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非小細胞肺癌EGFR基因突變與EML4?ALK融合基因的表達及其臨床病理特征

2018-07-26 06:26:36吳菡孫蘇安劉海燕劉文杰黃建
實用醫學雜志 2018年13期
關鍵詞:基因突變融合檢測

吳菡 孫蘇安 劉海燕 劉文杰 黃建

南京醫科大學附屬淮安第一醫院病理科(江蘇淮安223300)

精準醫療是目前醫學界的研究熱點,檢測相關位點突變是實施分子靶向治療的關鍵,可為臨床治療方案的制定和藥物改進提供重要的信息[1]。非小細胞肺癌(non?small cell lung cancer,NSCLC)占肺癌的80%~85%,其在基因組層面的多樣性和復雜性決定了治療和預防的難度較大,但也為肺癌分子靶向治療的研究提供了更多的方向和可能[2]。表皮生長因子受體(epithelial growth factor receptor,EGFR)信號通路在肺癌分子靶向治療中研究得較為集中且深入,而酪氨酸酶氨酸激酶抑制劑(tyrosine kinase inhibitors,TKIs)則是根據EGFR異常表達調控而研制出的相應的小分子藥物,并在臨床上收獲了顯著的治療效果[3]。RUSSO等[4]研究表明,EGFR?TKIs較放化療能顯著延長NSCLC患者的無進展生存期,且不良反應較少,但仍存在次級突變(secondary mutation)以及耐藥性等問題,靶向藥物還要根據基因研究的結果不斷改進。

棘皮動物微管相關蛋白4?間變性淋巴瘤激酶(echinoderm microtubule?associated protein?like 4?anaplastic lymphoma kinase,EML4?ALK)融合基因被稱為驅動程序突變,直接影響肺癌的發生和發展,是繼EGFR之后的又一個研究熱點[5]。CHRIS?TOPOULOS等[6]報道EML4?ALK融合基因陽性表達比例較小,但仍是重要的癌癥驅動基因,臨床上也針對存在ALK陽性的局部晚期和轉移的NSCLC群體而研制出有效的抗腫瘤藥物克唑替尼,但EML4?ALK融合基因突變尚不能作為評價NSCLC預后的獨立因素。EGFR基因突變是肺癌靶向治療的研究熱點,EML4?ALK融合基因為篩選靶向藥物獲益人群提供依據,本研究檢測NSCLC患者EGFR基因突變與EML4?ALK融合基因表達情況,可為完善肺癌治療靶向分子突變類型提供更多的循證醫學證據。

1 資料與方法

1.1 一般資料 收集2016年1月至2017年6月南京醫科大學附屬淮安第一醫院NSCLC標本213例,其中男119例,女94例;年齡25~87歲,中位年齡57歲;腺癌94例,非腺癌119例?;颊呔唇邮苓^放療、化療、免疫治療、EGFR?TKIs或ALK酪氨酸激酶抑制劑治療。本研究患者及其家屬知曉,獲本院醫學倫理委員會批準。

1.2 主要試劑與儀器 安捷倫Mx3000P實時熒光定量PCR儀(美國),樣本提取及EGFR、EML4?ALK檢測試劑盒購自廈門艾德生物醫藥有限公司。

1.2.1 核酸提取 (1)確保組織切片中腫瘤細胞比例>50%。(2)選取腫瘤細胞富集區,8 μm切片10張至1.5 mL EP管中,加入二甲苯1 mL,振蕩混勻10 s,14 000 r/min離心2 min,去上清,吸干EP管底部液體,重復上述步驟1次;加入1 mL無水乙醇,振蕩混勻10 s,14 000 r/min離心2 min,去上清,吸干EP管底部液體,重復上述1次;待乙醇充分揮發后,應用AmoyDx?FFPE樣品分離試劑盒(離心柱型)提取DNA和RNA。

