莖瘤芥黑斑病菌rDNA ITS區序列分析

摘要：以莖瘤芥（Brassica juncea Coss. var. tumida Tsen et Lee）黑斑病病株為試材，對黑斑病菌5.8 S rDNA及其側翼ITS區序列進行克隆、測序和比對分析。結果表明，5個供試病菌堿基序列同蕓薹鏈格孢的堿基序列相似度達到99.68%，不存在大于3 bp的堿基差異；而與甘藍鏈格孢和蘿卜鏈格孢的堿基差異較明顯，均存在大于3 bp的堿基差異，且存在大量的缺失片段。初步確定引起莖瘤芥黑斑病的病原菌為蕓薹鏈格孢。

關鍵詞：莖瘤芥（Brassica juncea Coss. var. tumida Tsen et Lee）；黑斑病；ITS；蕓薹鏈格孢

中圖分類號：S436.3 文獻標識碼：A 文章編號：0439-8114（2013）20-5044-03

Sequence Analysis of ITS Region of rDNA of Brassica juncea Coss. var. tumida Tsen et Lee Black Spot Disease

LIU Hong-fang，CHEN Fa-bo，YANG Yong-qiang

（Life Science and Technology Institute， Yangtze Normal University， Chongqing 408100，China）

Abstract：Taking Brassica juncea Coss. var. tumida Tsen et Lee black spot disease as materials， 5.8 S rDNA and its flanking ITS were cloned， sequenced and aligned. The results showed that the sequence of 5 pathogen were almost identical with that of Alternaria brassicae. Similarity degree reached 99.68%. There was no differences more than 3 bp base. There were obvious differences between the sequence of A. brassicicola and A. japonica， more than 3 bp different base and a lot of deletions. It was prelimiarily dertermined that the pathogen caused the black spot disease on Brassica juncea Coss. var. tumida Tsen et Lee was Alternaria brassicae.

Key words： Brassica juncea Coss. var. tumida Tsen et Lee； black spot disease； ITS； Alternaria brassicae

莖瘤芥（Brassica juncea Coss. var. tumida Tsen et Lee）是我國特有的作物資源，榨菜是利用其瘤莖為原料，經過專門的加工腌制而成的一種腌菜食品。在我國以“涪陵榨菜”最為著名，與歐洲酸菜、日本醬菜并稱世界三大名腌菜[1]。榨菜是重慶三峽庫區重要的農業支柱產業之一，是當地農業生產的主要經濟來源。黑斑病是莖瘤芥的主要病害之一，發生普遍，主要發生在莖瘤芥的莖和葉片上，此病發生后蔓延迅速，可導致莖瘤芥葉片枯死，植株早衰，甚至腐爛，嚴重影響莖瘤芥的產量和品質。

研究表明，引起十字花科蔬菜黑斑病的病原菌包括蕓薹鏈格孢（Alternaria brassicae）、甘藍鏈格孢（A. brassicicola）和蘿卜鏈格孢（A. japonica）[2]。鏈格孢屬內不同種之間培養性狀不穩定，且高度相似和重疊，在實際操作中用傳統方法很難鑒定到種的水平[3]。Jasalavich等[4]對十字花科蔬菜上的鏈格孢屬真菌核糖體DNA序列進行分析比較，認為可以基于其進行分類鑒定。目前，關于莖瘤芥黑斑病的研究鮮見報道。本試驗以我國莖瘤芥主產區涪陵5個不同種植區的莖瘤芥黑斑病病株為試材，通過對莖瘤芥黑斑病菌rDNA ITS序列進行分析，探索基于該區進行莖瘤芥黑斑病菌種水平上分類鑒定的可靠性，以期為該病的進一步研究提供理論依據。……