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64位博士組團盯上基因數(shù)據(jù)分析,能讓癌癥變得可控嗎

2016-11-26 01:06:32王鵬
就業(yè)與保障 2016年3期

王鵬

64位博士組團盯上基因數(shù)據(jù)分析,能讓癌癥變得可控嗎

王鵬

2月3日,已臨近新年,余偉師還在公司忙得不可開交。下午5點,見完投資人,他又匆匆趕回微軟創(chuàng)投加速器工作。目前,他和他的創(chuàng)始團隊10多名成員都在這里辦公。賽福基因是入駐微軟創(chuàng)投加速器的第7期項目之一。這份機會也來之不易,1400份申請,最后只有20個項目成功入圍。

當然,歷經(jīng)半年,他們不得不從這里搬走,一是因為他們將從微軟創(chuàng)投加速器“畢業(yè)”,新的項目將入駐,二是因為公司的核心團隊將陸續(xù)回國,他們需要更大的“戰(zhàn)場”。

創(chuàng)客ABC

A.他們是誰?

這是一支跨專業(yè)有機整合了64位海外華人博士的技術(shù)團隊,創(chuàng)始人兼CEO余偉師曾是美國國立衛(wèi)生研究院科學家,技術(shù)總監(jiān)劉湘濤是耶魯大學應用數(shù)學博士,市場負責人賈洪濤是俄亥俄州立大學生物醫(yī)學博士,運營負責人梁萌萌是南加州大學病理生物學博士。

B.他們在做什么?

打造一個基因數(shù)據(jù)智能分析平臺,為醫(yī)生、患者提供精準的疾病分類和診療建議,將癌癥轉(zhuǎn)為可控慢性病,為亞健康人群提供個性化健康管理措施。

C.融資狀況?

已完成天使輪融資,但尚未對外披露具體投資方和投資金額。

曾因“知識無用武之地”而深感寂寞

中國近年來癌癥及患病人群劇增,“我們國家每5分鐘有21人因為癌癥死亡,每5分鐘有35人被診斷為癌癥,我們肩上的責任還很重。”余偉師說。

十年前,還在讀碩士的余偉師就已經(jīng)開始研究基因與疾病、基因與癌癥的關(guān)系。2005年至2010年,他先后在國際知名雜志上發(fā)表了7篇基因與遺傳疾病、基因和癌癥發(fā)生相關(guān)的論文。2011年,他進入美國國立衛(wèi)生研究院從事博士后研究,主要研究干細胞和誘導干細胞分化的表觀遺傳學機制。期間他又發(fā)表了數(shù)篇具有國際影響力的文章,并獲得了美國政府近150萬美元的個人科研經(jīng)費,以及晉升為研究員和杰出人才通道的綠卡申請機會。

然而十載寒窗,余偉師逐漸認識到疾病,尤其是癌癥治療的復雜性,是他一個人每天待在實驗室里永遠也無法讀懂的世界。要想真正解決人類面臨的這一難題,他必須走出實驗室,和更多志同道合的專家們一起,充分接觸臨床,去和醫(yī)生們合作親自解決各種問題。

由于“人種差異大”,余偉師認為歐美基因庫案例雖然對人類疾病的了解有著重要的作用,但對中國人參考價值有限,一種“多年的知識儲備無用武之地”的落寞油然而生,與此同時,身邊不斷有朋友或者親屬死于癌癥的噩耗傳來,回國創(chuàng)業(yè)的念頭在他心里生根發(fā)芽。

在一些聚會上,他和身邊的華人博士交流,發(fā)現(xiàn)大家都深有同感,他們都迫切的希望能將自己所學應用到實踐中去,能幫助到那些正處于疾病痛苦中的同胞。“探索之路漫漫,有了同伴的互相攙扶,我立刻就不感到孤單了。”

考慮到中國基因數(shù)據(jù)分析市場成本高、時效低,且精準解析的維度欠缺。余偉師決心建立中國人自己的自動化數(shù)據(jù)分析平臺。

在美國,2013年余偉師和他的4個同伴一起組建了早期團隊,最初的目的也很簡單,就是想利用他們在醫(yī)學領(lǐng)域的跨學科的優(yōu)勢準確高效地解析人類基因組大數(shù)據(jù),為醫(yī)生、患者提供精準的疾病分類和診療建議。

