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菊花BBX基因家族鑒定及UV-A處理下表達模式分析

2025-09-15 00:00:00龍振濤向理理朱凡
湖南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2025年8期

中圖分類號: 8682.1+1 ;Q943 文獻標(biāo)識碼:A 文章編號:1006-060X(2025)08-0080-11

Identification of the BBX Gene Family in Chrysanthemum and Analysis of the Expression Patterns Under UV-A Treatment

LONG Zhen-tao1,XIANGLi-li2,ZHUFan1

(1.ColegeofpedAiulUsits;.lf HunanAgriculturalUniversity,Changsha4lO128,C)

Abstract:TheBBX(B-box)familyisagroupofincfingerproteintranscriptionfactors thatplaycrucialroles inplantightsignal transduction,photoperiodregulation,andsecondary metabolismregulation.The membersof theBBXgenefamily(CmBBXsin chrysanthemum(ChrysanthemummorifoliumRamat.)weresystematicallyidentifedfromthechrysanthemumgenomedatabase Mum GARDEN,followedbybioiformaticsaalysisandfunctionprediction.Atotalof35CmBBXswereidentifed.Theplogenetic analysisindicatedthatCmBBXscouldbeclasified intofivesub-families,which showeddifferencesintheconserveddomains. Predictioofcis-actingelementsinpromoterreginssowedthatthere werealargenumberoflight-resposiveelements inCmBBXs, andsome membershadMYB-bindingsites.UnderUV-Atreatment,theexpressionpatesoffourCmBBXs weresiilartothatofthe previouslyreported chrysanthemum anthocyaninregulatory geneCmMYB6.It is hypothesized that these CmBBXs maybe involvedin thelight-regulated anthocyaninmetabolism.

Key words: chrysanthemum; BBX gene family; identification; anthocyanin; expression

轉(zhuǎn)錄因子是一類具有特殊結(jié)構(gòu)的蛋白質(zhì)分子,其能夠與下游基因啟動子中的順式作用元件或其他蛋白結(jié)合,進而調(diào)控下游基因的表達[1]。植物轉(zhuǎn)錄因子根據(jù)其結(jié)構(gòu)特點可分為多個轉(zhuǎn)錄因子家族,比如MYB、NAC、WRKY、AP2/ERF等家族,這些轉(zhuǎn)錄因子家族在植物的生長發(fā)育過程中扮演著重要角色[2]。光是植物生長發(fā)育過程中不可或缺的環(huán)境因子之一,其不僅為植物的生長提供能量,也能作為信號影響植物生長發(fā)育。光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)是一個復(fù)雜的過程,在這個過程中有許多轉(zhuǎn)錄因子家族發(fā)揮著重大作用,比如COP1、PIFs、HY5、HYH等,其中COP1-HY5是光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的中心調(diào)控模塊[3-4]。此外還存在許多其他轉(zhuǎn)錄因子家族成員能夠與上述轉(zhuǎn)錄因子互作,在光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)中發(fā)揮作用,進而影響光形態(tài)建成[5]。

