摘要:菌株Amy-627是一株從長白山地區分離純化出的對22種植物病原真菌和3種致病細菌都有較明顯抑制效果的放線菌,其抗菌譜較廣,尤其對水稻稻瘟病病菌(Pyricularia oryzae)具有顯著的拮抗作用。通過形態特征、培養特征、生理生化檢測及抑菌譜等一系列比較。結果表明,發現該菌株與鏈霉菌屬的吸水鏈霉菌(Streptomyces hygroscopicus)的特征基本相符,通過16S rDNA序列比對同源性達99%。根據多項分類原則和系統進化樹的構建分析,將該菌株暫歸入吸水鏈霉菌(Streptomyces hygroscopicus)類。
關鍵詞:水稻稻瘟病病菌;鏈霉菌;拮抗;篩選;鑒定
中圖分類號:S476文獻標識碼:A文章編號:0439-8114(2011)14-2864-03
Screening and Identification of Amy-627 Strain against Pathogenic Fungus
Pyricularia oryzae
ZHANG Li,WANG Yong,XIE Cheng-cheng,GONG Li-jing,WANG Xue
(School of Chemical Engineering, Liaoning Science and Technology University,Anshan 114044,Liaoning,China)
Abstract: Amy-627, an actinomycete strain, was obtained from Changbai mountain. It had extensive antimicrobial spectrum of fermentation filtrate. The growth of 22 plant pathogens and 3 bacteria were strongly inhibited by Amy-627 on PDA plate. Especially, the pathogenic fungus, Pyricularia oryzae, was inhibited significantly by it. Besides, the morphology, cultural characteristics, physiological-biochemical characteristics and antimicrobial spectrum of this strain were studied comparatively. The results showed that the characteristics of this strain and Streptomyces hygroscopicu were similar and the homology of them was 99% by 16S rDNA sequences’ comparison. Base on the polyphasic taxonomical study and phylogenetic tree analysis, the strain Amy-627 was identified as Streptomyces hygroscopicus for the time being.
Key words: Pyricularia oryzae; actinomycete; antagonism; identification
放線菌種類繁多,代謝功能各異,是一類有著廣泛實際用途的生物資源。在抗菌活性物質的種類中,大約有70%是由放線菌(Actinomycetes)產生的[1,2]。利用具有生命特征的生物體及其代謝分泌物、復制物(生物源)經工藝加工而成的具有農藥功能的有害生物控制劑——農用抗生素類藥物,由于具有低毒、高效、選擇性強、殘留時間短、無公害等優點,正日益受到世界各國的重視,并將成為今后農藥行業發展的主要方向之一。
水稻稻瘟病是一種世界性病害,在我國絕大多數水稻種植區域均有發生。流行年份一般可造成10%~20%的經濟損失,嚴重者可達50%以上。稻瘟病在水稻整個生長階段皆可發生,具有危害時間長、侵染部位多和癥狀多樣性等特點,使化學防治難以達到預期的目的。近年來利用有益微生物來防治水稻稻瘟病已成為較流行的策略。放線菌廣泛存在于不同的自然生態環境里,現今發現的放線菌只占自然界存在的10%~20%,其資源利用還具有相當大的空間。因此,對采自長白山地區不同類型土壤進行了拮抗放線菌的篩選,并對抗菌效果最顯著的菌株進行了鑒定,以期為抗菌活性物質的提純提供試驗依據,也為進一步的中試放大及大規模生產打下基礎。
