周英武 彭桂英 顧立剛 殷勝駿
(北京中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)藥防治病毒性疾病教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100029)
利用生物芯片技術(shù)檢測(cè)人參皂苷Rg1對(duì)小鼠樹(shù)突狀細(xì)胞功能調(diào)控相關(guān)基因表達(dá)的影響①
周英武 彭桂英 顧立剛 殷勝駿
(北京中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)藥防治病毒性疾病教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100029)
目的:利用基因芯片技術(shù)檢測(cè)人參皂苷Rg1對(duì)小鼠骨髓來(lái)源DC細(xì)胞功能調(diào)控相關(guān)基因表達(dá)的影響。方法:分離C57小鼠骨髓細(xì)胞,經(jīng)GM-CSF、IL-4體外誘導(dǎo)培養(yǎng)6天的未成熟DC細(xì)胞(iDC)經(jīng)不同因素處理并分為:對(duì)照組(Ⅰ)、人參皂苷Rg1組(Ⅱ)、內(nèi)毒素(LPS)組(Ⅲ)、Rg1+LPS組(Ⅳ),24小時(shí)后收集各組細(xì)胞,抽提總RNA,利用樹(shù)突狀和抗原呈遞細(xì)胞基因芯片對(duì)細(xì)胞功能相關(guān)基因進(jìn)行檢測(cè)。結(jié)果:(Ⅱ/Ⅰ)上調(diào)≥2倍基因23個(gè),下調(diào)≥2倍基因45個(gè);(Ⅲ/Ⅰ)上調(diào)≥2倍基因15個(gè),下調(diào)≥2倍基因47個(gè);(Ⅳ/Ⅱ)上調(diào)≥2倍基因35個(gè),下調(diào)≥2倍基因15個(gè);(Ⅳ/Ⅲ)上調(diào)≥2倍基因37個(gè),下調(diào)≥2基因10個(gè)。這些基因功能主要涉及細(xì)胞因子分泌及其受體表達(dá)、抗原攝取、抗原提呈、細(xì)胞表面受體、信號(hào)傳導(dǎo)。結(jié)論:人參皂苷Rg1對(duì)DC作用涉及多個(gè)基因的表達(dá)調(diào)控,這些基因控制并影響著DC功能、分化和成熟,為進(jìn)一步尋找藥物靶點(diǎn)提供了線索。
人參皂苷Rg1;樹(shù)突狀細(xì)胞;基因芯片
人參具有的補(bǔ)氣生血和扶正祛邪等功效與其調(diào) 節(jié)機(jī)體免疫系統(tǒng)功能密切相關(guān),人參皂苷單體Rg1(ginsenoside Rg1)是人參三醇組皂苷的一個(gè)代表性單體,被認(rèn)為是其主要活性成分,對(duì)心血管、神經(jīng)系統(tǒng)及免疫功能等具有廣泛的藥理作用[1-3]。樹(shù)突狀細(xì)胞(Dendriticcell,DC)是機(jī)體內(nèi)最重要、功能最強(qiáng)的專職抗原提呈細(xì)胞,它啟動(dòng)并連接了天然免疫和獲得性免疫,特異性地激活T、B淋巴細(xì)胞,通過(guò)募集炎性分子在炎癥部位的聚集以及自身在病灶的浸潤(rùn),參與炎性反應(yīng)[4,5]。前期研究表明,人參皂苷Rg1具有促進(jìn)成熟樹(shù)突狀細(xì)胞表面粘附分子和共刺激分子的表達(dá),刺激T細(xì)胞增殖等作用[6]。為進(jìn)一步探討其調(diào)控機(jī)制,我們采用了基因芯片技術(shù),檢測(cè)人參皂苷Rg1對(duì)DC細(xì)胞功能調(diào)節(jié)相關(guān)基因表達(dá)的影響。
1.1 實(shí)驗(yàn)材料 人參皂苷Rg1購(gòu)于中國(guó)藥品生物制品檢定所(批號(hào) 110703-200424),淡黃色粉末,用RPM I1640溶液配制成2 mg/m l的溶液,并用0.22 μm的濾器(Millpore)過(guò)濾除菌;TRIZOL試劑(Invitrogen life technologies);Oligo Dendritic&Antigen Presenting CellGene Array(OMM-406,SuperArray)。
1.2 實(shí)驗(yàn)方法
