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醫學文獻中帶\"—\"符號、希臘字母、羅馬數字的檢索方法

2012-12-31 00:00:00孫淑萍
科技創新導報 2012年27期

摘要:利用維普資訊—中文科技期刊數據庫、萬方數據知識服務平臺數據庫,對帶“-”和希臘字母、羅馬數字等多藥耐藥(MDR)基因產物、相關蛋白的檢索方法及應注意的問題進行論述,探討其對醫學科技查新的影響。

關鍵詞:醫學文獻 \"-\"符號 希臘字母 羅馬數字 檢索方法

中圖分類號:G232 文獻標識碼:A 文章編號:1674-098X(2012)09(c)-0254-02

在醫學文獻中多藥耐藥(MDR)基因產物P-糖蛋白(P-gp)、谷胱甘肽-S-轉移酶-π(GST-π)及DNA拓撲異構酶Ⅱ(TopoⅡ)在腫瘤組織中的表達,治療過程中腫瘤細胞對化療藥物產生的耐藥性及其與臨床病理特征和預后的關系,已成為腫瘤領域的研究熱點。但對含“-”符號和希臘字母、羅馬數字等的多藥耐藥(MDR)基因產物、相關蛋白等檢索起來比較困難,很容易造成漏檢。本文以 “維普資訊—中文科技期刊數據庫—鏡像站”、“萬方數據知識服務平臺”數據庫為例,就科技項目查新檢索工作中,帶“-”符號和希臘字母、羅馬數字等多藥耐藥(MDR)基因產物、相關蛋白的檢索方法及應注意的問題,談一些認識和經驗。

1 維普資訊—中文科技期刊數據庫

1.1 帶“-”符號多藥耐藥(MDR)基因產物P-糖蛋白(P-gp)的檢索方法

多藥耐藥基因擴增及其編碼產物P糖蛋白(P-gp)的過度表達,是目前已發現的最重要的一種多藥耐藥機制,大多數腫瘤MDR的發生被認為與P-gp有關。檢索人員在檢索P-gp時,分別采用幾種不同檢索詞和書寫方式進行檢索,詳見檢索結果對照表,見表1。

表1 題名字段P糖蛋白的幾種不同檢索詞及書寫方式的結果比較(1989-2012,7月)

檢索結果分析:檢索式①命中110篇文獻。②和③都檢索出九十到一百多萬篇,經將該檢索式展開,都是以字母P命中的文獻,均與P-糖蛋白不相關,顯然是錯誤檢索。④⑤分別檢索到184篇、201篇文獻,但均沒有檢索到以P-gp、P-糖蛋白這兩種書寫方式命中的文獻。后發現在日常使用的電腦系統里,初始輸入法一般都默認為英文輸入法,自然會處在半角狀態下,若切換到中文輸入法狀態中,則會有全角半角兩種狀態。而維普資訊—中文科技期刊數據庫在對帶“-”的符號檢索時,不識別“-”的半角符號輸入方式,而默認“—”的全角符號輸入方式。⑥檢索到528篇文獻,能檢索到P-糖蛋白的文獻,但沒檢索到P—糖蛋白的文獻。⑦檢索到576篇文獻,這一檢索式,“-”和“—”都能檢索出來,但也有少部分不是P—GP 的文獻。如:基于DSP+GPS公交收費系統的終端設計等。

從表1中可以看出,采用同通配符“?”也就是⑥⑦檢索式檢索到的文獻均比上述任何一種檢索式檢索到的文獻多,而以序號①④⑤檢索式命中的文獻均比采用通配符“?”檢索到的文獻少很多,因此在維普資訊—中文科技期刊數據庫中,檢索帶“-”的P-gp檢索詞時,必須將“-”換成通配符“?”檢索,只有這樣,才能提高查全率,但以④⑤為檢索式,能夠提高查準率。

