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DNA條形碼在新型毒品原植物恰特草種屬鑒定中的應用研究

2017-08-01 00:01:02申鈺柯劉陳業(yè)陳鵬升陳云霞
森林公安 2017年3期
關鍵詞:數(shù)據(jù)庫植物研究

申鈺柯 劉陳業(yè) 周 旦 陳鵬升 陳云霞

DNA條形碼在新型毒品原植物恰特草種屬鑒定中的應用研究

申鈺柯 劉陳業(yè) 周 旦 陳鵬升 陳云霞

毒品原植物是指用來提煉、加工成鴉片、海洛因、甲基苯丙胺、嗎啡等麻醉藥物和精神藥物的原植物。其中罌粟、古柯、大麻被稱為世界三大毒品原植物。恰特草作為一種新型毒品原植物近兩年被大量走私入境。

恰特草(Catha edulis),又名:巧茶、也門茶、阿拉伯茶、埃塞俄比亞茶等,屬衛(wèi)矛科(Celastraceae)巧茶屬(Catha)植物,產(chǎn)于東非和阿拉伯半島等地區(qū)。其含興奮化學物質(zhì)卡西酮,對人體中樞神經(jīng)具有刺激作用,長期嚼食會染癖成癮,又被稱為“東非罌粟”,具有嚴重的社會危害性。世界衛(wèi)生組織將恰特草歸類為Ⅱ類軟性毒品。很多國家已將其列為興奮劑或受管制藥物,嚴禁旅客攜帶或郵寄入境。

2014年,恰特草已列入《精神藥品品種目錄(2013版)》,被視為第一類精神藥品,在我國毒品打擊范圍之內(nèi),凡種植、持有、販賣、走私、服食恰特草均屬違法犯罪行為。

恰特草作為一種新型的毒品原植物,其經(jīng)烘炒后的枝葉,外形酷似茶葉,形態(tài)上具有很高的偽裝性。一些不法分子在高額利潤的驅(qū)使下鋌而走險進行非法走私與貿(mào)易。而目前,恰特草的鑒定依然是依靠傳統(tǒng)的形態(tài)識別,但是對于一些形態(tài)特征被破壞,外觀不完整的檢材并不適用,具有一定的局限性,同時對案件的辦理也造成了一定阻礙。除此之外,傳統(tǒng)的形態(tài)識別法主要依靠鑒定人的經(jīng)驗,對鑒定人的專業(yè)知識要求較高,在無法使用傳統(tǒng)的形態(tài)特征鑒定時,就需要依靠一些不依賴于形態(tài)特征的新技術、新方法進行識別鑒定。

近年來,DNA分子技術被廣泛應用到植物樣本的檢驗,使一些微量植物物證也能進行種類鑒定或是個體識別。并且,多種手段聯(lián)合應用于植物物證的檢驗將成為一種新的發(fā)展趨勢。國內(nèi)對于毒品原植物的分子鑒定技術已經(jīng)有一定的研究,但對于新型毒品恰特草的分子鑒定技術研究還是空白。本研究致力于對恰特草的DNA分子鑒定技術進行探索,以期建立從DNA提取、條形碼片段擴增到數(shù)據(jù)分析的恰特草分子鑒定體系,同時初步建立恰特草的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫,實現(xiàn)恰特草的快速準確鑒定,為此類毒品案件的打擊提供技術支持。

一、材料與方法

(一)材料

恰特草新鮮植株由廣州海關緝私局提供(圖1-A),-20℃保存于國家林業(yè)局森林公安司法鑒定中心分子實驗室;經(jīng)烘炒處理過的茶葉狀恰特草葉片由南京海關緝私局提供(圖1-B),常溫保存于國家林業(yè)局森林公安司法鑒定中心植物實驗室。

