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實(shí)時(shí)熒光RT-PCR與細(xì)胞培養(yǎng)法在流感病毒檢測(cè)中的應(yīng)用效果觀察

2016-08-09 03:33:02姚秀林遼寧省撫順市疾病預(yù)防控制中心遼寧撫順113006
中國(guó)醫(yī)藥指南 2016年4期

姚秀林(遼寧省撫順市疾病預(yù)防控制中心,遼寧 撫順 113006)

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實(shí)時(shí)熒光RT-PCR與細(xì)胞培養(yǎng)法在流感病毒檢測(cè)中的應(yīng)用效果觀察

姚秀林
(遼寧省撫順市疾病預(yù)防控制中心,遼寧 撫順 113006)

【摘要】目的 分析研究實(shí)時(shí)熒光逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)RT-PCR和細(xì)胞培養(yǎng)法兩種檢測(cè)方法在流感病毒檢測(cè)中的應(yīng)用、及適合的領(lǐng)域。方法 采集2014年10月至2015年3月國(guó)家級(jí)流感檢測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院撫順市中心醫(yī)院內(nèi)科和兒科門診病例咽拭子樣本500份,同時(shí)采用實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè)流感病毒核酸,以及采用MDCK進(jìn)行陽性標(biāo)本培養(yǎng),分離流感病毒,比較兩種方法的靈敏度以及差異性。結(jié)果 在500份樣本中,通過熒光RT-PCR檢測(cè)陽性84份;通過MDCK細(xì)胞培養(yǎng)法陽性35份。二者之間的差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。結(jié)論 實(shí)施熒光RT-PCR在檢測(cè)流感病毒時(shí)快速有效,更適合應(yīng)急疫情的快速診斷。細(xì)胞培養(yǎng)法更適合核實(shí)疫情的實(shí)驗(yàn)室診斷,通過病毒抗原性和基因特性進(jìn)行分析,是流感病原學(xué)檢測(cè)的基礎(chǔ)。

【關(guān)鍵詞】實(shí)時(shí)熒光RT-PCR;細(xì)胞培養(yǎng)法;病毒核酸;MDCK

流感病毒可引起急性呼吸道疾病,具有傳染性,俗稱流行性感冒。目前流感已經(jīng)做到了全球監(jiān)測(cè),但是卻仍然無法完全控制,所以,有效的鑒定流感病毒,進(jìn)行有效分離是監(jiān)測(cè)和臨床診斷的基礎(chǔ)。本文通過實(shí)時(shí)熒光RT-PCR[1-2]、MDCK細(xì)胞培養(yǎng)法來對(duì)流感病毒的檢測(cè)分離進(jìn)行分析探討。

1 資料與方法

1.1標(biāo)本來源:2014年10月1日至2015年3月31日在國(guó)家級(jí)流感監(jiān)測(cè)哨點(diǎn)醫(yī)院撫順市中心醫(yī)院內(nèi)科和兒科門診就診患者,每周采集20份流感樣病例(體溫≥38 ℃,伴咳嗽或咽痛之一者)咽拭子樣本,置于MEM采樣液中,低溫運(yùn)送至實(shí)驗(yàn)室。樣本數(shù)量:500份。

1.2器材和試劑:儀器采用采用AB 7500 Fast熒光定量擴(kuò)增儀、倒置顯微鏡、二氧化碳培養(yǎng)箱。試劑來源:PCR試劑:提取試劑為QIAGEN RNeasy Mini Kit,擴(kuò)增試劑為甲、乙型流感病毒核酸檢測(cè)試劑盒(熒光探針PCR法)試劑廠家:江蘇碩世生物科技有限公司。細(xì)胞培養(yǎng)試劑:MDCK細(xì)胞由遼寧省疾控中心提供,抗A(H1N1)、抗A(H3N2)、抗A(SWL1)亞型血清,抗B型Yamagata、Victoria系病毒血清由國(guó)家流感中心提供,MEM、Hank's液、胎牛血清購(gòu)于GIBCO公司。

1.3方法

1.3.1實(shí)時(shí)熒光RT-PCR法:根據(jù)已采集的咽拭子進(jìn)行檢測(cè),并按照試劑盒說明進(jìn)行操作[3],用QIAGEN RNeasy Mini Kit提取樣本模板,通過反應(yīng)體系配置,后使用AB 7500 Fast熒光定量擴(kuò)增儀擴(kuò)增。