1.2 多藥耐藥(MDR)基因產物谷胱甘肽-S-轉移酶-π(GST-π)的檢索方法

谷胱苷肽S轉移酶( GST)是一組與細胞解毒有關的酶,與腫瘤細胞多藥耐藥密切相關的GST亞型主要是GST-α(堿性)、GST-μ(中性)和GST-π酸性),它可催化還原型谷胱甘肽(GSH)與化療藥物的結合,對不同的抗癌藥有特異的作用。下面以帶希臘字母的谷胱甘肽-S-轉移酶-π(GST-π)為例,探討幾種不同檢索詞的檢索方法。見檢索結果對照表,見表2。

檢索結果分析:

如前面所說的系統不識別“-”的半角符號輸入方式,檢索式①命中的全部是谷胱甘肽S轉移酶的文獻,其中也有谷胱甘肽S轉移酶π和谷胱甘肽S轉移酶-π或—π的文獻,還有谷胱甘肽S轉移酶的其它文獻,如:谷胱甘肽S轉移酶M1、T1和P1基因多態與肝癌易感性研究。②全部是以“谷胱甘肽”命中的文獻,顯然是錯誤檢索。③檢索到谷胱甘肽S轉移酶和谷胱甘肽硫轉移酶兩種寫法的文獻,如:谷胱甘肽S轉移酶在乳腺癌中的表達;谷胱甘肽硫轉移酶(GST-π)的肝內定位意義及與γ-GT、AFP的比較。④ 全部是谷胱甘肽—S—轉移酶的文獻,其中也包括谷胱甘肽—S—轉移酶π的文獻,還有其他學科的文獻。⑤去掉希臘字母,命中1620篇文獻,其中檢索到GST-π的文獻,也檢索到以GST縮寫字頭命名的其它學科的文獻。如:基于GST的工程造價預測模型理論研究。⑥檢索到全部含有GST的文獻,包括GST的前綴、后綴, 英文詞中含有GST的詞,如:rSj26GST-Sj32融合蛋白-IgG4-ELISA診斷慢性血吸蟲病的研究;基于GStreamer的媒體播放研究;美國wagstaff扁錠結晶器的二次開發利庇等。⑦能檢索到GSTpi的文獻,但大部分是帶有GST字母的文獻。⑧和⑨命中的全部是GST—PI和GSTPI的文獻。⑩檢索到GST—PI和GST—π的文獻,也能檢索到GST—的其他文獻,如GST—p16融合蛋白的表達、純化及鑒定。

從表2中可以看出,檢索式③可將谷胱甘肽S轉移酶的兩種書寫方式都檢索出來,查全率特別高;⑧⑨查準率高,但相對文獻比較少;⑤⑥可以檢索到以GST縮寫字命名的多學科文獻,再從這些文獻中找出GST—π,很麻煩,還浪費時間;所以在檢索帶有希臘字母的谷胱甘肽S轉移酶-π時,盡可能選③⑧⑨等檢索式,以防造成不必要的漏檢。

1.3 多藥耐藥基因產物DNA拓撲異構酶Ⅱ(TopoⅡ)的檢索方法

許多抗癌藥物是以DNA Topo1I為靶點的,DNA TopoI1表達水平的高低與這些藥物活性的發揮有密切關系;DNA TopoI1表達異常是引起多藥耐藥的主要機制之一。DNA拓撲異構酶Ⅱ(TopoⅡ)含有羅馬字母,如果去掉羅馬字母檢索,可以檢索到包括DNA拓撲異構酶Ⅰ(TopoⅠ)和DNA拓撲異構酶Ⅱ(TopoⅡ)的文獻,再去除DNA拓撲異構酶Ⅰ(TopoⅠ)的文獻,很浪費檢索時間。這就需要掌握羅馬字母的檢索方法。下面就以DNA拓撲異構酶Ⅱ(TopoⅡ)為例,探討應用不同檢索詞的檢索方法。見表3

