科學家正設法通過DNA記錄人體細胞變化事件,這種未來技術將為醫療事業做出重大貢獻。
說到儲存數據,我們首先想到的就是硬盤、U盤、光盤等。但合成生物學界的科學家正打算將另一種東西變成儲存器:DNA。
DNA是一種帶有遺傳信息的生物大分子。根據組成部分排列方式的不同,它能顯示出不同的生物功能,比如編碼、復制和轉錄的調控功能等,而組成部分排列的變異可能產生一系列疾病。從這個角度看,DNA就像是上帝編寫的生物程序,指導著不同的生物按特定方式生活。
“所有觸發衰老、癌癥和其他病變的過程,發生著無數的細胞變化事件,如果能借助DNA這種天然儲存器將事件記錄下來,對于生物和醫療技術會非常有幫助?!彼固垢4髮W的研究團隊基于這個想法,經過幾年努力,終于有了第一步的成果。
德魯·安迪教授是研究的帶頭人。他和同事們利用噬菌體病毒為原料,構建出一種名叫“重組酶可尋址數據”(簡稱RAD)的模塊,并將其植入大腸桿菌的DNA里,成功地制造出了可反復寫入數據的DNA儲存器。
噬菌體含有整合酶和切除酶兩種物質。在他們的RAD模塊里,整合酶可以讓整個DNA的排序逆反過來,而兩種酶同時存在時,DNA的序列又會還原最初的順序。如果將DNA序列的正向排列看做“1”,反向排列看做“0”,這段DNA便能利用計算機的二進制算法,像數碼儲存器一樣記錄數據了。
利用生物來儲存數據的嘗試,以前也有過,比如轉錄因子系統(轉錄因子是由基因編碼產生的調節性蛋白質。這種蛋白質能對自身或其他基因起到轉錄調節作用。)德魯團隊的突破在于,他們證明了儲存的數據可以一遍遍被重寫。想象一張CD光盤,如果你刻錄了一次,它的空間就滿了。但我們有了新的方法,能讓它像電腦硬盤一樣寫入數據,擦掉后又重寫。
相比轉錄因子,德魯的團隊發明的系統更加可靠,像數碼記錄一樣精準。而且,除了維系DNA本身所需的能量外,儲存數據的過程并不需要額外消耗細胞的精力。
利用兩種酶來控制DNA的排序,聽起來簡單,卻花費了研究團隊相當多的精力。因為這兩種對立的酶被置于同一個細胞內時,會非常不穩定,讓一切設計崩盤。團隊中的博士后杰宏·波耐特花了整整三年時間,調整了750次兩者的比例,終于找到了讓兩者平衡的方法。
如今,他們創建的模塊可以成功記錄100次細胞分裂事件。“單個細胞在衰老過程中,發生的事件大概是50-200個,如果你想將它們都儲存下來,就需要8位的數據儲存量?!毖芯繄F隊另一位成員,斯坦福大學的研究生薩博蘇托解釋。他們正在尋找更便捷的工具,讓模塊的儲存性能提高到8位(bits)或是1字節(byte)。
《南都周刊》