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黃瓜CsGASA4基因克隆及生物信息學分析

2018-07-16 11:21:46秦智偉于思琦周秀艷
東北農業大學學報 2018年7期

秦智偉,于思琦,劉 東,辛 明,周秀艷

(1.農業部東北地區園藝作物生物學與種質創制重點實驗室,哈爾濱 150030;2.東北農業大學園藝園林學院,哈爾濱 150030)

黃瓜(Cucumis sativus L.),別名胡瓜、王瓜,為葫蘆科甜瓜屬一年生攀緣草本植物,起源于喜馬拉雅山脈熱帶地區[1]。黃瓜生產栽培常受各種病原菌侵染,影響產量和品質。近年來,隨著世界保護地蔬菜栽培面積擴大,為多種流行病害提供適宜生存環境,尋找抗病基因對黃瓜抗病性育種意義重大。

GASA基因家族是一類受GA調控的基因家族[2]。GASA蛋白結構包含N-端信號肽序列,該序列通常由18~29個氨基酸殘基組成;信號肽后面是由7~31個極性氨基酸殘基組成的親水區域;C-端是約60個氨基酸組成的高度保守結構域,即GASA結構域[3]。GASA結構域是GASA家族成員核心結構域,Rubinovich和Sun等研究認為,該結構域缺失或保守半胱氨酸殘基突變均會導致GASA蛋白喪失功能[4-5]。張強等研究表明,GASA蛋白多數屬于分泌蛋白一類,該家族蛋白結構相似,但功能各異[6]。Kotilainen等研究表明,同為GASA基因家族不同成員功能可能相同或相反,非洲菊GEG和PRGL基因在花瓣伸長中表現相反功能——GEG基因通過抑制細胞伸長而抑制花瓣尺寸[7],PRGL基因則相反[8-9]。Shi等在赤霉素缺失的番茄突變體gib1中分離出的GAST1基因是首個GASA基因家族成員[10]。Herzog等在擬南芥中發現GASA基因家族[11]。矮牽牛[12]、非洲菊[7]、馬鈴薯[13]、水稻[14]、草莓[15]等中也有該家族基因。GASA蛋白在植物生長發育階段[16-18]、非生物脅迫[12,19]、生物脅迫[13,20]及激素信號轉導[5,21]中均有顯著作用。多數GASA家族基因受GA調控。赤霉酸(GA3)誘導矮牽牛后得到4個GIP同源基因高表達[12];……

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