檢索結果分析:檢索式①檢索到DNA拓撲異構酶Ⅰ和Ⅱ的文獻。②檢索到TopoⅠ和Ⅱ的文獻,還檢索到含有Topo詞的其他文獻。如:CAV與Topotecan方案二線治療難治性SCLC近期療效比較。③④命中的全部是DNA拓撲異構酶Ⅱ和TopoⅡ的文獻,查準率很高。⑤命中的全部是DNA拓撲異構酶Ⅱ或TopoⅡ的文獻。從表3中可以看出:在檢索DNA拓撲異構酶Ⅱ(TopoⅡ)時,應兩種寫法都用,這樣才能夠提高查全率,查準率。如果用檢索式③漏減132篇,用檢索式④,漏減53篇。

2 方數據知識服務平臺鏡像版——期刊論文庫

2.1 多藥耐藥(MDR)基因產物P-糖蛋白(P-gp)檢索方法。見表4

檢索結果分析:檢索式①②③命中文獻都是617篇;④⑤命中文獻都是544篇;因該系統不識別“-”和“—”,所以命中的都是P糖蛋白和P gp的文獻。所以采用檢索式①就可以,這樣可以提高查全率。⑥⑦均命中P-糖蛋白和P-gp的文獻,查準率高。所以在檢索P糖蛋白文獻時,應盡可能選這兩種檢索式。另外在使用萬方數據庫檢索時,檢索詞部分也可使用引號\" \"或書名號《》括起來的精確匹配檢索,但引號\" \"必須是半角狀態。

2.2 谷胱甘肽S轉移酶-π(GST-π)的檢索方法。見表5

檢索結果分析:檢索式①大部分是谷胱甘肽S轉移酶π的文獻,但也有谷胱甘肽S轉移酶的其它文獻。②全部是以谷胱甘肽S轉移酶命中的文獻。其中也有谷胱甘肽-S轉移酶π的文獻,也有谷胱甘肽S-轉移酶其它基因的文獻。如:谷胱甘肽S-轉移酶M1、T1基因多態性與抗結核藥物所致肝損害易感性的Meta分析。③④⑤⑥均是以GST命中的文獻,但能檢索到GST-π的文獻。也有其它文獻,如:融合蛋白GST-hRI對青光眼濾過術后瘢痕形成的改善作用。⑦⑧全部命中的是GST pi的文獻,但也有GST和GST-pi的文獻,該檢索式查準率高,但相對文獻量少。故在萬方數據庫中,檢索谷胱甘肽S轉移酶π時,除用上述檢索式檢索外,還應采用該項目主題關鍵詞去排除不相關的文獻。如有用戶需要檢索“多藥耐藥谷胱甘肽S轉移酶π基因在卵巢癌組織中的表達”,可用卵巢癌限制,這樣可以排除肺癌、胃癌、肝癌等其它腫瘤中的文獻。提高查準率。

DNA拓撲異構酶Ⅱ(TopoⅡ)的檢索方法。見表6

檢索結果分析:檢索式①可以檢索到DNA拓撲異構酶Ⅱ和DNA拓撲異構酶Ⅰ的文獻,但多數是以DNA拓撲異構酶Ⅱ命中的文獻。②全部是以DNA拓撲異構酶命中的文獻。③系統不識別該檢索式中的縮寫詞Ⅱ,全部是以Topo命中的文獻,這其中包括TopoⅡ的文獻,也有Topo的其它文獻,如銪-速尿-TOPO熒光配合物的研究及速尿的測定。④多數是以TopoⅡ命中的文獻,經將該檢索式展開,發現該系統識別帶引號\" \"中的羅馬數字Ⅱ。故在檢索TopoⅡ時,盡可能使用引號\" \"的精確匹配檢索。

綜上所述,在維普、萬方數據庫檢索中,我們必需考慮檢索詞的全稱、簡稱、英文名稱、縮寫詞、特殊符號、希臘字母、羅馬數字等不同的書寫方式以及各數據庫默認的檢索表達式,盡量避免漏減,提高查全率,這樣才能獲得所需要的醫學文獻。

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