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北京地區南瓜病毒病病原種類鑒定

2018-06-13 06:01:50陳利達曹金強石延霞柴阿麗謝學文李寶聚
中國蔬菜 2018年6期
關鍵詞:檢測

陳利達 曹金強 石延霞 柴阿麗 謝學文李寶聚

(中國農業科學院蔬菜花卉研究所,北京 100081)

南瓜(Cucurbita moschata Duch.,中國南瓜)、筍瓜(Cucurbita maxima Duch. ex Lam.,印度南瓜)、西葫蘆(Cucurbita pepo L.,美洲南瓜)、墨西哥南瓜(Cucurbita mixta Pangalo)和黑籽南瓜(Cucurbita ficifolia Bouché)并列為世界上南瓜屬作物的5個栽培種(李昕升 等,2017)。南瓜因產量高、效益好,且具有一定的保健作用,成為我國北方地區菜糧兼用作物之一。據聯合國糧農組織(FAO)統計,2014年全世界南瓜產量約為2 519萬t,我國占世界當年總產量的28.74 %,居世界第1位(王璐,2017)。隨著南瓜種植規模的擴大,病毒病也愈發嚴重,成為制約南瓜產業發展的主要因素之一,尤其在高溫干旱的年份,嚴重影響南瓜的品質與產量。據報道,能夠侵染南瓜的病毒種類有80多種,其中小西葫蘆黃花葉病毒(Zucchini yellow mosaic virus,ZYMV)、黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)、西瓜花葉病毒(Watermelon mosaic virus,WMV)、 南 瓜 花 葉 病 毒(Squash mosaic virus,SqMV)、番木瓜環斑病毒(Papaya ringspot virus,PRSV)和馬鈴薯Y病毒(Potato viurs Y,PVY)(Lecoq et al.,1997;Fletcher et al.,2000;周賢,2013;劉嘉峪 等,2017)發生相對普遍。

近年來北京地區南瓜的種植面積逐年增加,南瓜病毒病危害日趨嚴重,本文針對北京周邊地區采集的疑似感染病毒病的南瓜葉片,采用反轉錄PCR(RT-PCR)技術進行檢測,以期了解北京地區南瓜上主要病毒種類及其分布,為當地南瓜病毒病的防控和抗病品種的選育提供參考。

1 材料與方法

1.1 樣品采集

2016~2017年,在北京周邊地區采集疑似感染病毒病的南瓜樣本(葉片)共84份:順義區32份、昌平區15份、大興區12份、海淀區25份。所采樣品均保存在-80 ℃冰箱備用。

1.2 試劑與儀器

試劑:TRIzol Reagent購自英濰捷基(上海)貿易有限公司;反轉錄試劑盒FastQuant RT Kit購自天根生物科技(北京)有限公司;2×Taq Mix(MT201)購自博邁德科技(北京)有限公司。

儀器設備:3K15型高速離心機,德國Sigma公司生產;DYY-6C型電泳儀,北京市六一儀器廠生產;移液槍,德國Eppendorf公司生產;Jel Doc 2001型凝膠成像系統、Bio-Rad S1000 PCR儀,美國伯樂公司生產。

1.3 植物總RNA提取

采用TRIzol法提取南瓜葉片總RNA。取100 mg南瓜葉片于液氮中研磨,將0.2 g粉末轉入1.5 mL離心管,迅速加入1 mL TRIzol試劑,振蕩混勻,室溫下靜置5 min;4 ℃下12 000 r·min-1離心10 min;將上清液轉入1.5 mL離心管,加入0.2 mL氯仿混勻,室溫放置5 min;4 ℃下12 000 r·min-1離心10 min;取水相(約400 μL)加入等體積的異丙醇,室溫下靜置10 min;4 ℃下12 000 r·min-1離心10 min;棄上清液,加入1 mL 75%乙醇洗滌沉淀2次,4 ℃下12 000 r·min-1離心5 min;自然干燥,加入50 μL RNase-Free ddH2O溶解;以健康南瓜葉片總RNA為陰性對照,-80 ℃保存備用。

