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茶樹鈣調(diào)蛋白結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活因子(CAMTA)家族基因鑒定與表達分析

2025-03-13 00:00:00劉金仙王麗娟劉杰傅仙玉武廣珩
中國農(nóng)業(yè)科技導報 2025年3期
關鍵詞:分析

摘要:為了解茶樹鈣調(diào)蛋白結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活因子(calmodulin-binding transcription activator,CAMTA)家族成員的功能,探究其表達特性,利用生物信息學方法在茶樹全基因組中鑒定CsCAMTAs 基因,并對其理化性質(zhì)、基因結(jié)構(gòu)、結(jié)構(gòu)域、保守基序、系統(tǒng)進化、順式作用元件進行分析,利用qRT-PCR技術分析CsCAMTAs 在不同組織、不同激素處理和病菌脅迫下的表達情況。結(jié)果表明,在茶樹全基因組中共鑒定出10個CsCAMTAs 成員,共包含10個motifs,分布在6條染色體,均定位于細胞核。不同CsCAMTAs 基因差異較大,氨基酸數(shù)目為124~1 419個,編碼蛋白等電點為4.976~9.820,除1 個為弱疏水蛋白外,其他均為親水蛋白。系統(tǒng)進化分析將茶樹10 個CsCAMTAs 基因劃分為4個類群,有4個同源基因?qū)Γ椿驅(qū)υ诨蚪Y(jié)構(gòu)、保守結(jié)構(gòu)域、保守基序數(shù)量和相對位置等方面具有較高相似性。CsCAMTAs 啟動子區(qū)含有34個與光響應、激素誘導以及生物脅迫相關的順式作用元件。表達分析結(jié)果顯示,CsCAMTAs 在不同組織的表達有明顯差異,其中CsCAMTA1、3、4、7、8、10 在老葉中的表達水平較高;除CsCAMTA5 不受茉莉酸甲酯誘導外,其他CsCAMTAs 基因均受茉莉酸甲酯、脫落酸、水楊酸及茶輪斑病菌誘導表達,由此說明CsCAMTAs 不僅調(diào)控茶樹生長發(fā)育,還參與茶樹對病菌和激素的應答。

關鍵詞:茶樹;鈣調(diào)蛋白結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活因子(CAMTA);生物信息學分析;表達分析

doi:10.13304/j.nykjdb.2023.0591

中圖分類號:S571.1;Q78 文獻標志碼:A 文章編號:10080864(2025)03007112

鈣離子(Ca2+)是植物中廣泛存在的重要信使,介導多種信號轉(zhuǎn)導途徑,在植物脅迫響應和生長發(fā)育中具有重要作用[12]。鈣調(diào)蛋白(calmodulin,CaM)是最重要的一類Ca2+感受器,它自身沒有酶活性,一般通過Ca2+/CaM復合體來調(diào)控下游基因,與CaM結(jié)合的轉(zhuǎn)錄因子有很多,目前已鑒定出90多種,其中包括CAMTA、WRKY、MYB、NAC 和bZIP等[3-7]。

鈣調(diào)蛋白結(jié)合轉(zhuǎn)錄激活因子(calmodulinbinding transcription activator,CAMTA)作為 CaM 結(jié)合轉(zhuǎn)錄因子之一,廣泛存在于真核生物中,最早在煙草中被發(fā)現(xiàn)[2]。CAMTA由多基因家族編碼,且有多個功能保守結(jié)構(gòu)域,從N端到C端主要包括CG-1結(jié)構(gòu)域、TIG結(jié)構(gòu)域、ANK重復結(jié)構(gòu)域、IQ基序、CaMBD 結(jié)構(gòu)域[8-10]。植物CAMTA 基因可響應干旱[11-13]、鹽[1415]、低溫[16-18]等環(huán)境脅迫和脫落酸[19]、水楊酸[20]、乙烯[21]、生長素[22]等激素信號,在植物響應生物、非生物脅迫及生長發(fā)育過程發(fā)揮重要的調(diào)控作用[23]。不斷開發(fā)的生物信息學工具以及公開發(fā)布的基因組學數(shù)據(jù)使得許多植物基因家族被鑒定,目前擬南芥(Arabidopsis thaliana)[24]、大豆(Glycinemax)[25]、玉米(Zea mays)[26]、柑橘(Citrus sinensis 、Citrusclementina)[27]等多種植物的CAMTA基因被鑒定。

