王曉峰,張天夫,劉 新,劉曉軍
(1.吉林大學中日聯誼醫院 口腔科,吉林 長春130033;2.吉林大學中日聯誼醫院 婦產科)
CD133基因啟動子的克隆與序列分析
王曉峰1,張天夫1,劉 新1,劉曉軍2*
(1.吉林大學中日聯誼醫院 口腔科,吉林 長春130033;2.吉林大學中日聯誼醫院 婦產科)
近些年來,口腔頜面部惡性腫瘤的發病率逐年增加[1]。雖然目前針對惡性腫瘤的治療手段有了很多新的進展,但仍有部分腫瘤患者不能治愈。自從腫瘤干細胞(CSCs)理論提出后,給腫瘤患者帶來了新的曙光[2]。有研究表明,CD133是某些頭頸部腫瘤干細胞的表面特異性標記[3,4],我們推測CD133+細胞可能是頭頸部腫瘤的干細胞。所以我們克隆了CD133基因的啟動子并對其進行序列分析,為進一步探究CD133基因與腫瘤干細胞之間的關系提供新的理論基礎。
1.1 主要試劑
DH5α菌株和質粒,來源于吉林大學中日聯誼醫院科研中心。DNA Marker及限制性內切酶SpeI、MluI(日本Takara 公司)。限制性內切酶PacⅠ,SalⅠ(英國NEB公司)。Trans2K Plus DNA Marker(上海寶曼生物技術公司)。Blood gDNA Miniprep Kit(美國Biomiga公司)。引物合成(上海生工技術有限公司)。
1.2 人CD133基因啟動子的克隆
1.2.1 DNA提取及PCR引物設計 按試劑盒說明書進行外周血細胞基因組DNA的提取,并電泳鑒定。從Genbank數據庫獲得人CD133基因啟動子的DNA序列,PCR產物的長度為1 810 bp。設計引物如下:
上游引物: 5’-GTAGTCGACCTTCAGTGCCTCTTTCAGT-3’;下游引物5’-GCCTTAATTAAGTGGGGATCTGCCTCAGTC-3’。
1.2.2 PCR反應 以人外周血基因組DNA為模板進行PCR反應,反應產物經電泳鑒定。進行PCR產物的回收,產物電泳鑒定后于-20℃保存。
1.2.3 DH5α感受態細菌的制備及CD133基因啟動子PCR產物TA克隆 制備DH5α感受態細菌, -80℃保存。進行CD133基因啟動子PCR產物的T-A連接,16℃,30 min。
1.2.4 重組質粒的提取 將TA連接產物進行轉化,進行重組質粒的提取,電泳鑒定。
1.2.5 重組質粒的酶切鑒定 對提取的重組質粒pMD18-pCD133進行酶切,電泳鑒定。
1.2.6 重組質粒測序鑒定 將酶切鑒定的重組質粒進行擴增,進行DNA測序。
2.1 人CD133基因啟動子克隆的PCR結果
PCR產物經電泳檢測,可看到一清晰的擴增帶出現在1 810 bp附近,符合設計的人CD133基因啟動子的長度,電泳結果見圖1。

1:人CD133基因啟動子PCR產物; M:DNA marker D2000
2.2 酶切鑒定重組質粒pMD18-CD133的結果
應用限制性內切酶PacⅠ和SalⅠ-HF雙酶切質粒pMD18-CD133,酶切產物經電泳鑒定,在1 810 bp附近出現與CD133啟動子片段長度相符的電泳帶,酶切結果見圖2。
2.3 CD133的測序結果
應用Blast軟件進行測序,結果見圖3。

1:重組質粒pMD18-pCD133 ;M:DNA marker 2000;2:pMD18-pCD133經PacⅠ和SalⅠ-HF雙酶切
圖2 酶切鑒定pMD18-pCD133瓊脂糖凝膠電泳圖譜
現階段針對口腔頜面部惡性腫瘤的治療手段越來越多,但治療效果仍然不理想,復發率和轉移率依然很高。腫瘤干細胞理論的報道[2]給我們帶來曙光。尋找腫瘤細胞表面特異性標記物,通過篩選腫瘤干細胞,將會為進一步研究腫瘤發生、發展和預后帶來新的希望。目前研究表明,CD133 可能是很多腫瘤干細胞的表面標志。因此我們進行了CD133基因啟動子的克隆及序列分析,為進一步探究CD133基因的調控機制提供新的理論依據。

圖3 重組克隆質粒pMD18-T-CD133測序圖
[1]Parkin DM,Bray F,Ferlay J,et al. Global cancer statistics,2002[J]. CA Cancer J Clin,2005,55(2):74.
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[4]Moon Y,Kim D,Sohn H,et al.Effect of CD133 overexpression on the epithelial-to-mesenchymal transition in oral cancer cell lines[J].Clin Exp Metastasis,2016,33(5):487.
吉林省教育廳“十三五”科學技術項目(JJKH20170822KJ) 吉林省直衛生專項項目(sczsy201525)
1007-4287(2017)08-1428-02
2017-04-21)
*通訊作者