1.4 南瓜病毒病樣本RT-PCR檢測

以提取總RNA為模板,用FastQuant RT Kit試劑盒反轉錄合成病毒的cDNA第一條鏈。使用已報道的 CMV-F/CMV-R、SqMV-1/SqMV-2、PRSV-F/PRSV-R和PVY-1/PVY-2特異性引物(表1)對不同樣本進行RT-PCR擴增,其中ZYMV-1/2和WMV-1/2是根據GenBank已有的病毒外殼蛋白基因(Coat Protein,CP)序列所設計。所用引物均由博邁德科技(北京)有限公司合成。

表1 用于南瓜病毒病分子檢測的引物信息

PCR擴 增 體 系:2×Taq PCR Master Mix 10 μL,上下游引物各 0.5 μL,cDNA模板 1 μL,ddH2O補足至20 μL。PCR擴增條件:94 ℃預變性 4 min;94 ℃變性 30 s,53 ℃退火 30 s,72 ℃延伸45 s,共34個循環;72 ℃補充延伸10 min。擴增結束后,取5 μL PCR產物于1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,使用全自動凝膠成像系統記錄結果。PCR產物送至博邁德科技(北京)有限公司進行測序,并利用NCBI序列比對工具BLAST(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/)程序,根據核酸序列同源性確定病毒種類。

2 結果與分析

2.1 RT-PCR擴增結果

對采集的84份南瓜病毒病樣本(葉片)提取總RNA,利用不同特異性引物進行RT-PCR檢測,部分檢測結果見圖1。待測樣品中引物CMV-F/CMV-R可擴增出大小735 bp的條帶(圖1-a),引物ZYMV-1/ZYMV-2可擴增出大小582 bp的條帶(圖1-b),引物WMV-1/WMV-2可擴增出大小697 bp的條帶(圖1-c),陰性對照均未擴增出目的條帶。表明在待檢樣品中能分別測出CMV、ZYMV和WMV,但未檢測到SqMV、PRSV、PVY。

圖1 南瓜部分樣品RT-PCR檢測結果

2.2 南瓜主要病毒種類檢測結果

對采集的84份南瓜病毒病樣本進行PCR檢測,其中79份病樣檢測顯示陽性,檢出3種病毒分別為CMV、ZYMV和WMV,病毒檢出率94.05%。其中CMV檢出率最高,可達52.38%;其次為ZYMV,檢出率44.01%;WMV檢出率14.29%(表2)。因此,CMV在北京地區南瓜上侵染最普遍,為優勢病毒種類。

北京不同地區南瓜病毒種類及發生程度有所差異(表2)。在南瓜植株上檢出的病毒種類最多的是順義區和海淀區,檢測到3種病毒,這2個地區南瓜病毒病發生最為嚴重;其次是昌平區和大興區,分別檢測出2種病毒,該地區病毒病危害較輕。

表2 北京地區南瓜病毒種類及分布

2.3 南瓜植株上病毒的復合侵染情況

北京地區84份南瓜病毒病樣品中,發現14份病樣為2種病毒復合侵染,復合侵染率為16.67%(表3)。其中,北京順義區南瓜病毒病復合侵染種類為CMV和ZYMV,侵染率為18.75%;海淀區南瓜病毒病復合侵染種類為ZYMV和WMV,侵染率為32.00%,未檢出3種病毒復合侵染。

