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SLC26A4基因突變?cè)诙@疾病中的作用*

2011-01-23 04:59:54柴永川綜述楊濤吳皓審校
關(guān)鍵詞:基因突變功能

柴永川 綜述 楊濤 吳皓 審校

研究表明,大前庭水管綜合征(enlargement of vestibular aqueduct,EVA)和Pendred綜合征(pendrend syndrome,PS)的發(fā)病與SLC26A4基因密切相關(guān)。 SLC26A4基因最先由Everett等[1]在一個(gè)PS家系中定位克隆,并被命名為PDS基因。后續(xù)研究發(fā)現(xiàn)該基因突變也可引起非綜合征型聾(DFNB4)[2]。由于PDS基因與溶質(zhì)蛋白家族SLC26其他成員的結(jié)構(gòu)和功能類似,故PDS基因又重新命名為SLC26A4基因(solute carrier family 26,member 4,SLC26A4)。現(xiàn)在認(rèn)為EVA/PS是與SLC26A4有關(guān)的同一種遺傳病的兩種不同的疾病表現(xiàn)[3]。

1 SLC26A4基因的分子生物學(xué)基礎(chǔ)

2 SLC26A4基因的篩查研究

2.1SLC26A4基因突變譜及突變類型 對(duì)EVA/PS患者SLC26A4基因的篩查研究已廣泛開(kāi)展。SLC26A4基因突變譜很廣,截止到2010年1月,已有超過(guò)170種突變被報(bào)道(www.healthcare.uiowa.edu/labs/pendredandbor),除分布于SLC26A4的編碼區(qū)和剪接位點(diǎn)外,位于非編碼區(qū)外顯子1,結(jié)合轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子FOXI1的啟動(dòng)子序列中也發(fā)現(xiàn)有突變[8]。SLC26A4基因突變所導(dǎo)致的蛋白質(zhì)改變可遍及整個(gè)蛋白質(zhì)長(zhǎng)度,在其跨膜結(jié)構(gòu)的膜內(nèi)段及膜外段都有不均等的分布。突變類型也多種多樣,包括移碼突變、錯(cuò)義突變、無(wú)義突變以及剪接位點(diǎn)突變等。

2.2SLC26A4基因的突變熱點(diǎn) SLC26A4基因存在著熱點(diǎn)突變,但表現(xiàn)出明顯的地域和種族差異性。王秋菊等[9]于2007年通過(guò)對(duì)我國(guó)107個(gè)EVA耳聾家系及相應(yīng)對(duì)照人群的研究分析,揭示出中國(guó)EVA耳聾患者所特有的SLC26A4基因突變譜,其研究顯示高達(dá)97.9%的患者至少攜帶一個(gè)SLC26A4突變,并且88.4%的患者是雙等位基因突變,這些患者共出現(xiàn)了40種突變,包括25種新的突變,其中c.919-2A>G突變是中國(guó)人群中最常見(jiàn)的突變方式,占總突變數(shù)的57.63%,其次是p.H723R,占9.04%,而且在Exon7、8、10、19、15以及17中的突變之和占了總突變數(shù)的84.2%。這一特點(diǎn)對(duì)于臨床實(shí)踐具有重要的提示作用,即對(duì)于EVA/PS患者,只要進(jìn)行SLC26A4基因的突變熱點(diǎn)檢測(cè),就可以對(duì)大部分患者作出明確的分子診斷,極大的提高了基因篩查的效率。2008年戴樸等[10]針對(duì)中國(guó)人群SLC26A4基因高發(fā)突變c.919-2A>G在我國(guó)27個(gè)地區(qū)3 271名中重度感音神經(jīng)性聾患者中進(jìn)行了篩查,詳細(xì)闡述了此突變?cè)谖覈?guó)各民族地區(qū)的分布及其代表性和特異性。2009年戴樸等[11]利用變性高效液相色譜(DHPLC)技術(shù)和直接DNA測(cè)序的方法,對(duì)中國(guó)和美國(guó)EVS/PS患者進(jìn)行SLC26A4基因檢測(cè),揭示了中美患者不同的SLC26A4突變譜,并顯示出兩國(guó)EVA耳聾患者SLC26A4基因突變的高診斷檢出率,該研究顯示:在55例中國(guó)EVA耳聾患者中,有52例(95%)患者SLC26A4基因檢測(cè)出突變,其中36例(76%)患者具有雙等位基因突變,并且在SLC26A4基因突變圖譜中c.919-2A>G(73%)和 p.H723R(14%)占了總突變的87%;與中國(guó)人群相比,美國(guó)患者中SLC26A4基因突變檢出率相對(duì)較低,為20%(50患者中檢出10例突變:3例為雙等位基因突變,7例為單等位基因突變),并且p.L236P和p.T416P等是該人群中最常見(jiàn)的突變類型。

