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淺談基因工程中獲取目的基因的幾種方法

2015-10-23 16:31:36于麗麗
文理導航 2015年30期
關鍵詞:方法

【摘 要】依據基因工程的實際特點,分別對獲得目的DNA的反向PCR、反轉錄PCR和錨定PCR等幾個常用的基因克隆方法進行了對應的介紹和分析。

【關鍵詞】反向PCR;反轉錄PCR;錨定PCR;基因克隆;方法

據實踐可知,實施基因工程的程序,首先是要取得目的DNA的片段,這是前期必要的步驟。因此,怎么去圓滿地完成這一過程,就成為了基因工程中的首要因素。單從目的DNA的提供方式而言,其只有分離天然動植物DNA及人造DNA兩種方式。而就獲得目的基因的方法而言,其基本上有PCR、化學合成、cDNA和設置基因文庫的方式進行優選等幾種類型。

1.何謂基因工程的PCR

在一九八五年,美國相關公司的數名專家首先設置了快速復制增加特性DNA片段的工藝技術,具體的化學名稱叫做聚合酶鏈式反應,其英文縮寫即為PCR。基因聚合酶起初是在一九五五年被發現的,而富含較高實用價值的聚合酶是在七十年代初期才被發現的。然而,因為此聚合酶不具有耐高溫性能,其在高溫的情況下就會發生較大的性能改變,所以,不適合高溫的聚合酶鏈式反應。現時被廣為使用的一種聚合酶,是在一九七六年取自于溫泉水里的一種細菌。它是具有相當耐高溫性能且極為完好的一種酶。初始的PCR概念基本是指基因的修復和復制,它具有單一和短暫的性能缺陷。從一九八三年開始,PE公司就率先應用了新的PCR。

因為PCR屬于一類體外快速增加指定DNA或其序列的功能系統,所以還可以取名為DNA的體外擴增法。在當今PCR工藝已經是人類獲取外部基因的一個最佳手段,只要掌握了目的DNA的核苷酸排序,人們即能夠擬定出一段引物,采取PCR工藝,在試管內設置反應過程,經歷若干小時以后,即可以把相當小量的目的DNA或指定的基因片段增加數十萬倍。甚至達到百萬倍。

2.PCR工藝過程機理

由于PCR工藝是一項體外復制特定基因片段的生物技術,所以,其與基因分子的體內復制過程有若干相似的情況,同時也存在著不少的相異地方。細胞里基因的復制過程是首先把雙鏈DNA分解螺旋變成單鏈DNA。爾后,RNA引物與單鏈DNA模板結好對,在有四種核苷酸底物的前提下,基因聚合酶與RNA引物的3端依據堿基互補配對的規則組合成具有互補性的基因鏈。經過一個復制過程后,單個基因分子變成了雙個基因分子。PCR就是代表試管里進行的基因復制經歷,其余體內基因復制模式相同,都要具備單鏈模板、引物、四種核苷酸底物、基因聚合酶,復制后達到相同的效果。其區別就是PCR所使用的引物是單鏈的基因引物,其聚合酶是屬于耐高溫性能的。在試管中所作的整個復制過程分三個過程:第一步是變性過程,其為PCR反應的第一階段,也就是把模板基因放置在九十五攝氏度左右的高溫之中,將雙鏈基因轉變成單鏈基因;第二步即為退火過程,也就是把反應溫度下調到五十攝氏度左右,促使一隊引物先后與變性后的兩個模板實施配對;第三步為延伸過程,即把反應溫度設置在聚合酶反應的最佳溫度七十二攝氏度,爾后,用目的基因做模板合成新的基因鏈。因為其所用聚合酶的耐高溫品質,在每個復制階段完成后,無需增加任一別的反應組分即能夠重新開始下一階段的復制。

3.PCR方法的基因復制

采用PCR復制DNA片段系基因工程的一項重要手段。

3.1依托反向PCR復制目的基因片段

由基因組依托PCR復制基因片段過程的重要一環是引物的擬定,通常能夠依據業已公布的基因排列擬定引物,也可以憑借原有的相關基因序列擬定引物。若要依據cDNA排列擬定引物增加基因數目,擬定引物時,必須顧及到cDNA基因沒有內含子,而gDNA存在內含子,擬定引物時,不能夠置于外顯子的拼接點上。擬定引物時,一般可以在引物的末端設置一個酶切位點,從而促進基因片段與載體的連接。

反向PCR系一類依托原有系列增加其旁側序列的模式,憑借此方法,能夠實施染色體步移。其開始的步驟,是把基因組DNA依靠限制性的內切酶給予切割開來,莎草用的限制酶必須在原有序列中不存在切點,而后再依托連接酶把酶切片段連接起來,與此類產物中,其含有原來序列的環形基因會得到大幅度增加。由此獲取原來基因片段的旁側序列。

3.2 cDNA的制備及cDNA文庫的建立

cDNA的制備可以采用RT-PCR方法。亦被稱作反轉錄PCR。其屬于一類酶促進制備方法,就是用mDNA做模板,依靠反轉錄酶的作用,用四種脫氧核甘三磷酸為反應物成分制備DNA,再通過復制以后就可得到雙鏈的基因。

3.3錨定PCR過程及基因的復制

經過RT-PCR過程獲取的大規模雙鏈cDNA以后,欲要精選分離出所需的特定目的基因,若不用cDNA文庫篩選時,尚可運用錨定PCR的方法將其收獲。此種措施的特點,是憑借原已存在的一中特異性的引物來實現,其尤其適合于擴增那些緊掌握一段序列形態的目的基因,比如一端序列已經知道,而另一段序列未知的基因片段,能夠依托基因末端轉移酶將cDNA第一個末端添上一端多聚dG尾巴,爾后添加一個末端屬于多聚dC的特異引物,由此決定了擴增的特性。錨定PCR是研究遺傳學及醫學的有效方法。

小結

通過上述介紹和分析,我們基本掌握了獲取目的基因的來源和幾種相當實用的基因克隆方法,這幾種很常用的方法,它們都有各自的特性和優點,我們在實際基因工程研究中,還要不斷的總結、完善并加以創新,促使其能夠更好地為我們人類的遺傳、醫學等相關行業服務。

【參考文獻】

[1]趙煥英,包金風.實時熒光定量PCR技術的原理及其應用研究進展[J].中國組織化學與細胞化學雜志,2007.16(4):492-497

[2]董明,宮月華,王蘭等.DNA提取的應用與相關技術分析[J].遺傳,2003.25(2):205-207

[3]郭燕霞,劉開會,邱寧等.6種特殊生物檢材的DNA提取[J].刑事技術,2002.5:52-53

【作者簡介】

于麗麗(1981.12-),籍貫:吉林省梨樹縣;單位:公主嶺實驗中學。

(作者單位:公主嶺實驗中學)

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