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不同菜用甘薯品種莖尖代謝產(chǎn)物鑒定及途徑分析

2025-02-19 00:00:00張奕萱李慧峰黃詠梅李彥青滑金鋒銀捷陳天淵肖冬莫云川
關(guān)鍵詞:生物差異

摘要:為研究代謝產(chǎn)物對(duì)甘薯生長(zhǎng)發(fā)育的影響,以甘薯莖尖為研究對(duì)象,利用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(liquidchromatograph-mass spectrometer,LC-M)分離鑒定南寧菜、福菜薯18號(hào)、桂菜薯1號(hào)、桂菜薯2號(hào)、福薯7-6和臺(tái)農(nóng)71共6種菜用甘薯的差異代謝產(chǎn)物,探討代謝途徑的差異。結(jié)果表明,6個(gè)甘薯品種共得到差異代謝物4 210種,其中上調(diào)2 229種,下調(diào)1 981種,表明不同甘薯品種間存在顯著差異。差異代謝物涉及的代謝途徑主要包括初級(jí)膽汁酸生物合成、吲哚生物堿生物合成、黃酮和黃酮醇生物合成和色氨酸代謝,且不同品種間差異代謝物的積累和代謝途徑也存在較大差異。因此,推測(cè)差異代謝物的積累和代謝途徑的差異對(duì)甘薯品質(zhì)起著關(guān)鍵作用。以上研究結(jié)果為進(jìn)一步分析不同品種甘薯品質(zhì)差異的機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞:菜用甘薯;莖尖;代謝產(chǎn)物;代謝途徑doi:10.13304/j.nykjdb.2024.0371

中圖分類號(hào):S531;Q591 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號(hào):1008‐0864(2025)02‐0062‐08

甘薯是我國(guó)重要的食品和工業(yè)原料作物,在國(guó)民經(jīng)濟(jì)中占有重要地位[1]。盡管儲(chǔ)藏根是其主要食用部位,但甘薯的莖葉也被視為綠色蔬菜,并因其豐富的營(yíng)養(yǎng)成分和健康益處而備受關(guān)注。然而對(duì)于不同品種菜用甘薯的代謝特征和代謝通路差異了解尚不充分[2-3]。

甘薯莖葉富含維生素、礦物質(zhì)、葉酸、蛋白質(zhì)等營(yíng)養(yǎng)成分以及多酚、綠原酸、黃酮等有益健康的功能成分,這不僅使其成為重要的蔬菜、飼料來源,也將使其成為加工利用的新對(duì)象[4]。綠原酸是甘薯中酚酸類物質(zhì)的主要成分,具有抗氧化、抗誘變和清除自由基等抗氧化特性[5],意味著食用甘薯莖葉具有多種健康益處,如抗衰老、抗癌、抗菌、抗炎、抗高血壓和抗糖尿病(Ⅱ型)作用[6]。目前,消費(fèi)者對(duì)甘薯莖葉的營(yíng)養(yǎng)成分、生物活性和潛在健康益處越來越關(guān)注。研究表明,在甘薯中鑒定出的主要酚類化合物是酚酸和黃酮類化合物,其組成和含量因甘薯種類而存在差異[7]。劉主等[6]通過對(duì)糖尿病鼠進(jìn)行試驗(yàn)發(fā)現(xiàn),甘薯中的糖蛋白具有降血糖作用。曾果等[7]通過生物強(qiáng)化技術(shù)培育的高β-胡蘿卜素甘薯品種具有為兒童補(bǔ)充維生素A的作用。有關(guān)甘薯中酚類化合物的特征已有研究,然而關(guān)于甘薯中這些化合物的定量和表征信息有限。代謝組學(xué)研究能夠全面地揭示生物體內(nèi)代謝物的變化[8-9],但在菜用甘薯方面的應(yīng)用尚未充分展開。本研究以6種菜用甘薯的莖尖為研究對(duì)象,通過主成分(principa component,PC)分析、偏最小二乘判別分析(orthogonal partial leastsquares discriminant analysis,OPLS-DA)等多元統(tǒng)計(jì)分析方法分析不同品種間的差異代謝產(chǎn)物和代謝通路,從而為菜用甘薯的品質(zhì)改良和優(yōu)化提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)地概況

