于欣楊震楚元奎于美玲張怡清
1.寧夏醫科大學臨床醫學院醫學檢驗系 寧夏銀川 750004;2.寧夏醫科大學臨床學院心臟中心 寧夏銀川 750004;3.寧夏醫科大學藥劑科 寧夏銀川 750004
TNF-a基因結構和功能生物信息學預測1*
于欣1楊震2△楚元奎1于美玲3張怡清1
1.寧夏醫科大學臨床醫學院醫學檢驗系 寧夏銀川 750004;2.寧夏醫科大學臨床學院心臟中心 寧夏銀川 750004;3.寧夏醫科大學藥劑科 寧夏銀川 750004
目的:以TNF-a為研究對象,對其蛋白結構進行生物信息學預測和分析。方法:利用生物信息學軟件對基因編碼的蛋白質結構、理化性質、信號肽、跨膜結構、亞細胞定位、二級結構進行生物信息學分析。結果:TNF-a為脂溶性、胞外為主的具有信號肽分泌的蛋白,有8個磷酸化位點和7個糖激化位點,二級結構以β折疊為主;結論:TNF-a是一個很重要的細胞因子,本研究對TNF-a蛋白結構與功能的初步探索,對在蛋白質水平進一步了解TNF-a基因蛋白效應,進而探索其與高血壓及炎癥的關系。
TNF-a,生物信息學
對于蛋白質結構和功能,盡管可以通過實驗方法來實現,但利用生物信息學可以成本低且快速預測分析蛋白質結構和功能特性,尤其是對一些臨床疾病參與的蛋白質的基礎研究具有更大理論價值[1]。 伴隨著分子遺傳學在檢驗醫學中的進步,一些臨床遺傳學研究從簡單的單基因疾病轉向于復雜的多基因疾病研究如心血管疾病,高血壓,各種腫瘤,炎癥[2]等的研究中,TNF-a 是具有多種生物活性的細胞因子,TNF-a是體內與內分泌、炎癥關系最為密切的炎性因子[3], 以自分泌以及旁分泌等多種形式對不同器官產生不一樣的生物學效應?!?br>