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)及分組處理 按照文獻(xiàn)[7]略做改進(jìn),制備樹(shù)突狀細(xì)胞。無(wú)菌條件下取C57小鼠骨髓細(xì)胞,計(jì)數(shù),用完全 RPMI1640培養(yǎng)基調(diào)節(jié)濃度為1×106個(gè)/m l細(xì)胞懸液接種于培養(yǎng)皿中,并加入GMCSF(終濃度為40 ng/m l)及IL-4(終濃度為20 ng/m l),37℃,5%CO2條件下培養(yǎng)6天。第3、5天半量換液,并補(bǔ)充相應(yīng)細(xì)胞因子。在培養(yǎng)的第6天將iDC進(jìn)行分組,經(jīng)不同處理:對(duì)照組(Ⅰ)不做任何處理;人參皂苷Rg1組(Ⅱ)加入 Rg1使其終濃度為40 μg/ml;LPS組(Ⅲ)加入LPS使其終濃度為1μg/ml;人參皂苷Rg1+LPS組(Ⅳ)分別加入人參皂苷Rg1和LPS使其終濃度分別為40μg/m l和1μg/ml;37℃,5%CO2條件下培養(yǎng)24小時(shí)后,收集各組細(xì)胞。
1.2.2 RNA抽提及質(zhì)量檢測(cè) 加入TRIZOL試劑反復(fù)吹打裂解細(xì)胞,抽提RNA,用DNaseⅠ消化RNA樣品,去除其中可能含有的基因組DNA,然后用RNeasy MinEluteTM純化試劑盒(Qiagen)純化所得RNA,紫外吸收測(cè)定法和變性瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)RNA濃度和純度。
1.2.3 cDNA標(biāo)記與合成 將樣品RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)合成cDNA,在逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)液中加入RNA擴(kuò)增緩沖液,生物素標(biāo)記的UTP和擴(kuò)增酶類混合液,合成生物素標(biāo)記的cRNA探針,然后使用SuperArray ArrayGrade cRNA純化試劑盒純化cRNA探針。
1.2.4 芯片雜交 將純化的cRNA探針在GEAhyb雜交液中與Oligo GEA rray芯片雜交。
1.2.5 化學(xué)發(fā)光檢測(cè) 探針與芯片雜交后,加入鏈親和素偶聯(lián)的堿性磷酸酶(AP)及化學(xué)發(fā)光底物反應(yīng)。X射線膠片曝光后,在膠片上顯示檢測(cè)結(jié)果。
1.2.6 圖像采集和數(shù)據(jù)分析 X射線曝光膠片后,將膠片上的圖像掃描并轉(zhuǎn)換為灰度TIFF格式的圖片文件。運(yùn)行ScanAlyze軟件,將灰度TIFF格式圖片的點(diǎn)陣轉(zhuǎn)化為數(shù)字型數(shù)據(jù),將此原始數(shù)據(jù)儲(chǔ)存為M icrosoft Excel文件。運(yùn)用GEA rray表達(dá)分析配套軟件(GEArray Expression Analysis Suite)進(jìn)行完整的芯片數(shù)據(jù)分析。
2.1 RNA提取并鑒定 Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ組的RNA溶液A260/A280的比值在1.8~2.0之間。變性瓊脂糖凝膠電泳RNA條帶清晰,28S∶18S rRNA條帶亮度接近 2∶1,結(jié)果見(jiàn)圖 1。
2.2 基因芯片檢測(cè)結(jié)果分析
2.2.1 基因芯片分析 芯片上包含260個(gè)與抗原提呈細(xì)胞功能相關(guān)的基因,另外包括管家基因7個(gè)、陰性對(duì)照基因及背景點(diǎn)等28個(gè),共計(jì)12行、24列。為監(jiān)控芯片雜交體系的整個(gè)過(guò)程,在芯片上設(shè)置陰性對(duì)照,雜交時(shí)信號(hào)很低,說(shuō)明背景低。此外管家基因轉(zhuǎn)錄水平平均無(wú)顯著變化,說(shuō)明芯片的結(jié)果具有良好的穩(wěn)定性和可靠性,結(jié)果見(jiàn)圖2。
