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耐異煙肼和鏈霉素的結(jié)核分枝桿菌臨床分離株與敏感株差異蛋白表達(dá)研究

2013-08-14 04:08:54何秀云朱傳智逄宇黃香玉蔣麗氣趙雁林莊玉輝
中國(guó)防癆雜志 2013年3期
關(guān)鍵詞:耐藥差異

何秀云 朱傳智 逄宇 黃香玉 蔣麗氣 趙雁林 莊玉輝

目前,結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis Mtb)H37Rv全基因組序列已知,但許多蛋白質(zhì)功能仍不清楚。Mtb耐藥機(jī)制、致病機(jī)制研究還有待于揭示更多Mtb蛋白功能。雖然,目前治療結(jié)核病依然采用利福平(RFP)、異煙肼(INH)、鏈霉素(S)和吡嗪酰胺(PZA)的聯(lián)合化療,但RFP、INH和S耐藥現(xiàn)象嚴(yán)重。研究發(fā)現(xiàn)INH耐藥的分子診斷標(biāo)識(shí)有katG,inhA,kasA,oxyR-ahpC 間隔區(qū)突變,但仍有高達(dá)40%的耐INH菌株不能檢測(cè)到上述基因突變[1]。編碼核糖體S12蛋白的rpsL 基因突變(K43R,K88Q)是S耐藥的主要分子標(biāo)識(shí),其次是編碼16SrRNA的rrs基因突變(530莖環(huán)和915位核苷酸)[2]。但仍有約30%S耐藥結(jié)核分枝桿菌未檢測(cè)到rpsL或rrs基因突變,推測(cè)結(jié)核分枝桿菌S耐藥還存在其他機(jī)制[3]。

宿主免疫功能和感染的Mtb毒力強(qiáng)弱決定了機(jī)體感染Mtb的結(jié)果。不同Mtb臨床分離株和不同分枝桿菌的差異可從基因水平進(jìn)行解釋?zhuān)寻l(fā)現(xiàn)增強(qiáng)胞內(nèi)生長(zhǎng)基因(enhanced intracellular survival,eis)、增強(qiáng)胞內(nèi)生長(zhǎng)速率的基因(in vivo growth,ivg),增強(qiáng)侵入位點(diǎn)(mycobacterial enhanced entry locus,mel2)與 Mtb毒力有關(guān)[4-5]。但基因表達(dá)與否與所處的環(huán)境有關(guān),單從基因水平無(wú)法解釋菌株在不同培養(yǎng)條件下差異表達(dá)蛋白[6]。

尋找與結(jié)核分枝桿菌INH和S耐藥相關(guān)的新蛋白,以進(jìn)一步解析結(jié)核分枝桿菌INH和S耐藥機(jī)制是以后研究工作的重點(diǎn)內(nèi)容之一。蛋白質(zhì)組學(xué)可全面了解某組織、細(xì)胞器、甚至某生物的整體蛋白,其在疾病診斷標(biāo)識(shí)、疾病機(jī)制研究等方面已發(fā)揮重要作用?;诮?jīng)典雙向凝膠電泳的蛋白質(zhì)組學(xué)存在低分辨率和低敏感度,以及無(wú)法對(duì)不溶性蛋白質(zhì)、高分子量蛋白質(zhì)、極酸性蛋白質(zhì)和極堿性蛋白質(zhì)進(jìn)行分析的缺點(diǎn)。而定量蛋白質(zhì)組學(xué)能全面定量分析差異表達(dá)蛋白,為大范圍鑒定蛋白及其復(fù)合物提供了有效的途徑[7]。核素標(biāo)記相對(duì)和絕對(duì)定量(isobaric tags for relative and absolute quantitation,iTRAQ)技術(shù)是美國(guó)Applied Biosystems公司研發(fā)的一種新的體外多肽標(biāo)記技術(shù),該技術(shù)定量準(zhǔn)確性高,聯(lián)用液相色譜分離彌補(bǔ)了凝膠分離在蛋白質(zhì)疏水性,相對(duì)分子質(zhì)量和等電點(diǎn)方面的限制[10];該技術(shù)不僅可以對(duì)任何類(lèi)型的蛋白質(zhì)進(jìn)行鑒定,并可同時(shí)對(duì)8個(gè)樣品進(jìn)行定量,從而縮小了不同樣品不同批次間的試驗(yàn)誤差,有較好的重復(fù)性[8]。本研究采用iTRAQ技術(shù)分析耐INH和S的Mtb臨床分離株02166、INH和S敏感株01105和H37Rv的菌體蛋白,通過(guò)Mascot搜索及生物信息學(xué)對(duì)蛋白定量分析,旨在尋找與結(jié)核分枝桿菌INH和(或)S耐藥相關(guān)的新蛋白。