1材料與方法
1.1材料
1.1.1菌種58株放線菌(分離自長白山地區不同類型土壤)及用于發酵液生物檢測的22種植物病原真菌和3種致病細菌由遼寧科技大學生物工程實驗室生物制藥工藝室提供。
1.1.2培養基生物測定培養基:PDA培養基、牛肉膏蛋白胨培養基。基礎發酵培養基:葡萄糖9.000 g、玉米粉9.000 g、黃豆粉9.000 g、酵母膏1.200 g、牛肉膏0.300 g、(NH4)2SO4 1.200 g、NaCl 0.600 g、K2HPO4 0.120 g、FeSO4 0.006 g、ZnSO4 0.003 g、
MgSO4 0.060 g、去離子水300 mL,pH值7.4~7.6。
1.1.3主要儀器光學顯微鏡、電子顯微鏡、PCR擴增儀、核酸電泳儀、蛋白質電泳儀、DNA測序儀、高速離心機、恒溫搖床。
1.2活性菌株的篩選及抗菌譜的測定
1.2.1菌株的培養將58株放線菌接種于高氏一號培養平板內(9 cm培養皿),28 ℃培養7 d后取1 cm直徑的菌碟待用。將22株植物病原真菌和3株致病細菌分別接種于PDA培養基和細菌培養基,真菌25 ℃培養72 h,細菌37 ℃培養48 h待用。
1.2.2菌株的篩選采用混菌法[3]對58株放線菌進行菌體抑菌活性的初篩。以水稻稻瘟病病菌(Pyricularia oryzae)作為指示菌,25℃培養72 h,篩選出抑菌活性明顯的菌株作為目的生防菌。
1.2.3抗菌譜的測定采用杯碟法對初篩得到的菌株進行抗菌譜測定。牛津杯內盛200 μL發酵液,25 ℃培養72 h(真菌)、37 ℃培養48 h(細菌)后測定抑菌圈直徑。
1.3菌株鑒定
1.3.1形態特征采用插片法,28 ℃培養7 d,分別用光學顯微鏡和電子顯微鏡觀察菌絲和孢子形態。
1.3.2培養特征和生理生化檢測參照《鏈霉菌鑒定手冊》[4]推薦的部分培養基(表4)和方法進行試驗,28 ℃培養168 h,觀察記錄特征[5]。
1.3.316S rDNA測序及序列分析用微波法[6]提?。粒恚叮玻肪昕偅模危?,進行16S rDNA的擴增,根據16S rDNA的結構特點及其保守區設計特異引物(正向引物27f:5′-AGAGTTTGATCATGGCTCAG
-3′;反向引物1510r:5′-GGTTACCTTGTTACGACT
T-3′)。采用1%(m/v)瓊脂糖凝膠對PCR產物電泳檢測[7]。將目的DNA片段與其他DNA盡可能分開,回收DNA的瓊脂塊,經連接、轉化后,將轉化好的菌體穿刺培養,由大連寶生物(工程)有限公司測序。將所得的序列與GenBank數據庫中的已知序列進行BLAST比對,并選取與試驗菌株序列相似度較高的菌株,用DNAstar軟件進行序列排列分析,采用Boot-straping法對所構建的進化樹[8,9]進行評估,確定分離菌株的分類地位[10]。
2結果與分析
2.1活性菌株的篩選和抗菌譜的測定
將58株放線菌進行抑菌活性的初篩,大多數菌株抑菌活性很小,但有8株放線菌對水稻稻瘟病病菌(Pyricularia oryzae)有抑制作用,其中菌株Amy-627的抑制效果最好(表1)。
對初篩得到的菌株Amy-627進行發酵液的抗菌譜測定,發現菌株Amy-627的發酵液對22種常見植物病原真菌有不同程度的抑制作用(表2、圖1),但對水稻紋枯病病菌、小麥赤霉病病菌卻沒有效果,并且發酵液對3種致病細菌也有一定的抑制作用(表3)。證明菌株Amy-627所產生的活性物質的抑菌譜較廣,且對不同種類病原菌具有選擇性。
2.2拮抗菌株Amy-627的形態學觀察
通過光學顯微鏡和電子顯微鏡觀察發現,拮抗放線菌Amy-627菌株基內菌絲不斷裂,無橫隔,成分枝狀;孢子渾圓至橢圓,表面光滑;孢子絲為松環、初級螺旋、鉤狀(圖2)。
2.3拮抗菌株Amy-627的培養特征和生理生化特征
