張婷婷,田 云,盧向陽
(1.湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,湖南 長沙410128;2.湖南省農(nóng)業(yè)生物工程研究所,湖南 長沙410128)
WRKY轉(zhuǎn)錄因子是近年來在植物中發(fā)現(xiàn)的新的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子,因其N端含有由WRKYGQK組成的保守氨基酸序列而得名。SPF1是第一個WRKY轉(zhuǎn)錄因子,由Ishiguro等[1]于1994年從白薯中得到。隨著研究的深入,相繼從煙草、擬南芥、水稻、堅果等植物中克隆到了更多WRKY轉(zhuǎn)錄因子。目前,又分別在葡萄和長春花中發(fā)現(xiàn)多達(dá)59個和47個WRKY轉(zhuǎn)錄因子[2-3]。WRKY轉(zhuǎn)錄因子與植物的各種生命進(jìn)程緊密相關(guān),在植物抗逆、抗病、生長發(fā)育等方面均起著重要的調(diào)控作用[4]。
作者在此綜述了WRKY轉(zhuǎn)錄因子在植物種子萌發(fā)、根莖葉的發(fā)育、繁殖以及衰老等過程中的作用及機(jī)理。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子由2部分組成:含WRKY結(jié)構(gòu)域的N端和含一個鋅指結(jié)構(gòu)域的C端[5]。其中,N端的WRKY結(jié)構(gòu)域能特異性識別下游靶基因的W-box域(含 TTGACC/T 序 列)。實 驗 證 明:W-box 是WRKY與DNA特異結(jié)合的最小共有序列,其核心序列是TGAC;改變核心序列TGAC中的任意一個堿基,WRKY的識別能力迅速降低甚至失去[4,6]。C端的鋅指結(jié)構(gòu)域主要有2種類型:C2-H2(C-X4-5-C-X22-23-H-X1-H)型 和 C2-HC(C-X7-C-X23-H-X1-C)型[5]。鋅指結(jié)構(gòu)的N端有2個胱氨酸殘基,C端有2個組氨酸殘基,這4個殘基在空間上形成一個洞穴,恰好容納1個鋅離子,由于鋅離子可穩(wěn)定模體重α-螺旋結(jié)構(gòu),致使此α-螺旋能鑲嵌于DNA的大溝中,因此含鋅指結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)都能與DNA或RNA結(jié)合。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子主要是通過特異性識別下游靶基因的W-box域或者通過調(diào)控靶基因的表達(dá),來實現(xiàn)植物生長發(fā)育調(diào)控及各種生理應(yīng)答。
根據(jù)鋅指結(jié)構(gòu)域的類型,可以將WRKY轉(zhuǎn)錄因子分成3大類,見圖1。
第Ⅰ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子有2個WRKY結(jié)構(gòu)域,其鋅指結(jié)構(gòu)域為 C2-H2型,包括 AtWRKY33、At-ZAP1、CsSE71、PcWRKY1和SPF1等轉(zhuǎn)錄因子;第Ⅱ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子含有1個WRKY結(jié)構(gòu)域,其鋅指結(jié)構(gòu)域也為C2-H2型,包括AfABF2、AtWRKY1、AtWRKY17、AtWRKY18和PcWRKY3等轉(zhuǎn)錄因子;第Ⅲ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子含1個WRKY結(jié)構(gòu)域,其鋅指 結(jié) 構(gòu) 域 為 C2-HC 型,包 括 AtWRKY53、At-WRKY70、NtWRKY3和NtWRKY4等轉(zhuǎn)錄因子。第Ⅲ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子僅存在于高等植物體中,且?guī)缀跛羞@類轉(zhuǎn)錄因子都與生物脅迫應(yīng)答反應(yīng)相關(guān),這也說明第Ⅲ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子是植物在脅迫環(huán)境下通過適應(yīng)進(jìn)化產(chǎn)生的[7]。

