水稻寡分蘗突變體差異表達基因的鑒定和生物信息學(xué)分析

摘要：一般認為分蘗由OTL控制，對植物側(cè)生組織的研究表明，水稻分蘗的形成可能受激素的控制。以寡分蘗突變體G069與廣親和材料“02428”構(gòu)建的1對近等基因系02428－ftl為對象。采用RNA差異顯示技術(shù)分析了此對近等基因系在分蘗前期的基因差異表達。經(jīng)過片段回收，反式Nonhem雜交(Re-verse northem blotting)和測序分析，分離得到一個在“02428”中強勢表達的基因片段。生物信息學(xué)分析表明，該片段與水稻的cDNA和mRNA以及基因組序列高度相似，但沒有同源的氨基酸序列，說明該片段處于非編碼區(qū)：電子延伸序列與多個水稻多肽序列高度同源，含有一個明顯的蛋白激酶作用域，但未發(fā)現(xiàn)與已報道的基因同源。推測為一未知的調(diào)控蛋白。

關(guān)鍵詞：水稻；分蘗突變體；mRNA差異顯示

中圖分類號：S331；Q786 文獻標識碼：A 文章編號：0439－8114(2009)08－1793－03