茶樹(Camellia sinensis)是我國重要的經(jīng)濟作物,作為多年生常綠木本植物,其在生長和發(fā)育過程中,常常遭受病蟲害、干旱、高溫、低溫等生物和非生物脅迫,影響其產(chǎn)量和品質(zhì)。本研究基于茶樹全基因組信息,利用生物信息學方法鑒定茶樹CsCAMTAs 家族基因,并對其染色體位置、基因結(jié)構(gòu)、保守結(jié)構(gòu)域、系統(tǒng)進化、啟動子元件及其蛋白的理化性質(zhì)、互作網(wǎng)絡進行系統(tǒng)分析,通過qRT-PCR分析CsCAMTAs 基因在茶輪斑病菌脅迫、不同激素處理下及不同組織中的表達,以期為茶樹 CAMTA 基因的功能開發(fā)與抗逆育種提供參考。

1 材料與方法

1.1 試驗材料及處理

以武夷學院茶樹種植資源圃種植的7年生舒茶早茶樹為試驗材料,對其嫩葉(1芽2葉)分別進行如下單因素處理:①分別用0.5 mmol·L-1水楊酸(salicylic acid,SA)、0.2% 茉莉酸甲酯(jasmonicacid methyl ester,MeJA)、50 μmol·L-1 脫落酸(abscisic acid,ABA)噴灑葉片正反面;②用OD=0.2的茶輪斑病菌CLBB1懸浮液在葉片主脈兩側(cè)各針刺2個孔。其中激素處理分別于0、3、6、12、24 h 取樣;病菌處理分別于0、24、48、72 h 取樣。取樣后置于液氮中速凍,-80 ℃保存?zhèn)溆谩8魈幚砭? h樣品為對照。另外于2022年10月28日取根、莖、嫩葉、老葉、花材料,置于液氮速凍,-80 ℃保存?zhèn)溆茫渲幸愿M織樣品為對照。

1.2 試驗方法

1.2.1 茶樹CsCAMTAs 家族基因鑒定和理化性質(zhì)分析 從茶樹基因數(shù)據(jù)庫TPIA(http://tpia.teaplant.org/index.html)和tea PDGB (http://eplant.njau. edu. cn/tea/index. html)下載所有注釋為CAMTA 的蛋白序列,從全基因組水平預測茶樹所有 CAMTA 基因家族成員。從PlantTFdb數(shù)據(jù)庫中下載擬南芥CAMTA 蛋白序列作為參考序列,采用blastp比對檢索同源基因,去除冗余后,利用NCBI 中的Batch CD-search(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/bwrpsb/bwrpsb.cgi)檢測是否含有CAMTA特征性結(jié)構(gòu)域,剔除不含特征性結(jié)構(gòu)域的假陽性基因[28],將含有該家族典型結(jié)構(gòu)域的蛋白序列鑒定為茶樹CAMTA家族成員。利用在線工具Cell-PLoc 2.0(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Cell-PLoc-2/)進行CsCAMTAs蛋白亞細胞定位;利用EditSeq工具預測蛋白分子量以及等電點;利用ExPASy rotParam(https://web.expasy.org/protparam/)預測蛋白的親疏水性;利用在線工具——德泰生物(detaibio.com)預測蛋白的信號肽。

1.2.2 CsCAMTAs 基因染色體定位、基因結(jié)構(gòu)、保守結(jié)構(gòu)域和motif的分析 利用 TBtools軟件繪制CsCAMTAs 染色體定位圖。根據(jù)CsCAMTAs 注釋信息,利用GSDS2.0(http://gsds.gao-lab.org/)分析基因的結(jié)構(gòu)特征,并繪制相應的基因結(jié)構(gòu)圖。利用NCBI Batch CD-search 及SMART 在線網(wǎng)站對CsCAMTAs 編碼蛋白進行保守結(jié)構(gòu)域分析,然后用DOG2.0 對結(jié)果進行可視化展示。利用MEMESuite 5.4.1 (http://meme-suite.org/tools/meme)分析保守基序(motif),設置motif的搜索數(shù)值為10,其他維持默認值,并下載保守基序信息,采用TBtools繪制保守基序圖。

1.2.3 CsCAMTAs 基因系統(tǒng)進化分析 從NCBI、Ensembl、JGI數(shù)據(jù)庫下載已鑒定的擬南芥、番茄、玉米、柑橘CAMTA蛋白序列,利用MEGA 7.0軟件中Muscle對5個物種的CAMTA 蛋白序列進行多重比對,采用鄰接法(neighbor-joining method,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,bootstrap 取1 000,其他參數(shù)默認。

