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點(diǎn)狀掌跖角化病3家系A(chǔ)AGAB致病基因突變位點(diǎn)檢測(cè)

2014-03-22 13:19:21巖陳明飛吳梅亓興亮劉紅田洪青張福仁
關(guān)鍵詞:基因突變

張 巖陳明飛吳 梅亓興亮劉 紅田洪青張福仁?

·經(jīng)驗(yàn)交流·

點(diǎn)狀掌跖角化病3家系A(chǔ)AGAB致病基因突變位點(diǎn)檢測(cè)

張 巖1,2,3陳明飛3吳 梅3亓興亮3劉 紅3田洪青3張福仁3?

目的: 檢測(cè)點(diǎn)狀掌跖角化病家系中AAGAB基因的突變。方法: 分別對(duì)來自3個(gè)家系的3例患者應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增外周血基因組AAGAB基因的10個(gè)外顯子及鄰近內(nèi)含子區(qū)域,對(duì)其產(chǎn)物直接測(cè)序和序列分析。結(jié)果: 3例患者的AAGAB基因編碼區(qū)均未發(fā)現(xiàn)突變位點(diǎn)。結(jié)論: AAGAB基因與本研究中的點(diǎn)狀掌跖角化病患者發(fā)病無關(guān)聯(lián),提示可能存在其它致病基因。

點(diǎn)狀掌跖角化病; AAGAB基因; 基因突變

點(diǎn)狀掌跖角化病(punctate palmoplantar keratoderma,PPPK)是一種罕見的常染色體顯性遺傳性皮膚病,1由Buschke和Fischer 1910年首次報(bào)道。22003年Martinez-Mir等3通過全基因組掃描,將該病的致病基因定位于15q22-q24。此后,Zhang等4利用連鎖分析,將該病的致病基因定位于8q24.13-24.21。2012年Giehl等5利用全基因組外顯子測(cè)序技術(shù)發(fā)現(xiàn)本病的致病基因是位于15q22.33-q23區(qū)間的AAGAB基因,Pohler等6對(duì)此基因進(jìn)行了功能學(xué)上的分析。本實(shí)驗(yàn)對(duì)引起點(diǎn)狀掌跖角化病的AAGAB基因進(jìn)行了驗(yàn)證。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 3個(gè)PPPK家系(圖1)共3例患者,均來自山東省,知情同意后自愿參加本研究。所有患者均有典型掌跖部位特別是受壓部位圓形或卵圓形,較硬的黃色或淡黃色角質(zhì)丘疹(圖2)。組織病理示:表皮致密而顯著的角化過度柱,呈局灶性,界限清楚,顆粒層增厚。患者發(fā)病年齡16~25歲。

1.2 方法

1.2.1 基因組DNA的提取 知情同意后,收集PPPK患者外周血4 mL,2%EDTA抗凝,利用Axygen劑盒提取基因組DNA。

1.2.2 PCR擴(kuò)增AAGAB基因全部外顯子 通過美國(guó)國(guó)家生物信息中心(NCBI)的基因庫檢索到AAGAB基因序列,利用Premier Primer3軟件設(shè)計(jì)引物(表1)。PCR擴(kuò)增包括AAGAB基因的編碼區(qū)的10個(gè)外顯子及其兩側(cè)翼序列。