BBX蛋白(B-box zinc finger proteins)是鋅指蛋白轉(zhuǎn)錄因子(Zinc finger protein transcription factor)的一個亞族,因其氨基酸序列N端存在1個或2個B-box結(jié)構(gòu)域而得名。最早從擬南芥(Arabidopsisthaliana)中鑒定出32個BBX轉(zhuǎn)錄因子蛋白,并根據(jù)其序列中B-box結(jié)構(gòu)域的數(shù)量與是否含有CCT結(jié)構(gòu)域分為5個亞族[。研究發(fā)現(xiàn)BBX蛋白在植物進化中較為保守,在水稻(Oryzasativa)、矮牽牛(Petunia × hybrida)大豆(Glycinemax)與玉米(Zeamays)等植物中都鑒定出該轉(zhuǎn)錄因子家族[7-10]。許多研究發(fā)現(xiàn)BBX蛋白可能在光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與光形態(tài)建成中發(fā)揮關(guān)鍵作用[。比如在擬南芥中AtBBX28能夠直接與AtHY5互作進而抑制AtHY5的活性,在光照條件下AtBBX21能夠積累并激活A(yù)tHY5的轉(zhuǎn)錄,促進光形態(tài)建成,AtBBX23也能夠與AtHY5結(jié)合,共同調(diào)控下游靶基因[。非脅迫下植物花青苷的合成需要光誘導(dǎo),光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)成化學(xué)信號來促使花青苷積累,而BBX是光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的重要組成部分,這意味著BBX很有可能參與花青苷的代謝[3]。擬南芥中研究發(fā)現(xiàn)AtBBX21、AtBBX23和AtBBX24通過AtHY5來調(diào)控花青昔的合成,在蘋果中的研究也發(fā)現(xiàn)MdBBX20、MdBBX22在花青苷合成中起正調(diào)控作用[-12],這說明BBX在花青苷代謝中有很大的研究潛力。

菊花(ChrysanthemummorifoliumRamat.)是菊科菊屬的多年生宿根草本或亞灌木花卉,其觀賞性強,經(jīng)濟價值高,種植面積廣,在花卉產(chǎn)業(yè)中占有重要地位[13]。菊花是典型的短日照植物,對光照十分敏感,光照直接影響菊花的生長發(fā)育、花期與花色形成[4]。目前研究發(fā)現(xiàn)CmBBXs有調(diào)控菊花花期以及抗逆方面的功能,比如CmBBX24負向調(diào)控菊花開花[15],CmBBX8正向調(diào)控夏菊開花[16-17],CmBBX19負向調(diào)控菊花的耐旱性[18],CmBBX22在擬南芥中正向調(diào)控植物耐旱性[19],但在菊花中負向調(diào)控耐旱性[20]。總的來說,目前對于CmBBXs的研究主要是某一成員的功能挖掘,對于整個基因家族的鑒定與研究較少,同時對于CmBBXs是否參與光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及花青昔代謝研究較少,而調(diào)控花青昔代謝是改變菊花花色的重要手段。因此本研究通過生物信息學(xué)方法鑒定出35個CmBBXs成員,對其蛋白序列特征、系統(tǒng)進化等進行了分析與預(yù)測,對其中部分成員的功能進行科學(xué)性預(yù)測,并且分析了CmBBXs在UV-A處理下的表達模式,初步篩選了一些可能參與花青苷代謝的CmBBXs,為將來進一步研究CmBBXs成員在花青昔代謝與花色調(diào)控中的功能提供參考。

1材料與方法

1.1 試驗材料

本研究所獲取的CmBBXs基因與蛋白序列來自于菊花基因組數(shù)據(jù)庫MumGARDEN[21],供試菊花材料‘科隆香水’購于湖南省長沙市紅星花卉市場茂源花卉貿(mào)易有限公司,主要試劑有鹽酸溶液、甲醇溶液(均為分析純)、植物DNA提取試劑盒(艾科瑞生物公司)、反轉(zhuǎn)錄試劑盒與ChamQUniversalSYBRqPCRMasterMix(諾唯贊生物公司)。

1.2 試驗方法

1.2.1菊花CmBBXs家族成員的鑒定為了準(zhǔn)確獲取菊花CmBBXs轉(zhuǎn)錄因子家族成員,本研究在菊花基因組數(shù)據(jù)庫MumGARDEN(http://mum-garden.kazusa.or.jp/)以“B-box”為關(guān)鍵詞進行檢索,檢索出43個菊花CmBBXs候選成員。利用在線工具NCBICD-Search、InterPro、SMART驗證其是否具有“B-box”結(jié)構(gòu)域,手動剔除不含或者缺失“B-box'結(jié)構(gòu)域的候選成員。