1.2.4 CsCAMTAs 基因啟動子順式作用元件分析 截取CsCAMTAs 基因轉(zhuǎn)錄起始位點上游2 000 bp序列作為啟動子序列,提交至PlantCARE (http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)進行順式響應元件預測分析,并利用TBtools 軟件對預測結(jié)果進行可視化展示。

1.2.5 CsCAMTAs基因表達分析 采用多糖多酚植物RNA提取試劑盒(天根)提取樣品總RNA,電泳檢測后采用Go ScriptTM Reverse Transcription Mix(Promega)逆轉(zhuǎn)錄試劑盒,將樣品RNA 反轉(zhuǎn)錄成cDNA,-20 ℃保存?zhèn)溆谩@?Primer Primer 5.0軟件對CsCAMTAs基因序列設計引物,詳見表1。所有引物均由上海生工生物有限公司合成。以cDNA為模板、茶樹CsGAPDHs 基因為內(nèi)參,利用 CFX96實時熒光定量PCR 儀(Bio-Rad)和SYBER GreenPCR Mix Kit(NovaBroteiu)檢測 CsCAMTAs 基因在不同組織及不同處理下的相對表達量,將對照基因的表達量定義為1個單位,采用2-△△ CT法[29]計算基因的相對表達量,每個樣品3 次重復。采用SPSS 19.0軟件對相對表達量進行方差分析,并通過TBtools軟件繪制基因相對表達量熱圖。

2 結(jié)果與分析

2.1 茶樹CsCAMTAs 基因鑒定及理化性質(zhì)分析

基于茶樹全基因組數(shù)據(jù)綜合分析,共鑒定得到10 個茶樹CAMTA 家族基因,分別命名為CsCAMTA1~10(表2)。CsCAMTAs 編碼蛋白序列長度差異明顯,其中有4 個CsCAMTAs 基因(CsCAMTA1、4、7、10)編碼蛋白長度為124~325個氨基酸,分子量為14.29~36.55 kD,等電點8.722~9.820;有6 個CsCAMTAs 基因(CsCAMTA2、3、5、6、8、9)編碼蛋白長度為953~1 419 個氨基酸,分子量97.26~157.99 kD,等電點4.976~6.828,由此表明,大部分CsCAMTAs 基因的編碼蛋白為酸性蛋白。亞細胞定位及信號肽預測表明,CsCAMTAs蛋白均定位于細胞核且不含信號肽。除CsCAMTA10 蛋白呈微弱疏水性外,其余蛋白均為親水性蛋白。

2.2 CsCAMTAs 基因染色體定位、基因結(jié)構(gòu)和保守結(jié)構(gòu)域分析

染色體定位(圖1)顯示:10個CsCAMTAs 基因分布在茶樹的6條染色體,其中第11號染色體有3 個CsCAMTAs 基因;第7、第8 各有2 個;第1、第5、第6染色體各有1個。由此表明,CsCAMTAs 基因在染色體上的分布具有差異性和不均勻性。

由于內(nèi)含子位置及外顯子/內(nèi)含子的分布結(jié)構(gòu)在某些基因家族進化中起重要作用[30],為此,利用GSDS分析了10個CsCAMTAs 基因的結(jié)構(gòu),并繪制了相應基因結(jié)構(gòu)圖,如圖2所示。不同CsCAMTAs基因包含的內(nèi)含子數(shù)差異較大,在3~19個之間,CsCAMTTA4 和7 的內(nèi)含子數(shù)較少,均為3 個;CsCAMTA1、8 的內(nèi)含子數(shù)分別為4、8 個;其余CsCAMTAs 內(nèi)含子數(shù)均大于10個,其中CsCAMTA6的內(nèi)含子數(shù)最多,為19個。CsCAMTA4、7、10 基因不具備UTR( untranslated region)結(jié)構(gòu)。同源基因?qū)sCAMTTA2 和9 的外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)較為相似;CsCAMTTA3 與5、CsCAMTTA6 與8 靠3’端的外顯子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)也較為相似。

保守結(jié)構(gòu)域分析(圖3)顯示,除CsCAMTA8外,其余CsCAMTAs 均含有保守的CG-1結(jié)構(gòu)域,其中CsCAMTA1、4、7、10 只含有1個CG-1結(jié)構(gòu)域,不含其他結(jié)構(gòu)域; CsCAMTA2、3、5、6、8、9 還含有TIG結(jié)構(gòu)域和ANK重復結(jié)構(gòu)域,其中CsCAMTA3、5有2個ANK結(jié)構(gòu)域;另外,CsCAMTA2、3、5、9 含有IQ基序,CsCAMTA2、6、8 有CaMBD結(jié)構(gòu)域。綜上所述,同源基因?qū)sCAMTA2 與9、CsCAMTA3 與5、CsCAMTA6 與8 的保守結(jié)構(gòu)域較為相似。