在東亞的蒙古人種中,日本和韓國(guó)SLC26A4基因的主要突變方式為p.H723R。在日本p.H723R占SLC26A4突變的53%,而與日本有所不同的是韓國(guó)c.919-2A>G突變也比較普遍[12, 13]。在歐美的高加索人種中,最常見(jiàn)的三個(gè)突變是p.L236P(16%)、p.T416P(15%)和IVS8+1G>A(14%),這三者突變之和約占總突變數(shù)一半,而在東亞人群中這三種突變方式很少見(jiàn)[14]。

2.3SLC26A4非雙等位基因突變 在EVA/PS患者中,SLC26A4基因存在著大量的非雙等位基因突變,而且在不同國(guó)家中非等位基因突變的比例存在差異。據(jù)不同文獻(xiàn)報(bào)道,北美和歐洲的比例最高,占EVA患者總數(shù)的67%~85%[8, 15~17];東亞的日本和韓國(guó)分別為53%和19%[12, 13];我國(guó)為11.6%左右[9]。在一些無(wú)SLC26A4雙等位基因突變的EVA耳聾的小型家系中,通過(guò)單倍體型分析發(fā)現(xiàn):子代中SLC26A4基因型相同的兄弟姐妹,有的具有EVA表型,有的則完全正常,并且在一對(duì)SLC26A4等位基因完全相同但EVA表型卻完全不同的姐妹中,發(fā)現(xiàn)有其他相關(guān)基因的區(qū)別,這些與單基因常染色體隱性遺傳方式不符[8, 18]。上述事實(shí)表明除SLC26A4基因外,還存在著其他基因和/或環(huán)境因素參與了EVA/PS病因的構(gòu)成。

3 SLC26A4基因的功能研究

3.1SLC26A4基因正常功能的研究 SLC26A4表達(dá)于甲狀腺、腎臟及內(nèi)耳。和其離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能相對(duì)應(yīng),Pendrin在內(nèi)耳中表達(dá)于內(nèi)淋巴管、內(nèi)淋巴囊、橢圓囊、球囊、血管紋紡錘形細(xì)胞、耳蝸外溝和螺旋突起[19, 20],這些部位都與維持內(nèi)淋巴液離子環(huán)境的動(dòng)態(tài)平衡有著密切聯(lián)系。因此推測(cè)SLC26A4基因的突變可能導(dǎo)致內(nèi)淋巴液離子環(huán)境失衡,進(jìn)而導(dǎo)致耳聾,這一點(diǎn)已經(jīng)在近期研究中通過(guò)對(duì)EVA動(dòng)物模型SLC26A4基因敲除小鼠的內(nèi)淋巴液離子成分分析被初步證實(shí)[21]。但是有關(guān)SLC26A4基因突變致聾的具體分子機(jī)制目前尚不清楚。在甲狀腺中,SLC26A4基因表達(dá)于甲狀腺濾泡細(xì)胞的頂端膜上,該處Pendrin的功能與Cl-/I-的轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān)[6]。具體機(jī)制是甲狀腺濾泡細(xì)胞基底膜上有Na+-I-同向轉(zhuǎn)運(yùn)體(sodium iodide symporter, NIS)表達(dá),通過(guò)其轉(zhuǎn)運(yùn)作用I-從血液循環(huán)中被轉(zhuǎn)運(yùn)到甲狀腺濾泡細(xì)胞中,然后經(jīng)位于甲狀腺濾泡上皮頂膜上的Pendrin轉(zhuǎn)運(yùn)到膠質(zhì)中儲(chǔ)存。這種有效的I-的捕獲機(jī)制促使位于甲狀腺球蛋白絡(luò)氨酸殘基上的碘離子氧化和有機(jī)化,從而經(jīng)酶耦合形成甲狀腺激素。相關(guān)研究[6, 22]推測(cè):SLC26A4基因突變使得Pendrin失去Cl-/I-的離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能是導(dǎo)致并發(fā)性甲狀腺腫的原因,從而表現(xiàn)為Pendred綜合癥。但是臨床同時(shí)發(fā)現(xiàn),相同突變類型在不同的個(gè)體中其甲狀腺表型變化極大,導(dǎo)致這一現(xiàn)象的原因有待于深入研究。