圖1 供試材料

(二)方法

1.總DNA的提取

分別取新鮮及烘炒處理的恰特草葉、莖各50mg,液氮速凍,用冷凍研磨儀研磨1min,分別用國產(chǎn)DNA提取試劑盒(TIANGEN公司)及進口的DNeasy Plant Mini Kit植物基因組DNA提取試劑盒(QIAGEN公司)提取恰特草基因組DNA。DNA的質(zhì)量采用1%瓊脂糖凝膠電泳法檢測。

2.PCR擴增及測序

以恰特草DNA為模板,分別用引物rbcL- F(5'- ATGTCACCACAAACAGAAAC-3')、rbcL-R(5'-TCGCATGTACCTGCAGTAGC-3'),trnL-F-F(5'-TTTGAACTGGTGACACGAG-3')、trnLF-R(5'-GGTTCAAGTCCCTCTATCCC-3'),擴增葉綠體rbcL及trnL-F基因序列。

PCR反應在Biometra公司PCR儀上進行。反應體系為:2.5μL buffer,2μL dNTPs,2μL MgCl2,0.5μL primer-F,0.5 μL primer-R,2 μL DNA,0.2μL Ex-Taq,15.3μL MiliQ H2O。反應程序為:首先94℃預變性5min,然后每個循環(huán)94℃變性30s,52℃退火30s,72℃延伸1min,進行38個循環(huán),最后72℃延伸10min。

PCR反應結束后,擴增產(chǎn)物送華大基因進行測序,測序引物即為擴增引物。為保證所測序列的準確性,對rbcL及trnLF序列進行雙向測序。

3.序列分析

對測定的核苷酸序列進行序列分析。序列的拼接校準使用DNASTAR軟件進行;序列相似性用NCBI的BLAST程序(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/)進行分析。

二、結果與分析

(一)提取效果檢測與分析

通過瓊脂糖凝膠電泳檢測結果顯示,1-3號均在2000bp以上出現(xiàn)完整的條帶(圖2-A),表明在新鮮的恰特草組織中提取到了基因組DNA,但1號與3號樣均有一定的拖帶,說明DNA有一定降解,質(zhì)量不高;2號樣的質(zhì)量相對較好。4號未出現(xiàn)相應的條帶,并未提取到基因組DNA(見圖3),說明經(jīng)烘炒處理過的恰特草葉片中DNA可能已嚴重降解。通過進一步的PCR擴增及瓊脂糖凝膠電泳驗證,1-3號DNA都可用來開展下一步實驗(圖2-B)。

(二)rbcL及trnL-F序列片段的獲得及分析

以恰特草基因組DNA為模板,利用rbcL引物進行PCR擴增,從中獲得725bp rbcL片段序列(基因登錄號:KX377452);利用trnL-F引物進行PCR擴增,從中獲得453bp trnL-F片段序列(基因登錄號:KX377451)。將其在 NCBI上進行BLAST相似性檢索,均與衛(wèi)矛科植物具有一定相似性。但也通過檢索與研究發(fā)現(xiàn),GenBank中恰特草的DNA條形碼數(shù)據(jù)仍是空白。

三、討論

(一)恰特草DNA提取方法

新鮮的恰特草植株由于其葉和莖的細胞、形成層細胞分裂旺盛,代謝過程活躍,物質(zhì)合成迅速,因此新鮮的恰特草植株的細胞中DNA含量很高,這個比較有利于DNA的提取。本研究用國產(chǎn)DNA試劑盒(TIANGEN公司)成功地從新鮮的恰特草植株的莖細胞中抽提出了恰特草DNA。

但目前各地公安機關和各海關部門送檢的恰特草多為經(jīng)處理烘炒過的檢材。經(jīng)多次重復實驗,發(fā)現(xiàn)國產(chǎn)DNA提取試劑盒(TIANGEN公司)無法從處理過的恰特草中提取到可用以進一步PCR擴增的基因組DNA。主要原因有:①經(jīng)烘炒處理過的恰特草由于受到高溫處理致使DNA發(fā)生降解。②國產(chǎn)DNA試劑盒(TIANGEN公司)提取DNA精度較差,尤其對于一些微量DNA的提取效果不佳。

