黃云峰 黃致敬 羅燕飛 陸霜霜
【摘要】隨著先進(jìn)分子遺傳學(xué)檢測技術(shù)的發(fā)展,常用的二代測序技術(shù)和拷貝數(shù)檢測技術(shù)日益成熟,其檢測價格有所下降,并得以大量用于臨床診斷與治療中,基于此,兒科神經(jīng)系統(tǒng)疾病診斷水平取得飛速的發(fā)展。但這些新技術(shù)的使用,也會帶來一定的挑戰(zhàn)和問題,例如:如何挑選恰當(dāng)?shù)臋z測技術(shù)、如何解讀檢測結(jié)果等。因此,本文針對相關(guān)檢測技術(shù)做一個總結(jié),以期為類似研究提供參考。
【關(guān)鍵詞】遺傳病檢測技術(shù);兒科;神經(jīng)系統(tǒng)疾??;診治
【中圖分類號】R446 【文獻(xiàn)標(biāo)識碼】A 【文章編號】ISSN.2095-6681.2018.31..01
近些年,我國遺傳病檢測技術(shù)發(fā)展迅速,已經(jīng)基本上可以與世界同步。但也有一些新檢測技術(shù)處于起步應(yīng)用階段,因此,需要面臨一系列的挑戰(zhàn)和問題?;诖?,本文進(jìn)行一個簡單的概括,以供與兒科同行一起研究與討論。
1 第二代測序技術(shù)分析
與第一代測序技術(shù)比較,第二代測序技術(shù)具有測速費用低、速度塊等優(yōu)點,支持邊合成邊測序操作,從而在臨床疾病檢測中得到廣泛的使用?,F(xiàn)階段,主要包含以下幾種:全基因測序就是針對某種生物基因組內(nèi)的所有基因展開測序,可以真實展現(xiàn)整個生物體所有的遺傳信息;全外顯子測序(WES)則是運用目標(biāo)序列的捕獲技術(shù),對基因組所有外顯因子進(jìn)行捕獲操作,并實施高通量測序的技術(shù)[1]。與全基因組測序比較,這種技術(shù)在包含蛋白編碼信息的基礎(chǔ)上,展現(xiàn)出成本低、測序周期短、便于分辨數(shù)據(jù)等優(yōu)勢[2]。但這種技術(shù)也有一定的局限性,難以了解非編碼序列是否出現(xiàn)改變,無法全面的了解基因組狀況。疾病靶向序列測序技術(shù)(DTS)工作原理與全外顯子測序,就是先要捕獲目標(biāo)需求,隨之開展高通量測序。按需定制主要優(yōu)勢在于,能夠與某一類疾病、臨床表現(xiàn)有關(guān)的致病因子整合在一個基因測序包內(nèi)實施高通量測序操作,尤其適合用于臨床遺傳性病因異質(zhì)性強疾病檢測中[3]。DTS主要優(yōu)點為目標(biāo)區(qū)域比較集中,測序成本有所下降,有利于縮短測序及數(shù)據(jù)分析所用周期,進(jìn)而滿足臨床診斷要求。如今,DTS得以廣泛用于臨床診斷中,包含癲癇、先天遺傳代謝病、智力障礙等。上述疾病具有較強的異質(zhì)性,對于標(biāo)本取材、診斷比較困難的疾病,DTS因具有創(chuàng)傷小、可以同時檢測引起類似表現(xiàn)的幾十種甚至上百種基因優(yōu)點,能夠提前到臨床診斷后,在神經(jīng)病理等信息之前展開檢測。必須注意,DTS也有一些不足之處,主要表現(xiàn)為:無法檢測出未知致病基因;DTS基因包可能優(yōu)于設(shè)計缺陷,導(dǎo)致所納入已知基因并不全面,導(dǎo)致發(fā)生關(guān)鍵遺傳信息遺漏的情況;新疾病或者表型有關(guān)基因被發(fā)現(xiàn),DTS納入的基因需要不斷進(jìn)行更新,因此,優(yōu)秀的DTS檢測包需要定期更新納入基因。
2 拷貝數(shù)檢測技術(shù)分析
