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核糖核酸酶Onconase的稀釋復(fù)性條件優(yōu)化研究

2013-08-14 09:08:52徐殿勝王慶誠(chéng)
化學(xué)與生物工程 2013年10期
關(guān)鍵詞:效果

郭 紅,徐殿勝,王慶誠(chéng)

(1.華東理工大學(xué) 生物反應(yīng)器工程國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海200237;2.上海南方模式生物研究中心,上海201210)

核糖核酸酶是一類(lèi)廣泛存在于動(dòng)植物體內(nèi)的、具有水解作用的一類(lèi)酶。它通過(guò)剪切轉(zhuǎn)錄核糖核酸及對(duì)核糖核酸進(jìn)行修飾和降解來(lái)達(dá)到抑制腫瘤細(xì)胞生長(zhǎng)的目的[1]。

Onconase(豹蛙酶)是一種從北極豹蛙卵母細(xì)胞和早期胚胎中提取的核糖核酸酶,對(duì)人肺腺癌細(xì)胞、慢性粒細(xì)胞白血病細(xì)胞、黑色素瘤細(xì)胞及人體肺腺癌上皮細(xì)胞等都有細(xì)胞毒性作用[2,3],是一種具有很大開(kāi)發(fā)潛力的蛋白質(zhì)。

目前,國(guó)內(nèi)多通過(guò)畢赤酵母和大腸桿菌發(fā)酵來(lái)制備Onconase。作者在此先提純大腸桿菌發(fā)酵獲得的包涵體,再使包涵體復(fù)性得到有活力的Onconase蛋白。由于氧化型谷胱甘肽(GSSG)對(duì)蛋白質(zhì)中二硫鍵的重新形成起到很重要的作用,尿素對(duì)蛋白質(zhì)的復(fù)性也有意想不到的效果,因此,在復(fù)性緩沖溶液[4]中加入一定量的GSSG和尿素,并考察了復(fù)性溫度、尿素濃度、GSSG加入時(shí)間對(duì)復(fù)性效果的影響,以確定最優(yōu)稀釋復(fù)性條件,并與傳統(tǒng)的醋酸沉淀復(fù)性法進(jìn)行了對(duì)比。擬為Onconase生產(chǎn)工業(yè)化、提高Onconase產(chǎn)量提供幫助。

1 實(shí)驗(yàn)

1.1 試劑與儀器

牛血清白蛋白(BSA)、二硫蘇糖醇(DTT)、尿素(Genebase)、RNase A、Tween-20、鹽酸胍(BIO BASIC INC),Triton X-100、GSSG(Amresco)等。

TES 緩 沖 溶 液:50mmol·L-1Tris-HCl,20 mmol·L-1EDTA,100mmol·L-1NaCl,pH 值8.0。

DIBB緩沖溶液:20mmol·L-1Tris-HCl,6mol·L-1Guanidine-HCl,65mmol·L-1DTT(現(xiàn)加),10 mmol·L-1EDTA,pH 值8.0。

RB緩沖溶液:100mmol·L-1Tris-AcOH,100 mmol·L-1NaCl,3.0mmol·L-1還原型谷胱甘肽,0.6mmol·L-1氧化型谷胱甘肽,pH值8.0。

DB緩沖溶液:20mmol·L-1乙酸。

多功能酶標(biāo)儀(BIOTEK),AKTA Purifier(GE)。

1.2 方法

1.2.1 菌體破碎及包涵體的洗滌

在內(nèi)含Onconase包涵體的大腸桿菌發(fā)酵液中加入溶菌酶,勻漿破碎,于6000r·min-1離心1h;加入TES緩沖溶液及25%Triton X-100,勻漿后再于6000 r·min-1離心1h,重復(fù)操作1次;再加入TES緩沖溶液,勻漿,于6000r·min-1離心1h,重復(fù)操作直至上清液澄清,得到包涵體。

1.2.2 包涵體蛋白的溶解和稀釋復(fù)性

將包涵體溶解于一定體積的DIBB緩沖溶液中,室溫振蕩過(guò)夜。測(cè)定蛋白含量后,用DIBB緩沖溶液將蛋白質(zhì)濃度稀釋到10mg·mL-1。

將包涵體裂解液緩慢滴加至配制好的包涵體復(fù)性緩沖溶液中,設(shè)定合適的轉(zhuǎn)速進(jìn)行攪拌,保證蛋白質(zhì)的終濃度為0.1mg·mL-1,置于4℃層析柜中復(fù)性72h。然后于6000r·min-1離心1h,去除因聚集產(chǎn)生的蛋白質(zhì)沉淀。

