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環狀RNA與癌癥關系的研究進展

2018-03-31 10:57:34房樹志房遠
生物技術通訊 2018年1期
關鍵詞:胃癌

房樹志,房遠

中國人民解放軍第264醫院,山西 太原 030001

RNA家族可分為編碼RNA和非編碼RNA兩大類,而其中非編碼RNA包括長鏈非編碼RNA(lncRNA)、核 糖 體 RNA(rRNA)、轉 運 RNA(tRNA)、核小RNA(snRNA)及微小RNA(miRNA)等。有一類特殊的非編碼RNA,不存在5′和3′端,呈閉合環狀結構,這就是環狀RNA(circular RNA,circRNA)[1]。20世紀 70年代,環狀 RNA 在病毒中首次被發現,隨后在真核細胞中也發現環狀RNA的存在,但由于技術水平限制,環狀RNA被認為是垃圾分子、“暗物質”[2]。隨著科學技術的發展,尤其是二代測序技術的應用,人們發現環狀RNA在真核細胞中廣泛存在,并具有一定的生物學功能。

1 環狀RNA的特點

由于其特殊的環狀結構,環狀RNA不具有5′端帽子結構和3′端polyA尾,不易被核酸外切酶RNaseR降解,與其他非編碼RNA相比可以更穩定地存在[1,3]。大部分環狀RNA由外顯子形成,少數來源于內含子或內含子片段,然而同一個基因序列既可以轉錄成線性RNA,又可以轉錄成環狀RNA。大部分環狀RNA定位于細胞質中,少數定位于細胞核內,具有很強的組織、時序和疾病特異性[1,4]。如ciRS-7在腦組織中高表達,而在其他組織中表達量很低。多數環狀RNA為高度保守序列,僅有少數在進化上不保守[5]。

2 環狀RNA的功能

多數環狀RNA能在轉錄或轉錄后水平發揮調控作用,少數只能在轉錄水平發揮作用[1]。環狀RNA可以充當miRNA分子海綿,與miRNA相互作用。2014年,發表在《Nature》上的一篇文章首次證實了環狀RNA具有特異性結合miRNA的功 能[2]。 環 狀 miRNA ciRS-7(circularRNA sponge for miR-7)上有超過70個miR-7的結合位點;進一步功能研究發現ciRS-7能夠強烈抑制miR-7的活性,進而激活miR-7的下游基因;并且,還發現環狀RNA SRY-9可以作為miR-138的分子海綿[6]。這表明環狀RNA作為miRNA的分子海綿可能是一個普遍現象。此外,環狀RNA還可以通過競爭性調控經典RNA剪接、與snRNA或RNA合成酶Ⅱ相互作用等功能,參與轉錄及轉錄后調控[7-8]。

3 環狀RNA與癌癥

研究顯示,在多種癌癥組織與癌旁正常組織中,環狀RNA的表達存在差異,說明環狀RNA可作為新興腫瘤生物標志物,并可能參與腫瘤發生發展過程中的基因調控。

3.1 環狀RNA可作為新興癌癥生物標志物

Fu等[9]采用高通量測序技術獲得環狀RNA在肝細胞癌中的表達譜,并通過q-PCR技術證實環狀RNA hsa_circ_0004018在肝細胞癌中的表達量明顯低于癌旁正常組織;并且,hsa_circ_0004018的低表達與一些臨床指標存在相關性,如血漿AFP、腫瘤直徑、分化和TNM分期等;更為重要的是,從肝炎組織到肝硬化組織再到肝癌組織,hsa_circ_0004018的表達量呈梯度降低,在肝癌組織中的表達量明顯低于前兩者,說明hsa_circ_0004018存在肝細胞癌階段特異性表達特征。

Li等[10]通過對比101對胃癌組織與癌旁正常組織中環狀RNA水平,發現hsa_circ_002059的表達量在胃癌組織中明顯降低(P<0.001)。在36對術前術后胃癌患者血漿中,環狀RNA hsa_circ_002059的表達水平也明顯不同,ROC曲線下面積可達到0.73。更重要的是,hsa_circ_002059的表達與胃癌關鍵臨床指標有很強的相關性,如遠處轉移(P=0.036)和TNM分級(P=0.042)。因此,Li等指出環狀RNA has_circ_002059可作為一種新型的穩定的生物標志物,并在胃癌的臨床診斷中得到應用。