反應(yīng)條件:50 ℃30 min→95 ℃5 min預(yù)變性→95 ℃10 s變性55 ℃40 s退火、延伸及檢測(cè)熒光45cycle,55 ℃處收集熒光,檢測(cè)通道:FAM。

反應(yīng)體系配置:RT-PCR反應(yīng)液7.5 μL、酶混合液5 μL、甲型、乙型流感反應(yīng)液4 μL、去RNA酶水3.5 μL、病毒核酸/RNA5 μL,總體積25 μL。

1.3.2MDCK細(xì)胞培養(yǎng)法。流感病毒MDCK細(xì)胞分離步驟:①用無菌的移液管將清洗細(xì)胞的Hank's液從細(xì)胞培養(yǎng)瓶中移出;②用無菌的移液管吸取適量臨床標(biāo)本置于細(xì)胞培養(yǎng)瓶中,溫和搖動(dòng)數(shù)次;③然后放于37 ℃,5%CO2培養(yǎng)箱中吸附1 h;④吸出接種物,用Hank's液清洗細(xì)胞2遍;然后加入病毒生長(zhǎng)液于細(xì)胞培養(yǎng)瓶中;⑤放置于35 ℃培養(yǎng)箱培養(yǎng);⑥每日觀察細(xì)胞病變情況;⑦當(dāng)75%~100%細(xì)胞出現(xiàn)病變時(shí)進(jìn)行收獲,將HA≥16的樣本用血凝抑制試驗(yàn)(HI)判定流感病毒亞型[4]。

1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)方法:采用SPSS17.0軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)數(shù)資料比較采用χ2比較,運(yùn)用卡方檢驗(yàn),P<0.05差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié) 果

2.1自2014年10月1日起至2015年3月31日,分別通過兩種方法進(jìn)行檢測(cè)比較,500份咽拭子標(biāo)本通過熒光RT-PCT檢測(cè),結(jié)果檢測(cè)出陽性84份;通過MDCK細(xì)胞培養(yǎng)法檢測(cè),結(jié)果分離出陽性35份。見表1。

2.2通過兩種方法檢測(cè),綜合500份樣本總體檢測(cè)情況,實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè)陽性率為16.80%,MDCK細(xì)胞培養(yǎng)法檢測(cè)陽性率較低7.00%,二者之間差異明顯,具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.5804,P<0.05)。見表2。

3 討 論

通過對(duì)500份咽拭子運(yùn)用兩種方法檢測(cè),結(jié)果實(shí)時(shí)熒光RT-PCR檢測(cè)分離效果優(yōu)于MDCK細(xì)胞培養(yǎng)法,陽性率16.80%明顯高于細(xì)胞培養(yǎng)法7.00%。此方法具有一定的優(yōu)勢(shì),靈敏度高、簡(jiǎn)便快捷,通常可適用于流感爆發(fā)初期的大面積快速篩查,能及時(shí)準(zhǔn)確的為流感疫情處置提供有效依據(jù)。細(xì)胞培養(yǎng)法通常用于實(shí)驗(yàn)室診斷,主要針對(duì)流感病原的監(jiān)測(cè),其對(duì)于深入研究流感病毒的抗原性、耐藥性等方面更為顯著,但是細(xì)胞培養(yǎng)法由于操作較為復(fù)雜、耗費(fèi)時(shí)間過長(zhǎng)、需要活體病毒樣本,其對(duì)于標(biāo)本運(yùn)輸采集等環(huán)節(jié)限制比較明顯,要求很高[5],所以,細(xì)胞培養(yǎng)法針對(duì)流感爆發(fā)時(shí)的檢查以及臨床應(yīng)用上就有很大限制。

表1 2014年10月至2015年3月兩種方法分離流感病毒結(jié)果比較

表2 兩組檢測(cè)結(jié)果陽性率情況統(tǒng)計(jì)

綜上所述,兩種流感病毒的檢測(cè)手段,根據(jù)其不同的特點(diǎn),在運(yùn)用時(shí)應(yīng)區(qū)別對(duì)待,在流感爆發(fā)初期,應(yīng)選擇實(shí)時(shí)熒光RT-PCR法進(jìn)行檢測(cè),充分運(yùn)用其操作簡(jiǎn)單、及時(shí)的特點(diǎn),作為一種初選方法,而對(duì)于MDCK細(xì)胞培養(yǎng)法對(duì)核酸檢測(cè)陽性的標(biāo)本進(jìn)行分離,以此總體提高檢測(cè)效率。

參考文獻(xiàn)

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中圖分類號(hào):R511.7

文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:B

文章編號(hào):1671-8194(2016)04-0047-02

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