1.2.2 EGFR突變檢測 采用ARMS檢測EGFR基因突變狀態。樣品準備:紫外分光光度儀檢測提取的DNA樣本濃度與質量。DNA濃度稀釋至2 ng/μL,將 23.5 μL 已稀釋 DNA 樣品加入 1.5 μL Taq酶中混勻,依次取5 μL加入8連管PCR反應體系中。設立陰性、陽性對照,安捷倫Mx3000P實時熒光定量PCR儀檢測。循環條件為95℃、5 min為1個循環;95 ℃、25 s,64 ℃、20 s,72 ℃、20 s共15個循環;93 ℃、25 s,60 ℃、35 s,72 ℃、20 s共31個循環。判讀兩種突變類型的陽性范圍Ct值。

1.2.3 EML4?ALK融合基因檢測 采用RT?PCR分析EML4?ALK融合基因突變情況。(1)RT反應體系:逆轉錄酶 0.5 μL、RNA 模板 6 μL(RNA 總量0.5~5.0 μg),42 ℃、1 h,95 ℃、5 min逆轉錄得到ALK cDNA。(2)PCR擴增:ALK cDNA加入1.5 μL混合酶混勻,依次移取5 μL加入8連管PCR反應體系中,設立陰性、陽性對照,檢測儀器及循環條件同EGFR突變檢測,同樣判讀Ct值。

1.3 統計學方法 采用SPSS 17.0軟件進行數據分析,計數資料采用(n)或(%)表示,行χ2檢驗,P<0.05為差異有統計學意義。

2 結果

2.1 EGFR基因、EML4?ALK融合基因突變與臨床病理特征的關系 在213例NSCLC患者中,EGFR基因突變率為25.35%,EML4?ALK融合基因表達率為2.82%。臨床病理特征方面,兩種基因突變均表現為女性高于男性、非吸煙者高于吸煙者、腺癌高于非腺癌、<60歲高于≥60歲(僅EML4?ALK),差異有統計學意義(P<0.05)。見表1。

表1 EGFR基因突變、EML4?ALK融合基因表達與臨床病理特征的關系Tab.1 Correlation between EGFR gene mutation,EML4?ALK fusion gene expression and clinicopathological characteristics

2.2 EGFR基因突變和EML4?ALK融合基因表達的特點 54例EGFR基因突變類型為19 del(n=26)和 L858R(n=20),雙重突變者共 4例。6例EML4?ALK融合基因突變類型均為EML4 exon13?ALK exon20(E13?A20)型V1突變。見表2。未發現同時存在EGFR、EML4?ALK陽性的病例。

表2 EGFR基因突變和EML4?ALK融合基因表達的特點Tab.2 Characteristics of EGFR gene mutation and EML4?ALK fusion gene

3 討論

分子靶向治療是腫瘤治療的未來,有研究[7]顯示,EFGR酪氨酸激酶區域的突變主要發生在18~21號外顯子,其中19和21號外顯子突變約占所有突變的90%,且在不吸煙者、女性、腺癌患者中的突變率較高,并具有一定的地域差異,如東亞人群的EGFR突變率要明顯高于其他地域。仇秦威等[8]研究中國華南地區172例非小細胞肺癌患者的EFGR突變情況,結果顯示EGFR突變率為32%(55/172),且熱點突變為19號外顯子缺失和21號外顯子L858R突變;同時,發生EGFR突變也是在女性、無吸煙史和腺癌患者中比例較高。本研究中EGFR基因突變率為25.35%,其中以19號外顯子E19del和21號外顯子L858R突變為主(48.15%、37.03%),且仍以女性、非吸煙者和腺癌患者發生風險更高,與上述研究結果相符。目前,EFGR突變率在女性、非吸煙、腺癌中較高的原因尚不明確,LEVY等[9]研究發現,EGFR基因突變率在黃種人群要高于白種人群和黑種人群,在腫瘤組織學分級Ⅰ~Ⅱ級中也較高。YU等[10]研究表明,與miR?155、miR?16及miR?133a比較,非吸煙女性肺腺癌(lung adenocarcinoma,ADC)組織中miR?25在EGFR野生型的患者中表達升高,可能提示患者預后不佳。王玉等[11]研究發現EGFR突變患者miR?93?3p表達升高,miR?93?3p可能成為女性非吸煙肺腺癌靶向治療的新靶點。上述研究結果提示,遺傳因素、環境地域差異、生活習慣等均與EGFR突變有關,仍需進一步的研究。