2.3 CsCAMTAs 基因保守基序分析

為進一步了解茶樹CAMTA 蛋白結(jié)構(gòu)多樣性,利用MEME Suite 5.4.1對CsCAMTAs 基因保守基序進行分析,共鑒定出10個保守基序,命名為Motif 1~10(圖4、5),其氨基酸序列長度在29~50aa 之間。除CsCAMTA5 和8 不含Motif 1 外(序列為GSLFLFDRKVLRYFRKDGHN WRKKKDGKTVKEAHERLKVGNMEAJACYY),其他CsCAMTAs 基因均含有Motif 1,表明Motif 1 在CsCAMTAs 基因中較為保守。除CsCAMTA1、4、7、10 外,其他CsCAMTAs 基因均含有8個及以上基序,其中多數(shù)位于蛋白C端。CsCAMTA2、3、6、9 均含有Motif 1~10;且同源基因?qū)Φ谋J鼗蚰J捷^為相似,如CsCAMTA1 與10、CsCAMTA2 與9、CsCAMTA3 與5、CsCAMTA6 與8。10 個基序中,Motif 1、Motif 8 與CG-1結(jié)構(gòu)域相關;Motif 4、Motif 7與TIG結(jié)構(gòu)域相關;Motif 3、Motif 5與Ank-2結(jié)構(gòu)域相關;Motif 2、Motif 10與CaMBD、IQ結(jié)構(gòu)域有關;Motif 6功能未知,還有待進一步研究。

2.4 CsCAMTAs 基因系統(tǒng)進化分析

對茶樹CAMTA蛋白與來自擬南芥、番茄、玉米、柑橘的CAMTA蛋白序列進行系統(tǒng)進化分析,結(jié)果(圖6)顯示,50個CAMTAs 基因共劃分為6個亞組(GroupⅠ~GroupⅥ),茶樹的10個CsCAMTAs位于GroupⅡ和Group Ⅲ中,其中同源基因?qū)sCAMTA6、8 與擬南芥AtCAMTA1、2、3 聚在Group Ⅲ;CsCAMTA1、2、3、4、5、7、9、10 基因均聚在Group Ⅱ ,CsCAMTA3、5 分別與番茄的SlCAMTA1、2 聚在同一分支,推測CsCAMTAs 與番茄CAMTA 基因有較近的親源關系。

2.5 CsCAMTAs 啟動子順式作用元件分析

為更好地了解茶樹CAMTA 基因?qū)Νh(huán)境脅迫的響應,截取CsCAMTAs 基因轉(zhuǎn)錄起始位點上游2 kb區(qū)域作為啟動子區(qū),利用PlantCARE在線軟件對其進行順式作用元件分析,結(jié)果(圖7)顯示,共鑒定出34個順式作用元件,其中光響應元件21個;激素響應元件9個;壓力響應元件4個。從各元件在基因中的分布來看,光響應元件G-Box分布在9個CsCAMTAs 基因中,元件數(shù)量達28個,其次是ARE(厭氧誘導元件antioxidant responseelement)、ABRE(脫落酸響應元件abscisic acidresponse element)、Box4( 光響應元件lightresponsiveness element)、LTR(低溫響應元件lowtemperature responsiveness element),分布在8 個CsCAMTAs 基因中,元件數(shù)量分別為31、25、23、10個;激素響應元件CGTCA-motif(茉莉酸甲酯響應元件)與TGACG-motif(茉莉酸響應元件)在CsCAMTAs 基因中的分布和數(shù)量,與番茄中的結(jié)果一致[31]。不同CsCAMTAs 基因的激素響應元件在種類、數(shù)量上也有一定差異,CsCAMTA1 不含AuxRR(生長素響應元件);CsCAMTA8 只含有1種赤霉素響應元件P-Box(1 個)和1 種ABRE 元件(3個)。在CsCAMTAs 基因中,檢測到4種壓力響應元件,其分布范圍較廣,在CsCAMTAs 中的占比達60%~80%,其中LTR 與ARE 元件分布于8 個CsCAMTAs 基因,ARE元件的數(shù)量最多,達31個;MBS(MYB in drought)與TC 富集重復序列(防御與脅迫響應元件)分布于6個CsCAMTAs 基因,這些元件對于植物抵御逆境脅迫起重要作用。綜上, CsCAMTAs 在光響應、激素誘導以及低溫脅迫等過程中具有重要作用。