1.2.2菊花CmBBXs氨基酸序列特征分析利用ExPASy(https://web.expasy.org/cgibin/protparam/protparam)在線分析軟件對CmBBXs蛋白的氨基酸數(shù)量、不穩(wěn)定系數(shù)、相對分子量等理化性質(zhì)進行預(yù)測分析。使用WoLFPSOR(Thttps://wolfpsort.hgcjp/)對CmBBXs進行亞細胞定位預(yù)測。運用NCBI的CD-Search工具對CmBBXs家族的保守結(jié)構(gòu)域進行分析,并使用TBtools軟件進行可視化作圖。利用在線工具MEME(https://meme-suite.org/meme/doc/meme.html)對CmBBXs進行Motif分析。

1.2.3菊花CmBBXs進化分析從擬南芥數(shù)據(jù)庫(https://www.arabidopsis.org/)中下載已鑒定出的32條擬南芥AtBBXs序列,利用MEGAX中的ClustalW對鑒定出的CmBBXs家族的蛋白序列和擬南芥AtBBXs蛋白序列進行了多序列比對,使用最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,利用在線工具Itol(https://itol.embl.de/)對進化樹進行美化。

1.2.4菊花CmBBXs基因啟動子順式作用元件分析根據(jù)鑒定的CmBBXs序列,從MumGARDEN數(shù)據(jù)庫提取CmBBXs起始密碼子ATG上游 2000bp 序列,利用PlantCARE 數(shù)據(jù)庫(http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/pla-ntcare/html)對啟動子上游序列中所含的順式作用元件進行預(yù)測,并利用TBtools軟件進行可視化。

1.2.5UV-A處理與花青苷含量測定通過查閱文獻發(fā)現(xiàn)紫外光能夠促進花青昔的合成,為了研究紫外光對菊花花瓣花青苷合成的影響,購買切花菊‘科隆香水’,先避光水養(yǎng) 24h ,隨后選取生長狀況相同的菊花,將枝條統(tǒng)一修剪至 10cm 瓶插水養(yǎng),置于溫室中進行紫外光(UV-A, 320~400nm )處理,光強度控制在約 200μmol/μmol/μmol/μmol/μmol/μmol/μmol/μmol/nμmol/n, ( m2?s ),光周期為 14L/10 D(光照/黑暗),室內(nèi)溫度為 20% 。

在光照處理0、2、8、14d時進行取樣,取頂端花瓣,液氮保存。花青昔相對含量測定參考他人方法,取菊花花瓣鮮樣 0.1g ,使用液氮研磨,加入1mL1% (V/V)鹽酸甲醇溶液,黑暗浸提 24h ,離心后取上清液,測定 525nm 處吸光度, OD525 反映花青苷相對含量( OD525/100mgFW )[22]。

1.2.6UV-A處理下菊花CmBBXs表達模式分析為了研究CmBBXs在UV-A下的表達模式,取菊花在UV-Ag下處理0、6、24、 48h 的花瓣鮮樣,液氮速凍保存,每個處理3組生物學(xué)重復(fù),隨后于 -80°C 下保存,使用AGSteadyPure植物RNA提取試劑盒進行RNA提取,通過微量紫外分光光度計檢測RNA樣品的濃度與純度,并且通過 1% 瓊脂糖凝膠電泳驗證RNA的完整性。使用Vazyme反轉(zhuǎn)錄試劑盒將提取的RNA樣品反轉(zhuǎn)錄為cDNA。使用PrimerPremier5軟件設(shè)計CmBBXs基因家族q-pcr引物并驗證,按 照 ChamQUniversal SYBR qPCR MasterMix試劑盒說明書推薦體系加人反應(yīng)液,在Bio-Rad熒光定量儀上按如下程序進行PCR反應(yīng): 95°C 預(yù)變性 30s , 95°C 變性 15s , 60°C 退火延伸 30s ,40個循環(huán),3次技術(shù)重復(fù),基因相對表達量采用2?△CT公式進行計算,使用Tbtools軟件繪制基因表達熱圖,繪圖設(shè)置為LogScale、RowScale,聚類設(shè)置為Cluster Rows。

