植物
中科院植物研究所秦峰研究組利用全球不同地區的玉米自交系組成的自然變異群體,通過全基因組關聯分析發現,83個遺傳變異位點(解析至42個候選基因)與玉米苗期抗旱性顯著相關,為玉米抗旱新品種的培育提供了重要的基因資源和選擇靶點,相關結果發表于《自然-遺傳學》。在全球范圍內,干旱等自然災害嚴重威脅玉米生產,嚴重時會造成大幅減產甚至絕收。因此,克隆玉米抗旱基因、改良玉米抗旱性是農業生產的迫切需求。在抗旱性強的材料中,ZmVPP1的啟動子中含有一個長度為366-bp的DNA片段插入(InDel-379),該片段中含有3個干旱應答的MYB順式作用元件,因而提高了ZmVPP1在干旱脅迫下的表達量,從而促進根系發育、增加側根數目、提高葉片的光合速率和水分利用效率,增強玉米的抗旱能力。

ZmVPP1抗旱等位基因型能有效增強玉米苗期的抗旱性

玉米是禾本科玉蜀黍屬一年生草本植物
中科院昆明植物研究所高立志研究團隊,發現植物葉綠體基因組可以全部轉錄的新機制,研究論文發表于《科學報告》。葉綠體是地球上綠色植物把光能轉化為化學能、供給地球上的其它生物能量來源的重要細胞器。文章提出了一種新的葉綠體基因組雙向啟動子多重轉錄模型,即植物葉綠體基因組幾乎能夠在任意位置發生轉錄起始和終止,從而產生了諸多長短不一的轉錄本,其中很多轉錄本包含不完整的編碼框甚至假基因。這些轉錄本經內切酶和外切酶的作用,剪切掉不行使功能的序列,最終形成具有確切功能的轉錄本。葉綠體基因組的這種轉錄起始位點和終止位點隨機組合的轉錄模式,產生了若干相互重疊、長短各異的初始轉錄本,從而形成了研究所觀察到的葉綠體基因組全轉錄現象。
中科院昆明植物研究所郭振華研究員、李德銖研究員,與中科院海洋研究所李莉研究組一起,開發出一種被子植物中通用的雙酶切簡化基因組(Modified ddRAD,簡稱MiddRAD)二代測序文庫構建方法,研究論文發表于《植物方法》。在二代測序基礎上發展起來的RAD-seq技術是一項基于全基因組酶切位點的簡化基因組測序技術。由于特異性酶切位點在全基因組范圍內廣泛分布,通過RAD-seq能夠在大多數物種內獲得數萬至數十萬的單核苷酸多態性標記。該技術操作簡單靈活、檢測成本低、檢測通量高,特別適用于需要對大量個體進行SNP標記開發及分型的遺傳圖譜構建、系統發育分析及群體遺傳學等研究。
中科院武漢植物園章焰生研究團隊,利用白樺樹的樹皮為研究材料,從中分離了控制白樺脂酸合成的關鍵細胞色素氧化酶基因,被命名為BPLO基因,研究結果發表《BMC生物技術》。白樺脂酸為五環三萜類化合物,該化合物本身以及其衍生物對多種人類癌癥疾病具有較好的治療功效,尤其是對結腸癌以及黑色瘤的抑制作用明顯。白樺脂酸在很多種植物中均有合成,但其主要來源為白樺樹的樹皮,含量約為萬分之幾數量級。中國目前每年需求白樺脂酸的量在18-20噸左右,消耗約23萬噸的白樺樹樹皮用以提取制備白樺脂酸,隨著藥物市場需求的迅猛增長,以及白樺樹資源的有限性,白樺脂酸供應鏈出現斷層現象。新研究構建了酵母細胞人工合成途徑。
中科院植物研究所林榮呈研究組運用分子遺傳學等手段,發現了兩個類Myb型轉錄因子RVE1和RVE2負責光調控種子休眠和萌發的分子機理,研究結果發表在《自然-通訊》。種子休眠與萌發是兩個緊密關聯的植物生理過程,對農作物生產至關重要。休眠在種子成熟過程中逐漸形成,其程度往往在新收獲的種子中達到最高,可以幫助植物度過不利的環境、防止穗發芽及“胎萌”現象的發生。后熟、低溫和光照等因素往往可以打破休眠、促使種子萌發,使植物開始新的生命周期。種子休眠與萌發既受內在因素的控制,也受外界環境的調節。研究發現RVE1和RVE2是一對能同時調控種子休眠和萌發的轉錄因子,揭示了phyB抑制種子休眠的機理,解析了光信號通過phyB-RVE1/RVE2-GA3ox2通路整合內源激素代謝來調節植物早期生長發育的作用機制。

光敏色素B與RVE蛋白調節種子休眠和萌發的分子機理

種子萌發過程(圖片來自網絡
中科院昆遺傳與發育生物學研究所程祝寬研究組在水稻中鑒定出了一個同源重組起始因子OsMTOPVIB,OsMTOPVIB和古細菌拓撲異構酶TopVIB具有結構相似性,相關成果發表于《分子植物》。同源染色體重組是減數分裂的重要事件,同源染色體間的物質交換促進遺傳多樣性的發生;重組產生的交叉結可以將同源染色體緊密連接在一起,保證同源染色體準確地和紡錘體連接并且確保同源染色體均等分向細胞兩極。減數分裂重組起始于DNA雙鏈斷裂(double-strand breaks, DSBs)的產生。目前已鑒定的重組起始蛋白在真菌、動物和植物之間并不十分保守。和古細菌一樣,水稻減數分裂DSB由TopVIA和TopVIB所形成的二聚體催化產生。
中科院昆明植物研究所孫衛邦研究組馬永鵬副研究員在系統分析前人的研究基礎上,結合最新的研究案例,提出了群體遺傳學與生殖隔離相結合的研究思路,研究論文發表于《植物科學前沿》雜志。Homoploid hybrid speciation, HHS,稱為植物同倍體雜交物種形成。對于蟲媒傳粉的被子植物,在得到清晰的群體遺傳學證據之后,應該細致的評估和量化雜種與親本的生殖隔離強度,尤其是對于植物傳粉者敏感的花色與氣味方面。最新的研究案例顯示,天然雜交后代可以在很短的時間內,通過花色與氣味的差異調控其與親本在傳粉者種類與偏好的差異,迅速達到與親本合子前隔離的目的,加速HHS的過程。
北京大學生命科學學院瞿禮嘉研究團隊在植物雌雄識別的分子機制研究中取得進展,相關成果發表于《當代生物學》。植物和動物的有性生殖過程有賴于雌雄配子之間進行有效的信號交流。花粉管(雄方)通過與雌性的孢子體組織之間的相互作用和識別,將精細胞準確地運送到胚珠的珠孔端。其中,助細胞是花粉管最先接觸的雌配子體組織,它們與花粉管之間的相互識別和信號傳遞為接受花粉管并保證雙受精的完成提供了重要保障。花粉管與助細胞的信號交流需要FERONIA受體和ENODLs的共同參與。ENODLs蛋白是植物花粉管接受過程中從雌方鑒定出來的又一個重要組分,其功能的鑒定有助于深入理解植物雌雄互作的分子機制。