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雞傳染性喉氣管炎病毒SYBR Green Ⅰ實時熒光定量PCR檢測方法的建立與應用

2024-08-22 00:00:00張玉霞董雯雯袁小遠孟凱徐懷英
山東農業科學 2024年6期

關鍵詞:雞喉氣管炎病毒;TK基因;實時熒光定量PCR;特異性;敏感性;重復性

中圖分類號:S858.31 文獻標識號:A 文章編號:1001-4942(2024)06-0128-05

雞傳染性喉氣管炎是由喉氣管炎病毒(Infec-tious laryngotracheitis virus,ILTV)引起的一種急性、接觸性呼吸道傳染病,主要侵染雞的喉頭和氣管上皮細胞,同時也對雞鼻竇、氣囊和肺組織產生影響,被世界衛生組織(OIE)列為必須通報的疾病。ILTV首次于20世紀30年代報道自美國,屬于皰疹病毒科α-皰疹病毒亞科,病毒粒子為直徑85~105nm的正20面體立體對稱結構,有囊膜,是危害雞集約化養殖的主要病毒性呼吸道傳染病致病菌之一。近年來,在山東、江蘇、河北等部分地區,雞傳染性喉氣管炎的發病率不僅在蛋雞中增高,在蛋種雞和商品肉雞中也呈增加趨勢。

ILTV只有一個血清型,臨床病變有嚴重和輕微兩種形式,嚴重者表現出呼吸困難、氣喘、咳出帶血分泌物等主要癥狀,發病率和致死率高達70%。該病易與其他呼吸道疾病,如新城疫、傳染性支氣管炎等混淆,因此建立一種快速有效的診斷方法對ILTV的監測具有重要意義。

ILTV的基因組有79個開放閱讀框,編碼多種結構蛋白和致病性蛋白,其中,TK基因編碼胸腺嘧啶激酶,在核酸代謝中起主要作用,是病毒的主要毒力基因,也是構建基因缺失疫苗的主要靶標。本研究對ILTV的TK基因保守區域進行分析,利用Primer 5軟件設計了1對熒光定量PCR引物,建立了ILTV的實時熒光定量PCR檢測方法,為ILTV的監測與診斷提供技術支持。

1材料與方法

1.1病毒與臨床病料

ILTV、傳染性支氣管炎病毒(IBV)、禽流感H5(AIV-H5)、H9亞型滅活毒株(AIV-H9)、新城疫病毒(NDV)均由山東省禽病診斷與免疫重點實驗室鑒定并保存。臨床樣本為2022年1月一2023年1月該實驗室接收的病料組織,-80℃保存。

1.2主要試劑

SimplyP病毒DNA/RNA提取試劑盒購自杭州博日科技股份有限公司;質粒小提試劑盒、膠回收試劑盒、18-T載體連接試劑盒均購自天根生化科技(北京)有限公司;SYBR Green Premix TaqTM

1.3引物的設計與合成

根據GenBank已公布的ILTV的TK基因保守序列,利用軟件Primer 5.0分別設計1對普通PCR引物和1對熒光定量PCR引物(表1),均由北京華大基因科技有限公司合成,離心后用ddH2O稀釋至10μmol/L,-20℃保存。

1.4病毒核酸提取

將儲存于-80℃的感染ILTV的雞尿囊液按照SimplyP病毒DNA/RNA提取試劑盒說明書提取病毒DNA,于-80℃保存。

1.5質粒標準品的準備

以ILTV DNA為模板,利用引物TK-P1/P2對TK基因進行PCR擴增。擴增體系為:Taq Mix12.5μL,上、下游引物各1.0μL,模板DNA 2.0μL,加ddH2O補足至25μL。反應條件為:94℃預變性5 min;94℃變性1 min,55℃退火1 min,72℃延伸30 s,35個循環;72℃延伸7 min;4℃保存。擴增產物進行1.5%瓊脂糖凝膠電泳鑒定。

用膠回收試劑盒純化回收330 bp處陽性目的片段:使用18-T載體連接試劑盒將純化回收片段與18-T載體16℃連接30 min后,按說明書轉化至DH5α感受態細胞:在氨芐陽性的LB營養瓊脂平板上涂抹培養并篩選陽性克隆,挑取合格單菌落接入含氨芐的液體LB培養基中過夜擴大培養。用質粒提取試劑盒提取重組質粒后基因測序。

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