2 結(jié)果與分析

2.1 菊花CmBBXs家族成員的鑒定與命名

利用菊花(chrysanthemumseticuspe)基因組數(shù)據(jù)庫,檢索關(guān)鍵詞“B-box”,共獲得43個注釋為BBX的轉(zhuǎn)錄本,通過保守結(jié)構(gòu)域分析,發(fā)現(xiàn)其中8個蛋白序列不包含B-box結(jié)構(gòu)域,將其剔除,最終鑒定到35個菊花CmBBXs家族成員(圖1)。

為對CmBBXs進行系統(tǒng)命名,將35條CmBBXs蛋白序列提交至NCBI蛋白數(shù)據(jù)庫進行比對,結(jié)果發(fā)現(xiàn)(表1),其中12個成員已被命名(QueryCover為 100% ),其余23個成員的命名則參考與擬南芥AtBBXs的親緣關(guān)系,當(dāng)多個CmBBXs與同一AtBBX成員具有最高相似度時,按數(shù)字編號區(qū)分,如 與Cse_sc036011.1_g020.1皆與AtBBX2親緣最近,分別命名為CmBBX2與CmBBX2.1,以此類推。

在13個已命名的CmBBXs蛋白中,有6個成員的功能已進行研究,其中CmBBX24通過赤霉素(GA)途徑影響菊花的開花時間、耐寒性和耐旱性[5],CmBBX20促進菊花類黃酮和綠原酸(CGA)的合成[23],CmBBX22負向調(diào)控菊花耐旱性[20],CmBBX7與CmBBX8可協(xié)同調(diào)控夏菊開花時間[16-17.24],CmBBX13 在擬南芥中異源表達可延遲擬南芥開花[25]。這些研究表明,CmBBXs家族成員在花期調(diào)控、非生物脅迫應(yīng)答及次生代謝產(chǎn)物合成方面具有重要作用。

表1CmBBXs家族成員信息

2.2 菊花CmBBXs蛋白序列特征分析

利用在線程序ProtParam對CmBBXs進行蛋白理化性質(zhì)分析(表2),結(jié)果顯示CmBBXs家族編碼蛋白的長度為范圍為127~537個氨基酸,大部分成員長度介于200~400個氨基酸之間,蛋白相對分子質(zhì)量大小在 14376.25~60607.07 之間,CmBBXs理論等電點pI則介于4.11~9.04之間,其中28個成員屬于酸性蛋白,說明CmBBXs含有較多酸性氨基酸,不穩(wěn)定系數(shù)的變化范圍為 ,其中大部分屬于不穩(wěn)定蛋白,脂肪系數(shù)介于 50.30~86.89 之間,親水性平均值在-0.897至-0.117范圍內(nèi)變化,表明所有成員均為親水蛋白,亞細胞定位預(yù)測發(fā)現(xiàn),22個CmBBXs蛋白主要定位于細胞核,9個CmBBXs定位于葉綠體上,但也有少數(shù)成員定位于其他亞細胞結(jié)構(gòu),有3個成員定位于細胞質(zhì)、1個成員定位于細胞骨架。以上結(jié)果表明,CmBBXs成員大部分定位于細胞核中,但不同成員的理化性質(zhì)各有不同,這預(yù)示著該家族中大部分成員可能作為轉(zhuǎn)錄因子在菊花的生長發(fā)育過程中發(fā)揮著不同的調(diào)控功能

使用CD-Search對35個CmBBXs的氨基酸序列進行保守結(jié)構(gòu)域分析(圖2),發(fā)現(xiàn)有29個成員含有Bbox1_BBX-like結(jié)構(gòu),7個成員含有Bbox_SFsuperfamily結(jié)構(gòu),1個成員含有BBOX結(jié)構(gòu),1個成員含有Bbox2結(jié)構(gòu),14個成員含有CCT結(jié)構(gòu),這些不同保守結(jié)構(gòu)域的存在表明CmBBXs可能在DNA結(jié)合或蛋白-蛋白相互作用方面具有不同的特性。