圖1 WRKY轉(zhuǎn)錄因子的主要結(jié)構(gòu)類型Fig.1 Structure types of WRKY transcription factors
研究發(fā)現(xiàn),WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族能在植物的眾多生理過程中起到至關(guān)重要的作用,并且眾多影響因子能對其進(jìn)行誘導(dǎo)。
表1 為部分與植物生長發(fā)育相關(guān)的WRKY轉(zhuǎn)錄因子。
研究表明,WRKY轉(zhuǎn)錄因子對植物種子的形成、種子的萌發(fā)及胚胎發(fā)育等一系列生長發(fā)育過程具有調(diào)控作用。
種子萌發(fā)是指種子從吸脹開始的一系列有序的生理過程。在種子的萌發(fā)過程中,早期胚乳會擴(kuò)散形成胚囊或種子腔,之后胚乳將被胚胎取代,WRKY轉(zhuǎn)錄因子可通過招募SHB1觸發(fā)胚乳擴(kuò)散和種子腔的擴(kuò)大,從而影響種子的萌發(fā)[32]。
水稻 OsWRKY78 能夠調(diào)控種子的萌發(fā)[8];Sc-WRKY1雖然在發(fā)育中的種子內(nèi)不表達(dá),但在受精后的魚雷期胚胎中有強(qiáng)烈的瞬時表達(dá),從而影響到植物體細(xì)胞或毛狀體的發(fā)育[9]。另外,一些 WRKY轉(zhuǎn)錄因子在調(diào)控種子萌發(fā)的過程中受到ABA的影響[33]:AtWRKY2基因調(diào)控ABA依賴型的種子萌發(fā)和萌發(fā)后的早期生長發(fā)育,其T-DNA插入突變株在種子萌發(fā)和萌發(fā)后的早期生長階段對ABA反應(yīng)是高敏感的[10];在ABA存在條件下,小麥TaWRKY71基因過表達(dá)植株能夠提高種子萌發(fā)率,說明TaWRKY71基因能夠調(diào)控種子萌發(fā)[11]。
研究發(fā)現(xiàn),在植物根、莖、葉的形成發(fā)育方面,WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族起到了不可或缺的作用。
Ishida等[12]通過酵母單雜交實驗發(fā)現(xiàn),TTG2轉(zhuǎn)錄因子在擬南芥根的形成中起重要作用:抑制TTG2在植株中的表達(dá),導(dǎo)致根毛不能正常發(fā)育;AtWRKY75作為一個受病原菌誘導(dǎo)表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子,主要調(diào)控側(cè)根和根毛的生長,不僅參與調(diào)控植物葉片的衰老過程,還調(diào)控植物根的生長發(fā)育過程[14];At-WRKY68在嫩葉、根和老莢果中都有表達(dá),其中在根中的表達(dá)量最高,實驗發(fā)現(xiàn)AtWRKY68可能參與生長素和溫度調(diào)控的植物形態(tài)建設(shè)及發(fā)育過程[15];另外,植物生長素梯度對于維持根分生組織的活動至關(guān)重要,植物生長素的合成需要大量的黃酮醇,WRKY23在黃酮醇合成和根的生長過程中起重要作用[16]。

表1 與植物生長發(fā)育相關(guān)的WRKY轉(zhuǎn)錄因子Tab.1 WRKY Transcription factors related with plant growth and development
Zhang等[8]研究表明,OsWRKY78能夠調(diào)控莖的伸長:實時RT-PCR分析發(fā)現(xiàn),OsWRKY78在伸長的莖中表達(dá)量最豐富,抑制OsWRKY78表達(dá)將導(dǎo)致植物中體細(xì)胞長度的縮短。