3.2SLC26A4基因異常功能的研究 在SLC26A4基因的突變類型中,移碼突變、無(wú)義突變及剪接位點(diǎn)突變的致病性是公認(rèn)的。對(duì)于單個(gè)氨基酸改變的錯(cuò)義突變,若符合以下兩個(gè)原則則普遍被認(rèn)為具有高致病性可能:①與不同物種的基因序列相比較,證實(shí)被替代的氨基酸是高度保守的;②正常對(duì)照人群中相對(duì)應(yīng)的錯(cuò)義突變發(fā)生率極低。然而這些標(biāo)準(zhǔn)只能提供突變致病性的間接證據(jù),對(duì)于一些罕見(jiàn)的基因型多態(tài)并不能做出有效的推測(cè),而且個(gè)別功能性致病突變也可能發(fā)生在非保守氨基酸上,因此在這種情況下要明確突變?nèi)绾斡绊懟虻墓δ苤荒芙柚诠δ苎芯俊?/p>

3.2.1SLC26A4基因突變致Pendrin蛋白定位異常 Rotman-Pikielny等[23]在活體細(xì)胞中利用綠色熒光蛋白(green fluorescent protein,GFP)標(biāo)記野生型(wild-type,WT)及三種高加索人群中最常見(jiàn)的突變型Pendrin蛋白(p.L236P、P.T416P、p.G384E)在細(xì)胞內(nèi)的運(yùn)輸,共定位研究顯示GFP-WT Pendrin能正確定位到細(xì)胞膜上,而三種Pendrin突變體都滯留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中。和隱性遺傳模式相對(duì)應(yīng),突變Pendrin不會(huì)抑制野生型Pendrin或者其他膜蛋白(如病毒膜蛋白VSVGtsO45)到細(xì)胞膜上的運(yùn)輸,從而可以解釋攜帶有單個(gè)致病性突變的個(gè)體不會(huì)出現(xiàn)相關(guān)表型的原因。同年Taylor等[22]研究了9個(gè)錯(cuò)義突變的Pendrin突變體在細(xì)胞上的定位,不僅發(fā)現(xiàn)有完全滯留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的突變體,而且發(fā)現(xiàn)有部分滯留內(nèi)質(zhì)網(wǎng)、部分定位到細(xì)胞膜以及完全正確定位到細(xì)胞膜上的突變體。對(duì)于突變體蛋白為什么不能運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞膜上,一般認(rèn)為是突變引起了肽鏈的異常折疊,從而干擾了蛋白質(zhì)的成熟及其到細(xì)胞膜上的運(yùn)輸,這種突變機(jī)制在很多跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白中都有報(bào)道,而且這種突變都是致病性的[24]。對(duì)于滯留在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的Pendrin突變體在EVA/PS疾病中的致病性容易理解,但對(duì)于能正常定位到細(xì)胞膜或部分定位到細(xì)胞膜的Pendrin突變體的致病性則需進(jìn)一步的研究。