同時利用在線工具MEME對CmBBXs的保守基序進行了預(yù)測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)CmBBXs主要存在5種Motif,其中Motif1、Motif3、Motif4、Motif5主要構(gòu)成各種B-box結(jié)構(gòu)域,Motif2主要構(gòu)成CCT結(jié)構(gòu)域。35個CmBBXs存在不同的保守結(jié)構(gòu)域與Motif數(shù)量,這說明成員可能發(fā)揮的功能不同。

2.3 菊花CmBBXs的系統(tǒng)進化樹

為了解CmBBXs家族與擬南芥AtBBXs家族之間的聚類關(guān)系,對35個菊CmBBXs和32個AtBBXs的蛋白序列進行多重序列比對(ClustaIW),并用MEGAX構(gòu)建了系統(tǒng)發(fā)育進化樹(圖3)。根據(jù)聚類關(guān)系,可以將CmBBXs劃分為5個亞族,其中I亞族有5個成員,Ⅱ亞族有7個成員,Ⅲ亞族有3個成員,V亞族有13個成員,V亞族有6個成員。此外,CmBBX33未歸屬于上述5個亞族,而是形成一個獨立分支。

已有研究表明,AtBBXs家族不同亞族成員在光信號調(diào)控、開花時間調(diào)控和次生代謝調(diào)控等方面發(fā)揮不同作用,參與調(diào)控花青昔代謝的AtBBXs成員主要集中在第IV亞族[2]。本研究基于系統(tǒng)發(fā)育分析推測不同亞族的CmBBXs蛋白在菊花生長發(fā)育過程中也發(fā)揮不同的功能,其中13個V亞族的CmBBXs成員有可能參與菊花的花青苷代謝調(diào)控。

表2菊花CmBBXs蛋白理化性質(zhì)分析與亞細胞定位預(yù)測

注:nucl代表細胞核,cyto代表細胞質(zhì),chlo代表葉綠體,cysk代表細胞骨架。

圖2菊花CmBBXs保守結(jié)構(gòu)域分析與Motif分析

圖3菊花CmBBXs家族與擬南芥AtBBXs家族系統(tǒng)發(fā)育進化樹

I-V表示不同亞族,紅色為I亞族,黃色為Ⅱ亞族,綠色為Ⅲ亞族,藍色為IV亞族,紫色為V亞族)

2.4菊花CmBBXs啟動子順式作用元件

為了進一步研究CmBBXs的潛在應(yīng)答機制,提取CmBBXs啟動子上游2000bp序列,進行順式作用元件預(yù)測,結(jié)果顯示(圖4),CmBBXs家族成員的順式作用元件包括光響應(yīng)相關(guān)元件、激素響應(yīng)相關(guān)元件、抗逆與脅迫響應(yīng)相關(guān)元件以及MYB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。其中光響應(yīng)元件最多,大部分成員都存在多個光響應(yīng)元件,這表明CmBBXs可能在光信號調(diào)控中發(fā)揮作用,而光能夠促進菊花花青昔合成,因此,CmBBXs在光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)及花青苷代謝中的潛在作用值得進一步研究。

此外,CmBBX24、CmBBX22.4、CmBBX7與CmBBX28.3這4個成員的啟動子區(qū)存在與類黃酮生物合成調(diào)控相關(guān)的MYB轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)合位點。這表明部分CmBBXs可能與MYB轉(zhuǎn)錄因子相互作用,從而參與調(diào)控類黃酮色素的生物合成。

