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食品微生物DNA能力驗證樣品的均勻性和穩(wěn)定性研究

2016-07-30 07:48:07侯大海劉云國徐云峰劉凌霄
農(nóng)產(chǎn)品加工 2016年12期
關(guān)鍵詞:實驗室檢測能力

侯大海,劉云國,張 亮,徐云峰,劉凌霄

(1.新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆烏魯木齊 830046;2.廣東產(chǎn)品質(zhì)量檢驗監(jiān)督研究院,廣東廣州 510330;3.青州榮美爾生物科技有限公司,山東青州 262500;4.黃島出入境檢驗檢疫局,山東青島 266000)

食品微生物DNA能力驗證樣品的均勻性和穩(wěn)定性研究

侯大海1,2,*劉云國1,3,張亮3,徐云峰4,劉凌霄3

(1.新疆大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,新疆烏魯木齊830046;2.廣東產(chǎn)品質(zhì)量檢驗監(jiān)督研究院,廣東廣州510330;3.青州榮美爾生物科技有限公司,山東青州262500;4.黃島出入境檢驗檢疫局,山東青島266000)

食品微生物DNA能力驗證,是利用DNA檢測方法,通過實驗室間微生物檢測結(jié)果的比對來確定實驗室檢測能力的活動。以沙門氏菌(Salmonella)基因組DNA為測試目標,開展了實驗室間食品微生物DNA檢測能力驗證樣品的制備,研究了DNA檢測能力驗證中樣品的均勻性和穩(wěn)定性,以期為食品微生物DNA能力驗證的運作提供指導(dǎo)。

食品微生物;DNA能力驗證;均勻性;穩(wěn)定性

實驗室能力驗證,是通過實驗室間檢測結(jié)果的比對來確定實驗室能力的活動。通過持續(xù)地開展實驗室能力驗證活動,可以有效地提高實驗室的品質(zhì)控制能力和檢測水平,并提高檢測結(jié)果的可靠性和權(quán)威性[1]。同時,為科研工作以及政府管理工作提供科學(xué)、客觀的信息。常規(guī)微生物能力驗證,通常指寄送含或不含目標測試菌盲樣時的驗證能力。由于可能存在致病微生物,常規(guī)微生物能力驗證方式在檢測樣品的運輸、儲存、檢測時,存在較大的生物安全隱患。實驗室能力驗證活動中采用滅活的微生物,通過提取DNA進行檢測的方法可消除這種危險。因而研究食源性致病微生物時,DNA檢測能力驗證的運作極其重要。能力驗證計劃中的樣品制備不同于一般檢測樣品的制備,除保證樣品具有代表性和可靠性外,還應(yīng)考慮樣品的均一性和穩(wěn)定性[2]。基于以上能力驗證規(guī)則的要求,本文研究了沙門氏菌(Salmonella)DNA樣品能力驗證中的均勻性和穩(wěn)定性試驗。

1 材料與方法

1.1沙門氏菌的培養(yǎng)和制備

沙門氏菌菌株,來源于美國典型微生物菌種保藏中心(ATCC)。沙門氏菌標準菌株(ATCC 49416)經(jīng)活化后,挑取單菌落接種到含有200 mL的TSBYE三角瓶中大量培養(yǎng),以轉(zhuǎn)速10 000 r/min離心5 min收集沉淀,加入雙蒸水重新懸浮,水浴滅活后,分裝到Eppendorf管中凍干制樣[3]。

1.2均勻性試驗

若F<自由度為(v1,v2) 及給定顯著性水平α(通常α=0.05)的臨界值 Fα(v1,v2),則表明樣品內(nèi)和樣品間無顯著性差異,因而樣品是均勻的。

1.3穩(wěn)定性試驗

采用室溫條件下的儲存溫度(20℃),進行穩(wěn)定性試驗。樣品制備完畢后間隔15 d,從沙門氏菌陽性樣品中各隨機抽取6份樣品,進行熒光定量PCR檢測。采用2個樣本均數(shù)顯著性檢驗-t檢驗進行統(tǒng)計分析。

自由度df=2(n-1)

若|t|<自由度為2(n-1)給定顯著性水平α(α= 0.05)的臨界值t0.05[2(n-1)],則表明2次檢測結(jié)果無顯著性差異,因而樣品是穩(wěn)定的。

2 結(jié)果與分析

2.1均勻性試驗

(1)樣品A為沙門氏菌陽性樣品。隨機選取A樣品6個,進行熒光定量PCR檢測,結(jié)果與已知本底結(jié)果相吻合,說明均為陽性。CT值的平均值為14.75。

(2)樣品B為沙門氏菌陰性樣品。經(jīng)隨機選取B樣品6個,進行熒光定量PCR檢測,結(jié)果與已知本底結(jié)果相吻合,說明結(jié)果均為陰性。