3.2.2突變致Pendrin蛋白介導(dǎo)的離子轉(zhuǎn)運(yùn)異常 突變體蛋白正常運(yùn)輸?shù)郊?xì)胞膜上后,其離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能障礙也會(huì)引起疾病的發(fā)生。Taylor等[22]研究了Pendrin突變體在細(xì)胞中轉(zhuǎn)運(yùn)碘離子的功能,結(jié)果顯示相當(dāng)量的突變體與野生型的Pendrin存在著明顯的差異。他們首先使細(xì)胞轉(zhuǎn)染Na+/I-離子同向轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)(NIS),這樣NIS便可以從細(xì)胞外吸收足夠的I-,從而通過(guò)I-的外流實(shí)驗(yàn)分析這些突變體對(duì)I-轉(zhuǎn)運(yùn)功能的影響。結(jié)果顯示,僅轉(zhuǎn)染NIS的細(xì)胞I-的流出率很低,而共轉(zhuǎn)染了NIS和野生型SLC26A4的細(xì)胞在1分鐘時(shí)測(cè)量的I-流出率顯著提高。在共轉(zhuǎn)染了NIS和能正常定位到細(xì)胞膜上的Pendrin突變體(p.L117F,p.G209V)以及部分能定位到細(xì)胞膜上的Pendrin突變體(p.Y556C,p.G672E)的細(xì)胞中,只有p.L117F的細(xì)胞I-流出率與野生型相似,p.G209V有部分I-的流出功能,但是其流出率明顯降低,其余突變體的功能則與共轉(zhuǎn)染了NIS和完全不能定位到細(xì)胞膜的突變體(p.G102R、p.V138F、p.L236P、p.T410M、p.Q446R)的細(xì)胞一樣,完全喪失了I-的流出能力。這一結(jié)論表明,定位異常的Pendrin可完全喪失I-的轉(zhuǎn)運(yùn)能力,即使能正常定位到細(xì)胞膜的Pendrin突變體其轉(zhuǎn)運(yùn)I-的能力也可能有所下降,從而具有致病性。

2008年P(guān)era等[25]通過(guò)功能實(shí)驗(yàn)得出結(jié)論,用于預(yù)測(cè)SLC26A4錯(cuò)義突變后離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能降低的兩個(gè)標(biāo)準(zhǔn):①突變?cè)趯?duì)照人群中的低發(fā)生率;②突變導(dǎo)致了保守氨基酸的替代—有時(shí)是不可靠的。有些符合上述兩個(gè)標(biāo)準(zhǔn)的突變其離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能正常,而在正常對(duì)照人群中發(fā)現(xiàn)的某些被認(rèn)為是多態(tài)的基因改變,其離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能卻明顯降低。同時(shí)通過(guò)10個(gè)錯(cuò)義突變的功能試驗(yàn)一致性證實(shí):在蛋白質(zhì)水平上脯氨酸或者帶電氨基酸的增減對(duì)Pendrin的功能是有害的,其一個(gè)有力證據(jù)[25]是p.V88I和p. L597 S突變后Pendrin突變體的離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能正常,但當(dāng)p.V88I和p. L597S變成p.V88P和p. L597P后Pendrin的離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能則完全損失。這一結(jié)論對(duì)于預(yù)測(cè)突變的致病性有重要的幫助。但需要著重指出的是,當(dāng)錯(cuò)義突變沒(méi)有增減帶電氨基酸或者脯氨酸時(shí),這種改變?cè)诠δ苌霞瓤赡苁怯泻Φ囊部赡苁菬o(wú)害的,若要明確其致病性則需要功能驗(yàn)證。

4 SLC26A4基因與其他基因之間的聯(lián)系

4.1SLC26A4與FOXI1基因 2007年由Yang等[8]首先在EVA/PS患者中證實(shí)了SLC26A4與FOXI1基因之間的致病相關(guān)性,他們?cè)?72例SLC26A4無(wú)雙等位基因突變的EVA/PS患者中發(fā)現(xiàn)6例患者在轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因FOXI1中具有突變,9例患者在SLC26A4基因的啟動(dòng)子中具有c.-103T>C突變,其中有一例患者的突變類型是雙基因的復(fù)合雜合突變,即分別攜帶有SLC26A4和FOXI1單個(gè)等位基因突變;通過(guò)對(duì)啟動(dòng)子中c.-103T>C的突變以及FOXI1基因本身突變的功能研究證實(shí),F(xiàn)OXI1作為轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因與SLC26A4的啟動(dòng)子結(jié)合后,對(duì)SLC26A4的轉(zhuǎn)錄具有激活作用。當(dāng)SLC26A4轉(zhuǎn)錄調(diào)控基因FOXI1或啟動(dòng)子的突變聯(lián)合SLC26A4的致病突變時(shí),將引起EVA/PS疾病的發(fā)生,這種雙基因的遺傳模式在基因敲除的小鼠模型也得到了有力證實(shí)[8]。

