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《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》載文研究熱點(diǎn)分析

2017-03-21 05:10:22
關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)挖掘信息研究

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《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》(Journal of the American Medical Informatics Association,JAMIA)由美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)主辦,2015年的影響因子為3.428(數(shù)據(jù)來(lái)自2015版的JCR),雙月刊,在醫(yī)學(xué)信息學(xué)領(lǐng)域具有很大的影響力。通過(guò)對(duì)該刊近10年的載文進(jìn)行文獻(xiàn)計(jì)量分析,從側(cè)面反映當(dāng)前國(guó)外醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究現(xiàn)狀,為醫(yī)學(xué)信息學(xué)相關(guān)研究人員提供參考。

1 數(shù)據(jù)來(lái)源與方法

1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源

數(shù)據(jù)來(lái)源于生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)MEDLINE,以《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》2006-2015年載文為研究樣本,采用的檢索策略為“J Am Med Inform Assoc”[Journal] AND (“2006/01/01”[PDAT] : “2015/12/31”[PDAT])。

1.2 方法

以XML格式套錄檢索結(jié)果,運(yùn)用書(shū)目共現(xiàn)分析系統(tǒng)BICOMB[1]統(tǒng)計(jì)并抽取文獻(xiàn)記錄中的主要主題詞與副主題詞,按照出現(xiàn)頻次由高到低進(jìn)行排序,選取頻次≥22的主題詞/副主題詞作為高頻詞(表1)。

根據(jù)高頻詞在每篇文獻(xiàn)記錄中出現(xiàn)的情況,對(duì)高頻主題詞進(jìn)行統(tǒng)計(jì),形成高頻詞詞篇矩陣。將詞篇矩陣輸入gCLUTO軟件,采用系統(tǒng)聚類法對(duì)所得詞篇矩陣進(jìn)行聚類分析,聚類分析的結(jié)果可以反映出高頻詞之間的親疏關(guān)系,根據(jù)高頻主題詞的聚類結(jié)果以及主題詞之間的語(yǔ)義關(guān)系,總結(jié)出《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》的研究熱點(diǎn)。

表1 《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》高頻主題詞/副主題詞(頻次≥22)

2 結(jié)果

共得到1 644篇文獻(xiàn)記錄。聚類結(jié)果見(jiàn)圖1,其中橫軸代表文獻(xiàn),縱軸代表聚類的主題詞/副主題詞。兩詞聚集到一起的距離越短,關(guān)系越密切。

圖1 《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》高頻主題詞聚類

首先,根據(jù)每一類高頻詞的含義以及這些主題詞之間的語(yǔ)義關(guān)系,總結(jié)出每一類主題詞所代表的研究熱點(diǎn),即《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》近10年的研究熱點(diǎn)。如主題詞Artificial Intelligence (人工智能)和Algorithms(算法)距離較近,關(guān)系密切,首先聚成一類;Population Surveillance / methods(人口監(jiān)測(cè)/方法)再與前面兩個(gè)詞合成一類,依此類推。通過(guò)分析這些主題詞的語(yǔ)義關(guān)系可得出它們所代表的類團(tuán)含義標(biāo)簽,綜合各個(gè)類別的類標(biāo)簽可以得出該刊的研究熱點(diǎn)。其次,利用gCLUTO軟件計(jì)算各類成員對(duì)聚類貢獻(xiàn)率的指標(biāo)(描述度Descriptive和區(qū)分度Descriminating),選擇對(duì)每一類形成貢獻(xiàn)最大的來(lái)源文獻(xiàn)作為表示該類內(nèi)容的類標(biāo)簽文獻(xiàn),通過(guò)文獻(xiàn)內(nèi)容進(jìn)一步闡述該研究方向的具體內(nèi)容[2](圖2)。

圖2 類成員對(duì)聚類貢獻(xiàn)率指標(biāo)

3 分析

通過(guò)對(duì)2006-2015年《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》載文的高頻主題詞/副主題詞進(jìn)行共現(xiàn)聚類分析,可將該期刊的研究熱點(diǎn)總結(jié)為3個(gè)方面、8個(gè)主題方向。

