分子量陣列基因分析儀操作心得

摘要：分子量陣列基因分析儀已在科研實驗上使用多年，操作員積累了很多使用分子量陣列基因分析儀的經驗和技巧，這些實踐經驗和操作技巧的應用能夠有效的提高分子量陣列基因分析儀的使用效率。本文主要探討了分子量陣列基因分析儀的幾個應用，這些操作技巧的應用能使分子量陣列基因分析儀操作更加簡單，有效。

關鍵詞：質譜儀；點樣；軟件

Sequenom公司研發的分子量陣列基因分析儀已在市場上使用多年，在使用儀器的過程中，儀器操作員積累了大量操作經驗和技巧，這些操作經驗和技巧的應用可以提高操作員的工作效率，使得操作員的工作更加輕松，文章中將就Sequenom公司研發的分子量陣列基因分析儀的幾個操作技巧進行探討。在文章中儀器型號為MassARRY Analyzer 4，所使用的軟件版本為typer4.0。

1 點樣

MassARRY Analyzer 4分為兩部分組成，分別是點樣儀和質譜儀，點樣儀的作用就是把前期處理好的樣品轉移到芯片上，然后在把芯片放入質譜儀里面通過掃描而得到實驗數據。

1.1 清洗點樣儀

由于點樣儀所使用的點樣針是固定的，所以為了保持它的清潔，我們要對它進行清洗工作，清洗工作分周洗和日洗，周洗就是每周一次把點樣針浸泡在NaOH中，日洗就是在每日使用前需要用100%乙醇浸泡點樣針。

具體操作如下：打開點樣儀，輸入用戶名和密碼，進入主頁—TOOLS—SOLUTION（Drain排空機器剩余乙醇）—SOLUTION（Fill移動點樣針），把儀器上的乙醇瓶取出倒入100%乙醇并放入儀器，取出新的384孔板，在板子的A1到A6，B1到B6，C1到C6，D1到D6，24個孔中加入NaOH，并把板子固定在MTP1位置。

再次進入主頁—TOOLS—WEEKLY，這時儀器就會把點樣針浸泡入剛放NaOH的384孔板中進行周洗，此過程需要10分鐘，周洗結束后顯示屏界面依舊停留在TOOLS界面，選擇DAILY，這時儀器就會把點樣針浸泡入乙醇中進行日洗，此過程需要30分鐘。清洗結束后我們依然在TOOLS界面點擊SOLUTION（Drain排空機器剩余乙醇） —SOLUTION（Fill移動點樣針），取出乙醇瓶倒入50%乙醇并放入儀器。注意：點樣過程中清洗點樣針的乙醇濃度和日洗的乙醇濃度是不一樣的。

1.2 點樣位置的設置

取出新的芯片放到Scout Plate位置，把處理好的樣品板放到MTP1位置，取30ul標準品加入儀器的標樣收集孔里。回到顯示屏主頁 →MAPPING →選384 MTP →next →選24 PIMS →next →選384 SPECTROCHIPS →netx →選1 →next →MTPs1 →next，此時就根據實際情況選擇芯片與樣品板之間的位置，選完之后點save，在彈的對話框Type Mapping Filename中輸入要取的名字，如“1”。

1.3 儀器點樣參數的設置

再次回到顯示屏主頁 →METHODS，在Mapping File這里點OPEN，彈出的對話框選擇“1”即剛剛建立的Type Mapping Filename，Analysis這欄選volume check，SpectroCHIPs選1。在頁面最下方點擊cleaning，進入cleaning界面，Cleaning Sequence欄里rinse，dry（rinse），wash，dry（wash），4個選項都選上。頁面下方點擊aspirate/dispense，operation欄里選擇analyte&calibrant，Saveback。

1.4 點樣操作

顯示屏主頁 →TRANSFER，點擊屏幕右上方的open，選擇“1” →ok，點擊右下方的step，此時點樣針會把樣品點到芯片上一次，然后我們可以根據點樣針上方自帶的攝像頭看到點樣量的大小，點樣量的大小可以根據在METHODS →aspirate/dispense頁面里的dispense settings攔下dispense speed數值大小調節。數值越大，點樣量越大，反之越小。點樣量沒問題后就在TRANSFER界面上直接點右下方的run就可以完成全部點樣操作了。

2 質譜儀的使用

（1）打開連接質譜儀的電腦，點擊star →All Programs → Sequenom → Typer 4.0.20 → Typer 4.0.20，此時彈出MassARRAY Typer對話框，點擊Assay Editor輸入服務器名稱，用戶名和密碼，單擊Connect。在出現的對話框里導入所做實驗的位點信息。

（2）在MassARRAY Typer對話框上，點擊Plate Editor，在出現的對話框里建立樣品板的名字，位點信息，樣品信息→save。

（3）打開ChpLinker軟件，選中此次實驗的樣品板名，在Chip Barcode欄輸入芯片名→Add→Create。

（4）打開MassARRAY Anlyzer 4軟件，Mass Spectrometer Controls→Automatic Run Setup→Chip 1（Chip 2）選擇此次實驗的芯片名→Stat Autorun，此時儀器就自動運行，我們就只要等結果出來就好了。

總結起來，分子量陣列基因分析儀利用飛行時間質譜對核酸樣本進行高精度定性、定量分析，無需借助熒光染料等替代標記物，實驗結果精確、靈敏、特異性強。高分辨率排除非特異性背景信號干擾 相比于其他方法，在絕對定量方面具有更高的精確度技術是全球唯一利用高精度質譜技術對核酸進行分析的系統 MassARRAY技術通量大且靈活，單張芯片完成個生物樣本的高通量篩查，適合數百個位點，數千數萬生物樣本的分析實驗，在通量方面更加靈活，成本更低。

作者簡介：楊峰平（1982），男，漢族，上海金山人，實驗師，主要從事實驗技術與實驗儀器操作方面工作。