EML4?ALK融合基因是NSCLC的一個潛在治療靶點,是在2007年由SODA等[12]首次從NSCLC腫瘤組織中擴增出的,并已研制出ALK抑制劑——克唑替尼。目前,EML4?ALK突變率在NSCLC患者中并不高,LIU等[13]、ULIVI等[14]、張海燕等[15]報道的EML4?ALK突變率分別為8.7%(2/23)、8.4%(32/380)、7.6%(5/66),且均表現為女性、非吸煙、腺癌、年齡輕(≤59歲)具有更高的突變風險。本研究EML4?ALK融合基因表達率為2.82%(6/213),較上述研究結果低,考慮與本研究納入的213例患者中女性例數較少有關(94vs.119),但在檢出的6例陽性患者中,仍表現為女性、非吸煙、腺癌、年齡輕(<60歲)的突變特點,其原因可能為亞裔女性吸煙率較低、樣本量較少、納入標準及遺傳因素有關。FALLET等[16]認為EML4?ALK融合基因突變更傾向于淋巴結轉移的中晚期病例,本研究EML4?ALK融合基因突變與臨床分期無相關性,考慮為EML4?ALK融合基因突變樣本數量少、病理分期分布不均有關。

本研究6例EML4?ALK融合基因突變類型均為 V1突變(E13?A20),而鄭劍滔等[17]分析 9例EML4?ALK突變類型發現,其中雙位點突變3例,具體為亞型1突變9例,亞型3突變1例,亞型2突變2例,說明亞型1是EML4?ALK融合基因最常見的突變類型。同時,其研究還發現了EML4?ALK突變(亞型1及亞型2突變)與EGFR突變(19號外顯子突變)并存的病例。王旭洲等[18]也發現了6例EML4?ALK與EGFR兩種驅動基因的同時突變,并經AMRS法和FISH法驗證成立,說明EML4?ALK融合基因與EGFR雙突變并非完全排斥,只是這種情況的發生概率較低。本研究未發現上述兩種驅動基因突變的并存病例,考慮與樣本量較少、檢測方法較單一有關。

不足的是,首先,本研究并未對KRAS基因突變進行檢測,而其突變會導致EGFR信號通路持續激活,加速腫瘤細胞增殖,影響EGFR?TKIs療效[19];其次,本研究其他EGFR突變基因也有重要的研究價值,如20號外顯子T790M突變已被證實[20]是一種獲得性耐藥性的基因突變,其可導致第1、2代EGFR?TKIs藥物療效較差,同時也是第3代藥物要克服的問題;再次,本研究設計也較為簡單,納入樣本量較少,對于EML4?ALK融合基因的檢測方法也較為簡單,因此可在研究對象篩選、檢測指標選擇及檢測方法應用等方面展開研究;最后,EGFR基因突變的異質性也會影響EGFR?TKIs療效,如李志陽等[21]證實女性EGFR基因突變異質性率顯著高于男性,而多發肺結節患者的腫瘤異質性發生率最高,這對抗腫瘤治療具有很重要的意義,值得深入研究。

綜上所述,本研究證明NSCLC患者中EGFR基因突變最為常見,EML4?ALK融合基因陽性表達較少,兩種基因均在女性、非吸煙和腺癌患者中表達較高。本研究雖未觀察到EML4?ALK融合基因伴EGFR基因突變的病例,但報告確有存在,而多靶點抑制劑能否使靶向治療人群獲益更大仍有待進一步研究。

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