3.1 計(jì)算機(jī)技術(shù)在醫(yī)院管理與臨床診療中的應(yīng)用

3.1.1 臨床相關(guān)軟件或平臺(tái)開(kāi)發(fā)設(shè)計(jì)的研究

為了提高管理效率和服務(wù)質(zhì)量,為患者提供更好的醫(yī)療服務(wù),與其相關(guān)的各種平臺(tái)或軟件不斷被研發(fā)出來(lái)。該類所含的主題詞有Information Storage and Retrieval、Computerized Medical Records System、User-Computer Interface、Software、Controlled Vocabulary,研究?jī)?nèi)容包括能夠消除病人標(biāo)識(shí)信息的軟件設(shè)計(jì)[3]、可降低醫(yī)療費(fèi)用的健康信息技術(shù)平臺(tái)的設(shè)計(jì)[4]、前列腺癌預(yù)后評(píng)估軟件的開(kāi)發(fā)[5]、結(jié)構(gòu)化臨床文本術(shù)語(yǔ)接口的實(shí)現(xiàn)[6]等。

3.1.2 建立臨床數(shù)據(jù)研究網(wǎng)絡(luò)的研究

為提高臨床數(shù)據(jù)的利用并實(shí)現(xiàn)其價(jià)值,臨床數(shù)據(jù)研究網(wǎng)絡(luò)不斷涌現(xiàn)。該類所含的主題詞有Electronic Health Records/organization& administration、Patient-Centered Care、Computer Communication Networks,研究?jī)?nèi)容如國(guó)家健康中心數(shù)據(jù)增值網(wǎng)絡(luò)的實(shí)現(xiàn)[7]和促進(jìn)電子健康數(shù)據(jù)有效利用的臨床數(shù)據(jù)研究網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建[8-11]。

3.1.3 患者隱私的保護(hù)研究

網(wǎng)絡(luò)技術(shù)在醫(yī)療衛(wèi)生領(lǐng)域的應(yīng)用推動(dòng)了醫(yī)療信息共享的發(fā)展,復(fù)雜的網(wǎng)絡(luò)環(huán)境為患者隱私的保護(hù)提出了新的挑戰(zhàn)。該類所含的主題詞有Computer Security、Confidentiality、Information Dissemination、Medical Record Linkage。研究?jī)?nèi)容包括在保護(hù)病人隱私的前提下,為促進(jìn)臨床數(shù)據(jù)研究共享,通過(guò)構(gòu)造專家驅(qū)動(dòng)算法來(lái)減少病人身份重復(fù)識(shí)別所帶來(lái)風(fēng)險(xiǎn)的研究[12]、Bloom filter算法與密碼學(xué)在保護(hù)病人隱私方面有效性的實(shí)證研究[13]、DNA測(cè)序數(shù)據(jù)中一種新型的隱私保護(hù)加密模式[14]和差別隱私的研究[15]等等。

3.1.4 基于網(wǎng)絡(luò)的個(gè)人健康管理系統(tǒng)的相關(guān)研究

個(gè)人健康管理系統(tǒng)旨在實(shí)現(xiàn)個(gè)人健康信息的采集管理、個(gè)人健康狀況的分析,并提供個(gè)性化的健康促進(jìn)和干預(yù)方案,動(dòng)態(tài)追蹤個(gè)人健康狀況,為用戶提供健康管理服務(wù),使醫(yī)務(wù)工作者能夠短時(shí)間掌握患者的情況,提高醫(yī)療效果。該類包含的主題詞有Personal Health Records、Internet、Attitude to computers、Attitude to personnel,研究?jī)?nèi)容包括基于網(wǎng)絡(luò)的個(gè)人健康管理系統(tǒng)在季節(jié)性流感疫苗接種以及初級(jí)保健服務(wù)利用中的效果評(píng)價(jià)[16]、基于網(wǎng)絡(luò)的個(gè)人健康管理系統(tǒng)提高了年輕人性傳播疾病篩查率的隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)研究[17]等。

