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科學家完成迄今最大基因組測序

2014-01-22 18:49:30
中華肺部疾病雜志(電子版) 2014年2期
關鍵詞:研究

本生長在美國佐治亞州奧古斯塔國家高爾夫俱樂部第17號洞附近的火炬松(Pinus taeda)曾擋住了美國前總統德懷特·戴維·艾森豪威爾的很多桿球。1956年,他曾試圖砍掉這棵樹。如今,火炬松正在書寫一段與眾不同的歷史:火炬松的基因組有221.8億個堿基對——約為人類基因組的7倍多,是目前已完成測序的最大基因組。

火炬松原產于美國東南部,是美國南方松中重要的速生針葉用材樹種。在基因測序工作伊始,火炬松就被確定為研究對象。然而,火炬松基因組的龐大規模給傳統的全基因組“鳥槍法”測序(只能對短的基因組片段進行測序)出了一道難題。

新研究中,研究人員改進了原有的“鳥槍法”——利用基因克隆方法對單獨的DNA片段進行預處理,因而能夠更容易地拼裝出一個完整的基因組。該團隊發現,82%的火炬松基因組由重復的基因片段組成——而人類基因組中重復的基因片段只占25%。

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