2.6 不同組織CsCAMTAs 基因表達分析

熒光定量PCR 分析結(jié)果( 圖8)表明,CsCAMTA1 在花中不表達;CsCAMTA1、3、4、7、8、10 在老葉中的相對表達量較高,分別為根的3.41、30.86、70.15、60.66、3.20、66.39倍,顯著高于其他組織;CsCAMTA2、5 在莖中的相對表達量較高,分別為根的3.04、1.77倍;CsCAMTA6 在不同組織中均有表達,且不同組織中的表達量差異較小;CsCAMTA9 在莖、嫩葉、老葉、花中表達量顯著低于根。綜上所述,CsCAMTAs 基因表達具有組織特異性,不同CsCAMTAs 基因調(diào)控組織發(fā)育的模式及機制可能存在差別。

2.7 不同處理下CsCAMTAs 基因表達分析

CsCAMTAs 基因在不同激素(ABA、MeJA、SA)以及茶輪斑病菌(CLBB1)處理下的表達模式如圖9 所示。ABA 誘導下,在處理3 h 時除CsCAMTA6、9 表達量輕微上調(diào)外,其他CsCAMTAs基因的表達量均下調(diào);在處理6 和12 h 時CsCAMTA1~10 的表達量均明顯上調(diào),其中CsCAMTA3、4、5、9、10 在6 h時出現(xiàn)峰值,其相對表達量分別為0 h的312.84、261.79、49.07、54.82、104.75 倍,CsCAMTA1、2、7、8 的表達峰值出現(xiàn)在12 h時,其相對表達量分別為0 h的62.83、88.72、173.17、5.65 倍;在處理24 h 時CsCAMTAs 基因的相對表達量較12 h時顯著下調(diào)。

MeJA 誘導下,CsCAMTA1、3、4、7、10 的表達量變化趨勢較為相似,呈下降-上升-下降-上升的“W”型變化趨勢,均在3和12 h時表達量下調(diào),在6 和24 h 時表達量顯著上調(diào);CsCAMTA2、8 在6、24 h時輕微表達上調(diào),而在其他時間均出現(xiàn)不同程度下調(diào);CsCAMTA5 在整個處理過程中均為不同程度下調(diào);CsCAMTA6 在處理3 h表達量上調(diào),但幅度較小,在處理24 h 時表達量下調(diào);CsCAMTA9 在3 h表達量下調(diào),隨著處理時間的延長表達量明顯上調(diào)。

在SA 誘導下,除CsCAMTA2、8、10 在處理24 h及CsCAMTA5 在處理3和24 h時表達量下調(diào)外,CsCAMTA2、5、8、10 在其他時間點以及其他CsCAMTAs 基因表達量均顯著上調(diào),其中CsCAMTA8 在處理3 h時出現(xiàn)表達峰值,為0 h的8.13倍;CsCAMTA1、2、3、5、9、10 均在處理6 h時出現(xiàn)峰值,表達量分別為0 h的27.06、164.23、90.92、5.29、46.31、89.10倍;CsCAMTA4、6、7 在處理12 h出現(xiàn)峰值,表達量分別為0 h 的81.32、9.40、231.38倍。

在CLBB1針刺處理下,除CsCAMTA5、9 在處理24 h時表達量下調(diào)外,其余均呈不同程度上調(diào),其中CsCAMTA1、2、3、4、5、7、10 在處理48 h時顯著上調(diào),表達量分別為0 h 的13.29、5.85、7.94、775.21、3.94、57.60、173.16 倍;在處理72 h 時,僅CsCAMTA2、5 表達下調(diào),其他CsCAMTA 基因上調(diào)表達。

綜上所述,除CsCAMTA5 不受MeJA 誘導外,其他CsCAMTA 基因均不同程度地受MeJA、ABA、SA及病菌CLBB1誘導,表明CsCAMTAs 在響應生物脅迫應答和激素信號轉(zhuǎn)導中發(fā)揮著重要作用。