2.5 UV-A處理下菊花花瓣花青苷含量

研究表明紫外光對植物花青苷的合成有促進作用[27],研究對‘科隆香水’菊花進行了紫外光(UV-A)處理,持續(xù)觀察花瓣表型并測定花青昔相對含量。從圖5可以看出,處理0d時菊花花瓣內(nèi)輪呈現(xiàn)綠色,外輪為白色,隨著UV-A處理時間的延長,內(nèi)輪綠色褪去,外輪白色部分增多,到處理14d時,花瓣外輪變紅,檢測花青苷含量(圖6)發(fā)現(xiàn)處理14d時菊花花瓣中花青苷含量顯著上升,這表明UV-A能夠促進菊花花瓣花青昔合成。

2.6UV-A處理下菊花CmBBXs的表達模式分析

為了篩選可能參與菊花花青昔代謝的CmBBXs成員,在UV-A處理下收集處理 48h 內(nèi)不同時間點的菊花花瓣樣品,并檢測了CmBBXs的表達水平,同時分析了CmBBXs與已報道菊花花青苷合成轉(zhuǎn)錄因子CmMYB6表達模式的相關(guān)性[28]

圖4菊花CmBBXs啟動子順式作用元件分析

圖5UV-A處理菊花切花(圖中標(biāo)尺為 3cm )

圖6UV-A處理下菊花花瓣花青苷相對含量[-圖中不同小寫字母a,b表示不同處理天數(shù)下菊花花瓣花青苷含量差異顯著(Plt;0.05) ]

僅30個CmBBXs在花瓣中檢測到表達,其余5個成員未檢測到表達信號,推測這5個基因在花瓣中表達水平較低或不表達。對30個CmBBXs基因的表達進行了聚類分析(圖7),結(jié)果顯示在UV-A處理下,CmBBX20、CmBBX22、CmBBX22.2與CmBBX28.2的表達模式與CmMYB6相似,提示這些基因可能與CmMYB6共同調(diào)控紫外光誘導(dǎo)的花青昔積累。此外,還有7個成員在UV-A處理下表達量整體呈上升趨勢,且在 48h 時顯著上調(diào),與CmMYB6的表達趨勢一致,這些基因可能是紫外光誘導(dǎo)花青昔代謝的潛在調(diào)控因子。

3 討論與結(jié)論

3.1 討論

CmBBXs與AtBBXs構(gòu)建的系統(tǒng)進化樹表明,除CmBBX33單獨聚類成一支外,其余34個成員能夠與AtBBXs聚類成5個亞族,并且符合擬南芥中的分類規(guī)則。擬南芥I、Ⅱ亞族中含有2個B-box與1個CCT結(jié)構(gòu)域,I亞族中的成員存在1個B-box與1個CCT結(jié)構(gòu)域,IV亞族成員存在2個B-box結(jié)構(gòu)域,V亞族成員存在1個B-box結(jié)構(gòu)域,且V、V亞族無CCT結(jié)構(gòu)[。在鑒定的CmBBXs中I、Ⅱ、Ⅲ亞族的成員中存在B-box與CCT結(jié)構(gòu)域,IV、V亞族僅鑒定出B-box結(jié)構(gòu)域,這與擬南芥中的分類相似。在水稻中鑒定出30個OsBBX成員,根據(jù)BBX保守結(jié)構(gòu)域的組成與系統(tǒng)進化樹分析也可以分成5個亞族[7,此外在多個物種的BBX基因家族鑒定研究中也有類似發(fā)現(xiàn)[8.29-30]。可以看出不同物種的BBX在進化過程中相對保守,都能夠分為5個亞族,并且每個亞族中的成員在保守結(jié)構(gòu)域的組成上相似。

圖7UV-A處理48h內(nèi)菊花CmBBXs表達模式(紅框內(nèi)為CmMYB6與表達模式相近的CmBBXs成員)

