]。

圖4 不同濃度E3-AA6對毒素TcdB 的抑制作用

納米抗體因其分子量小、高特異性等特性,在治療艱難梭菌感染方面有著天然優勢[17]。本實驗室獲得了從駝羊血清中分離的抗艱難梭菌毒素的基因E3和AA6,蛋白分子量分別為15 kD左右,通過Linker連接,設計成雙特異性納米抗體,通過乳酸乳球菌表達系統,獲得了32 kD的純化蛋白。在細胞毒素實驗中,施加0.0125 ng/mL TcdB,Vero細胞24 h的變圓率為70%,施加50 μg/mL二價納米抗體E3-AA6,細胞變圓率明顯降低,通過CCK8試劑盒測定細胞活性,抑制率達到39%。證明二價納米抗體E3-AA6對艱難梭菌TcdB有一定的中和作用。結合乳酸乳球菌可通過胃進入到腸道,直接作用于艱難梭菌,為今后的體內實驗提供實驗依據。

4 結論

本研究成功構建了抗艱難梭菌毒素的重組表達載體pNZ8148- E3-AA6,通過NICE系統實現了二價納米抗體E3-AA6穩定表達;在對Vero細胞變圓實驗及CCK8實驗中,E3-AA6能夠有效的中和艱難梭菌毒素TcdB。

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