沙門氏菌陽性樣品的均勻性試驗結(jié)果(熒光定量PCR CT值)見表1,沙門氏菌樣品均勻性試驗方差分析結(jié)果見表2。

表1 沙門氏菌陽性樣品的均勻性試驗結(jié)果(熒光定量PCR CT值)

表2 沙門氏菌樣品均勻性試驗方差分析結(jié)果

F臨界值F0.05(5,6)=4.387,計算的F值為0.106 4,該值<F臨界值,無顯著性差異,這表明樣品中沙門氏菌含量均勻。

沙門氏菌均勻性試驗熒光定量PCR擴增曲線見圖1。

圖1 沙門氏菌均勻性試驗熒光定量PCR擴增曲線

2.2穩(wěn)定性試驗

沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗結(jié)果(熒光定量PCR CT值)見表3。

表3 沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗結(jié)果(熒光定量PCR CT值)

由表3可知,沙門氏菌陽性樣品第1次檢測的平均值結(jié)果為14.73,室溫條件下放置15 d后第2次檢測的平均值結(jié)果為14.93。

沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗結(jié)果見表4。

表4 沙門氏菌陽性樣品穩(wěn)定性試驗結(jié)果

t臨界值t0.05(10)=2.228,計算所得|t|值<t臨界值,無顯著性差異,這表明沙門氏菌樣品的穩(wěn)定性良好。

沙門氏菌穩(wěn)定性試驗熒光定量PCR擴增曲線見圖2。

圖2 沙門氏菌穩(wěn)定性試驗熒光定量PCR擴增曲線

3 結(jié)論與討論

本次沙門氏菌DNA能力驗證要求利用基于DNA技術(shù)的分子生物學(xué)手段進行檢測,試驗結(jié)果表明DNA樣品符合均勻性和穩(wěn)定性的要求。實驗室間食源致病微生物DNA檢測能力驗證提供的沙門氏菌檢測樣品已經(jīng)滅活,目的是消除能力驗證活動中食源致病微生物在運輸、儲存、檢測過程中的生物安全隱患。本次能力驗證活動的樣品在制備、保存、運輸、安全性等技術(shù)指標上均能達到實驗要求。本研究以CNAS-RL02∶2011能力驗證規(guī)則、CNASPD21∶2011能力驗證工作程序、CNAS-CL03∶2010能力驗證計劃提供者認可準則、ISO/IEC導(dǎo)則43-1∶1997利用實驗室間比對的能力驗證-能力驗證計劃的建立和運作、CNAS-CL04∶2010標準物質(zhì)/標準樣品生產(chǎn)者能力認可準則等規(guī)則為基礎(chǔ),結(jié)合食源致病微生物檢測實驗室的特點,通過對樣品均勻性、穩(wěn)定性等關(guān)鍵技術(shù)的研究,旨在建立一個與國際規(guī)范接軌、操作性強的食品微生物能力驗證關(guān)鍵技術(shù)規(guī)范。

[1]中國實驗室國家認可委員會.ISO/IEC 17025∶2005檢測和校準實驗室能力的通用要求 [S].北京:中國標準出版社,2005.

[2]中國合格評定國家認可委員會.CNAS-GL02∶2014能力驗證結(jié)果的統(tǒng)計處理和能力評價指南 [S].北京:中國標準出版社,2014.

[3]中華人民共和國衛(wèi)生部.GB 4789.4—2010食品安全國家標準食品微生物學(xué)檢驗沙門氏菌檢驗 [S].北京:中國標準出版社,2010.◇

Study on Uniformity and Stability of Food Micro-organism DNA Proficiency Testing

HOU Dahai1,2,*LIU Yunguo1,3,ZHANG Liang3,XU Yunfeng4,LIU Lingxiao3
(1.College of Life Science and Technology,Xinjiang University,Urumqi,Xinjiang 830046,China;2.Guangdong Testing Institute of Product Quality Supervision,Guangzhou,Guangdong 510330,China 3.Qingzhou Ronmer Biology Technology Co.,Ltd.,Qingzhou,Shandong 262500,China;4.Huangdao Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau,Qingdao,Shandong 266000,China)

Food micro-organism DNA proficiency testing is to determine the testing capacity by inter-laboratory testing results using DNA testing method.This study organized DNA proficiency testing of food micro-organism using genomic DNA of Salmonella as the test objective.The uniformity and stability of food micro-organism DNA samples are studied in order to provide guidance for the operation of DNA proficiency testing.

food micro-organism;DNA proficiency testing;uniformity;stability

R378

A

10.16693/j.cnki.1671-9646(X).2016.06.033

1671-9646(2016)06b-0022-03

2016-05-08

新疆大學(xué)自治區(qū)天山學(xué)者科研啟動金資金項目(45030);新疆自治區(qū)高層次人才引進工程專項經(jīng)費項目(45049)。

侯大海(1976— ),男,碩士,質(zhì)量工程師,研究方向為食品加工。
*

劉云國(1977— ),男,博士,教授級高級工程師,碩士生導(dǎo)師,研究方向為食品生物技術(shù)。

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