不同亞族的BBX成員可能發(fā)揮不同作用,擬南芥中I亞族的成員主要參與開花調(diào)控及光周期響應(yīng)[2,菊花中鑒定出5個I亞族成員,主要與AtBBX2、AtBBX6親緣相近,并且這5個成員啟動子上游序列中都存在許多響應(yīng)植物激素、光信號的順式作用元件,其可能通過參與激素信號與光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)來調(diào)控開花與光周期響應(yīng)。菊花中鑒定出Ⅱ亞族成員7個,主要與AtBBX7、AtBBX11親緣相近,其中AtBBX7調(diào)控開花,AtBBX11與葉綠素合成有關(guān),二者都屬于Ⅱ亞族[2],Ⅱ亞族的7個CmBBXs可能有類似功能。擬南芥IⅣ亞族成員主要參與花青苷代謝與下胚軸調(diào)控[2,菊花中鑒定出13個V亞族成員,主要與AtBBX20、AtBBX22及AtBBX24親緣較近,其中與AtBBX22相近成員最多,擬南芥中AtBBX20、AtBBX22及AtBBX24都參與花青苷代謝調(diào)控,菊花中的CmBBX20、CmBBX20.1、CmBBX20.2、CmBBX22.1等成員也存在大量光信號元件,也可能參與花青苷的代謝,值得進一步研究。

研究結(jié)果表明,UV-A能夠促進采后切花菊花瓣中花青苷的積累,在許多園藝作物中都有相類似的研究結(jié)果。有研究表明,UV-B能夠促進菊花花瓣中花青苷與類黃酮物質(zhì)的積累[31-33],UV-A能夠促進多種植物中花青苷的合成[34-3,這些已有研究證明了研究結(jié)果的可靠性。基于此,進一步分析了UV-A處理 48h 內(nèi)多個時間點的CmBBXs與已知的花青苷正向調(diào)控基因CmMYB6的表達模式,發(fā)現(xiàn)有4個CmBBXs與CmMYB6表達都是持續(xù)上調(diào),這與花青昔積累模式相似,由于基因調(diào)控速度遠快于次生代謝產(chǎn)物的產(chǎn)生,研究中UV-A處理14d時花瓣中花青昔含量上調(diào)。因此推測 48h 內(nèi)表達量持續(xù)上調(diào)且與CmMYB6表達模式相似的CmBBXs可能參與花青苷代謝。在紫薇(Lagerstroemiaindica)中研究發(fā)現(xiàn),黑暗處理會抑制葉片中花青苷的積累,恢復(fù)光照則可促進花青苷合成,有學(xué)者基于此分析黑暗與光照處理條件下LiBBX的表達模式,篩選與花青昔積累模式相似的LiBBX,最終鑒定出參與花青昔代謝的LiBBX4[37]。有學(xué)者在矮牽牛(Pe tunia×hybridc )中的研究發(fā)現(xiàn),白光促進矮牽?;ò曛谢ㄇ嘬辗e累,紅光則起抑制效應(yīng),通過分析白光與紅光處理下的矮牽牛轉(zhuǎn)錄組,發(fā)現(xiàn)有7個差異表達BBX基因可能參與花青苷合成[38],有學(xué)者在云南楊(PopulusyunnanensisDode)中鑒定出43個PyunBBX,通過分析其在UV-B下的表達模式。篩選出12個表達上調(diào)的PyunBBX,并從中鑒定出參與花青昔調(diào)控的PyunBBX18l39]。在芒果(Mangifera indica)中研究發(fā)現(xiàn),MiBBX24和MiBBX27參與藍光誘導(dǎo)下的芒果花青苷合成[40]。這些研究結(jié)果表明,通過研究不同光處理下BBX的表達模式能夠篩選出可能參與花青日代謝的BBA成貝。