于延沖[17]研究發(fā)現(xiàn),AtWRKY71能調(diào)控擬南芥的分枝發(fā)育。另外,某些與抗病能力相關(guān)的 WRKY轉(zhuǎn)錄因子也與植物生長發(fā)育密切相關(guān),如棉花Gh-WRKY15基因編碼的WRKY轉(zhuǎn)錄因子不僅有助于植物抵抗病毒和真菌感染,還能影響植物莖的伸長[18]。
植物的有性繁殖包括花的發(fā)育、果實和種子的形成。
開花是植物生命周期中的關(guān)鍵步驟,WRKY轉(zhuǎn)錄因子主要的調(diào)控作用表現(xiàn)為影響植物開花時間,且這種調(diào)控可能主要通過影響開花相關(guān)基因(FLC、FT、SOC1和CO)和花分生組織特征基因(AP1、SEP3、AP3、PI和AG)的表達(dá)來實現(xiàn)的。
Yu等[19]研究證實,WRKY轉(zhuǎn)錄因子能夠調(diào)控開花相關(guān)基因的表達(dá):芒草MlWRKY12蛋白為一個核蛋白,屬于Ⅱ類WRKY轉(zhuǎn)錄因子,主要存在于維管束鞘和薄壁細(xì)胞中,其過表達(dá)植株出現(xiàn)提前開花的特性,定量RT-PCR分析發(fā)現(xiàn)MlWRKY12的過表達(dá)對CO的表達(dá)水平有顯著影響。
王芳秀等[20]研究表明,WRKY轉(zhuǎn)錄因子很可能通過調(diào)控花分生組織特征基因的表達(dá)來影響開花:過量表達(dá)WRKY25的轉(zhuǎn)基因擬南芥在長光照下比野生型植株提前開花,且AP1基因的表達(dá)量在培養(yǎng)21d和27d的WRKY25過表達(dá)植株中均有上調(diào),由此推測WRKY25很可能通過增強(qiáng)AP1的表達(dá)來影響開花。
Luo等[21]研究證實,大豆GsWRKY20的表達(dá)株系在各種處理條件下都能比野生型株系提早開花,GsWRKY20加速植物開花可能主要是通過調(diào)控開花相關(guān)基因和花分生組織特征基因的表達(dá)來實現(xiàn)的。另有研究表明,AtWRKY71也能介導(dǎo)高鹽誘導(dǎo)下擬南芥的開花提前[17]。
種子是由胚珠經(jīng)過傳粉授精形成的。種子通常由種皮、胚和胚乳3部分構(gòu)成,少數(shù)植物的種子只有種皮和胚2部分。擬南芥種子的大小是由IKU路徑調(diào)節(jié),它包括KU2和MINI3,其中由MINI3編碼的At-WRKY10 具 有 調(diào) 控 胚 乳 增 殖 的 功 能[22];Johnson等[13]在擬南芥突變體中發(fā)現(xiàn)一種被Tag1內(nèi)源性轉(zhuǎn)座子標(biāo)記的TTG2基因,該基因表達(dá)的蛋白能影響種皮的生長發(fā)育進(jìn)程(即種子的形成);擬南芥AtWRKY10(MINI3)和AtWRKY44(TTG2)基因能調(diào)控種皮的發(fā)育和種子的大小;麻瘋樹JcWRKY04基因(與MINI3和TTG2直接同源)在種子的早期發(fā)育中起調(diào)控作用[23];玉米ZmWRKY116.2、-116.3 基因(與TTG2直接同源)編碼的WRKY蛋白能調(diào)控單寧酸產(chǎn)量和種皮發(fā)育[24]。
衰老是植物生長發(fā)育中的一個過程,衰老過程涉及到很多轉(zhuǎn)錄因子和相關(guān)基因。其中植物特異性轉(zhuǎn)錄因子WRKY家族中的部分成員在這個過程中起到了至關(guān)重要的作用,包括單個 WRKY轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控作用以及WRKYs轉(zhuǎn)錄因子之間直接或間接的相互調(diào)控作用。
