萬(wàn)翠香,章昭琳,王報(bào)貴,魏華,甘艷云
(1.南昌大學(xué)食品科學(xué)與技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南昌 330047;2.南昌大學(xué)中德聯(lián)合研究院,南昌 330047;3.江西省新余市農(nóng)業(yè)局,江西新余 338000)
高黏附力雙歧桿菌的篩選與鑒定
萬(wàn)翠香1,2,章昭琳1,王報(bào)貴1,魏華1,2,甘艷云3
(1.南昌大學(xué)食品科學(xué)與技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,南昌 330047;2.南昌大學(xué)中德聯(lián)合研究院,南昌 330047;3.江西省新余市農(nóng)業(yè)局,江西新余 338000)
利用體外細(xì)胞培養(yǎng)法,從實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有的10株雙歧桿菌中篩選具有較強(qiáng)粘附能力的菌株。采用革蘭氏染色法和平板計(jì)數(shù)法,評(píng)價(jià)了這10株雙歧桿菌對(duì)HT-29細(xì)胞的粘附性能,通過(guò)測(cè)定這10株雙歧桿菌的16S rRNA基因序列(16S rDNA)進(jìn)行分類(lèi)學(xué)鑒定。結(jié)果顯示,WBBI01,WBBI02,WBIN03,WBBI06具有極強(qiáng)的黏附力,其黏附指數(shù)分別達(dá)1.97×103,2.17×103,3.57×103,1.88×103。經(jīng)16S rDNA測(cè)序鑒定WBBI01,WBIN03,WBBI06均與兩歧雙歧桿菌S17有極高的同源性,而WBBI02屬于長(zhǎng)雙歧桿菌。結(jié)果表明,雙歧桿菌黏附性能具有明顯的種屬特異性,不同種屬雙歧桿菌的粘附能力相差極大,以?xún)善珉p歧桿菌的黏附性能最強(qiáng),嬰兒長(zhǎng)雙歧桿菌為最弱。
益生菌;16S rDNA;黏附;雙歧桿菌;黏附指數(shù)
雙歧桿菌是動(dòng)物腸道內(nèi)最重要的生理性細(xì)菌之一,能與腸道上皮細(xì)胞緊密聯(lián)系形成生物學(xué)屏障[1,2],而黏附是其與宿主相互作用的第一步[3],外源雙歧桿菌能否在腸道內(nèi)黏附和定殖是評(píng)定益生菌制劑效果的指標(biāo)之一。因此對(duì)雙歧桿菌黏附性能的研究具有重要的實(shí)際意義。
本研究采用體外細(xì)胞培養(yǎng)法[4],以實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有的10株雙歧桿菌為對(duì)象,通過(guò)革蘭氏染色法和平板計(jì)數(shù)法評(píng)價(jià)各雙歧桿菌的黏附性能,篩選具有較強(qiáng)黏附力的菌株;采用分子生物學(xué)手段對(duì)各雙歧桿菌進(jìn)行了鑒定,并結(jié)合DNAMAN軟件分析了各菌株之間親緣關(guān)系。本研究為雙歧桿菌的黏附機(jī)制及保護(hù)作用研究提供了良好的模式材料和方法,篩選獲得的高黏附性能的雙歧桿菌菌株為開(kāi)發(fā)益生菌制劑提供材料。
菌株和細(xì)胞:10株雙歧桿菌均由本實(shí)驗(yàn)室保藏;人結(jié)腸癌細(xì)胞系HT-29細(xì)胞株由南昌大學(xué)一附院饋贈(zèng)。
培養(yǎng)基:MRS(Solarbio);DMEM培養(yǎng)液(Hyclone);胰蛋白酶-EDTA消化液(Solarbio);胎牛血清(GIBCO),pH 7.4 PBS緩沖液,Taq PCR mix(Takara),T-載體(Takara)。
主要儀器:二氧化碳培養(yǎng)箱(Thermo),低速離心機(jī)(湘儀離心機(jī)),倒置光學(xué)顯微鏡,厭氧培養(yǎng)箱,血球計(jì)數(shù)板等。
1.2.1 雙歧桿菌的細(xì)胞黏附實(shí)驗(yàn)[5]
HT-29細(xì)胞常規(guī)培養(yǎng),實(shí)驗(yàn)之前將細(xì)胞接至6孔細(xì)胞板培養(yǎng)14 h,每孔中加入1 mL益生菌的菌懸液(細(xì)菌數(shù)為1×108~2×108mL-1)和1 mL新鮮的DMEM[6](pH=4.5)培養(yǎng)液,于37℃質(zhì)量分?jǐn)?shù)為5%的CO2,質(zhì)量分?jǐn)?shù)為95%空氣的二氧化碳培養(yǎng)箱中共孵育3 h。孵育結(jié)束后,輕柔吸走上清,預(yù)冷PBS漂洗細(xì)胞4次,以除去未黏附的細(xì)菌,甲醛固定,革蘭氏染色,鏡檢初步評(píng)價(jià)黏附能力。