表3 北京地區南瓜病毒復合侵染類型及分布

2.4 北京地區南瓜病毒病田間癥狀

圖2 南瓜病毒病田間發病癥狀

南瓜病毒病的發生可貫穿植株整個生長發育期,為系統性侵染。北京地區南瓜病毒病主要包括花葉、褪綠和皺縮等癥狀,經室內分子檢測后得知田間病毒種類為CMV、ZYMV和WMV 3種。CMV田間癥狀(圖2-a):葉片葉綠素分布不均,易出現黃色或淡黃色病斑。嚴重時葉片變小變脆,出現淺黃色部分斑駁,呈現黃綠分布不均的鑲嵌狀花葉癥狀。ZYMV田間癥狀(圖2-b):葉面出現花葉及斑駁癥狀,部分葉肉逐漸褪綠黃化,易出現明脈。嚴重時植株矮化,節間變短,葉緣卷曲形成雞爪狀,并常伴有蕨葉及葉面凹凸起伏癥狀。WMV田間癥狀(圖2-c):葉片變小變硬,葉緣部分失綠并伴有斑駁等癥狀。發病中后期植株表現皺縮矮化、葉片卷曲,發病嚴重時莖蔓變短,發病組織呈瘤狀突起。混合侵染的植株發病癥狀表現較為復雜,發病較重。CMV和ZYMV復合侵染后植株矮化,葉緣卷曲,葉片顏色變淺,出現蕨葉及葉面不平現象(圖2-d)。ZYMV和WMV復合侵染現象廣泛存在,其癥狀在葉片上表現明顯,葉片出現褪綠黃化,易形成深淺綠色相間花葉,伴有皺褶卷曲現象。有時葉緣處有斑駁突起,病株生長遲緩,開花結果后病情趨于加重(圖2-e)。

3 結論與討論

病毒病是制約南瓜生產的重要因素之一,隨著我國南瓜種植面積逐年增加,病毒病的危害日益加重,給南瓜生產造成嚴重的經濟損失。南瓜病毒病在我國長江地區、內蒙古、新疆、黑龍江等地普遍發生(馬英,2017)。不同地區引起南瓜病毒病的毒源種類不盡相同,新疆石河子地區南瓜病毒病毒源種類主要為CMV、ZYMV、WMV、PRSV-W(任琛榮 等,2016);黑龍江地區南瓜病毒病的毒源種類為CMV和WMV(楊國慧,2003)。本試驗結果表明,侵染北京地區南瓜的主要毒源有CMV、ZYMV和WMV 3種,未檢測到SqMV、PRSV、PVY等其他病毒,由于病毒分布具有區域性,目前SqMV只在黑龍江南瓜上有相關報道(李鳳梅,2002)。其他病毒種類也未檢出,可能是由于采樣數量少或部分南瓜植株病毒癥狀表現不明顯,導致漏采。在所有檢測樣品中CMV的檢出率較高,可能是由于CMV寄主范圍廣,可侵染1 000多種單、雙子葉植物(王海河 等,2001),且CMV可由60多種蚜蟲進行非持久性傳播,因此成為北京地區南瓜病毒病優勢毒源。此外,本次采集樣本共84份,其中有79份病樣顯示陽性,5份疑似感染南瓜病毒病,但在該樣本內未檢測到病毒,可能是生理性病害或藥害所致。

瓜類病毒復合侵染現象在不同地區均有報道,部分學者對我國瓜類主產區進行病毒種類調查,發現存在多種病毒復合侵染現象,其中以PRSV和WMV組合最為常見,占復合侵染組合的31.25%(尤毅 等,2016);重慶地區南瓜檢測樣品中有93.22%的樣品受2種以上病毒復合侵染(青玲 等,2010)。本試驗中2種病毒復合侵染率為16.67%,可能與連作、傳毒媒介、種子與土壤帶毒有關。尤其是昆蟲傳毒,CMV、ZYMV 、WMV均可通過蚜蟲進行傳播,部分蚜蟲可攜帶多種病毒進行再侵染,導致一種植株上出現2種或2種以上病毒復合侵染現象。也可能與病毒越冬習性有關,如國內學者在重慶地區對南瓜病毒病進行鑒定,發現農田周圍葎草上存在7 種病毒,且復合侵染的比例高達80%(青玲 等,2009)。CMV、ZYMV和WMV均為種傳病毒(楊國慧,2003),再加上田間管理不當、單一品種種植模式等,成為南瓜病毒病發生嚴重且存在復合侵染的主要原因。

本試驗已檢測出北京地區南瓜病毒病的毒源種類主要有CMV、ZYMV和WMV,但受采集數量和地域性的限制,無法涵蓋北京地區南瓜病毒所有種類,因此,是否存在其他病毒種類還有待進一步研究。

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