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利用Python改進(jìn)性狀分離比模擬實(shí)驗(yàn)

2021-03-25 02:28:48深圳第二外國語學(xué)校廣東深圳518110
生物學(xué)通報(bào) 2021年6期
關(guān)鍵詞:程序語言實(shí)驗(yàn)

許 凡 (深圳第二外國語學(xué)校 廣東深圳 518110)

模擬實(shí)驗(yàn)是一種常用的科學(xué)探究方法。通過對(duì)研究對(duì)象進(jìn)行模擬并建立模型,在模型的基礎(chǔ)上進(jìn)行研究,進(jìn)而揭示研究對(duì)象的本質(zhì)與活動(dòng)規(guī)律。

1 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容分析

性狀分離比的模擬實(shí)驗(yàn)是《普通高中生物學(xué)課程標(biāo)準(zhǔn)(2017年版)》中活動(dòng)建議“模擬植物或動(dòng)物性狀分離的雜交實(shí)驗(yàn)”,是人教版教材必修2《遺傳與進(jìn)化》模塊中第1 章“遺傳因子的發(fā)現(xiàn)”中的重要實(shí)驗(yàn)。該實(shí)驗(yàn)旨在讓學(xué)生通過模擬實(shí)驗(yàn)從感性上認(rèn)識(shí)遺傳因子的分離、配子的隨機(jī)結(jié)合與性狀之間的數(shù)量關(guān)系,通過體驗(yàn)孟德爾的假說深刻理解性狀分離比產(chǎn)生的原因及條件,從而突破分離定律的本質(zhì)這一教學(xué)重難點(diǎn)[1]。

該實(shí)驗(yàn)的實(shí)驗(yàn)器材僅為顏色不同的乒乓球與塑料小桶,易于準(zhǔn)備,但在實(shí)際教學(xué)過程中,更多教師選擇用動(dòng)畫或講解的方法完成實(shí)驗(yàn)教學(xué),而非讓學(xué)生完成實(shí)驗(yàn)。因?yàn)楸緦?shí)驗(yàn)雖操作簡單,但若希望實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)正確的性狀分離比,則需要加大抽取次數(shù)以確保樣本量足夠大,這會(huì)增加耗時(shí);且該實(shí)驗(yàn)中雌、雄配子隨機(jī)結(jié)合是模擬實(shí)驗(yàn)成功的關(guān)鍵。但人為抓取很難保證隨機(jī)性[2]。

2 改進(jìn)后的實(shí)驗(yàn)方案

原理:原實(shí)驗(yàn)中以2個(gè)小桶分別模擬雌、雄生殖器官,顏色不同的乒乓球模擬基因型不同的雌、雄配子,再通過隨機(jī)抽取并組合模擬雌、雄配子的隨機(jī)結(jié)合。從數(shù)學(xué)的角度上看,雌、雄生殖器官相當(dāng)于2 個(gè)集合,雌、雄配子的基因型即集合中的元素,若設(shè)計(jì)一段Python 語言,每次運(yùn)行均可隨機(jī)從2 個(gè)集合中各抽取1 個(gè)元素并進(jìn)行組合,便能完整模擬該過程。

Python 是一種跨平臺(tái)的計(jì)算機(jī)程序設(shè)計(jì)語言。是一個(gè)高層次的結(jié)合了解釋性、編譯性、互動(dòng)性和面向?qū)ο蟮哪_本語言,常被用于軟件開發(fā)、網(wǎng)絡(luò)爬蟲、科學(xué)計(jì)算和統(tǒng)計(jì)等領(lǐng)域。且Python語言易于解讀,即使對(duì)編程一無所知,學(xué)生也可合理猜測代碼的含義并進(jìn)行簡單修改。本文嘗試?yán)肞ython 解釋器軟件編寫源代碼,使學(xué)生在課堂上可通過變更實(shí)驗(yàn)參數(shù),快速獲得模擬實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。

計(jì)算機(jī)配置:Python 解釋器有針對(duì)Linux、Windows、OS X 系統(tǒng)的版本可從http://python.org/免費(fèi)下載。本節(jié)課所用程序運(yùn)算量較小,只要能安裝系統(tǒng)的電腦均可順利運(yùn)行。但一般的Python 解釋器界面比較單一,推薦下載“海龜編輯器”供上課使用(https://python.codemao.cn/)。

方法步驟:利用編程類軟件(如“海龜編輯器”)編輯Python 語言,輸入如圖1程序后,保存為“*.py”格式文件。在課堂上學(xué)生只需要點(diǎn)擊運(yùn)行,即可出現(xiàn)雌、雄配子每次隨機(jī)結(jié)合的基因型,并統(tǒng)計(jì)出各種基因型出現(xiàn)的次數(shù)(圖2),且每次運(yùn)行都是獨(dú)立事件,會(huì)獲得不同的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