1.2.2 雙歧桿菌的細(xì)胞黏附能力測(cè)定
將黏附結(jié)束的細(xì)胞培養(yǎng)板用2 mL冷PBS輕柔洗滌4次,之后加入400 L胰蛋白酶消化液消化1 min,加入600 L預(yù)冷的PBS終止反應(yīng)并輕輕吹打,將細(xì)胞及黏附的細(xì)菌制成菌懸液,吸到試管中,在振蕩器上充分振蕩,使細(xì)菌能夠分散懸浮[7,8]。然后將菌懸液進(jìn)行梯度稀釋?zhuān)♂尩?05,然后從各個(gè)稀釋度取10 L分區(qū)點(diǎn)滴到MRS平板培養(yǎng)基上,吹干后倒置于厭氧培養(yǎng)箱37℃培養(yǎng)24 h后,進(jìn)行活菌計(jì)數(shù),每株設(shè)立兩個(gè)平行樣本,每樣本設(shè)立3個(gè)重復(fù)。對(duì)照組細(xì)胞培養(yǎng)皿的細(xì)胞懸液用血細(xì)胞計(jì)數(shù)板對(duì)細(xì)胞個(gè)數(shù)進(jìn)行計(jì)數(shù)。根據(jù)活菌計(jì)數(shù)的結(jié)果以及對(duì)照培養(yǎng)皿細(xì)胞計(jì)數(shù)的結(jié)果,計(jì)算雙歧桿菌對(duì)HT-29[9]細(xì)胞的黏附效果。黏附指數(shù)以100個(gè)細(xì)胞上黏附的細(xì)菌數(shù)表示。
1.2.3 高黏附力雙歧桿菌的鑒定
利用16S rDNA分子生物學(xué)特征鑒定[10]。根據(jù)V3區(qū)兩端保守區(qū)設(shè)計(jì)引物,則能夠擴(kuò)增細(xì)菌V3區(qū)相對(duì)應(yīng)的可變區(qū)片段,測(cè)序分析比較來(lái)初步確定菌種的位置。設(shè)計(jì)引物為F:5’-GGTGAGAGTGGCGAACGGGT-3’,R:5’-AACGAGCGCAACCCTCGC-3’。以待測(cè)菌基因組為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,PCR反應(yīng)條件:95℃10 min,然后于94℃10 min,67℃30 s,72℃1.5 min擴(kuò)增30個(gè)循環(huán),72℃10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)膠回收后克隆到T載體上進(jìn)行測(cè)序。序列的同源性在GeneBank數(shù)據(jù)庫(kù)中使用BLAST工具進(jìn)行比較,并確定待測(cè)菌的分類(lèi)地位。
通過(guò)放大80倍的顯微鏡觀察了10株雙歧桿菌對(duì)HT-29細(xì)胞的黏附能力,結(jié)果如圖1所示。由圖1可以看出,雙歧桿菌屬的各種間不同菌株在體外對(duì)HT-29細(xì)胞的黏附能力相差很大,其中WBBI01, WBBI02,WBIN03,WBBR05,WBBI06,WLABO9雙歧桿菌均有較強(qiáng)的黏附力,WBBR04與WBLO01的黏附力較弱,而WBAN07雙歧桿菌黏附力極弱或幾乎沒(méi)有。

結(jié)果顯示:10株雙歧桿菌對(duì)HT-29細(xì)胞的黏附指數(shù)(菌體數(shù)目/100 HT-29 cell)分別為1.97×103,2.17× 103,3.57×103,2.82×102,1.71×103,1.88×103,5.00× 10,5.71×102,9.14×102,3.06×102,如圖2所示。

提取菌株的總DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到約1.4 kb的DNA片段。克隆測(cè)序后,將測(cè)定結(jié)果用Blastn進(jìn)行序列同源性比對(duì),根據(jù)比對(duì)結(jié)果分析10株菌株,采用16S rDNA序列分析的方法鑒定到屬,具體結(jié)果如表1所示。

表1 16S rDNA鑒定結(jié)果
本研究選取了4個(gè)系統(tǒng)發(fā)生組的雙歧桿菌典型株/標(biāo)準(zhǔn)株,另外以位于高GC含量的革蘭氏陽(yáng)性菌Listeria monocytogenesM7作為外群,基于Clustal V計(jì)算方法構(gòu)建了以16S rDNA序列為基礎(chǔ)的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)狀圖(見(jiàn)圖3)。