1.2.3 傳統(tǒng)的醋酸沉淀復(fù)性

將1mL包涵體溶液迅速用50mL DB稀釋?zhuān)?℃、12 000r·min-1離心30min,去沉淀,透析,去除變性劑。向溶液中加入20BV RB,并調(diào)節(jié)pH值為8.0,于4℃、12 000r·min-1離心30min,去沉淀。在復(fù)性緩沖溶液RB中4℃復(fù)性36~48h,于4℃、12 000r·min-1離心20min,去除復(fù)性過(guò)程產(chǎn)生的蛋白沉淀。

1.3 測(cè)定方法

1.3.1 蛋白含量的測(cè)定

采用Brandford法測(cè)定蛋白含量。

1.3.2 蛋白相對(duì)活力的測(cè)定

由于目的蛋白是核糖核酸酶,所以采用RNA熒光底物法測(cè)定目的蛋白活力,即目的蛋白Onconase和帶有熒光標(biāo)記的底物RNA進(jìn)行反應(yīng),通過(guò)檢測(cè)吸光度值得到蛋白相對(duì)活力(由于不需要各組實(shí)驗(yàn)間的對(duì)比,為簡(jiǎn)化實(shí)驗(yàn),直接利用每個(gè)時(shí)刻得到的活力曲線的斜率作為縱坐標(biāo),比較各組條件下得到的蛋白相對(duì)活力)。

2 結(jié)果與討論

2.1 醋酸沉淀法的復(fù)性效果(圖1)

圖1 醋酸沉淀法的復(fù)性效果Fig.1 The renaturation efficiency of acetic acid sinking method

由于醋酸沉淀法無(wú)需加入輔助復(fù)性的物質(zhì),節(jié)省了工藝成本,所以不失為一種可供選擇的方法。

2.2 稀釋復(fù)性條件的優(yōu)化

2.2.1 復(fù)性溫度的影響

復(fù)性緩沖溶液pH值為8.0、尿素濃度為2mol·L-1、GSSG先于包涵體加入復(fù)性緩沖溶液中、復(fù)性緩沖溶液體積為50mL、蛋白質(zhì)終濃度控制在0.1mg·mL-1,考察復(fù)性溫度對(duì)復(fù)性效果(復(fù)性緩沖溶液中總蛋白相對(duì)活力)的影響,結(jié)果見(jiàn)圖2。

圖2 復(fù)性溫度對(duì)復(fù)性效果的影響Fig.2 The effect of renaturation temperature on renaturation efficiency

從圖2可知,4℃下復(fù)性緩沖溶液中總蛋白相對(duì)活力最高。蛋白活力應(yīng)該隨著溫度升高而增大,且到達(dá)某一臨界溫度后不會(huì)再繼續(xù)上升。但包涵體復(fù)性過(guò)程需要經(jīng)過(guò)中間狀態(tài)——熔球態(tài),25℃時(shí)的復(fù)性效果沒(méi)有4℃好,這可能是因?yàn)?5℃時(shí)包涵體進(jìn)入熔球態(tài)的速度較快,容易出現(xiàn)錯(cuò)誤折疊的情況,進(jìn)而影響到總蛋白的相對(duì)活力。

2.2.2 尿素濃度的影響

復(fù)性緩沖溶液pH值為8.0、復(fù)性溫度為4℃、復(fù)性緩沖溶液體積為50mL、蛋白質(zhì)終濃度控制在0.1 mg·mL-1,考察尿素濃度對(duì)復(fù)性效果的影響,結(jié)果見(jiàn)圖3。

圖3 尿素濃度對(duì)復(fù)性效果的影響Fig.3 The effect of urea concentration on renaturation efficiency

從圖3可知,尿素濃度為2mol·L-1時(shí),復(fù)性緩沖溶液中的總蛋白相對(duì)活力最高,這可能是因?yàn)椋瑵舛刃∮?mol·L-1時(shí),尿素的主要作用是屏蔽蛋白質(zhì)所帶電荷,防止蛋白質(zhì)聚集沉淀的損失;而濃度大于2 mol·L-1時(shí),尿素奪取蛋白質(zhì)氫鍵的作用要強(qiáng)于屏蔽蛋白質(zhì)電荷的作用,從而促進(jìn)了蛋白質(zhì)變性的發(fā)生。

2.2.3 GSSG加入時(shí)間的影響

復(fù)性緩沖溶液pH值為8.0、復(fù)性溫度為4℃、復(fù)性緩沖溶液體積為50mL、蛋白質(zhì)終濃度控制在0.1 mg·mL-1、復(fù)性緩沖溶液中尿素濃度分別為2mol·L-1和1.5mol·L-1,考察 GSSG加入時(shí)間對(duì)復(fù)性效果的影響,結(jié)果見(jiàn)圖4。

從圖4可知,當(dāng)尿素濃度為2mol·L-1時(shí),GSSG先于包涵體加入復(fù)性緩沖溶液中效果稍好,但差別不明顯;當(dāng)尿素濃度為1.5mol·L-1時(shí),GSSG后于包涵體加入復(fù)性緩沖溶液中效果較好。

