基于QPSO算法和S-系統的基因調控網絡分析與重構

摘要：基于量子粒子群(QPSO)算法分析和重構了基因調控網絡。利用S-系統模型進行基因調控網絡的模擬，基本方法以真實實驗數據與模擬數據的差的平方和作為目標函數進行迭代優化，只能預測數目很少的參數并且算法的收斂率很低。依據基因網絡的稀疏性，提出了基于QPSO算法的逐步優化策略，將整個優化過程分為三個階段，通過逐步確定無效參數的位置來簡化模型。仿真實驗基于QPSO算法逐步優化策略成功實現了一個包含5個節點60個參數的S-系統優化。

關鍵詞：基因調控網絡；量子粒子群；S-系統；參數估計；重構；逐步優化策略

中圖分類號：N945 文獻標志碼：A 文章編號：1001－3695(2010)09－3279－04