圖3中,顯示了所測(cè)序的10株雙歧桿菌與其它同屬標(biāo)準(zhǔn)株以及其它細(xì)菌的親緣關(guān)系。樹(shù)狀圖通過(guò)DNAMAN軟件中的Align程序基于Clustal V方法構(gòu)建,并以Listeria monocytogenesM7作為外群。樹(shù)狀圖上方標(biāo)尺bar(0.05)為千個(gè)核苷酸的替換率。
雙歧桿菌在腸道中的黏附及定植,對(duì)維持腸道菌群的結(jié)構(gòu)及功能起主導(dǎo)作用,因此,研究雙歧桿菌的黏附機(jī)制對(duì)認(rèn)識(shí)微生態(tài)學(xué)的基本規(guī)律有著重要意義。粘附性能檢測(cè)是益生菌篩選的重要指標(biāo)之一[11-12],目前國(guó)內(nèi)外學(xué)者普遍采用體外培養(yǎng)腸上皮細(xì)胞的方法來(lái)評(píng)價(jià)菌株的黏附能力[13]。
1985年Huub等人開(kāi)啟了雙歧桿菌黏附作用研究的先河,但其研究?jī)H針對(duì)兩歧雙歧桿菌的脂磷壁酸(LTA),因此具有一定的局限性。20世紀(jì)90年代,Elo等人[14]采用體外細(xì)胞培養(yǎng)方法研究了4株雙歧桿菌對(duì)人腸癌細(xì)胞(Caco-2)的粘附能力,其研究發(fā)現(xiàn):兩歧雙歧桿菌12-1和SBT 2752,長(zhǎng)雙歧桿菌SBT-2919和SBT2934均對(duì)Caco-2細(xì)胞幾乎沒(méi)有粘附或粘附力非常弱。2005年Candela等人[15]同樣采用體外細(xì)胞培養(yǎng)方法對(duì)比了7株雙歧桿菌菌株對(duì)人腸道上皮細(xì)胞(Caco-2)的黏附能力,其研究表明雙歧桿菌對(duì)Caco-2的黏附具有種屬特異性,其中兩歧雙歧桿菌S17的黏附值(菌體數(shù)目/100 Caco-2cell)高達(dá)5.85×103,而長(zhǎng)雙歧桿菌E18和動(dòng)物雙歧桿菌BBSF的黏附力較弱,其黏附值(菌體數(shù)目/100 Caco-2cell)分別為1.94×102,1.77×102。Crociani等人[16]將體外細(xì)胞培養(yǎng)方法與體內(nèi)試驗(yàn)進(jìn)行了比較,驗(yàn)證了雙歧桿菌體外黏附實(shí)驗(yàn)的準(zhǔn)確性,為以后體外細(xì)胞培養(yǎng)方法研究雙歧桿菌黏附作用提供了理論依據(jù)。
16S rDNA是編碼原核生物核糖體小亞基rRNA(16S rRNA)的基因,長(zhǎng)度約為1 500 bp,在結(jié)構(gòu)與功能上具有高度的保守性,是細(xì)菌分類(lèi)學(xué)研究中最常用、最有用的“分子鐘”,若16S rRNA基因相似性大于97%,可以斷定其為同一個(gè)屬,并且初步認(rèn)為其為同一個(gè)菌種(Gerald,2005)[17]。經(jīng)典的菌株分類(lèi)鑒定方法的最大缺陷在于即使進(jìn)行了完整的各種鑒定試驗(yàn),也可能導(dǎo)致對(duì)所分離的菌株鑒定結(jié)果的不確定性。與之相比,16S rDNA全序列分析鑒定法具有簡(jiǎn)便、快速、靈敏和經(jīng)濟(jì)的優(yōu)點(diǎn),是目前應(yīng)用最廣的分子微生物學(xué)檢測(cè)的靶基因,已被眾多學(xué)者用來(lái)對(duì)細(xì)菌的快速鑒定[18]。2004年涂宏鋼等人利用16S rRNA全長(zhǎng)序列鑒定了植物乳桿菌;2005年付曉艷等人通過(guò)16S rDNA測(cè)序?qū)⒔Y(jié)果與同屬及非同屬的乳酸菌進(jìn)行同源性比較,鑒定了乳酸乳球菌;2009年張朝正等人[10]利用16S rDNA序列分析和Biolog快速鑒定方法鑒定產(chǎn)脂肪酶菌株;2011年詹鑾峰等人[19]將16S rDNA檢測(cè)法應(yīng)用到臨床細(xì)菌的檢驗(yàn)中,其研究通過(guò)設(shè)計(jì)合成所有細(xì)菌的通用引物,實(shí)現(xiàn)了一個(gè)樣品中同時(shí)檢測(cè)多種細(xì)菌。本研究所用的雙歧桿菌對(duì)照株序列同測(cè)定序列的16S rRNA基因進(jìn)化分析表明,其在16S rDNA序列相似性基礎(chǔ)上聚類(lèi)為3個(gè)簇群:Bifidobacterium bifidum;Bifidobacterium animalis;Bifidobacterium longum.本研究中的16S rDNA系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果可以顯示出這種進(jìn)化模式,可以看出所分析的10株細(xì)菌起源于同一祖先。