植物葉片的衰老過程受到衰老相關(guān)基因(SAGs)的調(diào)控。葉片衰老數(shù)據(jù)庫中SAGs候選基因的功能性分析顯示W(wǎng)RKY轉(zhuǎn)錄因子中的擬南芥AtWRKY75在葉片衰老過程中起正調(diào)控作用,AtWRKY75功能的缺失將延緩葉片衰老[34];擬南芥中,AtWRKY6 和AtWRKY18都與葉片衰老有關(guān)[25-26];通過對小麥旗葉衰老的芯片信息分析發(fā)現(xiàn),WRKYs轉(zhuǎn)錄因子的表達(dá)水平有明顯上調(diào),證明WRKY轉(zhuǎn)錄因子具有調(diào)控小麥旗葉衰老的功能[35]。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子的植物生長發(fā)育調(diào)控能力和抗病能力之間存在著某些密切的聯(lián)系。Murray等[29]研究發(fā)現(xiàn),AtWRKY53的缺失突變體更易受到感染,說明AtWRKY53是一個具有抗病性的調(diào)控因子;Miao等[30]研究表明,AtWRKY53具有加速葉片衰老的功能,在插入失活的AtWRKY53表達(dá)植株中,葉片衰老時間明顯延遲;AtWRKY70不但是病原防御轉(zhuǎn)錄因子,還是植株衰老的負(fù)調(diào)控因子,AtWRKY70的功能缺失將加速突變株衰老[31]。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子對植物生長發(fā)育的調(diào)控還可以通過直接的相互作用或者形成網(wǎng)絡(luò)信號途徑來實現(xiàn)。擬南芥中,AtWRKY54和AtWRKY70負(fù)調(diào)控葉片的衰老,且表現(xiàn)出相互作用及部分功能冗余現(xiàn)象。酵母雙雜交實驗顯示,AtWRKY54、AtWRKY70 和At-WRKY53能夠單獨地與AtWRKY30發(fā)生相互作用,通過這些相互作用可以招募到更多其它相關(guān)蛋白參與衰老途徑,形成以AtWRKY30為中心的葉片的衰老調(diào)控網(wǎng)絡(luò)[28]。之前的研究表明,擬南芥AtWRKY6與葉片衰老有關(guān)[25],Zhou等[27]通過進(jìn)一步的實驗表明:AtWRKY22不僅能夠參與調(diào)控黑暗誘導(dǎo)的植物葉片細(xì)胞衰老過程,還可以分別與AtWRKY6、At-WRKY53和AtWRKY70相互調(diào)控。
WRKY轉(zhuǎn)錄因子能夠參與植物的生長發(fā)育和生理進(jìn)程,并在這些過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,但其中的眾多作用機(jī)理尚不明確。近期的研究發(fā)現(xiàn),相關(guān)的WRKY轉(zhuǎn)錄因子不僅可以發(fā)生相互作用,還能構(gòu)建更為復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),從而實現(xiàn)調(diào)控植物生長發(fā)育等各方面的功能。確定WRKY轉(zhuǎn)錄因子之間、WRKY轉(zhuǎn)錄因子與其它蛋白之間的相互作用機(jī)理將進(jìn)一步闡述WRKY轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控模式和作用方式,有助于建立完善的 WRKY轉(zhuǎn)錄因子的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。同時,WRKY轉(zhuǎn)錄因子的抗病能力和調(diào)節(jié)植物生長發(fā)育之間的關(guān)系也是一個研究熱點。今后的方向不僅僅是研究WRKY轉(zhuǎn)錄因子的功能多樣性,更多的是要探尋其調(diào)控植物生長發(fā)育過程的作用機(jī)理和模式。隨著基因?qū)W、生物信息學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)等多學(xué)科的成熟,WRKY轉(zhuǎn)錄因子家族對植物生長發(fā)育的作用機(jī)理將更加清晰。
[1]ISHIGURO S,NAKAMURA K.Characterization of a cDNA encoding a novel DNA-binding protein,SPF1,that recognizes SP8 sequences in the 5′upstream regions of genes coding for sporamin andβ-amylase from sweet potato[J].Mol Gen Genet,1994,244(6):563-571.