2.2.2 差異基因的統(tǒng)計(jì) 使用6μg的cRNA樣品,是芯片上的大部分表達(dá)豐度較高的基因信號(hào)。經(jīng)終濃度為40μg/m l的人參皂苷Rg1和 1μg/m l LPS處理24小時(shí)后,人參皂苷Rg1組與對(duì)照組相比較(Ⅱ/Ⅰ)上調(diào)≥2倍基因23個(gè),下調(diào)≥2倍基因45個(gè);LPS組與對(duì)照組相比較(Ⅲ/Ⅰ)上調(diào)≥2倍基因15個(gè),下調(diào)≥2倍基因 47個(gè);人參皂苷 Rg1+LPS組與人參皂苷 Rg1組相比(Ⅳ/Ⅱ)上調(diào)≥2倍基因35個(gè),下調(diào)≥2倍基因 15個(gè);人參皂苷 Rg1+LPS組與LPS組相比(Ⅳ/Ⅲ)上調(diào)≥2倍基因37個(gè),下調(diào)≥2倍基因10個(gè)。表1和表2顯示的是差異表達(dá)值高于5倍或小于0.2倍。

圖1 RNA變性瓊脂糖凝膠電泳圖Fig.1 RNA denaturing agarose gelelectrophoresis

圖2 基因芯片掃描結(jié)果Fig.2 The Results ofm icroarray after scan

表1 差異表達(dá)明顯上調(diào)的基因(大于5)Tab.1 Significant up-regulation of gene expression(above 5)

表2 差異表達(dá)明顯下調(diào)的基因(小于0.2)Tab.2 Significant down-regulation of gene expression(below 0.2)
人參皂苷Rg1是人參的主要活性物質(zhì),具有增強(qiáng)免疫力及抗衰老活性。有研究表明,Rg1可通過(guò)增強(qiáng)前體DC與血管內(nèi)皮細(xì)胞的粘附,從而促進(jìn)DC前體細(xì)胞的移行和發(fā)育成熟;增加DC分泌IL-12 P40蛋白及其mRNA的轉(zhuǎn)錄,刺激T細(xì)胞的增殖及增強(qiáng)LPAK細(xì)胞殺傷腫瘤的活力,具有啟動(dòng)和增強(qiáng)免疫應(yīng)答的作用,但其機(jī)制有待進(jìn)一步研究[8,9]。基因芯片是一種特異、高效、快速的現(xiàn)代檢測(cè)技術(shù),被廣泛用于免疫學(xué)研究,如免疫細(xì)胞的分化、成熟、活化以及表型的改變,它能同時(shí)檢測(cè)上千個(gè)基因的變化,全面反映細(xì)胞基因變化水平。現(xiàn)代免疫學(xué)認(rèn)為,基因變化與免疫藥理存在一定聯(lián)系,在研究藥物對(duì)機(jī)體免疫系統(tǒng)的調(diào)節(jié),尋找藥物靶向,基因芯片更體現(xiàn)其優(yōu)越性,可以為中藥藥理研究提供了一種有效途徑[10]。
DC是最強(qiáng)的抗原提呈細(xì)胞,能活化初始T細(xì)胞,是特異性免疫應(yīng)答的啟動(dòng)因素[11]。本實(shí)驗(yàn)取C57小鼠骨髓來(lái)源細(xì)胞,用人參皂苷Rg1處理,基因芯片檢測(cè)不同狀態(tài)DC功能相關(guān)基因的表達(dá),研究發(fā)現(xiàn),不同劑量濃度 Rg1作用于DC,發(fā)現(xiàn)40μg/ml濃度能顯著促進(jìn)樹(shù)突狀細(xì)胞分泌IL-12等細(xì)胞因子,因此基因芯片分析采用此濃度。同時(shí)發(fā)現(xiàn),經(jīng)人參皂苷Rg1處理后的DC,不論是在成熟還是非成熟階段,其功能相關(guān)基因表達(dá)都發(fā)生了明顯變化,這些基因?qū)C的遷移、抗原攝取、抗原吞噬、抗原提呈以及自身分化成熟起著至關(guān)重要的作用。初步研究顯示,人參皂苷Rg1和LPS對(duì)iDC作用主要表現(xiàn)為協(xié)同促進(jìn)作用,在一定意義上可認(rèn)為,人參皂苷Rg1促進(jìn)了mDC的功能。這些基因在DC發(fā)育的不同階段,其表達(dá)水平可以一致,也可不同,有時(shí)甚至相反。如:在iDC階段,人參皂苷 Rg1促進(jìn)了 Anpep、Areg、ccl25 、cd2 、cd1d1、cd5、Csf3、Cxcl1、Ifi44 、Ifit1、IL-12b 、IL-17f、IL-1a、IL-4、Lta、Mx2、Tnfrsf11 基因表達(dá),在與LPS共同作用于DC細(xì)胞后,這些基因的表達(dá)仍然處于一種高水平狀態(tài),這種一致性說(shuō)明,人參皂苷Rg1促進(jìn)了DC的基因表達(dá)。其中,cd2、cd1d1、Mx2具有抗原呈遞攝取功能;Anpep、Ifi44、Ifit1、Lta為信號(hào)傳導(dǎo)分子;cd5是細(xì)胞表面受體 ;A reg、ccl25、Csf3、Cxcl1、IL-1a、IL-4、IL-12b、IL-17f、Tnfrsf11b 是細(xì)胞因子、趨化因子及其受體。以上結(jié)果表明人參皂苷Rg1對(duì)DC的調(diào)控可能涉及到多個(gè)靶點(diǎn)。
