豬EGFL6基因生物信息學分析

孫彩霞，李　明，喬瑞敏，韓雪蕾，李新建（河南農業大學牧醫工程學院，鄭州　450002）

豬EGFL6基因生物信息學分析

孫彩霞，李明，喬瑞敏，韓雪蕾，李新建*
（河南農業大學牧醫工程學院，鄭州450002）

為了解豬EGFL6基因基本特性，克隆該基因CDS區，運用生物信息學方法預測分析其氨基酸理化性質、同源性、蛋白功能及二三級結構等。結果表明，豬EGFL6基因CDS區全長1 665 bp，編碼554個氨基酸，與人、馬、小鼠、綿羊等氨基酸相似性均在75%以上，親緣關系較近，該蛋白具有親水性和不穩定性，是分泌蛋白，有12個潛在磷酸化位點，5個保守結構域，無跨膜結構區，無規則卷曲是二三級結構中最主要結構元件。該研究為進一步揭示豬EGFL6基因功能奠定基礎。

EGFL6；生物信息學；豬

孫彩霞,李明,喬瑞敏,等.豬EGFL6基因生物信息學分析[J].東北農業大學學報,2016,47(4):16-23.

Sun Caixia,Liming,Qiao Ruimin,et al.Bioinformatics analysis ofEGFL6 gene in pig[J].Journal of Northeast Agricultural University,2016,47(4):16-23.(in Chinese with English abstract)

網絡出版時間2016-4-22 10:01:11[URL]http://www.cnki.net/kcms/detail/23.1391.S.20160422.1001.010.html

表皮生長因子樣結構域蛋白6（Epidermal growth factor-like domain 6，EGFL6）是類表皮生長因子超家族蛋白成員之一，Yeung等首次發現，證實其位于人的Xp22染色體，因具有MAM結構域，故又命名為MAM[1-2]。人EGFL6蛋白含有553個氨基酸，相對分子質量為6.1×104，包含5個類表皮生長因子結構域和一個羧基端MAM結構域。小鼠、狗、豬的EGFL6基因均有12個外顯子組成，位于X染色體；雞EGFL6基因有12個外顯子組成，位于1號染色體，而斑馬魚EGFL6基因有13個外顯子組成，位于9號染色體。研究表明，EGFL6基因在一些腫瘤組織如乳腺癌、肺癌、腦脊膜瘤、黑色素瘤和卵巢癌等腫瘤組織呈高表達趨勢，尤其是卵巢癌TEC中表達量較高[3-4]。

亢中奎等首次開展人EGFL6基因對腫瘤細胞株A375和SKOV3增殖試驗，發現人EGFL6促進A375和SKOV3增殖，但增殖作用機制有待研究[5]；……