[2]GUO C,GUO R,XU X,et al.Evolution and expression analysis of the grape(Vitis vinifera L.)WRKY gene family[J].J Exp Bot,2014,65(16):1513-1528.
[3]楊致榮,王興春,薛金愛,等.藥用植物長春花 WRKY轉(zhuǎn)錄因子的鑒定及表達(dá)譜分析[J].生物工程學(xué)報,2013,29(6):785-802.
[4]AGARWAL P,REDDY M P,CHIKARA J.WRKY:Its structure,evolutionary relationship,DNA-binding selectivity,role in stress tolerance and development of plants[J].Mol Biol Rep,2011,38(6):3883-3896.
[5]RUSHTON P J,SOMSSICH I E,RINGLER P,et al.WRKY Transcription factors[J].Trends Plant Sci,2010,15(5):247-258.
[6]YAMASAKI K,KIGAWA T,SEKI M,et al.DNA-Binding domains of plant-specific transcription factors:Structure,function,and evolution[J].Trends Plant Sci,2013,18(5):267-276.
[7]EULGEM T,RUSHTON P J,ROBATZEK S,et al.The WRKY superfamily of plant transcription factors[J].Trends Plant Sci,2000,5(5):199-206.
[8]ZHANG C Q,XU Y,LU Y,et al.The WRKY transcription factor OsWRKY78 regulates stem elongation and seed development in rice[J].Planta,2011,234(3):541-554.
[9]LAGACE M,MATTON D P.Characterization of a WRKY transcription factor expressed in late torpedo-stage embryos of Solanum chacoense[J].Planta,2004,219(1):185-189.
[10]JIANG W B,YU D Q.Arabidopsis WRKY2transcription factor mediates seed germination and postgermination arrest of development by abscisic acid[J].BMC Plant Biol,2009,9:96.
[11]XU Q,F(xiàn)ENG W J,PENG H R,et al.TaWRKY71,A WRKY transcription factor from wheat,enhances tolerance to abiotic stress in transgenic Arabidopsis thaliana[J].Cereal Res Commun,2014,42(1):47-57.
[12]ISHIDA T,HATTON S,SANO R,et al.Arabidopsis TRANSPARENT TESTA GLABRA2 is directly regulated by R2R3 MYBtranscription factors and is involved in regulation of GLABRA2 transcription in epidermal differentiation[J].Plant Cell,2007,19(8):2531-2543.
[13]JOHNSON C S,KOLEVSKI B,SMYTH D R.TRANSPARENT TESTA GLABRA2,a trichome and seed coat development gene of Arabidopsis,encodes a WRKY transcription factor[J].Plant Cell,2002,14(6):1359-1375.
[14]CHOI C,PARK Y H,KWON S I,et al.Identification of At-WRKY75 as a transcriptional regulator in the defense response to Pcc through the screening of Arabidopsis activation-tagged lines[J].Plant Biotechnol Rep,2014,8(2):183-192.
[15]王學(xué)蘭,林良斌,余迪求.擬南芥WRKY68轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的表達(dá)譜分析[J].植物分類與資源學(xué)報,2013,35(1):41-47.
[16]GRUNEWALD W,de SMET I,LEWIS D R,et al.Transcription factor WRKY23 assists auxin distribution patterns during Arabidopsis root development through local control on flavonol biosynthesis[J].Proc Natl Acad Sci USA,2012,109(5):1554-1559.
[17]于延沖.擬南芥轉(zhuǎn)錄因子WRKY71對花和分枝發(fā)育的調(diào)控機(jī)制研究[D].濟(jì)南:山東大學(xué),2011.
[18]YU F F,HUAXIA Y F,LU W J,et al.GhWRKY15,A member of the WRKY transcription factor family identified from cotton(Gossypium hirsutumL.),is involved in disease resistance and plant development[J].BMC Plant Biol,2012,12:144.
