杜雪飛,葛以躍,祁賢
1. 南京市疾病預防控制中心,南京 210009; 2. 江蘇省疾病預防控制中心,南京 210009
·論著·
2013—2014年南京市流感病毒H3N2亞型血凝素分子遺傳特性分析
杜雪飛1,葛以躍2,祁賢2
1. 南京市疾病預防控制中心,南京 210009; 2. 江蘇省疾病預防控制中心,南京 210009
2013—2014年南京市流感病原監測系統分離到31株流感病毒H3N2亞型毒株,通過提取病毒RNA,反轉錄-聚合酶鏈反應(reverse transcriptase-polymerase chain reaction,RT-PCR)擴增血凝素(hemagglutinin,HA)基因片段,進行PCR產物純化、測序并分析其遺傳進化特征。結果顯示,31株分離株與疫苗株A/Texas/50/2012之間的核苷酸和氨基酸進化距離分別為0.010 2和0.012 1,核苷酸和氨基酸的同源性分別為97.9%~99.6%和97.2%~99.3%。遺傳進化分析表明,分離株的HA基因分屬不同的進化分支,3株2013年分離株屬3B基因型,3株2014年分離株屬3C.1基因型,2株2014年分離株屬3C.2b基因型,其余23株屬3C.3a基因型。與疫苗株相比,分離株的分子特征表現為發生N128A/T和P198S/A(去信號肽排列)氨基酸位點變異,均位于抗原決定簇B;分離株抗原決定簇上發生變異的位點共計24個;7株分離株出現126 NWT糖基化位點,3株分離株糖基化位點45NSS和144NNS消失。結果提示, 2013—2014年南京市流感病毒H3N2亞型的HA基因較疫苗株發生了較大變異,疫苗對病毒的預防效果需重新評估。
流感病毒H3N2亞型;血凝素;分子特征
自1968年以來,甲型H3N2亞型流感病毒一直是人類季節性流感的重要病原。在人群免疫壓力下,抗原漂移成為H3N2亞型變異的主要方式,也是持續引起流行的主要動因[1]。甲型流感病毒抗原變異中,以血凝素(hemagglutinin,HA)基因最重要,分析HA基因序列可在分子水平了解甲型流感病毒的變異特點和規律?!?br>