該技術(shù)主要由多重連續(xù)探針擴增技術(shù)(MLPA)、微陣列比較基因組雜交(aCCH)組成,其中,aCCH是在芯片上使用攜帶不同熒光素的樣本和正常對照樣本展開共雜交,此時,發(fā)現(xiàn)相對于正常對照樣本基本組可知,病例樣本基因組DNA拷貝數(shù)發(fā)生改變。aCGH檢測技術(shù)的優(yōu)勢在于,用來進(jìn)行單次檢測的DNA樣本量比較少,可以覆蓋整個基因組,且具有較高的分辨率[4]。而在國內(nèi),使用aCGH技術(shù)最主要的問題在于價格,從技術(shù)方面分析,aCGH無法檢測小于2 kb的DNA片段缺失或者重復(fù)情況。MLPA就是運用探針和目的DNA序列實施雜交處理,依托連接、產(chǎn)物電泳分離等步驟對目的DNA序列展開定性及半定量分析技術(shù)[5]。MLPA展現(xiàn)出試驗周期短、操作方便等優(yōu)勢,進(jìn)一步確定基因是否重復(fù)或者缺失。與上一種技術(shù)對比,該技術(shù)的缺點在于,一次檢測區(qū)域范圍有一定的閑置,無法覆蓋整個基因組。MLPA技術(shù)的優(yōu)點是,其價格明顯低于aCGH,且操作簡單,能夠快速分析數(shù)據(jù),獲得良好的檢測信息。不得不說,雖然遺傳性檢測用于兒科神經(jīng)系統(tǒng)疾病診治的作用越來越大,也需要清晰地看到每一種技術(shù)的局限性。例如:無法準(zhǔn)確展開查體操作,確定患者臨床癥狀及體征,將共濟失調(diào)誤診為肌無力,那么,就無法正確挑選疾病靶向測序包,由于肌無力和共濟失調(diào)作為兩個不同的疾病靶向測序包,還必須了解所用測序包是否滿足自己檢測的目的。此外,還必須向患兒家長說明遺傳性檢查在臨床診治中的應(yīng)用價值。因此,不要濫用遺傳學(xué)檢測技術(shù),醫(yī)者需要在與家
長進(jìn)行充分的溝通之后,由家長決定是否讓孩子接受檢測。
3 結(jié) 論
綜上所述,優(yōu)于遺傳學(xué)檢測技術(shù)的迅速發(fā)展,檢測成本明顯下降,檢測準(zhǔn)確的得到相應(yīng)的提高。我們可以相信,遺傳學(xué)檢測會稱為臨床一種有效的技術(shù)手段用于兒科神經(jīng)系統(tǒng)診療工作中,不僅可以準(zhǔn)確診斷病情,也能為評估患者預(yù)后情況、特異性治療提供一定的依據(jù)。
參考文獻(xiàn)
[1] 胡 林,李煥錚,欒兆棠,等.應(yīng)用全外顯子測序技術(shù)對一個Escobar綜合征家系進(jìn)行基因突變分析[J].中華醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)雜志,2017,34(2):209-212.
[2] 謝 華,呂凌云,高志杰,等.探索全外顯子測序在兒童神經(jīng)發(fā)育障礙中的診斷價值[J].中華檢驗醫(yī)學(xué)雜志,2017,40(8):623-629.
[3] 劉維強,張慧敏,李浩賢,等.全外顯子及靶向文庫捕獲測序在多囊腎病基因診斷中的應(yīng)用比較[J].分子診斷與治療雜志,2017,9(5):301-307.
[4] 劉旭霞,姜騰勇,郭 俊,等.目標(biāo)基因捕獲測序技術(shù)檢測1例肥厚型心肌病致病基因突變[J].臨床檢驗雜志,2014,32(5):333-336.
[5] 張麗娜,梁立陽,孟 哲,等.應(yīng)用微陣列比較基因組雜交技術(shù)對55例智力低下/發(fā)育遲緩患兒基因組拷貝數(shù)變異的分析[J].中國兒童保健雜志,2014,22(8):795-798.
本文編輯:趙小龍