材料和方法

一、菌株

Mtb臨床分離株02166和01105由國(guó)家疾病預(yù)防控制中心國(guó)家結(jié)核病參比實(shí)驗(yàn)室從臨床分離、鑒定(毒力、耐藥性和基因型)和保存。02166菌株和01105菌株均為北京基因型、毒力高于H37Rv。02166菌株對(duì)INH和S耐藥、對(duì)RFP、EMB、Km、Ofx敏感,01105菌株對(duì)上述抗結(jié)核藥均敏感。02166菌株、01105菌株及H37Rv抽提菌體蛋白的菌體由國(guó)家結(jié)核病參比實(shí)驗(yàn)室提供。菌體經(jīng)鈷60照射滅活,保存于-80℃?zhèn)溆谩?/p>

二、主要試劑和儀器

iTRAQ-8plex標(biāo)試劑盒購(gòu)自ABI公司;胰蛋白酶(trypsin)、三乙基碳酸氫銨(triethylammonium bicarbonate,TEAB)購(gòu)自Sigma公司;Bradford定量試劑盒購(gòu)自美國(guó)伯樂(lè)Bio-Rad公司;三氯乙酸(trichloroacetic acid,TCA)、羥乙基哌嗪乙硫磺酸{2-[4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazinyl]ethanesulfonic acid,HEPES}、3-[3-(膽酰胺丙基)二甲氨基]丙磺酸內(nèi)鹽{3-[(3-Cholamidopropyl)dimethylammonium]-1-propanesulfonate,CHAPS}、苯甲基磺酰氟化物(phenylmethyl sulfonylfluoride,PMSF)、二硫蘇糖醇(dithiothreitol,DTT)、十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)、乙腈、碘乙酰胺(iodoacetamide,IAM)等試劑均為進(jìn)口分裝試劑,磷酸二氫鉀(KH2PO4)、氯化鉀(KCl)、丙酮、甲酸等為國(guó)產(chǎn)分析純。低溫超高壓連續(xù)細(xì)胞破碎機(jī)JN3000為廣州聚能生物科技有限公司產(chǎn)品;超聲波細(xì)胞粉碎儀JY92-Ⅱ?yàn)閷幉ㄐ轮ド锟萍脊煞萦邢薰井a(chǎn)品;半制備型高壓液相色譜 (high pressure liquid chromatography,HPLC)系統(tǒng)為日本島津產(chǎn)品,Luna 5uSCX 100A色譜柱(250×4.60mm,5μm)為美國(guó)菲羅門(mén)公司(Phenomenex)產(chǎn)品;Nano-LC MicroTOF-QⅡ?yàn)槊绹?guó)Bruker公司產(chǎn)品;C18反相色譜柱(100×0.075mm,5μm)為美國(guó) Agilent產(chǎn)品。

三、菌體蛋白iTRAQ分析

(一)菌體蛋白提取

滅活的 Mtb經(jīng)1×PBS(pH 7.4)洗滌30min,4℃、8000×g離心30min,棄上清。30ml裂解液[Tris-Cl 20mmol/L,pH 8.5;1mmol/L乙二胺四乙酸(ethylenediaminetetraacetic acid,EDTA),1mmol/L PMSF充分懸浮沉淀,低溫超高壓連續(xù)細(xì)胞破碎機(jī)將菌細(xì)胞破碎、功率不超過(guò)1500W,1次循環(huán)后將菌液再重新進(jìn)樣,4次循環(huán)破菌,溶液總體積不超過(guò)50ml。4℃、20000×g離心30min,取20ml上清加入5ml 50%TCA/丙酮(100ml丙酮溶解50g TCA),冰水浴2h,4℃、20000×g離心30min。-20℃預(yù)冷丙酮洗滌沉淀3次,每次洗滌均4℃、20000×g離心30min;沉淀自然晾干,即為制備好的Mtb全菌體蛋白樣品,凍存于-80℃?zhèn)溆谩?/p>