[19]YU Y C,HU R B,WANG H M,et al.MlWRKY12,A novel Miscanthus transcription factor,participates in pith secondary cell wall formation and promotes flowering[J].Plant Sci,2013,212:1-9.
[20]王芳秀,黎舒佳,余迪求.WRKY25過量表達(dá)導(dǎo)致擬南芥在長光照下開花提前[J].植物分類與資源學(xué)報,2011,33(6):653-659.
[21]LUO X,SUN X L,LIU B H,et al.Ectopic expression of a WRKY homolog fromGlycine sojaalters flowering time in Arabidopsis[J].PLoS One,2013,8(8):e73295.
[22]LUO M,DENNIS E S,BEACOCK W J,et al.MINISEED3(MINI3),A WRKY family gene,and HAIKU2(IKU2),a leucine-rich repeat(LRR)KINASEgene,are regulators of seed size in Arabidopsis[J].Proc Natl Acad Sci USA,2005,102(48):17531-17536.
[23]XIONG W,XU X,ZHANG L,et al.Genome-wide analysis of the WRKY gene family in physic nut(Jatropha curcas L.)[J].Gene,2013,524(2):124-132.
[24]WEI K F,CHEN J,CHEN Y F,et al.Molecular phylogenetic and expression analysis of the complete WRKY transcription factor family in maize[J].DNA Res,2012,19(2):153-164.
[25]ROBATZEK S,SOMSSICH I E.A new member of the Arabidopsis WRKY transcription factor family,AtWRKY6,is associated with both senescence-and defence-related processes[J].Plant J,2001,28(2):123-133.
[26]CHEN C,CHEN Z.Potentiation of developmentally regulated plant defense response by AtWRKY18,apathogen-induced Arabidopsis transcription factor[J].Plant Physiol,2002,129(2):706-716.
[27]ZHOU X,JIANG Y,YU D.WRKY22 Transcription factor mediates dark-induced leaf senescence in Arabidopsis[J].Mol Cells,2011,31(4):303-313.
[28]BESSEAU S,LI J,PALVA E T.WRKY54 and WRKY70 co-operate as negative regulators of leaf senescence in Arabidopsis thaliana[J].J Exp Bot,2012,63(7):2667-2679.
[29]MURRAY S L,INGLE R A,PETERSEN L N,et al.Basal resistance against Pseudomonas syringae in Arabidopsis involves WRKY53 and a protein with homology to a nematode resistance protein[J].Mol Plant Microbe Interact,2007,20(11):1431-1438.
[30]MIAO Y,ZENTGRAF U.The antagonist function of Arabidopsis WRKY53 and ESR/ESP in leaf senescence is modulated by the jasmonic and salicylic acid equilibrium[J].Plant Cell,2007,19(3):819-830.
[31]UIKER B,SHAHID M M,SOMSSICH I E.The WRKY70 transcription factor of Arabidopsis influences both the plant senescence and defense signaling pathways[J].Planta,2007,226(1):125-137.
[32]KANG X,LI W,ZHOU Y,et al.A WRKY transcription factor recruits the SYG1-like protein SHB1to activate gene expression and seed cavity enlargement[J].PLoS Genet,2013,9(3):e1003347.
[33]RUSHTON D L,TRIPATHI P,RABARA R C,et al.WRKY Transcription factors:Key components in abscisic acid signaling[J].Plant Biotech J,2012,10(1):2-11.
[34]LI Z,PENG J,WEN X,et al.Gene network analysis and functional studies of senescence-associated genes reveal novel regulators of Arabidopsis leaf senescence[J].Integr Plant Biol,2012,54(8):526-539.
[35]ZHU X L,LIU S W,MENG C,et al.WRKY Transcription factors in wheat and their induction by biotic and abiotic stress[J].Plant Mol Biol Rep,2013,31(5):1053-1067.