2.3 不同復(fù)性體系比較

基于以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果,分別取350mL3種緩沖溶液:加有GSSG的含2mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液、含1.5mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液、醋酸沉淀復(fù)性緩沖溶液,采用稀釋復(fù)性方法[5],緩慢滴加包涵體裂解液,攪拌(5min后,在含1.5mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液中加入等量的GSSG),放入4℃層析柜中復(fù)性72h。然后于6000r·min-1、4℃離心1h,去除沉淀,用陽(yáng)離子交換柱South15s進(jìn)一步純化。測(cè)定Onconase含量,并計(jì)算回收率,結(jié)果見(jiàn)表1。

圖4 GSSG加入時(shí)間對(duì)復(fù)性效果的影響Fig.4 The effect of addition time of GSSG on renaturation efficiency

表1 復(fù)性并純化后的Onconase蛋白含量及回收率Tab.1 The content and recovery of Onconase after renaturation and purification

由表1可知,先加GSSG的含2mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液的復(fù)性效果最好,Onconase含量和回收率均高于其它兩種復(fù)性體系。

2.3 討論

(1)由于Onconase的等電點(diǎn)較高,為9.7左右,故選用陽(yáng)離子交換柱層析進(jìn)行純化。

(2)常用的蛋白質(zhì)變性劑為6mol·L-1尿素或4 mol·L-1鹽酸胍。這是由于高濃度的尿素或鹽酸胍可以破壞蛋白質(zhì)的氫鍵,即蛋白質(zhì)的二級(jí)結(jié)構(gòu),從而使蛋白質(zhì)不能形成活性所必需的高級(jí)結(jié)構(gòu),起到變性作用。然而近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),低濃度的尿素具有降低非正確折疊和蛋白的活性狀態(tài)、提高解折疊狀態(tài)和折疊中間體的穩(wěn)定性的作用[6,7]。這可能是因?yàn)槟蛩氐娜芙庾饔靡环矫鏁?huì)奪取蛋白質(zhì)的氫鍵,另一方面卻可以防止蛋白質(zhì)的聚集(可能是由于尿素屏蔽了蛋白質(zhì)之間的電荷作用)。為此,本研究選擇尿素作為變性劑,并考察了尿素濃度對(duì)復(fù)性效果的影響。

(3)研究發(fā)現(xiàn),待復(fù)性的蛋白質(zhì)本身含有二硫鍵時(shí),應(yīng)該在復(fù)性過(guò)程中加入諸如GSH(還原型谷胱甘肽)/GSSG、DTT/GSSG等具有氧化還原作用的體系。氧化還原體系通過(guò)促進(jìn)不正確形成的二硫鍵快速交換反應(yīng),提高了正確配對(duì)的二硫鍵的產(chǎn)率。Onconase本身只有104個(gè)氨基酸,卻含有4個(gè)二硫鍵,其二硫鍵能否正確折疊對(duì)蛋白活力影響很大。因此,實(shí)驗(yàn)選擇DTT/GSSG氧化還原體系,以確保Onconase的正確折疊。

以往的實(shí)驗(yàn)中曾選擇在過(guò)夜裂解包涵體時(shí)加入DTT、在配制復(fù)性緩沖溶液時(shí)加入GSSG的方式,并取得了良好的效果。后有報(bào)道稱(chēng)將GSSG后于包涵體加入到復(fù)性緩沖溶液中效果更好[6]。考慮到在蛋白質(zhì)折疊過(guò)程中,從伸展態(tài)到中間態(tài)的速度只需要幾毫秒,因此將GSSG和包涵體加入到復(fù)性緩沖溶液中的時(shí)間間隔設(shè)為5min,對(duì)GSSG先于、后于包涵體加入到復(fù)性緩沖溶液中的效果進(jìn)行比較,但由于時(shí)間所限,并沒(méi)有進(jìn)行時(shí)間梯度上的探討。

然而,對(duì)于1.5mol·L-1尿素體系和2mol·L-1尿素體系所得出的結(jié)論為何相反的問(wèn)題,由于因素復(fù)雜,有待進(jìn)一步深入探討。

(4)對(duì)蛋白HPLC級(jí)別的純度分析需要進(jìn)一步研究。

3 結(jié)論

采用稀釋復(fù)性方法從包涵體中復(fù)性得到有活力的Onconase蛋白,并與傳統(tǒng)的醋酸沉淀復(fù)性方法進(jìn)行了比較,考察了復(fù)性溫度、尿素濃度、GSSG加入時(shí)間對(duì)復(fù)性效果的影響。結(jié)果表明,在最佳復(fù)性溫度為4℃、采用最佳復(fù)性體系(先加GSSG的含2mol·L-1尿素的稀釋復(fù)性緩沖溶液)時(shí),復(fù)性純化后Onconase含量和回收率明顯高于醋酸沉淀復(fù)性法。

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