(二)菌體蛋白復(fù)溶及定量

取部分制備好的Mtb全菌體蛋白樣品沉淀于1.5ml離心管,加入復(fù)溶緩沖液(8mol/L尿素,4%CHAPS,30mmol/L HEPES,pH 調(diào)至8.0~8.3),加入PMSF至終濃度1mmol/L、EDTA至終濃度2mmol/L,混勻并冰上放置5min。加入DTT至終濃度10mmol/L,超聲(超聲波發(fā)射2s、間歇3s、功率240W)5min助溶,15℃、20000×g離心25min。取上清,加入DTT至終濃度10mmol/L,56℃恒溫水浴1h,迅速加入IAM至終濃度55~100mmol/L,暗室室溫靜置1h。加入4倍于樣品溶液體積的預(yù)冷丙酮,-20℃沉淀至少3h。4℃、20000×g離心20min,棄上清。300μl 50%TEAB、0.1%SDS溶液復(fù)溶沉淀,超聲(超聲波發(fā)射2s、間歇3s、功率240W)3min助溶。Bradford試劑盒測(cè)定蛋白質(zhì)含量。

(三)蛋白質(zhì)酶解

每個(gè)樣品取100μg蛋白,含0.1%SDS的50%TEAB補(bǔ)齊體積至3個(gè)樣品為相同體積。每100μg蛋白質(zhì)樣品加入3.3μg胰蛋白酶,37℃水浴24h;補(bǔ)加1μg胰蛋白酶,37℃水浴12h。酶解樣品真空冷凍干燥,30μl含0.1%SDS的50%TEAB復(fù)溶肽段。取1μl復(fù)溶肽段經(jīng)ZipTip?Pipette Tips脫鹽,1μl基質(zhì)洗脫的蛋白樣品直接上樣基質(zhì)輔助激光解析電離飛行時(shí)間質(zhì)譜儀(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)檢測(cè)肽質(zhì)量指紋圖譜以評(píng)價(jià)胰蛋白酶消化效果。

(四)標(biāo)記肽段

將iTRAQ-8plex標(biāo)記試劑盒中的標(biāo)記試劑(113、115和121)平衡至室溫,每管標(biāo)記試劑中加入70μl異丙醇,顛倒混勻后加入到對(duì)應(yīng)的酶解肽段樣品中,113標(biāo)記臨床分離株01105、115標(biāo)記臨床分離株02166、121標(biāo)記 H37Rv?;靹?、稍離心后,室溫靜置2h。

(五)半制備型HPLC分離肽段

A 液(25%乙腈,10mmol/L KH2PO4,磷酸調(diào)pH值至3.0孔徑0.22μm有機(jī)膜過(guò)濾)平衡系統(tǒng),10~20min;標(biāo)記的樣品用A液稀釋10倍,全部上樣,流速1ml/min。洗脫梯度:0%~5%B液(25%乙腈,2mol/L KCl,10mmol/L KH2PO4,磷酸調(diào)pH值至3.0,孔徑0.22μm 有機(jī)膜過(guò)濾),1min;5%~30%B液,20min;30%~50%B液,5min;50%B液,5min;50%~100%B液,5min;分部收集樣品。收集樣品用C18反相色譜柱除鹽,低溫抽干、0.1%甲酸復(fù)溶肽段用于Nano LC分離。

