郭建華,李向碧,岳秀陽,曹 政
(1.西南大學榮昌校區動物醫學系,重慶 榮昌 402460;2.重慶澳龍生物制品有限公司,重慶 榮昌 402460)
UNG酶在獸用生物制品支原體PCR檢測中防止假陽性的應用
郭建華1,李向碧2,岳秀陽2,曹政2
(1.西南大學榮昌校區動物醫學系,重慶 榮昌 402460;2.重慶澳龍生物制品有限公司,重慶 榮昌 402460)
為了研究尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG酶)在減少獸用生物制品支原體PCR檢測中的假陽性情況,本研究通過在PCR試劑中加入UNG酶,在PCR反應前25℃作用10 min,再50℃作用2 min,結果顯示,該法可以有效防止PCR產物的污染,減少假陽性的產生。
UNG酶;獸用生物制品;PCR;假陽性
支原體是無細胞壁、必須細胞內寄生的單細胞微生物,經常見于生物制品的污染[1]。現行的中國獸藥典中,對支原體的檢查規定用細胞培養法,在顯微鏡下看到支原體菌落作為判斷的依據,但檢查的時間長達29 d,所以常見于成品、血清的檢驗,對半成品、原輔材料則用培養法檢驗不能滿足需要,所以很多廠家采用更加快捷的PCR方法進行檢驗。
PCR方法非常敏感,但在陰性對照甚至空白對照中會出現假陽性的情況,使實驗者無法對結果進行判斷。尿嘧啶-N-糖基化酶(UNG酶)可以降解含有脫氧尿嘧啶核苷酸(dU)的雙鏈DNA或單鏈DNA中的尿嘧啶糖苷鍵。如果在PCR反應體系中以dUTP取代dTTP,使PCR產物都是含有dU的DNA鏈,在PCR開始前增加50℃的保溫步驟,UNG酶即可將反應體系中已有的dU的DNA污染物中的尿嘧啶堿基降解,并在隨后變性這步的條件下DNA鏈斷裂,消除由于污染DNA產生的擴增,從而保證擴增結果的特異性,準確性。同時UNG酶被滅活,不會再降解新擴增的產物U-DNA。因此UNG酶廣泛用于醫學檢驗中,但在獸用生物制品中,還未見報道[2-3]。
本研究以豬瘟細胞苗產品、生產用牛睪丸細胞作為檢驗對象,研究了UNG酶在獸用生物制品支原體PCR檢測中消除假陽性的作用。
1.1材料細胞源豬瘟活疫苗,重慶澳龍生物制品有限公司2014年生產,血清是內蒙古金源康生物工程有限公司生產。
UNG酶、dUTP、Taq DNA聚合酶(5 units/μL)(附10×PCR Buffer(100 mmol/L Tris-HCl,pH值8.3)、dNTPs(dATP、dGTP、dCTP、dTTP均為10 mmol/L)、DNA分子量標準DL-2 000、支原體核酸提取試劑盒等,購自上寶生物工程(大連)有限公司。
豬鼻支原體,購自中國獸醫藥品監察所。
1.2方法
1.2.1引物的來源與合成擴增用引物序列來自參考文獻[4-5],正向引物序列為:5′-ACACCAT?GGGAGCTGGTAAT-3′,反向引物序列為:5′-CTTCATCGACTTTCAGACCCAAGGCAT-3′,引物由Invitrogen(上海)合成。
1.2.2樣品的處理與DNA提取樣品的處理按照2010版《中國獸藥典》第3部進行[6]:隨機取5瓶疫苗制品,分別用生理鹽水將凍干品復原到10頭份每mL,將5瓶稀釋液充分混勻制成混懸液,用來提取DNA。
1.2.3PCR反應取1 μL制備的基因組DNA為模板(約50 ng),加入下面的PCR反應體系中:50 mmol/L KCl,10 mmol/L Tris(pH值8.3),1.5 mmol/ L MgCl2,0.001%(wt/vol)gelatin,引物各為 0.6 μmol/L,dNTP各為200 μmol/L,Taq DNA酶1.5 U,UNG酶1U、dUTP600 μmol/L,共20 μL。反應條件:25℃UNG酶處理2 min,95℃2 min使UNG酶失活,95℃預變性,5 min;95℃變性,1 min,57℃退火溫度下退火1 min,72℃延伸1 min,共35個循環;最后在72℃下10 min延伸。擴增完后,保存-20℃保存備用。陽性對照組加豬鼻支原體DNA為模板,陰性對照組不加模板,以生理鹽水替代,不加UNG酶的試驗組反應體系中不加入UNG酶和dUTP,25℃10 min和95℃2 min反應步驟,其余不變。
1.2.4電泳檢測取PCR產物5 μL,在1.0%(w/ v)瓊脂糖凝膠進行電泳,電場強度5 V/cm,時間50 min。
2.1不加UNG酶的試驗組PCR結果如圖1所示,陰性對照、血清樣品、豬瘟疫苗均出現與陽性對照相同的條帶(300 bp)。

圖1 不加UNG酶組PCR產物電泳圖
