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鯉春病毒RT-PCR檢測方法的建立與應用

2017-11-17 06:23:18肇慧君
獸醫導刊 2017年16期
關鍵詞:實驗檢測方法

吳 斌 趙 娜 張 琳 肇慧君

(遼寧出入境檢驗檢疫局,遼寧大連 116000)

鯉春病毒RT-PCR檢測方法的建立與應用

吳 斌 趙 娜 張 琳 肇慧君

(遼寧出入境檢驗檢疫局,遼寧大連 116000)

本文根據鯉春病毒糖蛋白設計并合成引物,對SVCV進行擴增鑒定,對所建立的RT-PCR方法進行靈敏度和特異性實驗,實驗結果表明,只有SVCV能夠擴增出特異性片段,大小為714bp,對照組核酸均沒有擴增,表明所設計的引物具有良好的特異性,方法的靈敏度為10-5。利用建立的方法對人工感染SVCV的鯉魚進行檢測,實驗結果表明,2個感染樣品中均檢出SVCV病毒。本實驗建立的RT-PCR為SVCV檢測診斷提供了新的技術手段。

鯉春病毒(SVCV);RT-PCR;特異性;靈敏度;人工感染

鯉春病毒血癥(Spring viraemia of carp,SVC)是一種由鯉春病毒(SVCV)引起的急性出血并伴有高度傳染的流行病,對漁業生產將帶來極大危害甚至是毀滅性的風險。鯉科是SVCV最容易感染的魚類,一般在鯉、錦鯉、草魚、鰱、鳙、鯽等魚中都能夠產生明顯的病癥,但鯉是這幾種魚中最敏感的宿主,SVC發病的特征為腹部漲水、魚體滲血、發病急并且死亡率很高,通常在春季暴發并引起急性死亡。SVC最早流行于歐洲、中東和俄羅斯,2008年,我國將鯉春病毒血癥列為一類動物疫病并添加在新頒布的動物疫病名錄中[1]。本文建立了SVCV的RT-PCR檢測方法。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 病毒

實驗室保存的凍存毒株,經細胞系FHM增殖得到SVCV,用于特異性分析的傳染性胰腺壞死病毒(IPNV)、傳染性造血器官壞死病毒(IHNV)、病毒性出血敗血癥病毒(VHSV)均為實驗室保存。

1.1.2 儀器和試劑

(1)儀器

RT-PCR儀:美國ABI公司生產的9700PCR儀。

電泳儀:美國Bio-rad生產的A101439。

(2)試劑

PrimeScript?OneStepRT-PCRKitVer.2(DyePlus)、TaKaRaMiniBESTViralRNA/DNAExtractionKitVer.5.0購自寶生物公司。

1.2 方法

1.2.1 引物設計

根據SVCV糖蛋白基因設計引物并由寶生物(大連)有限公司合成(表1)。

表1 SVCV RT-PCR引物

1.2.2 一步法RT-PCR

反應總體系為50μl,分別為2×One-Step Buffer25μL,PrimeScript 1 Step Enzyme Mix2μL,RT-PCR Forward Primer(10uM)1μl,RT-PCR Reverse Primer(10uM)1μL,DEPC處理的滅菌雙蒸15μl,將 5μL的RNA加入到體系中,充分混勻,簡單離心,置于PCR儀中。反應條件為:50℃逆轉錄30min,min,95℃預變性2 min,95℃ 1min、55℃ 1min、72℃ 1min s,35個循環,最后 72℃ 延伸10min,4℃保存。PCR 產物用 1.5 %的瓊脂糖凝膠電泳(90V,15min)進行分析。

2 結果與討論

2.1 病毒擴增鑒定結果

在病毒提取完畢后,對所提取的RNA進行RT-PCR擴增,其擴增產物經1.5%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,標準條帶為Marker 2000,其電泳圖片如下。結果表明,SVCV具有清晰明顯的條帶,大小為714bp。

圖1 SVCV擴增RT-PCR產物電泳結果

2.2 特異性實驗結果

根據合成的兩條引物對VHSV、SVCV、IPNV、IHNV進行特異性擴增實驗,結果如圖2,只有SVCV出現清晰明顯的條帶,大小為714bp,其他三種核酸沒有特異性條帶出現。

圖2 特異性實驗PCR電泳圖

2.3 敏感性實驗結果

將已測定病毒的SVCV進行10倍稀釋,按照1.2.3進行RNA提取,以10 倍系列稀釋RNA10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、陽性對照為模板,進行RT-PCR 敏感性檢測,結果顯示該方法的最低可以檢測出10-5(圖3)

圖3 靈敏性實驗PCR電泳圖

2.4 對人工感染鯉魚鑒定結果

人工感染的草鯉魚,在注射的第四周末出現無目的漂游,與對照組相比較,沒有積極進食表現。第五周后病魚體色深,腹部腫大(如圖4 A),皮膚有明顯出血現象(圖4B,C),出現感染鯉春病毒血癥的典型癥狀。

圖4 出現典型癥狀的實驗組魚和健康草鯉魚魚對比圖

人工感染的帶有典型病癥的鯉魚樣品RNA經過RT-PCR擴增產物經瓊脂糖凝膠電泳結果顯示。其中,經人工感染SVCV的病魚樣品RNV通過RT-PCR得到的產物,經1.5%的瓊脂糖凝膠電泳得到的結果如圖5,SVCV病魚樣品的到了與陽性質粒與相同大小的片段714bp,說明鯉魚被成功感染鯉春病毒。

圖5 感染SVCV病魚樣品RT-PCR結果圖

3 結論

本文根據鯉春病毒糖蛋白設計并合成引物,對SVCV進行擴增鑒定,對所建立的RT-PCR方法進行靈敏度和特異性實驗,實驗結果表明,只有SVCV能夠擴增出特異性片段,大小為714bp,對照組核酸均沒有擴增,表明所設計的引物具有良好的特異性,方法的靈敏度為10-5。因為普通RT-PCR和套式PCR相結合的方法可以增強實驗靈敏度、增強檢測的敏感性、可靠性。利用建立的方法對人工感染SVCV的鯉魚進行檢測,實驗結果表明,2個感染樣品中均檢出SVCV病毒。本實驗建立的RT-PCR為SVCV檢測診斷提供了新的技術手段。

[1]王姝,徐立蒲,王靜波,等.鯉春病毒血癥風險分析[J].北京農業,2012,(18):107-110.

[2]鄒勝利.水皰性口炎病毒與Monocyte和MoDC的互作研究[D].浙江理工大學,2015.

[3]劉葒.聚合酶鏈式反應和基因芯片技術的研究及在主要水生動物病毒檢疫和監測中的應用[D].華中農業大學,2004.

[4]郭闖,陳靜,劉訓猛,等.間接ELISA方法快速檢測鯉春病毒(SVCV)的初步研究[J].金陵科技學院學報,2012,28(4):79-81.

[5]歐陽征亮.鯉春病毒血癥病毒(SVCV)糖蛋白DNA疫苗的構建及免疫效果的評估[D].中山大學,2007.

國家質檢公益項目(201410059)

吳斌(1968—),女,遼寧大連人,博士研究生,研究員,主要從事水生動物疫病研究。

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