(六)Nano LC分離及質(zhì)譜鑒定

HPLC分離并脫鹽的0.1%甲酸復(fù)溶肽段上樣。流動(dòng)相 A 液:H2O,0.1%甲酸;B液:乙腈,0.1%甲酸。洗脫梯度為:0%~5%B液,0~10min;5%~45%B液,10~80min;45%~80%B液,80~85min;80%B液,85~100min;80%~5%B液,100~105min;5%B 液,105~120min。流速0.0003ml/min。Nano LC 分離的樣品直接注入MicroTOF-QⅡ質(zhì)譜儀,一級(jí)質(zhì)譜(mass spectrometry,MS)掃描質(zhì)荷比(m/z)范圍為300~2000。每個(gè)一級(jí)質(zhì)譜圖自動(dòng)選擇3個(gè)最強(qiáng)母離子進(jìn)行串級(jí)掃描,MS-MS掃描 m/z范圍為200~3000,每組樣品質(zhì)譜鑒定3次重復(fù)。MicroTOF-QⅡ質(zhì)譜儀檢測(cè)參數(shù):離子源(ESI,正離子掃描),掃描范圍(Auto MS2,m/z 50~2000),Set capillary(1400V),干燥熱源 (150 ℃),碰 撞池 (500.0VPP),傳輸時(shí) 間(150μs),前脈沖存儲(chǔ)時(shí)間(2.0μs),校準(zhǔn)方法(自動(dòng)調(diào)諧優(yōu)化電壓,外標(biāo)法校準(zhǔn)質(zhì)量數(shù))。

(七)生物信息學(xué)分析

質(zhì)譜掃描完畢,得到質(zhì)譜信號(hào)圖。質(zhì)譜數(shù)據(jù)分析軟件DataAnalysis 4.0(美國(guó)Bruker公司)打開(kāi)質(zhì)譜信號(hào)圖,打開(kāi)baf數(shù)據(jù),自動(dòng)分析標(biāo)峰得到mgf文件。合并mgf文件。將合并后的mgf文件進(jìn)行Mascot檢索(SwissProt下載的Mtb數(shù)據(jù)庫(kù)為搜索數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行本地搜索)。Mascot檢索參數(shù):酶(enzyme):胰蛋 白 酶 (trypsin);數(shù) 據(jù) 庫(kù) (database):swissprot-rat;肽段電荷 peptide charge:+,++,+++;儀器(instrument):ESI-QUAD-TOF;固定修飾(fixed modification):脲甲基化carba-midomethyl(C);可變修飾(variable modification):Gln->pyro-Glu(N-term Q),氧化反應(yīng) oxidation(M),iTRAQ-8plex(K),iTRAQ-8plex(N-term)和iTRAQ-8plex(Y);肽質(zhì)量值誤差范圍(peptide tol):0.1u(monoisotopic);MS-MS碎片離子的質(zhì)量值誤差范圍(MS-MS tol):0.1u;最大錯(cuò)配(max missed cleavages):1。篩選:P<0.05。差異表達(dá)蛋白質(zhì)定量以Mascot搜庫(kù)結(jié)果為基礎(chǔ),以mz 113和mz 121為對(duì)照組,依據(jù)Mascot的加權(quán)方式,根據(jù)一組肽段核素報(bào)告基團(tuán)的相對(duì)含量的比例進(jìn)行定量,02166菌株分別與01105菌株和H37Rv的直接比值顯示相對(duì)定量結(jié)果,根據(jù)不同肽段鑒定次數(shù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,從而判定相對(duì)定量結(jié)果的統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)[9](DataAnalysis 4.0軟件直接給出統(tǒng)計(jì)結(jié)果,P<0.05或P>0.05)。若蛋白質(zhì)標(biāo)記的報(bào)告基團(tuán)信息丟失,則該蛋白無(wú)定量信息。

結(jié) 果

一、菌體蛋白鑒定及相對(duì)定量

02166菌株與01105菌株比較有153個(gè)差異表達(dá)蛋白,其中,表達(dá)上調(diào)蛋白12個(gè)(3個(gè)蛋白上調(diào)倍數(shù)>1.2);表達(dá)下調(diào)蛋白141個(gè)(104個(gè)蛋白下調(diào)倍數(shù)<0.8)。02166菌株與 H37Rv菌株比較有129個(gè)差異表達(dá)蛋白,表達(dá)上調(diào)蛋白33個(gè)(20個(gè)蛋白上調(diào)倍數(shù)>1.2);表達(dá)下調(diào)蛋白96個(gè)(67個(gè)蛋白下調(diào)倍數(shù)<0.8)。