試驗(yàn)于2022年在廣西壯族自治區(qū)農(nóng)業(yè)科學(xué)院明陽基地 (22°27′18″—22°36′29″N,108°2′—108°18′E) 溫室大棚進(jìn)行,土壤為赤紅壤。甘薯株行距為20 cm×20 cm,栽插密度為250 500株·hm?2,田間管理同當(dāng)?shù)厮健T圆搴?0 d,摘取莖尖,樣品儲(chǔ)藏在?80 ℃冰箱備用,每品種6個(gè)生物學(xué)重復(fù)用于代謝產(chǎn)物測(cè)定。

1.2 試驗(yàn)材料

選取南寧菜(NNC)、福菜薯18號(hào)(FCS18)、桂菜薯1 號(hào)(GCS1) 、桂菜薯2 號(hào)(GCS2) 、福薯7-6(FS7-6)和臺(tái)農(nóng)71(TN71)共6個(gè)甘薯品種。南寧菜株型匍匐型,頂芽和頂葉黃綠色,成葉墨綠色,葉心形或心形帶齒,葉脈、葉脈基部、葉柄、柄基及莖均為綠色,葉片較大,莖直徑較粗,分枝數(shù)中等,味甜、軟滑,且葉片較耐煮、不爛,食味好。福菜薯18 號(hào)株型短蔓半直立,萌芽性能好,葉心形,帶齒,莖尖無茸毛;植株生長(zhǎng)旺盛,腋芽再生能力強(qiáng);中抗甘薯根腐病、甘薯莖線蟲病,感甘薯黑斑病;耐濕耐水肥。桂菜薯1號(hào)株型表現(xiàn)為直立或半直立,莖端無茸毛,葉形深裂復(fù)缺刻,頂葉綠色或黃綠色,莖色綠,無茸毛,燙后顏色綠,有香味、甜味和滑膩感。桂菜薯2號(hào)株型表現(xiàn)為直立或半直立,莖端無茸毛,葉形深裂復(fù)缺刻,頂葉黃綠色或綠色,成葉深綠色,莖綠色,莖尖燙熟后顏色綠色,有香味和甜味,無澀味。福薯7-6株型短蔓半直立,頂葉、成葉、葉脈、葉柄和莖蔓均為綠色。葉脈基部淡紫色,葉心形,莖尖絨毛少,食味清甜,無苦澀味,適口性好。臺(tái)農(nóng)71株型短蔓半直立,基部分枝多,頂葉、成葉、葉脈、葉柄、莖蔓均為綠色,葉心形,茸毛少,口感鮮嫩滑爽。

1.3 試驗(yàn)方法

1.3.1 菜用甘薯樣品預(yù)處理 選取完整、成熟的甘薯莖尖,放入研缽研磨,將研磨好的粉末樣品儲(chǔ)存于?80 ℃ 冰箱備用。

1.3.2 代謝產(chǎn)物提取 取 100 mg 研磨樣本,置于 EP 管中,加入500 μL 的 80%甲醇水溶液;渦旋振蕩,冰浴靜置 5 min,4 ℃、15 000 r·min?1離心20 min;取一定量的上清加質(zhì)譜級(jí)水稀釋至甲醇含量為53%;4 ℃、15 000 r·min?1離心20 min,收集上清,進(jìn)行液相色譜? 質(zhì)譜聯(lián)用儀(liquidchromatograph mass spectrometer,LC-MS)分析[10]。

1.3.3 LC-MS 分析 ①色譜條件。在LC-MS 系統(tǒng),分析條件如下:取5 μL提取物進(jìn)行色譜分離,色譜柱(100 mm×2.1 mm,1.7 μm, Waters,USA)柱溫為40 ℃,流速為0.35 mL·min?1,其中流動(dòng)相包括水和 0.1%甲酸溶液(溶劑A)、5%乙腈溶液(溶劑B)。 洗脫梯度程序:以5%溶劑B為起始條件,保持1 min;并將5%~100% B 保持8.0 min;隨后在 9.0—12.0 min使用100%溶劑B;最后在12.0—15.0 min使用5%溶劑B。