表4為菌株Amy-627在不同培養基上的培養結果。按常規方法培養觀察,拮抗放線菌Amy-627菌株在馬鈴薯浸汁、伊莫松、無機鹽淀粉等6種培養基上生長良好,菌落為灰白色、不透明、表面成致密絲絨狀;氣生菌絲體為灰白色,基內菌絲為白色,不產生可溶性色素。生理生化測定結果表明,拮抗放線菌Amy-627菌株革蘭氏染色陽性;明膠液化;牛奶凝固;不水解淀粉;能水解纖維素;硝酸鹽還原為陽性;不產生黑色素和H2S;能利用葡萄糖、果糖、木糖、肌醇、蔗糖、鼠李糖、甘露醇。
2.4拮抗菌株Amy-627的分子鑒定
通過PCR方法克隆拮抗放線菌Amy-627菌株的16S rDNA,獲得16S rDNA近全長序列,共1 475 bp,電泳結果見圖3。BLAST相似性分析表明,拮抗放線菌Amy-627菌株與Streptomyces hygroscopicus的16S rDNA序列同源性為99%,拮抗放線菌Amy-627菌株與相關菌株的系統發育樹如圖4。由此可見,拮抗放線菌Amy-627菌株與Streptomyces hygroscopicus處于同一分支。
3結論和討論
當氣溫在20 ℃左右時,遇降雨,稻瘟病病菌便可產生大量分生孢子進行侵染,逐步擴展蔓延。在生產上常用化學農藥進行病害防治,但稻瘟病病菌會產生抗藥性,從而導致化學防治的失敗。研究篩選的放線菌Amy-627對稻瘟病病菌有較好的抑菌效果,有關菌株的生防效果和抑菌機理方面還有待進一步研究。
一般認為,兩菌株16S rRNA基因序列同源性小于97%時為不同的種,但同源性大于97%時也不一定是同一個種。研究序列分析并構建系統發育樹,從其同源性高的菌株或系統發育樹上可看出,與拮抗放線菌Amy-627菌株處于同一分支的是Streptomyces hygroscopicus,16S rDNA序列同源性為99%,但在形態特征、培養特征和生理生化特性方面存在一些差異,故目前還不能將其完全歸為Streptomyces hygroscopicus。另外該菌株是否可被看作是農用抗生素的一個新來源,還需要后續試驗的進一步驗證。
參考文獻:
[1] CANEDO L M, PUENTS J L F, PEREZ B J, et a1.IB-96212,a novel cytotoxic macrolide produced by a marine Micromonospora. II. Phsico-chemical properties and structure determination [J]. J Antibiot, 2000, 53(5):479-483.
[2] 呂志堂,張利平,李艷華,等.滄州高鹽環境嗜鹽放線菌多樣性研究[J]. 河北大學學報(自然科學版),2006,26(1):1-6.
[3] 周德慶.微生物學實驗手冊[M].上海:上??茖W技術出版社,1986.121-123.
[4] 中國科學院微生物研究所放線菌分類組.鏈霉菌鑒定手冊[M].北京:科學出版社,1975.13-15.
[5] 東秀珠,蔡妙英.常見細菌系統鑒定手冊[M]. 北京:科學出版社,2001.
[6] 許平,李文均,徐麗華,等. 微波法快速提取放線菌基因組DNA[J].微生物學通報,2003,30(4):82-84.
[7] URAKAWA H, KITA-TSUKAMOTO K, OHWAHA K. Microbial diversity in marine sediments from Sagami Bay and Tokyo Bay, Japan, as determined by 16S rRNA gene analysis[J].Micorbiology,1999, 145:3305-3315.
[8] KIM D, CHUN J, SAHIN N,et al. Analysis of thermophilic clades within the genus streptomyces by 16S ribosomal DNA sequence comparsons[J]. Int J Syst Bacteriol,1996,46(1):581-587.
[9] 張光亞,陳美慈,韓如暢,等.一株異氧硝化細菌的分離與系統發育分析[J].微生物學報,2003,43(2):156-161.
[10] 羅紅麗,黃英,王黎明,等.西藏地區土壤放線菌種群多樣性及拮抗活性研究[J]. 微生物學報,2005,45(5):724-727.
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