2013年10月,余偉師團隊接收了一份來自廣東省中山醫(yī)院的病例全基因數(shù)據(jù),這是他們的第一次團隊協(xié)作。

接到第一單,余偉師等5人興奮得不得了,連軸轉(zhuǎn)工作了一周,在數(shù)據(jù)提供方隱去臨床診斷結(jié)果的前提下,他們通過分析該患者的基因數(shù)據(jù)最終將此病例判斷為“結(jié)腸癌”患者,并給出了藥物治療的方案。而同時參與這次基因大數(shù)據(jù)分析的另外一家國際知名機構(gòu)花了一個月的時間最終卻給出了一個“樣本出錯”的結(jié)論。(應余偉師要求,此處隱去該機構(gòu)名稱。)

余偉師介紹稱,進行基因大數(shù)據(jù)分析除了要過硬的專業(yè)知識和算法外,還要能夠判斷哪些信號是雜質(zhì)和噪音,“因為癌旁正常組織和腫瘤組織并不是絕對單一的,當醫(yī)學領(lǐng)域的不同學科的人交叉合作時,就擁有了更強的辨別能力”。

64個華人博士組成“幕僚團隊”

2014年,余偉師團隊完成了第一階段的技術(shù)攻克,并在美國與各大癌癥中心進行臨床測試,同時也與國內(nèi)多家知名醫(yī)院完成了技術(shù)測試。經(jīng)過短短兩年時間,當初的5人團隊已經(jīng)壯大成64個分別來自分子醫(yī)學、生物信息學、分子遺傳學等各個研究領(lǐng)域的國際頂尖人才。

他們利用生物信息學與云計算正在開發(fā)出智能化、全自動的基因數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)平臺,在實現(xiàn)復雜基因數(shù)據(jù)的精準解析度基礎(chǔ)上,能使成本降低50%~80%。

2015年10月,余偉師放棄了在美國所獲得的一切成果,回國加入了創(chuàng)業(yè)大潮,“我們希望能夠團結(jié)帶動更多的科學家投入到這個事業(yè)中,幫助醫(yī)生實現(xiàn)精準治療,將癌癥真正轉(zhuǎn)變?yōu)榭煽氐穆圆 薄?/p>

據(jù)余偉師介紹,在目前的64位國際頂尖人才中,有20多人已成為賽福基因的核心成員,據(jù)不完全統(tǒng)計,團隊核心成員在精準醫(yī)療領(lǐng)域發(fā)表的論文600篇之多,其中生物信息學基因數(shù)據(jù)分析相關(guān)論文200余篇。

未來核心成員會陸續(xù)回國參與到公司的全職經(jīng)營中來,賽福基因也為他們預留了豐厚的股權(quán)作為激勵。而其他成員多在美國各大癌癥研究機構(gòu)工作,以基因公司科學顧問的角色繼續(xù)通力合作為賽福基因提供技術(shù)支持。

也在此時,正好趕上微軟創(chuàng)投加速器招收項目,微軟創(chuàng)投大中華區(qū)負責人杜楓介紹稱,微軟創(chuàng)投加速器招收項目有三個標準:一是廣闊的市場,二是團隊要最有可能解決這個問題,三是技術(shù)要具有領(lǐng)先性。

“賽福基因剛好具備這三點,所以他們可以從1400份申請中脫穎而出,成為了微軟創(chuàng)投加速器第7期項目中唯一的生物醫(yī)學方向的團隊。”杜楓說。

基因信息挖掘機:從1000G中挖出幾KB的信息

目前,賽福基因主要為醫(yī)院和醫(yī)療科研單位提供基因大數(shù)據(jù)分析服務,所以他們也是一家B2B的公司,“現(xiàn)在國內(nèi)有很多機構(gòu)具備了基因檢測能力,也誕生了很多基因檢測公司,但是卻缺乏專業(yè)的生物信息分析的團隊,我們可以直接和他們對接”。

在對接醫(yī)院方面,賽福基因的服務對象有兩個,一個是給臨床醫(yī)生提供患者的個性化治療建議,另一個是基于臨床案例給醫(yī)院提供大數(shù)據(jù)樣本的分析報告。

“北京大學腫瘤醫(yī)院的沈琳副院長曾搜集了15對胃腸間質(zhì)瘤的樣本,這是胃癌里面非常罕見的一種疾病,我們幫他做了基因數(shù)據(jù)分析后,對于她未來的臨床治療起到了很大的幫助,她也特別滿意。”

在數(shù)據(jù)來源上,主要由醫(yī)院、第三方檢測機構(gòu)、體檢中心等幾方面提供。為了讓記者更形象地理解基因數(shù)據(jù)分析的難度,余偉師打了個比方,如果對一個人進行全基因組測序,根據(jù)測序深度不同,大概會產(chǎn)生300G到1000G的內(nèi)容,而賽福基因要做的就是從1000G的內(nèi)容中挖掘出幾KB的關(guān)鍵信息,供醫(yī)院和科研機構(gòu)使用。