從實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),在Ⅳ/Ⅲ(即LPS+Rg1組/LPS組)差異表達(dá)基因中,Erbb2和Ifi44均高表達(dá)。Erbb2作為細(xì)胞表面膜受體,是表皮生長(zhǎng)因子受體(EGFR)家族成員之一[12];而Ifi44又稱p44,位于胞漿內(nèi),是IFN-α/β的誘導(dǎo)基因,是干擾素抗病毒途徑中的一個(gè)重要分子[13]。考慮到Erbb2是EGFR家族成員,我們認(rèn)為Rg1可能通過(guò)和DC表面EGFR相結(jié)合,從而啟動(dòng)EGFR-p44MAPK信號(hào)通路從而產(chǎn)生下游的作用。而且單純用Rg1刺激DC,也發(fā)現(xiàn)Ifi44轉(zhuǎn)錄水平明顯增高(比值為2.8),進(jìn)一步證實(shí)我們推測(cè)的可能性。
此外,我們用ELISA檢測(cè)人參皂苷Rg1影響DC分泌IL-12和IL-4的情況(數(shù)據(jù)待發(fā)表),發(fā)現(xiàn)二者均上調(diào),這也和基因芯片結(jié)果(IL-12和IL-4差異表達(dá)值分別為3.84和2.57)一致,一方面證明基因芯片結(jié)果的可靠性,另一方面表明人參皂苷Rg1影響DC的功能,誘導(dǎo)了混合型Th1/Th2免疫反應(yīng),這與人參具有的雙向調(diào)節(jié)作用一致。
綜上所述,人參皂苷Rg1對(duì)DC功能調(diào)控涉及多基因、多靶點(diǎn),這些基因貫穿了DC分化、成熟與凋亡整個(gè)過(guò)程,控制著DC的細(xì)胞因子分泌、受體表達(dá)、吞噬和抗原提呈功能。但有關(guān)EGFR-p44MAPK信號(hào)通路以及差異表達(dá)明顯上調(diào)的相關(guān)蛋白功能還有待進(jìn)一步研究確定。
1 ChengY,Shen LH,Zhang JT.Anti-amnestic and anti-aging effectsofginsenoside Rg1 and Rb1 and itsmechanism of action[J].Acta Pharmacol Sin,2005;26(2):143-149.
2 Zhang JT.Nootropicmechanisms of ginsenoside Rg1--influence on neuronal plasticity and neurogenesis[J].Acta Pharm Sin,2005;40(5):385-388.
3 Zhao CH,Chen XC,Zhu Y Getal.Rolesof telomere and telomerase in the processofginsenoside Rg1 protection against tert-butyl hydroperoxideinduced senescence in WI-38 cells[J].Chin Pharmacol Bull,2005;21(1):61-66.
4 Gervais A,ToutiraisO,Bouet-Toussaint Fetal.In vitro antitumor lymphocyte generation using dendritic cells and innate immunity mechanisms as tumor cell treatments[J].Anticancer Research,2007;27(4B):2385-2392.
5 Watanabe S,YamakawaM,HiroakiTetal.Correlation of dendritic cell infiltration with active crypt inflammation in ulcerative colitis[J].Clin Immunol,2007;122(3):288-297.
6 王 毅,郝 鈺,邱全瑛etal.人參皂甙Rg1、Rh1對(duì)樹(shù)突狀細(xì)胞刺激T細(xì)胞增殖及LPAK抗腫瘤活性的影響[J].中國(guó)免疫學(xué)雜志,2003;19(4):248-252.
