這種豬育種芯片價格比行價便宜一半

這種豬育種芯片價格比行價便宜一半

由中國農業大學動物科技學院劉劍鋒教授團隊設計研制的新款豬55KSNP芯片已于4月底投入生產。該款芯片是在中外豬種全基因組重測序、多組織轉錄組和蛋白組圖譜構建的基礎上，整合現有重要經濟功能基因的公開報道的候選位點，并加入72個我國部分地方豬種特有SNP，綜合優化研制而成（命名為55KCAU-Porcine）。

我國作為養豬大國，持續、高效開展生豬遺傳改良十分迫切。利用全基因組選擇、實現精準群體遺傳關聯的評估、組織區域性乃至全國聯合遺傳評估，是加速我國豬育種效率、自主培育優良品種的有效途徑。目前，國內外市場上常用的豬育種芯片為60KSNP芯片，有6萬個位點，但是位點在染色體的分布均勻性不高，約10K位點位置不詳。劉劍鋒介紹，該團隊在多品種測序的基礎上，經過大量位點信息的搜集，整合，經過一年多的系統分析，最終設計確定5萬多個位點用于新的芯片定制。新研發的芯片主要有三個優點：一是具有經濟性狀的功能相關性。芯片搜集并確定了10K與豬生長性狀、繁殖性狀及健康性狀等相關的顯著位點，實用性更高；二是位點分布均勻，多態性好。芯片的位點在全基因組分布均勻，提高了捕捉基因組潛在功能變異的功效，而且在篩選位點時使用該團隊的重測序數據，保證了所選位點有較高的多態性；三是具有特異性。不僅對比篩選我國代表性的地方豬種、國內外高度選育商用豬種的特征位點，還特別加入了72個國內部分地方特有的SNP位點。

據悉，這款55KSNP芯片的開發，不僅適用于我國豬的育種、品種鑒定、地方品種資源的評價、功能基因鑒定等研究，同時維持了低成本的芯片檢測成本，預計出售價格約為主流60KSNP芯片的一半，應用前景廣闊。目前該團隊將全面開展芯片的應用效果評估，同時與深圳市金新農科技股份有限公司合作開發豬基因組選擇的聯合評估系統，并在6家生豬國家核心育種場實施基于基因組選擇策略的區域性聯合育種。