4.2SLC26A4基因與KCNJ10基因 2009年Yang等[27]發(fā)現(xiàn)內(nèi)向整流鉀離子通道KCNJ10是EVA/PS致病因子中另一個(gè)重要的遺傳因素。他們對(duì)89例SLC26A4只有單等位基因突變的EVA/PS患者進(jìn)行KCNJ10基因序列篩查時(shí)發(fā)現(xiàn)2例患者具有KCNJ10單等位基因的突變。在利用電壓鉗技術(shù)對(duì)這兩個(gè)突變產(chǎn)物進(jìn)行電生理檢測(cè)時(shí)顯示:這兩個(gè)突變產(chǎn)物與野生型KCNJ10的產(chǎn)物相比,鉀離子通道的導(dǎo)電活性明顯降低,而此鉀離子電導(dǎo)活性是維持內(nèi)耳靜息電位必不可少的關(guān)鍵因素,對(duì)聽(tīng)覺(jué)功能至關(guān)重要[28, 29]。在小鼠模型中Yang等[27]還發(fā)現(xiàn)SLC26A4突變導(dǎo)致了KCNJ10基因在耳蝸血管紋處表達(dá)明顯減少,表明這兩個(gè)基因之間存在著病理上的聯(lián)系;他們推測(cè),SLC26A4突變后將導(dǎo)致內(nèi)淋巴液離子環(huán)境的改變,局部環(huán)境的改變選擇性地降低了KCNJ10在血管紋處的表達(dá),因而失去了維持內(nèi)耳靜息電位的基礎(chǔ),這可能是耳聾發(fā)生的直接因素。不過(guò)SLC26A4突變?nèi)绾尉唧w導(dǎo)致KCNJ10基因表達(dá)減少的分子機(jī)制目前還不清楚。

5 結(jié)語(yǔ)

綜上所述,SLC26A4基因是引起EVA/PS的主要隱性遺傳基因,但不是EVA/PS病因的唯一基因因素;FOXI1及KCNJ10基因突變也可能參與EVA/PS的發(fā)病;目前尋找更多的EVA/PS發(fā)病的基因及環(huán)境因素是研究的一大熱點(diǎn)。SLC26A4基因篩查發(fā)現(xiàn),其突變譜和突變類型復(fù)雜多樣,不同種族及人群中的突變各具特點(diǎn)。中國(guó)是一個(gè)地域廣闊的多民族國(guó)家,要明確各個(gè)地區(qū)及民族的SLC26A4的突變特點(diǎn),還需要更加廣泛和深入的篩查研究。SLC26A4基因所編碼的Pendrin蛋白結(jié)構(gòu)復(fù)雜,其準(zhǔn)確的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)信息對(duì)于研究Pendrin的功能和預(yù)測(cè)錯(cuò)義突變的致病性非常重要,此領(lǐng)域的研究亟待加強(qiáng)。

SLC26A4在不同組織中表達(dá),而在不同組織所發(fā)揮的離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能不同,其在各組織中的具體作用還不是十分明確。SLC26A4基因異常功能研究顯示,突變后的基因表達(dá)產(chǎn)物有以下幾種可能:①突變體蛋白在細(xì)胞內(nèi)運(yùn)輸發(fā)生障礙而不能正確定位到細(xì)胞膜上;②能正確定位到細(xì)胞膜上但離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能發(fā)生嚴(yán)重障礙;③能正確定位到細(xì)胞膜上但離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能發(fā)生部分障礙(低功能突變)。此外,SLC26A4基因與其他基因在EVA/PS的疾病的發(fā)生機(jī)制中存在著重要聯(lián)系,EVA/PS是一種受多基因影響的復(fù)雜型遺傳性疾病。部分SLC26A4基因突變可能不影響突變蛋白本身的細(xì)胞內(nèi)定位和離子轉(zhuǎn)運(yùn)功能,但可能干擾其與其它EVA/PS相關(guān)基因的相互結(jié)合與作用。有關(guān)這方面分子機(jī)制的研究將對(duì)EVA/PS耳聾的分子診斷與基因治療具有重要的意義。

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