7 Boudreau J,Koshy S,Cummings D,Wan Y.Culture ofmyeloid dendritic cells from bonemarrow precursors[J].JVis Exp,2008;25(17):769-769.
8 王 毅,王本祥,劉鐵漢etal.人參皂苷Rg1的腸內(nèi)菌代謝Ⅱ.人參皂苷Rg1和Rh1免疫活性[J].中國(guó)藥理學(xué)報(bào)(英文版),2000;21(9):792-796.
9 王 毅,郝 鈺,婁金麗etal.人參皂苷Rg1和 Rh1對(duì)樹(shù)突狀細(xì)胞功能的影響[J].中國(guó)病理生理雜志,2004;20(10):1764-1764.
10 馬宇瀅,張新民.基因芯片技術(shù)在免疫學(xué)研究中的應(yīng)用及其對(duì)中醫(yī)藥研究的啟發(fā)[J].中西醫(yī)結(jié)合學(xué)報(bào),2004;2(2):90-93.
11 Stuart LM,LucasM,Simpson Cetal.Inhibitory effectsof apoptotic cell ingestion upon endotoxin-drivenmyeloid dendritic cellmaturation[J].J Immunol,2002;168(4):1627-1635.
12 Alison Reid,Laura Vidal,Heather Shawetal.Dual inhibition of ErbB1(EGFR/HER1)and ErbB2(HER2/neu)[J].Euro JCancer,2007;43(3):481-489.
13 Lin L,Hwang Y,Chen E Y.Gene-gene and gene-environmentinteractions in interferon therapy for chronic hepatitis C[J].FutureMedicine,2007;8(10):1327-1335.
[收稿2010-04-29 修回2010-07-09]
(編輯 倪 鵬)
Identification of the regulatory effect of Ginsenoside-Rg1 on functional regulation gene expressing in murine dendritic cell by bio-chip technology
ZHOUYing-Wu,PENGGui-Ying,GULi-Gang,YINSheng-Jun.KeyLaboratoryofChineseMedicineonViralInfectious Disease,BeijingUniversityofChineseMedicine,MinistryofEducation,Beijing100029,China
Objective:cDNA microarrary technique was emp loyed to detect the effects of ginsenoside-Rg1 on functional regu lation of gene expressing inmurinemarrow-derived dendritic cells.Methods:Immature dendritic cells(iDC)derived from bonemarrow of C57m ice were induced by GM-CSF and IL-4 for six days in vitro and
different treatments for 24 h.Then the cellswere divided into themedia control group(Ⅰ),ginsenoside Rg1 group(Ⅱ),LPSgroup(Ⅲ)and ginsenoside Rg1 plus LPSgroup(Ⅳ).24 h later,total RNA of the cells was collected,and four chips ofOligo Dendritic&Antigen Presenting CellGene Array were used to investigate the transcription levels of the functional genes from dendritic cells.Results:Therewere twenty-three genes up-regulated and forty five genes down-regulated two-folds above inⅡ/Ⅰ;fifteen genes up-regulated and forty seven genes down-regulated two-folds above inⅢ/Ⅰ;thirty fivegenesup-regulated and fifteen genes down-regulated two-folds above inⅣ/Ⅱ;thirty seven genes up-regulated and ten genes down-regulated two-folds above inⅣ/Ⅲ.The function of these genes involves the secretion of the cytokines and the exp ression of their receptors,antigen uptake and p resentation,cell surface receptors and signal transduction.Conclusion:The effects of ginsenoside-Rg1 on dendritic cell involve in multi-regulation and expression of geneswhich contribute to the functions,differentiation and maturation of the dendritic cells.This study provides a clue to further seek the target ofmedicine.
Ginsenoside-Rg1;Dendritic cell;Microarrary
R285.5
A
1000-484X(2010)12-1086-05
10.3969/j.issn.1000-484X.2010.12.007
①本文為國(guó)家自然科學(xué)基金青年科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.30701105)
周英武(1974年-),男,在讀博士,講師,主要從事中醫(yī)藥免疫調(diào)節(jié)的分子機(jī)制研究,E-mail:zhouyingwuhn@163.com;
及指導(dǎo)教師:彭桂英(1978年-),女,博士,副教授,主要從事中醫(yī)藥免疫調(diào)節(jié)的分子機(jī)制研究,E-mail:penggy@bucm.edu.cn。