本研究結(jié)合了各雙歧桿菌黏附實(shí)驗(yàn)的優(yōu)化方案,采用體外細(xì)胞培養(yǎng)法,以實(shí)驗(yàn)室現(xiàn)有的10株雙歧桿菌為對(duì)象,篩選具有較強(qiáng)黏附能力的菌株。黏附結(jié)果表明,雙歧桿菌各種屬間不同菌株在體外對(duì)HT-29細(xì)胞的黏附能力相差很大,其中WBBI01,WBBI02,WBIN03, WBBR05,WBBI06,WLABO9雙歧桿菌均有較強(qiáng)的黏附力,WBIN03具有最高的黏附值(菌體數(shù)目/100 HT-29 cell):3.57×103。本研究篩選獲得的高黏附性能的雙歧桿菌菌株為開(kāi)發(fā)益生菌制劑提供了材料[20]。
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Screening and Identification of high adhesion Bifidobacteria to HT-29 Cell
WAN Cui-xiang1,2,ZHANG Zhao-lin1,WANG Bao-gui1,WEI Hua1,2,GAN Yan-yun3
(1.State Key Laboratory of Food Science and Technology,Nanchang University,Nanchang 330047,China;2.Jiangxi-OAI Joint Research Institute,Nanchang 330047,China;3.Jiangxi Xinyu Agricultural Bureau,Xinyu,338000,China)
The adhesion capacity of tenBifidobacteria strainsin vitro was investigated.Gram staining and plate counting method were used to evaluate their adhesion capacity to HT-29 cell,and 16S rDNA sequencing analysis was carried out to identify the strain..Based on the data in vitro,High attachment was observed inBifidobacteriaWBBI01,WBBI02,WBIN03,WBBI06,their adhesion index reached(bacterial cells/100 Caco-2 cells)1.97×103,2.17×103,3.57×103,1.88×103repectively,while low attachment was shown in other strains.Identification of the strain indicates that the homology ofBifidobacteriaWBBI01,WBIN03,WBBI06 with B.bifidumS17 were all above 99%,WBBI02 belongs toB.longum.The adhesion capacity varied considerably among different strains.B.bifidumWBIN03 was the most adhesive and the adhesion ability ofBifidobacteriaWBAN07 was the weakest among all the tested strains.
Bifidobacteria;16S rDNA sequencing;Identification;Adhesive activity
Q93-33
A
1001-2230(2012)05-0013-03
2011-12-26
國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(30900038),國(guó)家“863”計(jì)劃專(zhuān)題(2008AA10Z337),國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31000048),2009年江西省主要學(xué)科學(xué)術(shù)和技術(shù)帶頭人培養(yǎng)計(jì)劃,江西省教育廳科研基金(GJJ10379)。
萬(wàn)翠香(1977-),女,副教授,主要從事益生菌的分子生物學(xué)研究。
章昭琳
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