UV-A能夠促進菊花花瓣中花青苷的積累,進一步研究CmBBXs在UV-A下的表達模式篩選出CmBBX20、CmBBX22、CmBBX22.2與CmBBX28.2這4個成員是潛在的菊花花青昔調(diào)控基因,這些CmBBXs皆屬于第IV亞族(其中CmBBX28.2雖命名為BBX28.2,但進化樹聚類屬于V亞族)。擬南芥中研究發(fā)現(xiàn)AtBBX21、AtBBX23和AtBBX24都能夠通過AtHY5來調(diào)控花青苷的合成,蘋果中的研究發(fā)現(xiàn)MdBBX20、MdBBX22在花青苷合成中起正調(diào)控作用[1l-12],梨中PpBBX21,草莓中FaBBX24都對花青苷代謝具有調(diào)控效應(yīng)[41-42]。這些植物中已鑒定的參與花青苷調(diào)控的BBX都屬于V亞族,所以本研究中鑒定出的這4個CmBBXs成員極有可能參與花青苷的代謝,值得更進一步的研究。此外有學(xué)者不僅鑒定出參與花青昔代謝調(diào)控的BBX成員,并且探究其互作因子,豐富了花青苷代謝的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。在蘋果中的研究發(fā)現(xiàn),蘋果BBX蛋白MdCOL11能夠促進花青苷的合成,并且能夠激活蘋果花青苷調(diào)控基因MdMYBA的表達[43],此外蘋果中MdBBX1、MdBBX17、MdBBX15、MdBBX35、MdBBX51與MdBBX54都能夠激活花青苷正調(diào)控因子MdMYB10的表達[44],在草莓中的研究發(fā)現(xiàn)FaMYB5能夠與FaBBX24互作從而調(diào)控草莓中花青苷的合成[42],說明 BBX 很有可能通過MYB參與花青苷代謝調(diào)控。除MYB外,BBX還能夠通過HY5來調(diào)控花青昔代謝,在擬南芥中研究發(fā)現(xiàn)AtBBX21能夠調(diào)節(jié)AtHY5的表達,進而促進花青苷的合成,AtBBX24能夠干擾AtHY5與花青苷合成基因啟動子的結(jié)合,從而抑制花青苷的積累[45],在楊樹中過表達PtrBBX23能夠促進MYB轉(zhuǎn)錄因子與花青苷結(jié)構(gòu)基因的表達,從而促進花青苷合成,并且PtrBBX23能夠與PtrHY5互作[4,蘋果MdBBX37能夠與花青苷正向調(diào)控因子MdMYB1、MdMYB9互作,抑制二者對下游靶標(biāo)的結(jié)合,從而抑制花青苷積累;并且MdBBX37能夠與MdHY5的啟動子相結(jié)合,通過抑制MdHY5的表達影響花青苷代謝[47],蕎麥中FtBBX22和FtHY5能夠形成復(fù)合物促進FtMYB42的表達從而正向調(diào)節(jié)光誘導(dǎo)的花青素積累[48]。這說明BBX-MYB-HY5可能構(gòu)成花青苷代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò),在菊花中CmBBXs是否與CmMYB、CmHY5共同調(diào)控花青苷代謝還有待進一步研究。

3.2 結(jié)論

從菊花基因組數(shù)據(jù)中鑒定出35個CmBBXs成員,并對其進行命名。蛋白理化性質(zhì)分析發(fā)現(xiàn)大部分CmBBXs屬于酸性、不穩(wěn)定蛋白,都具有親水性。CmBBXs具有不同保守結(jié)構(gòu)域與Motif數(shù)量,這可能導(dǎo)致其成員間的功能差異。進化分析發(fā)現(xiàn)CmBBXs與擬南芥AtBBXs相似,成員分為5個亞族。順式作用元件分析發(fā)現(xiàn)CmBBXs存在許多光響應(yīng)相關(guān)元件、激素響應(yīng)相關(guān)元件、抗逆與脅迫響應(yīng)相關(guān)元件以及MYB轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,這說明CmBBXs可能參與調(diào)控光信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、光形態(tài)建成與激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)等。UV-A下CmBBXs表達模式分析發(fā)現(xiàn)CmBBX20、CmBBX22、CmBBX22.2與CmBBX28.2這4個成員表達上調(diào),且與菊花花青苷代謝調(diào)控基因CmMYB6表達相似,是潛在的菊花花青昔代謝調(diào)控基因。

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(責(zé)任編輯:高國賦)

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