劉春,李瓊艷,荀利杰,胡文波,呂金風,劉茹鳳,夏慶友
家蠶基因組生物學國家重點實驗室,農業部蠶桑重點實驗室,西南大學,重慶 400715
家蠶光澤小眼(varnished eye)突變基因的精細定位
劉春,李瓊艷,荀利杰,胡文波,呂金風,劉茹鳳,夏慶友
家蠶基因組生物學國家重點實驗室,農業部蠶桑重點實驗室,西南大學,重慶 400715
家蠶(Bombyx mori)光澤小眼(varnished eye,ve)突變體是家蠶突變品種中少數關于家蠶復眼形態異常的自然隱性突變品種之一,表現為成蟲復眼小,表面富有光澤,有瘤狀突起;小眼數量少且不規則。經典遺傳學連鎖圖譜將ve基因定位在第6連鎖群32.2座位,但到目前為止,該突變性狀的形成機理仍不清楚。文章以突變品種ve和對照品種Dz為親本,雜交產生的F1代雄個體與輪回親本ve雌個體回交產生的BC1代為材料進行ve基因的精細定位。通過對ve低密度連鎖圖譜分析發現,ve基因被定位在SNP3~SNP6之間,物理圖譜距離大約為1.2 Mb。利用1563個BC1代個體構建ve高密度連鎖圖譜,最終將ve基因定位在SNP5~SNP61之間,物理圖譜距離大約為221.8 kb。通過家蠶基因數據庫對ve最終定位區域內進行預測基因檢索,發現有6個預測基因。對6個預測基因進行生物信息學分析和測序,這些候選基因都有可能參與家蠶復眼形成,但在編碼區沒有發現ve特異的突變位點;對這些候選基因進行表達分析,發現編號為BGIBMGA013642的候選基因在ve復眼形成過程中的表達量明顯比正常對照Dz低,推測該基因為最佳候選基因。
家蠶;光澤小眼;SNP標記;精細定位;候選基因
昆蟲視覺器官能夠感受波長范圍為253~700 nm的光波,光波受體細胞刺激產生生物電位,傳播到中樞神經系統引起視覺反應。……