圖1 利用Python 模擬豌豆雜交實(shí)驗(yàn)(一)

圖2 運(yùn)行程序后呈現(xiàn)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果

3 改進(jìn)方案優(yōu)勢(shì)分析

3.1 快速獲得可靠結(jié)果,提高課堂效率 學(xué)生利用Python 進(jìn)行模擬實(shí)驗(yàn)時(shí),只需1 s 便能快速獲得實(shí)驗(yàn)結(jié)果,相較小球抽取的方法更加便捷,且電腦操作可保證隨機(jī)性。

3.2 學(xué)生可隨意修改樣本量 教師可將提供給學(xué)生的文件中的樣本量設(shè)置為10,當(dāng)學(xué)生運(yùn)行后發(fā)現(xiàn)結(jié)果不符合3:1 時(shí),教師再引導(dǎo)學(xué)生思考樣本量大小對(duì)于該實(shí)驗(yàn)準(zhǔn)確度的影響。學(xué)生對(duì)程序文件進(jìn)行簡單修改后,可更改樣本量。具體操作方法為:將程序文件中“for i in range(1,11)”的數(shù)字進(jìn)行更改,即將“11”改為“樣本量+1”。若期望樣本量為100,則修改為“101”。經(jīng)筆者測試,即使將樣本量修改為10 000 后,也僅需3 s 即可出現(xiàn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果。

3.3 修改集合元素,利于學(xué)生自主學(xué)習(xí) 經(jīng)改進(jìn)后,操作時(shí)間極大縮短,實(shí)驗(yàn)的原理也更加清晰,教師可在此基礎(chǔ)上將實(shí)驗(yàn)進(jìn)行延伸,探究基因連鎖現(xiàn)象與自由組合定律的本質(zhì)[3]。

在完成上述實(shí)驗(yàn)后,教師可提問:若A/a所在染色體上存在另一對(duì)等位基因B/b,且A和B在同一染色體上,如何修改程序模擬該個(gè)體自交后代性狀分離比?學(xué)生通過討論可得出結(jié)論:修改2個(gè)集合的元素,即將集合{A,a}修改為{AB,ab}。

進(jìn)一步提問:若A/a與B/b2對(duì)等位基因位于非同源染色體上,如何模擬非等位基因的自由組合與自交后代的性狀分離比?學(xué)生首先需要修改程序模擬非等位基因自由組合的過程(圖3),再模擬4 種配子結(jié)合的過程(程序見圖4)。

圖3 利用Python 模擬非等位基因自由組合過程

圖4 利用Python 模擬豌豆雜交實(shí)驗(yàn)(二)

學(xué)生在思考問題的同時(shí)便完成了知識(shí)的遷移,修改程序并運(yùn)行獲得相應(yīng)結(jié)果可提高學(xué)生學(xué)習(xí)的成就感,并具有高度自我效能感,使其有信心挑戰(zhàn)更多的遺傳學(xué)問題。

4 結(jié)語

隨著高中教學(xué)改革的逐步推進(jìn),如何提高高中生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)質(zhì)量成為當(dāng)前高中生物學(xué)教學(xué)面臨的又一挑戰(zhàn)。在新媒體背景下,數(shù)字化實(shí)驗(yàn)?zāi)J叫枰饾u走進(jìn)高中課堂,如何科學(xué)利用新媒體技術(shù)推動(dòng)中學(xué)生物學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)創(chuàng)新發(fā)展,也是亟待教師思考的問題[4]。本文通過引進(jìn)Python語言模擬性狀分離比實(shí)驗(yàn),可充分發(fā)揮學(xué)生的能動(dòng)性,教師僅需在課前準(zhǔn)備好最初的編程語言,在課上對(duì)語言進(jìn)行簡單的講解、疑問解答,學(xué)生通過合作與討論,邊操作邊思考,邊討論邊嘗試,通過問題的深入與知識(shí)的遷移,學(xué)生對(duì)微觀的遺傳規(guī)律及本質(zhì)理解得更加透徹。

此外,當(dāng)前學(xué)科之間的交融愈發(fā)明顯,例如,在本節(jié)課Python 語言的編寫過程中,既要求學(xué)生正確理解生物學(xué)科孟德爾遺傳定律,也需要運(yùn)用高中數(shù)學(xué)“算法與程序框圖”的邏輯能力;既體現(xiàn)注重改造創(chuàng)新的技術(shù)型,又體現(xiàn)了注重項(xiàng)目改造開發(fā)的工程型,是STEM 教育(科學(xué)、技術(shù)、工程、數(shù)學(xué))理念的具體應(yīng)用,提高學(xué)生聯(lián)系各學(xué)科知識(shí)及處理問題的能力。

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