本研究通過使用進口DNeasy Plant Mini Kit植物基因組DNA提取試劑盒(QIAGEN公司)成功地從經(jīng)烘炒處理過的恰特草樣本的莖中提取出了較高質(zhì)量的DNA。這表明進口DNA試劑盒提取DNA精度較高,適用于物證鑒定中提取經(jīng)烘炒處理過的恰特草樣本DNA。

(二)經(jīng)烘炒處理過的恰特草不同部位DNA降解程度不同

通過使用DNeasy Plant Mini Kit植物基因組DNA提取試劑盒(QIAGEN公司)提取經(jīng)烘炒處理過的恰特草樣本的莖和葉片組織發(fā)現(xiàn),從莖的組織中能成功提取較高質(zhì)量的基因組DNA,并且能夠用于進一步的PCR擴增,而葉片組織無法提取到可用于擴增的DNA。這說明在經(jīng)烘炒處理過后,恰特草的葉片和莖中的基因組DNA發(fā)生了不同程度的降解[10],但是莖中的DNA降解程度要明顯低于葉片的降解程度。將此研究結論應用于鑒定過程中,在鑒定經(jīng)烘炒處理過的恰特草檢材時,應盡量選取莖部位的恰特草檢材,由于莖中的DNA降解程度相對葉片較低,這樣更有利于提取恰特草DNA。但由于實驗材料的限制,該實驗僅針對一批烘炒處理的恰特草樣本進行了DNA提取實驗,或許不同批次材料處理程度不一樣,其中的DNA降解程度就不同,所以結論還需進一步論證確實。該部分研究結論僅供參考。

圖2 DNA檢測

(三)初步建立恰特草DNA條形碼數(shù)據(jù)庫

GenBank是美國國家生物技術信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)建立的DNA序列數(shù)據(jù)庫。GenBank也是目前全球公用的最具權威性、使用最頻繁的DNA序列數(shù)據(jù)庫。將研究獲得的恰特草核苷酸序列在GenBank中進行檢索比對,只與衛(wèi)矛科的其他植物具有一定相似性,并未有相似程度高的物種。說明研究獲得的序列無誤,并非其他科屬植物,但也說明一點,目前GenBank中仍缺少恰特草DNA條形碼rbcL與trnL-F序列片段。將獲得的恰特草核苷酸序列上傳到GenBank中,獲取恰特草rbcL的基因登錄號(KX377452)與trnL-F的基因登錄號(KX377451)。

近年來,國家林業(yè)局森林公安司法鑒定中心也建立了毒品原植物的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫。通過本研究獲得的恰特草DNA條形碼序列,也豐富與充實了國家林業(yè)局森林公安司法鑒定中心毒品原植物的DNA條形碼數(shù)據(jù)庫。對于打擊近年來走私恰特草案件是具有現(xiàn)實意義,也拓寬了毒品原植物分子鑒定領域的研究。

(四)DNA條形碼鑒定技術在恰特草實際鑒定中的應用

2016年5月,也門籍犯罪嫌疑人瑪某乘坐某航班,從廣州白云機場口岸入境。經(jīng)查驗,在其行李箱內(nèi)查獲用綠色塑料袋包裹的植物枝葉碎片,凈重78312.4g。廣州海關緝私局為了查明這起“行李箱藏匿疑似恰特草”案,委托國家林業(yè)局森林公安司法鑒定中心對涉案的植物進行種屬鑒定。但是該涉案植物檢材均為植物枝葉碎片,已無法使用形態(tài)特征進行識別鑒定。針對該檢材,使用該論文改良的基因組DNA提取法均成功提取到DNA,并通過與該研究建立的DNA條形碼序列數(shù)據(jù)庫進行序列比對,送檢的3份涉案檢材(圖3)均為恰特草所有,成功進行了種屬鑒定。

圖3 廣州海關緝私局送檢疑似恰特草枝葉碎片

本文系南京森林警察學院大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓練計劃項目((201612213007)成果

(作者單位 南京森林警察學院)

(責任編輯 劉允杰)

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