01105菌株與H37Rv菌株比較差異表達(dá)蛋白有130個(gè),表達(dá)上調(diào)蛋白113個(gè)(74個(gè)蛋白上調(diào)倍數(shù)>1.2);下調(diào)表達(dá)蛋白27個(gè)(11個(gè)蛋白下調(diào)倍數(shù)<0.8)。

02166菌株與01105菌株和H37Rv比較共同差異表達(dá)蛋白有86個(gè),共同表達(dá)下調(diào)69個(gè)(其中Rv3118、Rv2626c和Rv2986c表達(dá)下調(diào)倍數(shù)<0.5),共同表達(dá)上調(diào)6個(gè)(Rv0234c和Rv2466c表達(dá)上調(diào)倍數(shù)>1.2),11個(gè)蛋白表達(dá)下調(diào)或上調(diào)不一致表1 67個(gè)蛋白在02166菌株與01105菌株比較中差異表達(dá),卻在02166菌株與H37Rv比較中無(wú)差異表達(dá);43個(gè)蛋白在02166菌株與H37Rv比較中差異表達(dá),卻在02166菌株與01105菌株比較中無(wú)差異表達(dá)。

二、差異表達(dá)蛋白相對(duì)分子質(zhì)量和等電點(diǎn)分布

02166菌株與01105菌株或H37Rv比較無(wú)冗余的差異表達(dá)蛋白共196個(gè),其理論相對(duì)分子質(zhì)量和等電點(diǎn)分布廣泛,相對(duì)分子質(zhì)量范圍為7.63~326.22;等電點(diǎn)范圍為3.74~12.48。83.4%差異表達(dá)蛋白相對(duì)分子質(zhì)量小于60,77.4%差異表達(dá)蛋白等電點(diǎn)小于7(圖1A,B)。

三、差異表達(dá)蛋白功能分析

根據(jù)巴斯德研究所功能分類(lèi)樹(shù)(http://genolist.pasteur.fr/tuberculist)對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行功能分類(lèi),差異表達(dá)蛋白主要參與脂類(lèi)代謝(1)、中間代謝和呼吸(7)和保守假定蛋白(10);兩組差異表達(dá)蛋白均無(wú)屬于穩(wěn)定RNAs(4)、插入序列和噬菌體(5)、PE/PPE 家 族 蛋 白 (6)、未 知 功 能 蛋 白 (8)(圖2)。

四、核糖體蛋白和參與脂類(lèi)代謝蛋白

9個(gè)核糖體蛋白在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均下調(diào)表達(dá),其中Rv0056、Rv0651、Rv0652、Rv0701和Rv0719為50S核糖體蛋白,Rv2785c、Rv2909c和Rv3458c為30S核糖體蛋白,Rv1630為可能的核糖體蛋白S1。Rv0641(50S核糖體蛋白)和Rv0707(30S核糖體蛋白)僅在02166菌株與01105菌株比較中下調(diào)表達(dá),Rv2442c和Rv3456c(50S核糖體蛋白)僅在02166菌株與H37Rv比較中分別下調(diào)和上調(diào)表達(dá)。

表1 02166菌株與01105菌株和H37Rv比較表達(dá)上調(diào)或下調(diào)不一致的蛋白

34個(gè)脂類(lèi)代謝(1)蛋白在INH耐藥菌株中差異表達(dá):Rv3804c、Rv3140、Rv2245、Rv0824c、Rv1925、Rv3130c、Rv3801c、Rv1094、Rv2941和 Rv3800c在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均下調(diào)表達(dá);Rv0154c、Rv0222、Rv0242c、Rv0503c、Rv1070c、Rv1492、Rv2187、Rv2247、Rv2831 和 Rv3274c在02166菌株與01105菌株比較中下調(diào)表達(dá),Rv0873和Rv1181在02166菌株與01105菌株比較中上調(diào)表達(dá);Rv0231、Rv1074c、Rv1483、Rv2244、Rv2246、Rv2524c、Rv2940c、Rv3720和 Rv3774在02166菌株與H37Rv比較中下調(diào)表達(dá),而Rv1543、Rv1544和Rv3061c在02166菌株與H37Rv比較中上調(diào)表達(dá)。

