趙拴平, 徐 磊, 賈玉堂
(安徽省農業科學院畜牧獸醫研究所, 安徽 合肥 230031)
大別山黃牛是我國優良的地方品種牛,主要產于安徽省大別山東部的金寨﹑岳西﹑六安等縣和湖北省大別山西部的黃陂﹑大悟﹑英山等縣,是大別山地區著名的地方品種。大別山牛體型小、耐粗飼、適應性強、抗病力強、容易管理,是我國寶貴的地方牛遺傳種質資源。
CART基因(可卡因-苯丙胺調節轉錄肽基因,Cocaine-and amphetamine-regulated transcript)是一種類生長抑制素多肽,最早從綿羊下丘腦抽提物中分離獲得[1],研究發現,CART基因參與動物攝食、能量代謝調節、應激反應等多種生理過程。E.Valle等研究發現CART基因位于牛20號染色體[2],包含3個外顯子和2個內含子,SNP位點主要集中在基因的內含子和啟動子區[2-3],牛CART基因SNPs位點與生長性狀關聯分析發現,多態性位點A1A1(C1)基因型個體的體重顯著高于A1B1基因型個體(P<0.05),A2A2(C2)基因型個體的體重顯著低于A2B2基因型個體(P<0.05)[3]。
本研究依據牛CART基因序列(NC_007318.6)設計引物,利用PCR、測序和生物信息學技術分析大別山牛CART基因SNPs位點與體尺性狀的相關性,以期為大別山牛品種資源保護和開發利用奠定基礎。
試驗樣品為安徽大別山黃牛血樣300份,樣本間無親緣關系,頸靜脈采血法采集每頭牛血液10 mL,ACD 抗凝,低溫帶回實驗室,-80℃冰箱凍存備用。
利用DNA提取試劑盒(天根生化科技有限公司,北京)進行血液樣品基因組提取,1.0%瓊脂糖凝膠電泳檢測其完整性,核酸分析儀測定其純度和濃度。
分別取20份大別山牛稀釋DNA樣各1.0 μL,混合均勻,構建4個獨立大別山牛基因組DNA池。……