Xuan[11]通過基因芯片分析技術,對比了4對食管鱗狀細胞癌組織及癌旁正常組織中環狀RNA的表達,發現在698個被檢測到的環狀RNA中,302個在癌癥組織中呈上調趨勢,396個在癌組織中呈下調趨勢。隨后,作者通過qRT-PCR技術進一步檢測明顯上調的環狀RNA hsa_circ_100855,結果顯示hsa_circ_100855在癌癥組織與癌旁正常組織中的表達存在明顯差異,并且在TNM 3~4期和頸淋巴結轉移或分化差的病人中的表達量更高,說明hsa_circ_100855可以作為預測、診斷食管鱗狀上皮癌生物標志物。

三期胃癌根治性術后常有復發,因此Zhang等[12]希望通過研究環狀RNA這種新型的生物標志物,預測三期胃癌根治術后的復發情況。作者從3071個環狀RNA中挑選46個在胃癌組織和癌旁正常組織中存在差異的環狀RNA,其中8個在復發病人癌灶和癌旁正常組織中存在明顯差異。在隨后的隊列研究中,通過單因素及多因素cox回歸分析,發現4個環狀RNA,即hsa_circ_101308、hsa_circ_104423、hsa_circ_104916、hsa_circ_100269的表達差異最為明顯。作者依據此4個環狀RNA,將胃癌病人分為高危組和低危組。在測試隊列和驗證隊列中,高危組術后復發率明顯高于低危組。因此,作者認為以這4個環狀RNA為基礎建立的分類方法,對于三期胃癌術后復發的早期預測有一定的指導意義。

3.2 環狀RNA在癌癥發生、發展中的作用

環狀RNA可以作為分子海綿結合miRNA,從而在轉錄后水平調節基因的表達,參與癌癥的發生發展。

Li等[13]證實circ-ITCH作為miRNA分子海綿,具有多個miRNA結合位點,包括miR-7結合位點、miR-17結合位點和miR-214結合位點等。并且,這些miRNA常常與癌癥有關,如miR-7表達水平的升高與食管鱗狀上皮癌相關,miR-17可以作為診斷食管鱗狀上皮癌的生物標志物,miR-214在卵巢癌和胃癌中表達升高,miR-216b在鼻咽癌發生中起抑制作用。此外,circ-ITCH可提高ITCH的水平,激發泛素介導的磷酸化Dvl2降解,從而抑制在癌癥中發揮重要作用的Wnt/βcatenin通路。致癌基因c-Myc是Wnt信號通路的下游靶點,作者證實環狀RNA circ-ITCH可以影響c-Myc的表達。

Xie[14]等發現,環狀RNA circ_001569雖然不能影響miR-145的表達,但可影響其轉錄,從而提高miR-145下游靶點(E2F5、BAG4、FMNL2)的表達水平。E2F5、BAG4、FMNL2在結直腸癌癌組織中高表達,并在結直腸癌的發生發展中起重要作用。這些靶點通過抑制細胞周期停滯及細胞凋亡,從而至少部分上促進結直腸癌癌細胞的生長,并可以提高結直腸癌癌細胞的侵襲能力。

Zhong等[15]通過基因芯片技術,發現環狀RNA circTCF25在膀胱癌中的表達與癌旁組織存在明顯差異。并且circTCF25可成為miR-103a-3p、miR-107的分子海綿,而 miR-103a-3p、miR-107與13個增殖、轉移及侵襲相關的靶點功能上調有關。隨后,作者證實circTCF25的過表達能夠下調miR-103a-3p及miR-107,提高CDK6表達,從而促進體內、外癌細胞的增殖和轉移。此研究為探討環狀RNA在膀胱癌中的作用打下了基礎。

Zhang等[16]發現,hsa_circ_100269在胃癌組織中的表達量明顯降低(P<0.01)。隨后,作者通過使用Target-Scan和miRanda預測到miRNA-630可與hsa_circ_100269結合,并發現miR-630在胃癌組織中高表達(P=0.006),與hsa_circ_100269的表達量明顯負相關(r=-0.688)。Zhang等通過雙螢光素酶報告系統證實miR-630是hsa_circ_100269作用的直接靶點。并且,在hsa_circ_100269表達的細胞中,miR-630表達量降低,胃癌細胞的增殖受到抑制。說明環狀RNA hsa_circ_100269可通過與mi630相互作用,參與胃癌的發生發展。為環狀RNA參與疾病過程機制提供了新思路。

4 結語

目前,環狀RNA的研究仍處于起步階段,而癌癥是一種復雜疾病,其發生發展與多種因素相關。現階段研究表明環狀RNA具有成為癌癥生物標志物的潛能,并參與癌癥調控。更加深入的機制研究可為癌癥的診斷與治療打開新局面。

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