林元震,張衛華,程 玲,張心菲,張鑫鑫,
(1 華南農業大學 林學與風景園林學院/廣東省森林植物種質創新與利用重點實驗室,廣東 廣州 510642;2 廣東省林業科學研究院,廣東 廣州 510520)
基于空間效應與競爭效應的林木遺傳分析模型
林元震1,張衛華2,程 玲1,張心菲1,張鑫鑫1,2
(1 華南農業大學 林學與風景園林學院/廣東省森林植物種質創新與利用重點實驗室,廣東 廣州 510642;2 廣東省林業科學研究院,廣東 廣州 510520)
【目的】建立空間效應與競爭效應的分析模型,以提高林木遺傳評估的準確性. 【方法】利用R軟件及其程序包breedR模擬數據,結合實測數據,采用XFA1結構擬合加性效應、近鄰競爭效應和AR1結構擬合空間效應,建立隨機區組設計模型(RCBM)、空間模型(SM)、空間與測量誤差模型(SUM)和空間與競爭模型(SCM),運行ASReml估算遺傳參數,進行模型比較。 【結果】對于模擬數據,估計的參數結果均顯示 SCM是最優模型,其大大降低了隨機誤差方差,隨機誤差方差分別由7.56(RCBM)、5.72(SUM)降低到3.13(SCM),分別降低了58.6%、45.3%,并估算到四周近鄰競爭方差;SCM模型估算的單株狹義遺傳力在0.40左右,高于RCBM(0.24)和SUM模型(0.30);設置參數的不同初始值,SCM估計的參數結果均較為穩定;對于實測數據,估算結果與模擬結果比較一致。 【結論】SCM模型是新的單株混合模型,可用于林木遺傳分析。
空間效應;競爭效應;單株混合模型;REML;遺傳分析
Key words:spatial effect; competition effect; individual-tree mixed model; REML; genetic analysis
林木遺傳改良通常需在田間試驗基礎上,估算參試樣本(種源、家系、單株或無性系)目標性狀的遺傳參數,并運用一定的評價方法篩選出具有優異目標性狀的種源、家系或無性系[1]?!?br>