②質(zhì)譜條件。在Q ExactiveTM HF-X質(zhì)譜儀上進(jìn)行質(zhì)量采集,該系統(tǒng)在電噴霧電離正負(fù)模式下運(yùn)行,設(shè)置如下:一級(jí)離子掃描m/z范圍:80~1 200,分辨率 70 000,二級(jí)打碎片離子分辨率 17 500,能量梯度為 20/50;在正、負(fù)模式下,噴霧電壓分別為:3.50、3.00 kV,離子源溫度為300 ℃。

1.4 數(shù)據(jù)分析

將質(zhì)譜分析采集得到的原始數(shù)據(jù)經(jīng)過Compound Discoverer 2.1(Thermo Fisher Scientific)軟件處理,獲得整理好的數(shù)據(jù)后,將其導(dǎo)入MetaboAnalyst 進(jìn)行主成分(PC)分析、正交偏最小二乘法判別分析(OPLS-DA),以篩選不同甘薯品種的差異代謝物,并進(jìn)行KEEG(kyoto encyclopedia ofgenes and genomes)通路分析和代謝通路分析。

2 結(jié)果與分析

2.1 主成分分析和偏最小二乘法判別分析

為比較不同甘薯品種的代謝物組成,通過非靶向LC-MS獲得的數(shù)據(jù)進(jìn)行主成分(PC)分析,結(jié)果(圖1)表明,正離子模式下,PC1和PC2的貢獻(xiàn)率分別為18.8% 和12.7%,累計(jì)貢獻(xiàn)率為31.5%;負(fù)離子模式下,PC1和PC2的貢獻(xiàn)率分別為21.6%和14.2%,累計(jì)貢獻(xiàn)率為35.8%。不同品種間較分散,而同一品種的不同生物學(xué)重復(fù)聚集在一起。同時(shí)樣本均分布在95%置信區(qū)間,表明分析結(jié)果可靠,不同甘薯品種的代謝物存在差異。

OPLS-DA結(jié)果(圖2)表明,R2 和Q2 值均大于0.9,說明模型有效,預(yù)測(cè)能力好。通過置換檢驗(yàn)對(duì)模型有效性做進(jìn)一步的檢驗(yàn),結(jié)果表明,6個(gè)甘薯品種之間有顯著性差異(Plt;0.05),說明模型穩(wěn)健性好,不存在過擬合現(xiàn)象。福菜薯18號(hào)與南寧菜、桂菜薯1 號(hào)與南寧菜、桂菜薯1 號(hào)與福菜薯18號(hào)、桂菜薯2號(hào)與南寧菜、桂菜薯2號(hào)與福菜薯18號(hào)、桂菜薯2號(hào)與桂菜薯1號(hào)、福薯7-6與南寧菜、福薯7-6 與福菜薯18 號(hào)、福薯7-6 與桂菜薯1號(hào)、福薯7-6與桂菜薯2號(hào)、臺(tái)農(nóng)71與南寧菜、臺(tái)農(nóng)71與福菜薯18號(hào)、臺(tái)農(nóng)71與桂菜薯1號(hào)、臺(tái)農(nóng)71與桂菜薯2號(hào)、臺(tái)農(nóng)71與福薯7-6樣品間差異較大,說明不同甘薯品種存在差異,而同一品種內(nèi)的6次生物學(xué)重復(fù)較集中,即組內(nèi)差異較小。