3.2 數(shù)據(jù)挖掘、人工智能在醫(yī)學(xué)中的應(yīng)用

3.2.1 自然語(yǔ)言處理和數(shù)據(jù)挖掘的研究

主要包括電子病歷的自然語(yǔ)言處理、信息抽取以及分類、聚類等方面的研究。該類包含的主題詞有Support Vector Machine、Data Mining/methods、Electronic Health Records、Natural Language Processing,研究?jī)?nèi)容如臨床記錄醫(yī)學(xué)概念中指代關(guān)系的自動(dòng)解決方案研究[18]、通過(guò)對(duì)關(guān)鍵詞特點(diǎn)的分類減少支持向量機(jī)對(duì)臨床文本分析過(guò)程中大訓(xùn)練數(shù)據(jù)集的依賴[19]、在醫(yī)學(xué)摘要分類中支持向量機(jī)與多項(xiàng)樸素貝葉斯算法的比較研究[20]。

3.2.2 臨床決策支持系統(tǒng)和計(jì)算機(jī)輔助藥物治療

臨床決策支持系統(tǒng)能夠在診療過(guò)程中提供實(shí)時(shí)幫助,根據(jù)患者的病情生成各種可供選擇的診療方法及用藥參考,減少醫(yī)療差錯(cuò)的發(fā)生。涉及的主題詞有Guideline Adherence、Clinical Decision Support Systems、Data Ming 、Electronic Health Records/standards、Electronic Prescribing、Medication Errors/prevention & control、Medical Order Entry Systems、Computer-Assisted Drug Therapy、Reminder Systems,研究?jī)?nèi)容包括臨床決策支持系統(tǒng)在急診病人輕度顱腦損傷CT診斷中的應(yīng)用效果研究[21]、臨床決策支持系統(tǒng)在肺結(jié)核與缺鐵性貧血風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估中的實(shí)證研究[22]、臨床決策支持系統(tǒng)在哮喘評(píng)估與管理中的精準(zhǔn)度研究[23]、決策支持在提高臨床醫(yī)生處方行為中的證據(jù)支持研究[24]、腎功能不全患者用藥物劑量調(diào)整決策支持研究[25]、電子病歷處方安全的長(zhǎng)期隨訪評(píng)估顯示臨床決策支持系統(tǒng)能最大程度地保障處方安全[26]、臨床決策支持系統(tǒng)能在很大程度上減少醫(yī)療差錯(cuò)[27]。

3.2.3 人群監(jiān)測(cè)方法的相關(guān)研究

主要包括采用某些算法對(duì)傳染病進(jìn)行監(jiān)測(cè),包含的主題詞有Diffusion of Innovation、Physicians′Practice Patterns、Electronic Health Records/utilizatio、Artificial Intelligence、Algorithms、Population Surveillance / methods,研究?jī)?nèi)容如基于秩次的空間聚類算法檢測(cè)疫情的爆發(fā)[28]。

3.3 生物信息學(xué)相關(guān)研究

主要包括生物信息學(xué)領(lǐng)域相關(guān)概念、范式的研究,包含的主題詞有Information Systems、Biomedical Research、Medical Informatics,研究?jī)?nèi)容涉及生物信息學(xué)研究的新范式[29]等。

4 結(jié)論

通過(guò)對(duì)《美國(guó)醫(yī)學(xué)信息學(xué)會(huì)雜志》近10年的載文進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)其研究熱點(diǎn)主要集中于臨床相關(guān)軟件或平臺(tái)開(kāi)發(fā)設(shè)計(jì)、患者隱私的保護(hù)、自然語(yǔ)言處理與數(shù)據(jù)挖掘、臨床決策支持系統(tǒng)等。伴隨著計(jì)算機(jī)、網(wǎng)絡(luò)和信息技術(shù)的快速發(fā)展,醫(yī)學(xué)信息學(xué)的研究領(lǐng)域日趨廣泛,數(shù)據(jù)挖掘與人工智能在臨床診療中發(fā)揮的作用也與日俱增,自然語(yǔ)言處理與數(shù)據(jù)挖掘的應(yīng)用將會(huì)更加深入,臨床決策支持系統(tǒng)將更好地服務(wù)于診療過(guò)程。

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