討 論

研究表明iTRAQ技術(shù)可用于鑒定大分子、極酸、極堿蛋白,不僅可以彌補(bǔ)雙向電泳不足,而且iTRAQ定量鑒定的蛋白數(shù)量多于經(jīng)典雙向凝膠電泳[10]。本研究采用iTRAQ技術(shù)有效地定量鑒定了耐INH和S Mtb臨床分離株02166、藥物敏感臨床分離株01105和標(biāo)準(zhǔn)株H37Rv之間的差異蛋白,02166菌株菌體蛋白與01105菌株和H37Rv比較共同差異表達(dá)蛋白有86個(gè),且差異表達(dá)蛋白的相對(duì)分子質(zhì)量和等電點(diǎn)分布范圍廣泛。

katG (Rv1908c)、aphC (Rv2428)、kasA(Rv2245)和inhA(Rv1484)基因突變與部分耐INH的 Mtb臨床分離株相關(guān)[11-12]。Rv2245和 Rv1484參與脂肪酸合成,Rv1908c和Rv2428參與解毒作用。本研究發(fā)現(xiàn),Rv1908c和Rv2245在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均下調(diào)表達(dá),Rv2428只在02166菌株與H37Rv比較中下調(diào)表達(dá),Rv1484在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均未出現(xiàn)差異表達(dá)。藥物S主要與細(xì)菌核糖體30S亞基單位結(jié)合,抑制蛋白合成。研究表明,rpsL和rrs基因突變與S耐藥相關(guān)[13],rpsL編碼30S核糖體蛋白S12(Rv0682)。本研究未鑒定到Rv0682,但發(fā)現(xiàn)9個(gè)核糖體蛋白在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均下調(diào)表達(dá),其中Rv0056、Rv0651、Rv0652、Rv0701和Rv0719為50S核糖體蛋白,Rv2785c、Rv2909c和Rv3458c為30S核糖體蛋白,Rv1630為可能的核糖體蛋白S1。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn) Rv0056、Rv0652、Rv0701、Rv1630和Rv2785c在Mtb中均為藥物/化合物優(yōu)先作用靶點(diǎn)(http://tdrtargets.org/)。但這5個(gè)核糖體蛋白在02166菌株中下調(diào)表達(dá)與Mtb S耐藥的關(guān)系,有待進(jìn)一步試驗(yàn)驗(yàn)證。

基于雙向電泳的蛋白質(zhì)組學(xué)的研究鑒定到5個(gè)蛋白(Rv1446c、Rv3028c、Rv0491、Rv2971和Rv2145c)在INH耐藥Mtb中上調(diào)表達(dá)[14]。S耐藥株上調(diào)表達(dá)Rv0350、Rv0440、Rv1240、Rv3075c、Rv2971、Rv3028c、Rv2145c、Rv2031c和 Rv0569,進(jìn)一步采用silico docking分析表明只有Rv0350、Rv0440和Rv2971與S呈現(xiàn)有意義的相互作用[15]。因此,Rv2971、Rv3028c和Rv2145c在S耐藥株和INH耐藥株中均上調(diào)表達(dá)。本研究發(fā)現(xiàn)Rv0440、Rv2145c和Rv3028c在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均下調(diào)表達(dá),Rv0350和Rv2971、Rv1240分別在02166菌株與01105菌株比較中上調(diào)和下調(diào)表達(dá)、Rv3075和Rv2031在02166菌株與H37Rv比較中下調(diào)表達(dá),Rv0491、Rv0569和Rv1446c在本研究中未鑒定到。這種不同蛋白質(zhì)組學(xué)方法發(fā)現(xiàn)不同差異表達(dá)蛋白的現(xiàn)象較常見(jiàn)[16]。