2.2UNG酶添加組電泳結果如圖2所示,陰性對照、血清樣品、豬瘟疫苗均無特異條帶。

圖2 UNG酶添加組PCR產物電泳圖
本試驗中,在不加入UNG酶時,陽性對照、樣品、陰性對照都有特異性條帶,甚至有時候換掉所有的試劑,仍然會出現同樣的結果。加了UNG酶后,樣品、陰性對照的特異性條帶消失了。為了驗證PCR結果的可靠性,在本研究中,所有檢驗樣本血清、豬瘟疫苗成品、陽性對照均按照中國獸藥典的方法進行了培養法檢驗,結果與加了UNG酶的結果一致。2014年本公司豬瘟疫苗成品中也未檢出支原體,對各批次成品、半成品的PCR檢驗結果表明,加UNG酶后也不影響檢驗的敏感性與特異性。
本研究的UNG酶可消除PCR產物污染。其造成PCR假陽性原因還有很多,要徹底根除PCR的假陽性。還需要嚴格操作和區分操作,如DNA提取區域、加PCR試劑區域、加模板區域、電泳區域,用的微量移液器也不能混用,另外套式PCR、Touchdown PCR等方法也能提高試驗的特異性和重復性[7],企業可以采用多種技術,指定操作規程,保證檢驗的可靠性。
當然,對生物制品的成品是否被支原體污染的檢驗以及下最終的結論,還需要按照中國獸藥典的培養法來進行。需要指出的是,對于被檢樣品被滅活的支原體,PCR仍然可以檢測出來,培養法卻檢測不出來。筆者建議用多種方法互相驗證,確保產品的質量,PCR檢驗更用于牛睪丸、生產用細胞原輔材料以及中間品的快速檢驗,培養法更多用于成品的檢驗。
[1]Zhi Y,Mayhew A,Seng N,et al.Validation of a PCR method for the detection of mycoplasmas according to European Pharmaco?poeia section 2.6.7[J].Biologicals,2010,38:232-237.
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Application of Uracil-N-glycosylaseto Avoid FalsePositivein theDetection of Mycoplasma Contaminatein Veterinary Biological Products
GUO Jian-hua1,LI Xiang-bi2,YUE Xiu-yang2,CAO Zheng2
(1.Department of Veterinary Medicine,Southwest University,Chongqing 402460,China;2.Chongqing Auleon Biologicals Company Limited,Chongqing 402460,China)
To investigate the method of avoidance of false positive in the detection of mycoplasma contaminate in veterinary bi?ological productions,Uracil-N-glycosylase was added to PCR reaction mix.And 25℃for 10 minutes and 50℃for 2 minutes were processed before PCR reaction.The results showed that uracil-N-glycosylase prevented the contamination of PCR products and re?duced the false positive efficiently.Uracil-N-glycosylase can avoid false positive in detection of mycoplasma contamination in vet?erinary biological production.
Uracil-N-glycosylase;Biological products;PCR;False positive
CAO Zheng
TQ464.8
A
0529-6005(2016)07-0083-02
2015-03-25
西南大學科研基金資助(08BSr04)
郭建華(1977-),男,副教授,博士,從事微生物資源開發與分子生物學研究工作,E-mail:guo0619@swu.edu.cn
曹政,E-mail:maodenghu@163.com