1.2.3 DNA測(cè)序PCR產(chǎn)物經(jīng)醋酸鈉-乙醇沉淀法純化后,利用ABI 3130XL遺傳分析儀進(jìn)行直接測(cè)序,并進(jìn)行結(jié)果分析。

2 結(jié)果

以上檢測(cè)未發(fā)現(xiàn)AAGAB基因編碼區(qū)及其側(cè)翼序列的突變及多態(tài)性(圖3)。

3 討論

圖1 3例患者家系圖圖2 雙手掌散在分布圓形或橢圓形、暗黃色、堅(jiān)硬的角質(zhì)丘疹

圖3 基因測(cè)序圖

表1 AAGAB基因外顯子引物

點(diǎn)狀掌跖角化病全球范圍內(nèi)發(fā)病率約為2.5/10萬,且無性別差異。7該病主要表現(xiàn)為雙手掌和足跖部位多發(fā)的圓形或橢圓形黃色角質(zhì)丘疹,部分皮損中心呈火山口狀凹陷。8既往對(duì)該病的研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)其致病基因集中于以下3個(gè)區(qū)域:15q22-q24,8q24.13-24.21,15q22.33-q23,但對(duì)于前兩個(gè)區(qū)域的研究尚未發(fā)現(xiàn)致病基因,且無有效重復(fù)驗(yàn)證。2012年Giehl等5利用全基因組外顯子測(cè)序技術(shù)確定本病的致病基因是位于15q22.33-q23區(qū)間的AAGAB基因。Pohler等6對(duì)此基因進(jìn)行了功能上的分析,AAGAB基因全長(zhǎng)約54 kb,由10個(gè)外顯子組成,可編碼315個(gè)氨基酸殘基。該基因編碼了一個(gè)α-和γ-銜接蛋白-結(jié)合蛋白p34,是一個(gè)具有Rab樣GTP酶結(jié)構(gòu)域的細(xì)胞溶質(zhì)蛋白,研究發(fā)現(xiàn)它在膜泡運(yùn)輸中具有重要作用。AAGAB基因突變后,p34蛋白的缺失導(dǎo)致細(xì)胞分裂加快,且極大地提高了表皮生長(zhǎng)因子受體的表達(dá)水平和酪氨酸磷酸化水平,從而導(dǎo)致細(xì)胞信號(hào)放大和細(xì)胞過度增殖。

本研究中3個(gè)PPPK家系的先證者均具有典型的臨床及組織病理學(xué)改變,但對(duì)其AAGAB基因外顯子及側(cè)翼序列進(jìn)行測(cè)序,未發(fā)現(xiàn)任何突變位點(diǎn)。我們推測(cè)原因可能是:(1)未檢測(cè)AAGAB基因的全部?jī)?nèi)含子區(qū),突變也可能位于啟動(dòng)子區(qū)域或者3'端的非翻譯區(qū);(2)該病具有遺傳異質(zhì)性。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果提示該3個(gè)點(diǎn)狀掌跖角化病家系的發(fā)病不是由于該基因編碼區(qū)的基因突變所致。下一步我們將進(jìn)一步擴(kuò)充樣本,采用全基因組外顯子測(cè)序技術(shù)對(duì)該病進(jìn)行研究,以確定其致病基因,同時(shí)行功能學(xué)研究,為了解本病的發(fā)病機(jī)制及基因治療奠定基礎(chǔ)。

1 Brauer A.über eine besondere Form des heredit?ren Keratoms (Keratoma dissipatum hereditarium palmare et plantare).Arch Dermatol,1913,114:211-236.

2 Buschke A,F(xiàn)ischer W.Keratodermia maculosa dissem inata symmetrica palmaris et plantaris.In:Neisser A,Jacobi E,eds. Ikonographia Dermatological.Berlin:Urban-Schwarzenberg,1910.183-192.

3Martinez-Mir A,Zlotogorski A,Londono D,et al.Identification of a locus for type I punctate palmoplantar keratoderma on chromosome 15q22-q24.JMed Genet,2003,40:872-878.

4 Zhang XJ,Li M,GaoTW,et al.Identification of a locus for punctate palmoplantar keratodermas at chromosome 8q24.13-8q24.21.J Invest Dermatol,2004,122:1121-1125.

5Giehl KA,Eckstein GN,Pasternack SM,etal.Nonsensemutations in AAGAB cause punctate palmoplantar keratoderma type Buschke-Fischer-Brauer.Am JHum Genet,2012,91(4):754- 759.

6 Pohler E,Mamai O,Hirst J,et al.Haploins ufficiency for AAGAB causes clinically heterogeneous forms of punctate palmoplantar keratoderma.Nat Genet,2012,44(11):1272-1276.

7 Kelsell DP,Stevens HP.The palmoplantar keratodermas:Much more than palms and soles.MolMed Today,1999,5:107-113.

8魏羽佳,宋守榮,王亮,等.掌跖角化病一家系9例.中華皮膚科雜志,2001,34:233.

(收稿:2014-03-20 修回:2014-04-28)

Detection ofmutations of AAGAB gene in three Chinese fam iliesw ith punctuate palmop lantar keratoderma

ZHANG Yan,CHEN Ming-fei,WU Mei,et al.Shandong Academy ofMedical Sciences,Jinan,250062

Objective:To identifymutations of AAGAB gene with punctuate palmoplantar keratoderma in Chinese patients.Methods:All ten exons and their flanking intronic sequence of AAGAB genewere amplified by polymerase chain reaction,and then,subjected to automatic DNA sequencing.Results:The pathogenicmutation was not found in all exons and their flanking intronic sequences of AAGAB gene.Conclusion:Themutation which causes PPPK in the three families is not located in the exons of AAGAB gene.Further study is needed to identify the causative gene.

punctuate palmoplantar keratoderma;AAGAB gene;mutations

1山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院,濟(jì)南,250062

2濟(jì)南大學(xué)山東省醫(yī)學(xué)科學(xué)院醫(yī)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院,濟(jì)南,250062

3山東省皮膚病性病防治研究所,濟(jì)南,250022

?通信作者

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