2.2 不同甘薯品種間差異代謝物的篩選

將變量投影重要性(variable importance inprojection, VIP)≥1、Plt;0.05 和倍數(shù)變化(foldchange,F(xiàn)C) ≥ 2的差異代謝物定義為顯著性差異代謝物。由表1可知,福菜薯18號(hào)和南寧菜之間有314 種顯著差異代謝物,其中189 種上調(diào),125種下調(diào);桂菜薯1號(hào)和南寧菜之間有304種顯著差異代謝物,其中166種上調(diào),138種下調(diào);桂菜薯1號(hào)和福菜薯18號(hào)之間有253種顯著差異代謝物,其中138種上調(diào),115種下調(diào);桂菜薯2號(hào)和南寧菜之間有300種顯著差異代謝物,其中148種上調(diào),152種下調(diào);桂菜薯2號(hào)和福菜薯18號(hào)之間有311種顯著差異代謝物,其中155種上調(diào),156種下調(diào);桂菜薯2號(hào)和桂菜薯1號(hào)之間有292種顯著差異代謝物,其中132種上調(diào),160種下調(diào);福薯7-6和南寧菜之間有287種顯著差異代謝物,其中162種上調(diào),125種下調(diào);福薯7-6和福菜薯18號(hào)之間有254 種顯著差異代謝物,其中116 種上調(diào),138種下調(diào);福薯7-6和桂菜薯1號(hào)之間有276種顯著差異代謝物,其中126種上調(diào),150種下調(diào);福薯7-6和桂菜薯2號(hào)之間有315種顯著差異代謝物,其中154種上調(diào),161種下調(diào);臺(tái)農(nóng)71和南寧菜之間有331種顯著差異代謝物,其中185種上調(diào),146種下調(diào);臺(tái)農(nóng)71和福菜薯18號(hào)之間有272種顯著差異代謝物,其中146 種上調(diào), 126 種下調(diào);臺(tái)農(nóng)71和桂菜薯1號(hào)之間有209種顯著差異代謝物,其中119種上調(diào),90種下調(diào);臺(tái)農(nóng)71和桂菜薯2號(hào)之間有209種顯著差異代謝物,其中132種上調(diào),77種下調(diào);臺(tái)農(nóng)71和福薯7-6之間有283種顯著差異代謝物,其中162種上調(diào),122種下調(diào)。在福菜薯18號(hào)和南寧菜中檢測(cè)到的上調(diào)差異代謝物最多,而在臺(tái)農(nóng)71和桂菜薯2號(hào)最少。在臺(tái)農(nóng)71和福薯7-6中檢測(cè)到的下調(diào)差異代謝物數(shù)量最高,在臺(tái)農(nóng)71和桂菜薯2號(hào)最少。各品種間的差異代謝物均有所不同,呈現(xiàn)出顯著差異,推測(cè)6種甘薯品種的差異是由于代謝物差異所致。綜上,南寧菜和福菜薯18 號(hào)、桂菜薯1 號(hào)、桂菜薯2號(hào)、福薯7-6、臺(tái)農(nóng)71間的代謝物譜差異較大。

2.3 差異代謝富集分析

KEGG 富集分析結(jié)果表明,福菜薯18 號(hào)、桂菜薯1 號(hào)、桂菜薯2 號(hào)、福薯7-6、臺(tái)農(nóng)71 與南寧菜的差異代謝物分別涉及72、81、80、60、63條通路,主要通路如圖3 所示。福菜薯18 號(hào)與南寧菜的差異代謝物主要富集在色氨酸代謝、吲哚生物堿生物合成,其中注釋到色氨酸代謝途徑的差異代謝物最多,其次是次生代謝物的生物合成途徑。值得注意的是,生物堿合成相關(guān)的代謝途徑包括吲哚生物堿生物合成、莽草酸途徑生物堿的生物合成、萜類化合物和聚酮類生物堿的生物合成、皂苷生物堿的生物合成、組氨酸和嘌呤生物堿的生物合成萜烯和聚酮生物堿的生物合成,這些生物合成通路上富集的差異基因在桂菜薯1號(hào)和南寧菜數(shù)量較多;除莽草酸途徑生物堿的生物合成外,桂菜薯2號(hào)與南寧菜中還顯著富集了與類固醇激素生物合成有關(guān)的代謝途徑。在福薯7-6 與南寧菜的差異代謝物富集分析中,主要是次生代謝物合成的途徑,次生代謝過程被認(rèn)為是植物在長(zhǎng)期進(jìn)化中對(duì)生態(tài)環(huán)境適應(yīng)的結(jié)果,在植物適應(yīng)生態(tài)環(huán)境中起重要作用。臺(tái)農(nóng)71與南寧菜的差異代謝物富集的代謝通路主要為次生膽汁酸生物合成、黃酮和黃酮醇生物合成[10]、初級(jí)膽汁酸生物合成。