“當我們生物信息團隊將突變的基因位點篩查出來后,分子醫(yī)學和遺傳學的博士團隊就發(fā)揮作用了,他們深耕于人類疾病的不同領(lǐng)域,知曉不同的位點和疾病之間的關(guān)聯(lián),最終和臨床信息相結(jié)合,輔助醫(yī)生制定更精準的治療方案。”余偉師說。

在余偉師看來,他們團隊強大的基因數(shù)據(jù)分析能力得益于團隊成員的學科交叉,“特別是癌癥是一種復雜的基因組疾病,要想篩查出涉及疾病的關(guān)鍵位點,就必須具備過濾基因數(shù)據(jù)噪音的能力以及對疾病信號通路的精確把握,這需要不同專業(yè)的頂尖人才的相互碰撞和探討交流,才能完成。”

杜楓介紹稱,基因產(chǎn)業(yè)是新興產(chǎn)業(yè),目前就像一片汪洋大海上浮出了幾個小島,剩下的大部分信息還在水下,“所以基因行業(yè)還沒有A+B一定等于C,只有A+B可能會推導出C”。

“基因數(shù)據(jù)分析其實就像在繪制海圖,把大洋上的島嶼一個個挖掘并連接起來,怎么才能連接起來時,很多人都在探索的問題,賽福基因走得稍微早一點,他們將這些醫(yī)學領(lǐng)域的教授和博士聯(lián)結(jié)起來,其他人要繪制‘海圖’也得這么做。”杜楓說。

構(gòu)建基因數(shù)據(jù)智能分析系統(tǒng)

在余偉師看來,賽福基因能順利走上基因數(shù)據(jù)分析的商業(yè)化道路與基因檢測技術(shù)的日益成熟,成本也大幅度降低密不可分,因為這使普通患者基因測序成為可能。

2003年,進行一次個人的全基因測序需要30億美金;2011年,喬布斯患胰腺癌,進行DNA測序花費10萬美元,雖然價格縮水了10000倍,但依舊非常人所能承受;2015年基因測序的費用降到了1000美金,價格再次大幅降低,參與測序的人數(shù)增加為基因數(shù)據(jù)分析提供了商業(yè)化可能。

值此契機,余偉師決定在該領(lǐng)域深挖,他也看到了一個案例一個案例地去進行基因數(shù)據(jù)分析的低效和繁瑣,為了讓基因數(shù)據(jù)更高效地實現(xiàn)精準解析,他們正在籌劃構(gòu)建一個基因數(shù)據(jù)的智能分析系統(tǒng),醫(yī)生和科研人員在該系統(tǒng)中自助式的導入樣本數(shù)據(jù),利用后臺的算法模型,就可以高效地得到自己想要的分析結(jié)果。

余偉師介紹稱,利用生物信息學與云計算開發(fā)出智能化、全自動的基因數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)平臺,使成本降低50% ~80%,能實現(xiàn)復雜基因數(shù)據(jù)的精準解析度。

長期而言,賽福基因還希望在智能分析系統(tǒng)基礎(chǔ)上建立一個可視化系統(tǒng)及云服務端口,使醫(yī)生與科學家之間的交流效率提升到一個新的次元。“在這個智能分析平臺上,我們還會對亞健康人能夠提供一些個性化的健康管理的措施,給醫(yī)藥研究院提供動態(tài)的數(shù)據(jù)分析,加強精準醫(yī)療在癌癥治療上的應用。”

近兩年來,世界各國政府紛紛以各種方式支持精準醫(yī)療計劃發(fā)展,加速該領(lǐng)域的產(chǎn)業(yè)化。其中,基因檢測被《時代》雜志評選為“50項最重要發(fā)明”榜首,業(yè)內(nèi)普遍認為精準醫(yī)療計劃將催生上萬億的市場,其中基因檢測服務業(yè)五年內(nèi)或達到百億級。

在余偉師看來,精準醫(yī)療計劃處于疾病診療的風口,將會全面推動傳統(tǒng)醫(yī)療的變革,掀開疾病個體化治療的新篇章。“隨著精準醫(yī)療時代的開啟,無論是B端還是C端都將前景廣闊,對此我們深信不疑。”

不過,余偉師也表示看到了目前國內(nèi)市場的魚龍混雜,沒有出現(xiàn)相關(guān)的行業(yè)標準,“目前賽福基因公司正在贏得國內(nèi)相關(guān)權(quán)威部門的支持,我們正在積極地與此行業(yè)的各方進行磋商,希望能憑借我們在美國參與精準醫(yī)療計劃積累的經(jīng)驗幫助中國在基因測序整體行業(yè)的發(fā)展貢獻自己的力量。”

(稿件來源:《新京報》)

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