綜上所述,定量蛋白質(zhì)組學(xué)能有效鑒定到差異表達(dá)蛋白。Rv0234c、Rv2466c、Rv3118、Rv2626c和Rv2986c在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均差異表達(dá)(下調(diào)倍數(shù)<0.5或上調(diào)倍數(shù)>1.2),9個(gè)核糖體蛋白在02166菌株與01105菌株和H37Rv比較中均下調(diào)表達(dá)。這些蛋白與INH和S耐藥關(guān)系還未見(jiàn)報(bào)道,因此,值得進(jìn)一步探討這些蛋白與Mtb INH、S耐藥的關(guān)系,為進(jìn)一步研究結(jié)核分枝桿菌INH、S耐藥機(jī)制提供新靶點(diǎn)。

[1]Espasa M,González-Martín J,Alcaide F,et al.Direct detection in clinical samples of multiple gene mutations causing resistance of Mycobacterium tuberculosis to isoniazid and rifampicin using fluorogenic probes.J Antimicrob Chemother,2005,55(6):860-865.

[2]Ulger M,Aslan G,Emekda?G,et al.Investigation of rpsL and rrs gene region mutations in streptomycin resistant Mycobacterium tuberculosis complex isolates.Mikrobiyol Bul,2009,43(1):115-120.

[3]Nhu NT,Lan NT,Phuong NT,et al.Association of streptomycin resistance mutations with level of drug resistance and Mycobacterium tuberculosis genotypes.Int J Tuberc Lung Dis,2012,16(4):527-531.

[4]Zhang M,Gong J,Lin Y,et al.Growth of virulent and avirulent Mycobacterium tuberculosis strains in human macrophages.Infect Immun,1998,66(2):794-799.

[5]Janagama HK,Hassounah HA,Cirillo SL,et al.Random inducible controlled expression(RICE)for identification of mycobacterial virulence genes.Tuberculosis(Edinb),2011,91 Suppl 1:S66-68.

[6]Florczyk MA,McCue LA,Stack RF,et al.Identification and characterization of mycobacterial proteins differentially expressed under standing and shaking culture conditions,including Rv2623from a novel class of putative ATP-binding proteins.Infect Immun,2001,69(9):5777-5785.

[7]Kumar SG,Venugopal AK,Mahadevan A,et al.Quantitative proteomics for identifying biomarkers for tuberculous meningitis.Clin Proteomics,2012,9(1):12.

[8]Wu WW,Wang G,Baek SJ,et al.Comparative study of three proteomic quantitative methods,DIGE,cICAT,and iTRAQ,using 2Dgel-or LC-MALDI TOF/TOF.J Proteome Res,2006,5(3):651-658.

[9]Ong SE,Mann M.Mass spectrometry-based proteomics turns quantitative.Nat Chem Biol,2005,1(5):252-262.

[10]Shui W,Gilmore SA,Sheu L,et al.Quantitative proteomic profiling of host-pathogen interactions:the macrophage response to Mycobacterium tuberculosis lipids.J Proteome Res,2009,8(1):282-289.

[11]Soudani A,Hadjfredj S,Zribi M,et al.Genotypic and phenotypic characteristics of tunisian isoniazid-resistant Mycobacterium tuberculosis strains.J Microbiol,2011,49(3):413-417.

[12]Yao C,Zhu T,Li Y,et al.Detection of rpoB,katGand inhA gene mutations in Mycobacterium tuberculosis clinical isolates from Chongqing as determined by microarray.Clin Microbiol Infect,2010,16(11):1639-1643.

[13]TudóG,Rey E,Borrell S,et al.Characterization of mutations in streptomycin-resistant Mycobacterium tuberculosis clinical isolates in the area of Barcelona.J Antimicrob Chemother,2010,65(11):2341-2346.

[14]Jiang X,Zhang W,Gao F,et al.Comparison of the proteome of isoniazid-resistant and-susceptible strains of Mycobacterium tuberculosis.Microb Drug Resist,2006,12(4):231-238.

[15]Sharma P,Kumar B,Gupta Y,et al.Proteomic analysis of streptomycin resistant and sensitive clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis.Proteome Sci,2010,8:59.

[16]Mehaffy C,Hess A,Prenni JE,et al.Descriptive proteomic analysis shows protein variability between closely related clinical isolates of Mycobacterium tuberculosis.Proteomics,2010,10(10):1966-1984.

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