3 討論

基于茶樹全基因組信息,Li等[32]、Zhou等[33]對CAMTA 基因家族進行了鑒定,但由于標準不同,所得家族成員數(shù)存在差異。CAMTA 基因有多個功能保守結(jié)構(gòu)域,本研究參照吳嫻[34]在小麥上的鑒定標準,按照只要擁有其中1個典型保守結(jié)構(gòu)域的序列都鑒定為茶樹CAMTA 成員(CsCAMTAs)的標準,共鑒定出10個茶樹CAMTA 基因,將其分別命名為CsCAMTA1~10,即CsCAMTA 基因數(shù)量與葡萄中一致[35],高于香蕉[36]、擬南芥[37]、水稻[38]、芒果[39],但低于大豆[25]、番茄[31]、甘藍型油菜[40]。10個CsCAMTAs 基因分布在6條染色體上,不同基因大小差異較大,編碼蛋白的氨基酸數(shù)為124~1 419aa,與柑橘[27]、芒果[39]等相似。除CsCAMTA10 蛋白外,其他均屬于親水蛋白,與Kakar等[41]的研究結(jié)果一致。分子量較小的CsCAMTA1、4、7、10蛋白的等電點為8.722~9.820,均為堿性蛋白,占比40%,與Yang等[42]研究結(jié)果一致。不同CsCAMTAs基因的結(jié)構(gòu)差異也較大,特別是內(nèi)含子數(shù)量(3~19),但同源基因?qū)Φ耐怙@子/內(nèi)含子結(jié)構(gòu)具有較高的相似性,表明茶樹同橡樹[28]、毛果楊[43]、玉米[26]和木薯[44] 等物種一樣基因結(jié)構(gòu)具有較高的保守性。保守結(jié)構(gòu)域預測分析發(fā)現(xiàn),CsCAMTAs 有1~5個高度保守的功能結(jié)構(gòu)域,除CsCAMTA8 外,其他CsCAMTA 基因均含有CG1 結(jié)構(gòu)域,其中CsCAMTA1、4、7、10 僅含有1個CG1結(jié)構(gòu)域,其他均含3個及以上CG1結(jié)構(gòu)域,且均含有TIG結(jié)構(gòu)域,這與Rahman等[45]研究結(jié)果類似。另外,親緣關系更近的同源基因?qū)ΤJ亟Y(jié)構(gòu)域較為相似外,保守基序模式也高度相似。因此,推測CAMTAs 基因生物學功能多樣化的內(nèi)在原因是由于基因結(jié)構(gòu)的差異,但親緣關系較近的同源基因?qū)υ诨蚪Y(jié)構(gòu)、保守結(jié)構(gòu)域、保守基序上相似性較高,與Schweighofer等[46]在擬南芥中的結(jié)果一致。

CAMTA 基因的表達與植物生長和發(fā)育有關。擬南芥AtCAMTA1 和5 在花粉發(fā)育過程都有表達,且AtCAMTA1 在花粉發(fā)育過程中特異性表達[47]。Yang等[48]研究發(fā)現(xiàn),番茄7個CAMTA/SR 基因在果實發(fā)育和成熟過程中差異性表達,其在番茄果實發(fā)育與成熟中起重要作用。本研究表明,茶樹不同CsCAMTAs基因在根、莖、嫩葉、老葉、花等組織中的表達模式存在差異,這與Li等[32]、Zhou等[33]研究結(jié)果一致,且這種差異表達模式在柑橘[27]、蒺藜苜蓿[49]、油菜[40] 中也有類似的發(fā)現(xiàn)。由此說明,CsCAMTAs 基因參與了茶樹的生長和發(fā)育,但不同成員的作用存在一定差異。關于CsCAMTAs 參與調(diào)控茶樹生長發(fā)育的,仍需進一步研究。

CAMTA 基因除與植物生長發(fā)育有關,同時還參與多種生物、非生物脅迫響應。研究表明,CAMTA 基因在冷、干旱、病原菌、生長素、水楊酸、脫落酸和茉莉酸誘導下表達量發(fā)生變化[14,16,50-52]。本研究分析了CsCAMTA1~10 在激素誘導和生物脅迫下的表達特性,也得到了相似的結(jié)果,除CsCAMTA5 不受MeJA 誘導外,其他CsCAMTAs 基因均不同程度受MeJA、ABA、SA及病菌CLBB1的誘導。對CsCAMTAs 基因的啟動子分析發(fā)現(xiàn),啟動子區(qū)包含34種與壓力、激素以及光響應相關的順式作用元件,如ABRE、LTR、MBS、CGTCAmotif、TGACG-motif 等。由此表明,CsCAMTAs 在響應生物脅迫應答、激素信號轉(zhuǎn)導以及茶樹生長發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用。

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