3 討論

本研究對(duì)6個(gè)不同甘薯品種的莖尖進(jìn)行了非靶向代謝組學(xué)檢測(cè),PC分析表明,不同甘薯品種間差異較大。與南寧菜相比,福菜薯18號(hào)、桂菜薯1號(hào)、桂菜薯2號(hào)、福薯7-6和臺(tái)農(nóng)71莖尖中的上調(diào)代謝物數(shù)量分別為189、166、148、162和185種,下調(diào)代謝物數(shù)量分別為125、138、152、125、146種,在這些差異代謝物中,僅有46種相同,表明6個(gè)甘薯品種的代謝物譜存在顯著差異。Tan等[11]分析不同基因型甘薯的代謝組學(xué)顯示,不同基因型之間存在顯著的代謝差異。這與本研究結(jié)果一致,進(jìn)一步驗(yàn)證了甘薯不同品種間代謝特征的差異性。福菜薯18號(hào)與南寧菜差異代謝物的富集分析表明,色氨酸代謝途徑被顯著富集,注釋到色氨酸代謝途徑的差異基因最多,其次是次生代謝物生物合成途徑。色氨酸可通過一系列酶催化反應(yīng)轉(zhuǎn)化為多種次生代謝產(chǎn)物,如植物激素生長(zhǎng)素、色素類黃酮和類黃酮醇等[12]。桂菜薯1 號(hào)與南寧菜的差異代謝物也富集在色氨酸代謝途徑,同時(shí)還顯著富集于次生膽汁酸生物合成、組氨酸代謝、Ⅱ型聚酮產(chǎn)品的生物合成、初級(jí)膽汁酸生物合成;桂菜薯2 號(hào)與南寧菜的差異代謝物富集在初級(jí)膽汁酸生物合成、次生膽汁酸生物合成、類固醇激素生物合成、碳水化合物的消化和吸收; 臺(tái)農(nóng)71與南寧菜的差異代謝物主要富集在次生膽汁酸生物合成、黃酮和黃酮醇的生物合成、初級(jí)膽汁酸生物合成。由此表明,南寧菜、福菜薯18號(hào)、桂菜薯1號(hào)、桂菜薯2號(hào)、福薯7-6和臺(tái)農(nóng)71的代謝途徑存在顯著差異。色氨酸還參與植物光合作用的調(diào)節(jié),光合作用是植物能量的主要來源,而色氨酸在光合作用中扮演重要角色,它通過調(diào)控光合作用,影響光合作用的速率和效率[13] 。生長(zhǎng)素可調(diào)節(jié)光合作用相關(guān)酶的活性,從而影響光合作用的速率和產(chǎn)物的積累,色氨酸的存在和調(diào)控為植物的能量供給提供了重要保障。色氨酸還可增強(qiáng)植物對(duì)各種脅迫的耐受性,包括干旱、高溫、低溫、鹽脅迫等,其通過調(diào)節(jié)植物生長(zhǎng)素、抗氧化酶活性以及相關(guān)基因的表達(dá)等途徑發(fā)揮作用。在高粱拔節(jié)期噴施色氨酸能顯著提高籽粒產(chǎn)量、千粒重、莖粗和穗長(zhǎng),同時(shí)降低株高、減輕倒伏的風(fēng)險(xiǎn),這一措施還有助于提高高粱植株的SPAD 值和凈光合速率,增加籽粒千粒重,從而達(dá)到增產(chǎn)增收效果[14]。本研究也發(fā)現(xiàn),差異代謝物顯著富集于色氨酸代謝,因此,南寧菜、福菜薯18號(hào)和桂菜薯1號(hào)光合作用的增強(qiáng)可能與色氨酸及其產(chǎn)物的增加有關(guān),通過進(jìn)一步探究甘薯色氨酸代謝的調(diào)節(jié)機(jī)制,或許能夠發(fā)現(xiàn)類似的促生長(zhǎng)效果,從而為甘薯產(chǎn)量和質(zhì)量的改良提供新途徑。同時(shí),色氨酸還可通過合成次生代謝產(chǎn)物的方式,增強(qiáng)植物的抗逆能力。將代謝組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)相結(jié)合,深入理解植物代謝調(diào)控機(jī)理,對(duì)深入解析作物高產(chǎn)、優(yōu)質(zhì)的調(diào)控機(jī)制提供了新的方向。

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